More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1222 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1222  tRNA/rRNA methyltransferase  100 
 
 		 186 aa  390  1e-108  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000181503  normal  0.0200658 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1170  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  97.31 
 
 		 186 aa  382  1e-105  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000414692  hitchhiker  0.000503269 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0973  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  74.19 
 
 		 180 aa  291  4e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000107173 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0310  RNA methyltransferase TrmH, group 2  53.89 
 
 		 156 aa  179  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2182  RNA methyltransferase TrmH, group 2  56.36 
 
 		 154 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00014694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0257  RNA methyltransferase TrmH, group 2  52.69 
 
 		 156 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0233  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  52.07 
 
 		 156 aa  171  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0188294 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0214  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  51.48 
 
 		 156 aa  171  5e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.163476 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4881  RNA methyltransferase TrmH, group 2  50.6 
 
 		 151 aa  170  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2343  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  52.69 
 
 		 159 aa  169  2e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.2665  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0452  RNA methyltransferase  51.5 
 
 		 156 aa  169  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2851  RNA methyltransferase  51.5 
 
 		 172 aa  169  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5323  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  49.4 
 
 		 151 aa  169  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2906  RNA methyltransferase  50.9 
 
 		 170 aa  168  5e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6180  RNA methyltransferase TrmH, group 2  50.9 
 
 		 156 aa  167  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0540  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  50.9 
 
 		 156 aa  167  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.699614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2768  RNA methyltransferase  50.9 
 
 		 156 aa  167  7e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2862  RNA methyltransferase  50.9 
 
 		 156 aa  167  9e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.427649 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0358  putative tRNA/rRNA methyltransferase protein  50.3 
 
 		 156 aa  166  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0648772 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0503  RNA methyltransferase  49.7 
 
 		 179 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4242  RNA methyltransferase  49.11 
 
 		 154 aa  166  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.175929 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2845  RNA methyltransferase  50.3 
 
 		 156 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3201  RNA methyltransferase  50.3 
 
 		 156 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0174  RNA methyltransferase  50.3 
 
 		 156 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0668  RNA methyltransferase  50.3 
 
 		 156 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0422  RNA methyltransferase  50.9 
 
 		 156 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1418  RNA methyltransferase  50.3 
 
 		 156 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0485  RNA methyltransferase  49.7 
 
 		 179 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0272  RNA methyltransferase  48.5 
 
 		 156 aa  165  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1648  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  49.71 
 
 		 156 aa  164  5e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.158148  normal  0.993753 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0413  RNA methyltransferase  47.62 
 
 		 153 aa  164  8e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.85413 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0616  RNA methyltransferase TrmH, group 2  49.7 
 
 		 154 aa  163  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4175  RNA methyltransferase TrmH, group 2  49.1 
 
 		 156 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4386  RNA methyltransferase  47.88 
 
 		 154 aa  162  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5052  RNA methyltransferase  47.62 
 
 		 157 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0599206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4925  RNA methyltransferase  47.62 
 
 		 153 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.61078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67710  putative rRNA methylase  48.21 
 
 		 153 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000281538  normal  0.793348 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1943  RNA methyltransferase  49.1 
 
 		 156 aa  161  6e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2237  RNA methyltransferase TrmH, group 2  51.25 
 
 		 168 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140944  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5103  RNA methyltransferase  47.02 
 
 		 153 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0337  RNA methyltransferase TrmH, group 2  48.19 
 
 		 151 aa  160  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0552  RNA methyltransferase  50.6 
 
 		 157 aa  159  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.242542  normal  0.84663 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04710  RNA methyltransferase TrmH, group 2  47.02 
 
 		 153 aa  159  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.187102  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0163  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  47.93 
 
 		 159 aa  158  4e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5861  putative rRNA methylase  47.59 
 
 		 153 aa  158  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0279492  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3163  RNA methyltransferase  46.11 
 
 		 154 aa  157  6e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3815  RNA methyltransferase  47.31 
 
 		 156 aa  157  8e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.221085 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2823  RNA methyltransferase TrmH, group 2  47.59 
 
 		 161 aa  157  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00419688  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4396  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  48.48 
 
