More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1452 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1452  putative rRNA methylase  100 
 
 
156 aa  323  7e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000390375  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1197  RNA methyltransferase  78.43 
 
 
164 aa  247  4e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.188758  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3293  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  74.03 
 
 
160 aa  231  4.0000000000000004e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.212145  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2379  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  71.05 
 
 
158 aa  230  6e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00313017  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0924  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  69.93 
 
 
158 aa  222  1e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.73808e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3322  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  69.28 
 
 
158 aa  218  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000129205  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2088  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  66.23 
 
 
154 aa  214  2.9999999999999998e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.227987  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1700  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  66.89 
 
 
157 aa  209  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000455125  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2332  RNA methyltransferase  60.27 
 
 
152 aa  186  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11010  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  56.85 
 
 
162 aa  179  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0271045  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0805  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  56.85 
 
 
168 aa  178  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.309509 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2278  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  57.53 
 
 
164 aa  177  4.999999999999999e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.117934  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0453  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  53.69 
 
 
154 aa  168  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0505  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  52 
 
 
157 aa  165  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1049  RNA methyltransferase  53.06 
 
 
153 aa  166  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.432365  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0602  RNA methyltransferase  50.68 
 
 
162 aa  164  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.863015  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0516  RNA methyltransferase  50.68 
 
 
162 aa  164  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0459  RNA methyltransferase  50.68 
 
 
162 aa  164  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.172229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0455  RNA methyltransferase  50.68 
 
 
162 aa  164  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0623  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  50.68 
 
 
162 aa  164  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0547  RNA methyltransferase  50.68 
 
 
162 aa  164  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0694927  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0584  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  50.68 
 
 
162 aa  164  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4754  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  50.68 
 
 
162 aa  164  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0101258  hitchhiker  0.00000000000898658 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0548  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  50.68 
 
 
162 aa  164  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.67047e-31 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0127  RNA methyltransferase  51.7 
 
 
164 aa  164  4e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00636988  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0462  RNA methyltransferase  50.68 
 
 
162 aa  163  6.9999999999999995e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0432  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  55.41 
 
 
152 aa  163  8e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.112018  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2405  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  52.03 
 
 
155 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000095272  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1370  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  52 
 
 
157 aa  161  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1880  RNA methyltransferase TrmH, group 2  51.7 
 
 
155 aa  160  4.0000000000000004e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000892134  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0470  RNA methyltransferase  50 
 
 
162 aa  160  5.0000000000000005e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0138  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  46.31 
 
 
153 aa  158  3e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0147773  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1574  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  51.68 
 
 
154 aa  157  7e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1687  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  54.79 
 
 
164 aa  154  3e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0194  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  50 
 
 
156 aa  154  4e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.141115  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2133  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  52.35 
 
 
154 aa  154  5.0000000000000005e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2141  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  53.8 
 
 
160 aa  152  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1605  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  47.62 
 
 
153 aa  151  2.9999999999999998e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000286837  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0834  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  56.58 
 
 
152 aa  151  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0618819 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2823  RNA methyltransferase TrmH, group 2  52.35 
 
 
161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00419688  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0152  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  48.63 
 
 
166 aa  146  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1004  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  53.29 
 
 
188 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2107  rRNA methylase (SpoU class)  50.68 
 
 
152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0823  tRNA/rRNA methyltransferase  49.33 
 
 
162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0580  RNA methyltransferase  48.7 
 
 
169 aa  143  1e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2885  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  52.32 
 
 
158 aa  142  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.938343  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1518  RNA methyltransferase  43.92 
 
 
153 aa  142  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0990  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  45.21 
 
 
172 aa  142  2e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2090  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  49.01 
 
 
153 aa  141  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000512947 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0450  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  50 
 
 
152 aa  141  3e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1308  rRNA methylase-like protein cspR  43.24 
 
 
153 aa  140  8e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0763  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  43.92 
 
