More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2332 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2332  RNA methyltransferase  100 
 
 		 152 aa  320  4e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11010  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  66.23 
 
 		 162 aa  219  9.999999999999999e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0271045  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0805  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  64.24 
 
 		 168 aa  213  5.9999999999999996e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.309509 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0453  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  66.01 
 
 		 154 aa  210  5.999999999999999e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0432  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  63.58 
 
 		 152 aa  204  3e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.112018  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2379  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  64.83 
 
 		 158 aa  201  4e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00313017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0127  RNA methyltransferase  60.53 
 
 		 164 aa  201  4e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00636988  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2088  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  66.21 
 
 		 154 aa  199  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.227987  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1049  RNA methyltransferase  60.26 
 
 		 153 aa  199  9.999999999999999e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.432365  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1197  RNA methyltransferase  62.76 
 
 		 164 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.188758  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1370  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  62.75 
 
 		 157 aa  191  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0505  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  59.87 
 
 		 157 aa  191  4e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3293  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  63.19 
 
 		 160 aa  190  6e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.212145  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2278  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  58.67 
 
 		 164 aa  188  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.117934  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0924  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  62.07 
 
 		 158 aa  187  7e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.73808e-35 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1452  putative rRNA methylase  60.27 
 
 		 156 aa  186  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000390375  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0194  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  57.52 
 
 		 156 aa  186  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.141115  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2133  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  57.89 
 
 		 154 aa  184  4e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3322  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  61.38 
 
 		 158 aa  183  6e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000129205  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2107  rRNA methylase (SpoU class)  56.29 
 
 		 152 aa  182  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0152  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  54.3 
 
 		 166 aa  181  3e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1700  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  60 
 
 		 157 aa  177  4e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000455125  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1880  RNA methyltransferase TrmH, group 2  53.64 
 
 		 155 aa  177  4.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000892134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0470  RNA methyltransferase  53.25 
 
 		 162 aa  176  9e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0602  RNA methyltransferase  51.95 
 
 		 162 aa  176  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.863015  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0516  RNA methyltransferase  51.95 
 
 		 162 aa  176  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0459  RNA methyltransferase  51.95 
 
 		 162 aa  176  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.172229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0455  RNA methyltransferase  51.95 
 
 		 162 aa  176  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0547  RNA methyltransferase  51.95 
 
 		 162 aa  176  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0694927  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0623  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  51.95 
 
 		 162 aa  176  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0548  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  51.95 
 
 		 162 aa  176  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.67047e-31 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0584  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  51.95 
 
 		 162 aa  176  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4754  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  51.95 
 
 		 162 aa  176  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0101258  hitchhiker  0.00000000000898658 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0462  RNA methyltransferase  51.95 
 
 		 162 aa  175  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2405  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  52.98 
 
 		 155 aa  174  4e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000095272  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1605  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  52.03 
 
 		 153 aa  169  1e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000286837  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0541  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  52.32 
 
 		 152 aa  167  5e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.854981 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0138  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  51.03 
 
 		 153 aa  164  4e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0147773  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0990  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  49.32 
 
 		 172 aa  163  5.9999999999999996e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2205  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  57.43 
 
 		 152 aa  163  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2268  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  57.43 
 
 		 152 aa  163  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00048141  hitchhiker  0.0001006 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1308  rRNA methylase-like protein cspR  49.34 
 
 		 153 aa  162  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1943  RNA methyltransferase  50.98 
 
 		 156 aa  162  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.158878  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1909  RNA methyltransferase  50.98 
 
 		 156 aa  162  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0507641  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1518  RNA methyltransferase  49.34 
 
 		 153 aa  162  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4881  RNA methyltransferase TrmH, group 2  51.01 
 
 		 151 aa  159  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0580  RNA methyltransferase  49.35 
 
 		 169 aa  158  3e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5323  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  50.34 
 
 		 151 aa  157  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1391  RNA methyltransferase  50 
 
 		 156 aa  157  5e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.444743  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0337  RNA methyltransferase TrmH, group 2  51.01 
 
 		 151 aa  156  8e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1130  putative tRNA/rRNA methyltransferase  55.03 
 
 		 177 aa  156  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1323  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  49.67 
 
