More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0541 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_0541  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  100 
 
 		 152 aa  315  1e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.854981 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2107  rRNA methylase (SpoU class)  59.74 
 
 		 152 aa  189  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0127  RNA methyltransferase  55.63 
 
 		 164 aa  182  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00636988  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0194  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  55.19 
 
 		 156 aa  179  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.141115  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0432  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  53.95 
 
 		 152 aa  178  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.112018  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11010  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  56.29 
 
 		 162 aa  178  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0271045  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2405  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  54.97 
 
 		 155 aa  177  4.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000095272  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0805  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  54.3 
 
 		 168 aa  173  7e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.309509 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1049  RNA methyltransferase  55.26 
 
 		 153 aa  171  2.9999999999999996e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.432365  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0152  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  53.64 
 
 		 166 aa  171  3.9999999999999995e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1909  RNA methyltransferase  51.28 
 
 		 156 aa  167  4e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0507641  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1943  RNA methyltransferase  51.28 
 
 		 156 aa  167  4e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.158878  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2332  RNA methyltransferase  52.32 
 
 		 152 aa  167  5e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2133  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  51.66 
 
 		 154 aa  165  2.9999999999999998e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0453  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  52.29 
 
 		 154 aa  162  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0990  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  49.32 
 
 		 172 aa  161  3e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1880  RNA methyltransferase TrmH, group 2  49.67 
 
 		 155 aa  160  8.000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000892134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2278  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  52.03 
 
 		 164 aa  159  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.117934  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0580  RNA methyltransferase  51.3 
 
 		 169 aa  158  2e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1391  RNA methyltransferase  48.7 
 
 		 156 aa  157  4e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.444743  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1346  rRNA methylase (SpoU class)  48.7 
 
 		 209 aa  157  4e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0272  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  50.67 
 
 		 148 aa  154  5.0000000000000005e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2182  RNA methyltransferase TrmH, group 2  51.68 
 
 		 154 aa  152  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00014694  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0505  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  48.41 
 
 		 157 aa  152  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1605  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  47.97 
 
 		 153 aa  151  2.9999999999999998e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000286837  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2088  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  54.73 
 
 		 154 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.227987  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1308  rRNA methylase-like protein cspR  42.76 
 
 		 153 aa  150  5e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1518  RNA methyltransferase  42.76 
 
 		 153 aa  149  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1268  rRNA methylase (SpoU class)  45.16 
 
 		 169 aa  149  1e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000665769  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2417  hypothetical protein  47.68 
 
 		 149 aa  148  3e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0138  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  52.05 
 
 		 153 aa  147  4e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0147773  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1323  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  45.39 
 
 		 156 aa  147  5e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.431138  normal  0.429518 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3163  RNA methyltransferase  46.36 
 
 		 154 aa  147  6e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2563  hypothetical protein  47.02 
 
 		 149 aa  147  6e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2343  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  47.02 
 
 		 159 aa  147  6e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.2665  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0602  RNA methyltransferase  44.52 
 
 		 162 aa  147  7e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.863015  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0516  RNA methyltransferase  44.52 
 
 		 162 aa  147  7e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0459  RNA methyltransferase  44.52 
 
 		 162 aa  147  7e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.172229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0455  RNA methyltransferase  44.52 
 
 		 162 aa  147  7e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2407  RNA methyltransferase CspR  48.99 
 
 		 154 aa  147  7e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0547  RNA methyltransferase  44.52 
 
 		 162 aa  147  7e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0694927  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4754  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  44.52 
 
 		 162 aa  147  7e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0101258  hitchhiker  0.00000000000898658 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0548  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  44.52 
 
 		 162 aa  147  7e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.67047e-31 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0584  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  44.52 
 
 		 162 aa  147  7e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0623  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  44.52 
 
 		 162 aa  147  7e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0417  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  47.02 
 
 		 171 aa  146  9e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.897811  hitchhiker  0.000103614 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0241  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  47.02 
 
 		 171 aa  146  9e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1700  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  53.33 
 
 		 157 aa  146  9e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000455125  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0462  RNA methyltransferase  44.52 
 
 		 162 aa  145  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1370  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  45.16 
 