 
152 aa  140  9e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.635512  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0359  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  47.62 
 
 
174 aa  138  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.012351  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1909  RNA methyltransferase  46.75 
 
 
156 aa  138  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0507641  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4609  TrmA family RNA methyltransferase  48.34 
 
 
153 aa  138  3e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00112922  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1268  rRNA methylase (SpoU class)  43.62 
 
 
169 aa  138  3e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000665769  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1943  RNA methyltransferase  46.75 
 
 
156 aa  138  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.158878  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1528  RNA methyltransferase  50.33 
 
 
152 aa  138  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130723  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5052  RNA methyltransferase  46.98 
 
 
157 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0599206  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4925  RNA methyltransferase  46.98 
 
 
153 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.61078  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0313  rRNA methyltransferase, TrmH family  42.86 
 
 
169 aa  136  1e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000102446  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3280  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  48.99 
 
 
157 aa  136  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3194  RNA methyltransferase TrmH, group 2  47.02 
 
 
153 aa  135  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00355106  hitchhiker  0.0000259155 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0026  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  48.32 
 
 
160 aa  135  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0658  rRNA methylase (SpoU class)  46.45 
 
 
170 aa  134  4e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000212975  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0597  rRNA methylase, SpoU family  46 
 
 
155 aa  134  5e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000064162  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4979  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  48.32 
 
 
157 aa  134  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0541  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  45.21 
 
 
152 aa  134  6.0000000000000005e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.854981 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4110  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  48.32 
 
 
157 aa  134  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2539  RNA methyltransferase  48.99 
 
 
159 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.438382  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03464  predicted rRNA methylase  48.32 
 
 
157 aa  133  8e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3818  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  48.32 
 
 
157 aa  133  8e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0102  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  48.32 
 
 
157 aa  133  8e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03415  hypothetical protein  48.32 
 
 
157 aa  133  8e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1155  rRNA methylase (SpoU class)  46 
 
 
168 aa  133  8e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0200534  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0099  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  48.32 
 
 
157 aa  132  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3943  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  48.32 
 
 
157 aa  132  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1248  RNA methyltransferase  44.97 
 
 
161 aa  132  9.999999999999999e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1874  RNA methyltransferase TrmH, group 2  50 
 
 
156 aa  133  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0452  RNA methyltransferase  48.68 
 
 
156 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4034  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  48.32 
 
 
157 aa  132  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0078  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  44.97 
 
 
151 aa  133  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0413  RNA methyltransferase  45.64 
 
 
153 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.85413 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2768  RNA methyltransferase  48.03 
 
 
156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2906  RNA methyltransferase  48.03 
 
 
170 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1391  RNA methyltransferase  44.81 
 
 
156 aa  131  3e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.444743  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0040  RNA methyltransferase  44.3 
 
 
159 aa  132  3e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6180  RNA methyltransferase TrmH, group 2  48.68 
 
 
156 aa  131  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5103  RNA methyltransferase  45.64 
 
 
153 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2862  RNA methyltransferase  48.68 
 
 
156 aa  131  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.427649 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2182  RNA methyltransferase TrmH, group 2  48.98 
 
 
154 aa  132  3e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00014694  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2864  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  49.03 
 
 
162 aa  131  3.9999999999999996e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1472  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  44 
 
 
156 aa  131  3.9999999999999996e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0119863  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1700  RNA methyltransferase  44.3 
 
 
152 aa  131  3.9999999999999996e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.295449  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0238  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  47.06 
 
 
153 aa  130  5e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.460006  normal  0.0379576 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0272  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  43.84 
 
 
148 aa  130  5e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1670  RNA methyltransferase  47.37 
 
 
165 aa  130  6e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0552  RNA methyltransferase  44.97 
 
 
157 aa  130  6e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.242542  normal  0.84663 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1511  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  42.95 
 
 
156 aa  130  6e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000000118005  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0307  RNA methyltransferase  46.31 
 
 
154 aa  130  6e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>