 		 156 aa  152  1e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.431138  normal  0.429518 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04710  RNA methyltransferase TrmH, group 2  49.32 
 
 		 153 aa  152  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.187102  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2343  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  52.94 
 
 		 159 aa  153  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.2665  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09600  predicted rRNA methylase SpoU family  49.32 
 
 		 159 aa  152  1e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000307354  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4386  RNA methyltransferase  50.33 
 
 		 154 aa  152  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5052  RNA methyltransferase  49.32 
 
 		 157 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0599206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0552  RNA methyltransferase  53.42 
 
 		 157 aa  151  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.242542  normal  0.84663 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0307  RNA methyltransferase  52.03 
 
 		 154 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0417  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  50.34 
 
 		 171 aa  150  4e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.897811  hitchhiker  0.000103614 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0241  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  50.34 
 
 		 171 aa  150  4e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0413  RNA methyltransferase  48.65 
 
 		 153 aa  150  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.85413 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4925  RNA methyltransferase  48.99 
 
 		 153 aa  151  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.61078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2823  RNA methyltransferase TrmH, group 2  52.03 
 
 		 161 aa  150  8e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00419688  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3163  RNA methyltransferase  48.99 
 
 		 154 aa  149  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3194  RNA methyltransferase TrmH, group 2  52 
 
 		 153 aa  149  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00355106  hitchhiker  0.0000259155 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0823  tRNA/rRNA methyltransferase  50.68 
 
 		 162 aa  149  1e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4242  RNA methyltransferase  47.65 
 
 		 154 aa  149  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.175929 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0763  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  45.64 
 
 		 152 aa  149  1e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.635512  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0616  RNA methyltransferase TrmH, group 2  51.01 
 
 		 154 aa  148  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0211  RNA methyltransferase  51.35 
 
 		 154 aa  148  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000450191  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5103  RNA methyltransferase  48.32 
 
 		 153 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3946  RNA methyltransferase  49.01 
 
 		 153 aa  148  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0213  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  51.35 
 
 		 154 aa  148  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.653568  normal  0.505987 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0658  rRNA methylase (SpoU class)  49.68 
 
 		 170 aa  148  3e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000212975  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0313  rRNA methyltransferase, TrmH family  46.67 
 
 		 169 aa  148  3e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000102446  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4609  TrmA family RNA methyltransferase  53.33 
 
 		 153 aa  147  3e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00112922  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4529  RNA methyltransferase  51.35 
 
 		 154 aa  147  4e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2407  RNA methyltransferase CspR  51.02 
 
 		 154 aa  147  4e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2573  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  50 
 
 		 153 aa  147  4e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4126  RNA methyltransferase  50.68 
 
 		 154 aa  147  5e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00837599  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1574  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  49.32 
 
 		 154 aa  147  5e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4812  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  49.66 
 
 		 157 aa  147  5e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.799981  hitchhiker  0.00015333 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0359  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  47.06 
 
 		 174 aa  147  5e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.012351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0272  RNA methyltransferase  50 
 
 		 156 aa  147  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3498  RNA methyltransferase  51.35 
 
 		 154 aa  147  6e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.584508  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67710  putative rRNA methylase  47.97 
 
 		 153 aa  147  6e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000281538  normal  0.793348 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3736  RNA methyltransferase  51.35 
 
 		 154 aa  147  7e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.607715 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3807  RNA methyltransferase  51.35 
 
 		 154 aa  147  7e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.509614  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3934  RNA methyltransferase  51.35 
 
 		 154 aa  147  7e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000097835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1670  RNA methyltransferase  51.33 
 
 		 165 aa  146  8e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1511  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  47.62 
 
 		 156 aa  145  1.0000000000000001e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000000118005  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4247  RNA methyltransferase  50.68 
 
 		 154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0108586  hitchhiker  0.00213899 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0450  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  49.32 
 
 		 152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1874  RNA methyltransferase TrmH, group 2  53.33 
 
 		 156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3202  RNA methyltransferase TrmH, group 2  51.01 
 
 		 164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3912  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  48 
 
 		 157 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0834  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  53.47 
 
 		 152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0618819 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2885  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  48.97 
 
 		 158 aa  144  3e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.938343  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3896  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  47.33 
 
 		 157 aa  144  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.282741 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>