 		 153 aa  155  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1670  RNA methyltransferase  47.88 
 
 		 165 aa  155  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1000  tRNA/rRNA methylase  47.85 
 
 		 155 aa  154  5.0000000000000005e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0879  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  47.85 
 
 		 155 aa  154  5.0000000000000005e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0874  RNA methyltransferase  46.71 
 
 		 159 aa  154  5.0000000000000005e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.812063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3541  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  47.88 
 
 		 189 aa  154  5.0000000000000005e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.675577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2864  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  47.88 
 
 		 162 aa  154  6e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1677  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  46.67 
 
 		 161 aa  154  7e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.451539  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1241  RNA methyltransferase TrmH, group 2  48.24 
 
 		 183 aa  153  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00538  putative tRNA/rRNA methyltransferase  47.31 
 
 		 154 aa  152  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0437  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  45.35 
 
 		 168 aa  152  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.463566 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4135  RNA methyltransferase  46.75 
 
 		 162 aa  152  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.438164  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0081  RNA methyltransferase  46.75 
 
 		 162 aa  152  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0075  RNA methyltransferase  46.75 
 
 		 162 aa  152  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3202  RNA methyltransferase TrmH, group 2  45.51 
 
 		 164 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4038  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  47.31 
 
 		 154 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03960  hypothetical tRNA/rRNA methyltransferase YibK  44.71 
 
 		 158 aa  152  2.9999999999999998e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3185  putative tRNA/rRNA methyltransferase protein  45.4 
 
 		 161 aa  151  5e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1130  putative tRNA/rRNA methyltransferase  46.2 
 
 		 177 aa  151  5e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2407  RNA methyltransferase CspR  47.88 
 
 		 154 aa  150  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1127  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  50 
 
 		 153 aa  150  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0124  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  49.1 
 
 		 154 aa  149  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0417  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  44.91 
 
 		 171 aa  149  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.897811  hitchhiker  0.000103614 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0241  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  44.91 
 
 		 171 aa  149  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3854  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  49.11 
 
 		 157 aa  149  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3498  RNA methyltransferase  47.59 
 
 		 154 aa  149  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.584508  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4081  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  44.77 
 
 		 157 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4019  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  44.77 
 
 		 157 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.921331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3912  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  44.77 
 
 		 157 aa  148  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4812  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  44.91 
 
 		 157 aa  149  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.799981  hitchhiker  0.00015333 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0307  RNA methyltransferase  48.81 
 
 		 154 aa  149  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0990  RNA methyltransferase  46.15 
 
 		 154 aa  148  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.411714  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3974  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  44.19 
 
 		 157 aa  147  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.818121 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3896  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  44.19 
 
 		 157 aa  147  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.282741 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4247  RNA methyltransferase  46.71 
 
 		 154 aa  147  8e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0108586  hitchhiker  0.00213899 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0052  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  47.31 
 
 		 154 aa  147  8e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22350  predicted rRNA methylase SpoU family  45.29 
 
 		 158 aa  147  9e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0125418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3440  RNA methyltransferase TrmH, group 2  44.91 
 
 		 158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4529  RNA methyltransferase  46.11 
 
 		 154 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0132  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  47.31 
 
 		 154 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0211  RNA methyltransferase  46.71 
 
 		 154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000450191  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3736  RNA methyltransferase  46.11 
 
 		 154 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.607715 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3807  RNA methyltransferase  46.11 
 
 		 154 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.509614  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3934  RNA methyltransferase  46.11 
 
 		 154 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000097835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0265  RNA methyltransferase  45.78 
 
 		 154 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.13438  normal  0.0255655 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1700  RNA methyltransferase  44.58 
 
 		 152 aa  146  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.295449  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0213  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  46.71 
 
 		 154 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.653568  normal  0.505987 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3910  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  46.2 
 
 		 158 aa  145  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4126  RNA methyltransferase  46.11 
 
 		 154 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00837599  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3943  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  43.71 
 
 		 157 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4034  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  43.71 
 
 		 157 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0264  RNA methyltransferase  45.51 
 
 		 154 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114775 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>