More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0983 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE0983  RNA methyltransferase  100 
 
 		 155 aa  323  5e-88  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.553899  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0913  RNA methyltransferase  98.06 
 
 		 155 aa  318  1.9999999999999998e-86  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0421038  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0908  RNA methyltransferase  96.13 
 
 		 155 aa  312  9e-85  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.002208  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0597  rRNA methylase, SpoU family  72.55 
 
 		 155 aa  238  2.9999999999999997e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000064162  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0040  RNA methyltransferase  69.28 
 
 		 159 aa  231  3e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1511  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  69.48 
 
 		 156 aa  224  4e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000000118005  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1248  RNA methyltransferase  65.36 
 
 		 161 aa  222  1e-57  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0823  tRNA/rRNA methyltransferase  62.09 
 
 		 162 aa  212  1.9999999999999998e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1097  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  58.17 
 
 		 156 aa  183  1.0000000000000001e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.116876  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11010  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  52.7 
 
 		 162 aa  156  9e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0271045  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1605  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  49.66 
 
 		 153 aa  156  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000286837  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1700  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  49.32 
 
 		 157 aa  152  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000455125  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0194  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  48.99 
 
 		 156 aa  151  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.141115  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1574  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  44.3 
 
 		 154 aa  147  7e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0763  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  47.33 
 
 		 152 aa  145  1.0000000000000001e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.635512  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0990  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  47.62 
 
 		 172 aa  145  2.0000000000000003e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0138  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  45.58 
 
 		 153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0147773  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0127  RNA methyltransferase  48.39 
 
 		 164 aa  144  6e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00636988  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2405  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  45.58 
 
 		 155 aa  141  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000095272  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0152  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  44.9 
 
 		 166 aa  140  4e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2107  rRNA methylase (SpoU class)  46.62 
 
 		 152 aa  141  4e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2278  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  48.34 
 
 		 164 aa  140  8e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.117934  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2379  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  43.33 
 
 		 158 aa  137  6e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00313017  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1197  RNA methyltransferase  43.33 
 
 		 164 aa  137  7.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.188758  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2088  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  44.97 
 
 		 154 aa  137  7.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.227987  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1049  RNA methyltransferase  43.33 
 
 		 153 aa  134  4e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.432365  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3293  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  42.67 
 
 		 160 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.212145  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0541  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  43.54 
 
 		 152 aa  131  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.854981 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0272  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  45.21 
 
 		 148 aa  131  3e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2332  RNA methyltransferase  45.7 
 
 		 152 aa  130  5e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0805  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  46.62 
 
 		 168 aa  130  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.309509 
 
 
-
 
NC_002620  TC0827  spoU rRNA methylase family protein  44.08 
 
 		 151 aa  130  9e-30  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000730061  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0924  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  43.24 
 
 		 158 aa  130  9e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.73808e-35 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1452  putative rRNA methylase  42.38 
 
 		 156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000390375  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3322  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  42.57 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000129205  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2133  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  46.58 
 
 		 154 aa  127  5.0000000000000004e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0078  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  43.24 
 
 		 151 aa  127  6e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2267  rRNA methylase  44.37 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00105703  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002216  tRNA (cytosine34-2'-O-)-methyltransferase  44.08 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0313  rRNA methyltransferase, TrmH family  44.08 
 
 		 169 aa  125  2.0000000000000002e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000102446  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1518  RNA methyltransferase  42.57 
 
 		 153 aa  124  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1308  rRNA methylase-like protein cspR  42.57 
 
 		 153 aa  124  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1687  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  44.3 
 
 		 164 aa  125  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0213  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  44.3 
 
 		 154 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.653568  normal  0.505987 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3301  RNA methyltransferase  42.95 
 
 		 154 aa  124  4.0000000000000003e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0858286 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3498  RNA methyltransferase  44.3 
 
 		 154 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.584508  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0307  RNA methyltransferase  45.64 
 
 		 154 aa  124  5e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0211  RNA methyltransferase  44.3 
 
 		 154 aa  124  6e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000450191  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3807  RNA methyltransferase  44.97 
 