 		 157 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4038  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  48.34 
 
 		 154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3202  RNA methyltransferase TrmH, group 2  45.7 
 
 		 164 aa  145  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2823  RNA methyltransferase TrmH, group 2  49.32 
 
 		 161 aa  144  4.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00419688  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4529  RNA methyltransferase  47.33 
 
 		 154 aa  143  6e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1700  RNA methyltransferase  44.97 
 
 		 152 aa  144  6e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.295449  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1588  RNA methyltransferase  44.81 
 
 		 182 aa  143  7.0000000000000006e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000775856  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0211  RNA methyltransferase  46.67 
 
 		 154 aa  143  9e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000450191  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0213  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  46.67 
 
 		 154 aa  142  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.653568  normal  0.505987 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3498  RNA methyltransferase  46.67 
 
 		 154 aa  142  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.584508  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3736  RNA methyltransferase  47.33 
 
 		 154 aa  142  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.607715 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0470  RNA methyltransferase  43.87 
 
 		 162 aa  142  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3934  RNA methyltransferase  47.33 
 
 		 154 aa  142  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000097835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3440  RNA methyltransferase TrmH, group 2  48 
 
 		 158 aa  142  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4386  RNA methyltransferase  46.67 
 
 		 154 aa  142  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0879  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  47.62 
 
 		 155 aa  142  2e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4247  RNA methyltransferase  46.67 
 
 		 154 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0108586  hitchhiker  0.00213899 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1000  tRNA/rRNA methylase  47.62 
 
 		 155 aa  142  2e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3807  RNA methyltransferase  47.33 
 
 		 154 aa  142  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.509614  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0313  rRNA methyltransferase, TrmH family  44.44 
 
 		 169 aa  142  2e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000102446  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09600  predicted rRNA methylase SpoU family  46.36 
 
 		 159 aa  141  3e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000307354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002216  tRNA (cytosine34-2'-O-)-methyltransferase  46.1 
 
 		 159 aa  141  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4175  RNA methyltransferase TrmH, group 2  46.41 
 
 		 156 aa  141  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4126  RNA methyltransferase  46.67 
 
 		 154 aa  141  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00837599  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0264  RNA methyltransferase  45.33 
 
 		 154 aa  141  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114775 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0540  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  45.75 
 
 		 156 aa  141  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.699614  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2539  RNA methyltransferase  46.36 
 
 		 159 aa  141  4e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.438382  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0467  23S rRNA methyltransferase  44.3 
 
 		 152 aa  141  4e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0307  RNA methyltransferase  47.33 
 
 		 154 aa  140  4e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0163  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  44.37 
 
 		 159 aa  140  5e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3293  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  46.21 
 
 		 160 aa  140  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.212145  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0272  RNA methyltransferase  47.4 
 
 		 156 aa  140  7e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0413  RNA methyltransferase  43.71 
 
 		 153 aa  140  7e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.85413 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3912  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  45.7 
 
 		 157 aa  140  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5323  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  44.3 
 
 		 151 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3201  RNA methyltransferase  45.75 
 
 		 156 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0616  RNA methyltransferase TrmH, group 2  47.65 
 
 		 154 aa  139  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1418  RNA methyltransferase  45.75 
 
 		 156 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0668  RNA methyltransferase  45.75 
 
 		 156 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3974  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  45.03 
 
 		 157 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.818121 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6180  RNA methyltransferase TrmH, group 2  46.41 
 
 		 156 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0485  RNA methyltransferase  46.36 
 
 		 179 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0503  RNA methyltransferase  46.36 
 
 		 179 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3896  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  45.03 
 
 		 157 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.282741 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0174  RNA methyltransferase  45.75 
 
 		 156 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2845  RNA methyltransferase  45.75 
 
 		 156 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2851  RNA methyltransferase  47.02 
 
 		 172 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1197  RNA methyltransferase  45.52 
 
 		 164 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.188758  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4881  RNA methyltransferase TrmH, group 2  44.3 
 
 		 151 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2379  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  44.83 
 
 		 158 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00313017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2862  RNA methyltransferase  46.41 
 
 		 156 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.427649 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>