 		 154 aa  124  6e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.509614  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4038  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  45.33 
 
 		 154 aa  124  7e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3736  RNA methyltransferase  44.97 
 
 		 154 aa  124  7e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.607715 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3934  RNA methyltransferase  44.97 
 
 		 154 aa  124  7e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000097835  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4529  RNA methyltransferase  42.95 
 
 		 154 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1323  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  41.5 
 
 		 156 aa  123  8.000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.431138  normal  0.429518 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3440  RNA methyltransferase TrmH, group 2  42.67 
 
 		 158 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4126  RNA methyltransferase  44.3 
 
 		 154 aa  122  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00837599  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0026  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  41.61 
 
 		 160 aa  122  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1951  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  43.62 
 
 		 154 aa  122  1e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000939499  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00152  RNA methyltransferase  42.76 
 
 		 159 aa  123  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0264  RNA methyltransferase  42.95 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114775 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2563  hypothetical protein  42.57 
 
 		 149 aa  122  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0265  RNA methyltransferase  42.28 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.13438  normal  0.0255655 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2823  RNA methyltransferase TrmH, group 2  41.45 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00419688  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4247  RNA methyltransferase  44.3 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0108586  hitchhiker  0.00213899 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2417  hypothetical protein  41.89 
 
 		 149 aa  121  3e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3946  RNA methyltransferase  45.64 
 
 		 153 aa  121  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4386  RNA methyltransferase  42.28 
 
 		 154 aa  120  5e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0470  RNA methyltransferase  40.27 
 
 		 162 aa  121  5e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1880  RNA methyltransferase TrmH, group 2  40 
 
 		 155 aa  120  6e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000892134  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0132  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  44.67 
 
 		 154 aa  119  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1155  rRNA methylase (SpoU class)  42.76 
 
 		 168 aa  119  9.999999999999999e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0200534  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5861  putative rRNA methylase  40.27 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0279492  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1700  RNA methyltransferase  42.28 
 
 		 152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.295449  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1629  tRNA/rRNA methyltransferase  42.28 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0124  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  45.03 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00538  putative tRNA/rRNA methyltransferase  42.95 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0602  RNA methyltransferase  38.93 
 
 		 162 aa  118  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.863015  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0516  RNA methyltransferase  38.93 
 
 		 162 aa  118  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0459  RNA methyltransferase  38.93 
 
 		 162 aa  118  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.172229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0455  RNA methyltransferase  38.93 
 
 		 162 aa  118  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0552  RNA methyltransferase  38.93 
 
 		 157 aa  118  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.242542  normal  0.84663 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0547  RNA methyltransferase  38.93 
 
 		 162 aa  118  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0694927  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0548  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  38.93 
 
 		 162 aa  118  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.67047e-31 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1130  putative tRNA/rRNA methyltransferase  38.93 
 
 		 177 aa  118  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0623  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  38.93 
 
 		 162 aa  118  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0584  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  38.93 
 
 		 162 aa  118  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4754  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  38.93 
 
 		 162 aa  118  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0101258  hitchhiker  0.00000000000898658 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4881  RNA methyltransferase TrmH, group 2  39.33 
 
 		 151 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2343  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  40.79 
 
 		 159 aa  118  3.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.2665  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0432  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  43.24 
 
 		 152 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.112018  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4812  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  42 
 
 		 157 aa  118  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.799981  hitchhiker  0.00015333 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0505  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  39.07 
 
 		 157 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0075  RNA methyltransferase  40.79 
 
 		 162 aa  117  4.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0012  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  40 
 
 		 153 aa  117  4.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.121067  normal  0.063625 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0081  RNA methyltransferase  40.79 
 
 		 162 aa  117  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4135  RNA methyltransferase  40.79 
 
 		 162 aa  117  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.438164  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5052  RNA methyltransferase  40.67 
 
 		 157 aa  117  6e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0599206  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5323  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  39.33 
 
 		 151 aa  117  6e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0102  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  43.33 
 
 		 157 aa  117  7e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3818  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  43.33 
 
 		 157 aa  117  7e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>