More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3854 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3854  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  100 
 
 		 157 aa  327  5.0000000000000004e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4038  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  90.91 
 
 		 154 aa  288  2e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0124  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  86.18 
 
 		 154 aa  277  4e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0132  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  86.18 
 
 		 154 aa  276  9e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3440  RNA methyltransferase TrmH, group 2  74.03 
 
 		 158 aa  233  7e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0307  RNA methyltransferase  73.03 
 
 		 154 aa  226  6e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0265  RNA methyltransferase  70.39 
 
 		 154 aa  223  9e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.13438  normal  0.0255655 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0264  RNA methyltransferase  70.39 
 
 		 154 aa  222  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114775 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4529  RNA methyltransferase  70.39 
 
 		 154 aa  217  3.9999999999999997e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3498  RNA methyltransferase  70.39 
 
 		 154 aa  218  3.9999999999999997e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.584508  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0213  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  70.39 
 
 		 154 aa  217  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.653568  normal  0.505987 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4247  RNA methyltransferase  71.05 
 
 		 154 aa  217  5e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0108586  hitchhiker  0.00213899 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4126  RNA methyltransferase  70.39 
 
 		 154 aa  216  7.999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00837599  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3736  RNA methyltransferase  70.39 
 
 		 154 aa  215  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.607715 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3934  RNA methyltransferase  70.39 
 
 		 154 aa  215  2e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000097835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3946  RNA methyltransferase  68.42 
 
 		 153 aa  215  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0211  RNA methyltransferase  69.74 
 
 		 154 aa  214  4e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000450191  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3807  RNA methyltransferase  69.74 
 
 		 154 aa  214  5e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.509614  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4242  RNA methyltransferase  62.91 
 
 		 154 aa  209  7.999999999999999e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.175929 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3163  RNA methyltransferase  63.16 
 
 		 154 aa  207  4e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3577  RNA methyltransferase  72.37 
 
 		 154 aa  206  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00152  RNA methyltransferase  64.97 
 
 		 159 aa  204  5e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2267  rRNA methylase  63.29 
 
 		 158 aa  202  2e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00105703  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67710  putative rRNA methylase  62.25 
 
 		 153 aa  202  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000281538  normal  0.793348 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002216  tRNA (cytosine34-2'-O-)-methyltransferase  64.33 
 
 		 159 aa  201  4e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2799  hypothetical tRNA/rRNA methyltransferase  67.52 
 
 		 159 aa  201  5e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.100203  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3484  RNA methyltransferase TrmH, group 2  72.37 
 
 		 153 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5861  putative rRNA methylase  60.93 
 
 		 153 aa  198  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0279492  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5103  RNA methyltransferase  58.55 
 
 		 153 aa  196  7e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4925  RNA methyltransferase  57.89 
 
 		 153 aa  196  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.61078  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5052  RNA methyltransferase  57.89 
 
 		 157 aa  196  9e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0599206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4881  RNA methyltransferase TrmH, group 2  57.62 
 
 		 151 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2407  RNA methyltransferase CspR  59.87 
 
 		 154 aa  196  1.0000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5323  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  57.62 
 
 		 151 aa  194  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0413  RNA methyltransferase  57.89 
 
 		 153 aa  194  6e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.85413 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4396  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  59.48 
 
 		 153 aa  193  8.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04710  RNA methyltransferase TrmH, group 2  58.28 
 
 		 153 aa  192  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.187102  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2823  RNA methyltransferase TrmH, group 2  55.56 
 
 		 161 aa  191  3e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00419688  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1538  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  57.89 
 
 		 170 aa  191  4e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3280  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  57.14 
 
 		 157 aa  190  7e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2539  RNA methyltransferase  57.89 
 
 		 159 aa  189  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.438382  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0358  putative tRNA/rRNA methyltransferase protein  57.79 
 
 		 156 aa  188  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0648772 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0337  RNA methyltransferase TrmH, group 2  56.67 
 
 		 151 aa  187  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2182  RNA methyltransferase TrmH, group 2  57.89 
 
 		 154 aa  187  4e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00014694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3301  RNA methyltransferase  58.55 
 
 		 154 aa  187  5.999999999999999e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0858286 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00538  putative tRNA/rRNA methyltransferase  56.49 
 
 		 154 aa  187  5.999999999999999e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0233  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  57.14 
 
 		 156 aa  186  8e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0188294 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0214  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  57.14 
 
 		 156 aa  186  9e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.163476 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0990  RNA methyltransferase  56.58 
 
 		 154 aa  185  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.411714  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0163  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  53.64 
 
 		 159 aa  185  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3912  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  56.58 
 
 		 157 aa  185  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0052  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  55.92 
 
 		 154 aa  184  3e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4081  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  55.92 
 
 		 157 aa  185  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2864  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  55.92 
 
 		 162 aa  185  3e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1670  RNA methyltransferase  57.24 
 
 		 165 aa  184  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4019  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  55.92 
 
 		 157 aa  185  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.921331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0552  RNA methyltransferase  54.97 
 
 		 157 aa  184  4e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.242542  normal  0.84663 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3541  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  55.92 
 
 		 189 aa  184  6e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.675577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3896  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  55.92 
 
 		 157 aa  184  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.282741 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3974  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  55.92 
 
 		 157 aa  184  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.818121 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1677  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  56.41 
 
 		 161 aa  183  7e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.451539  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3202  RNA methyltransferase TrmH, group 2  57.24 
 
 		 164 aa  183  7e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3910  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  56.21 
 
 		 158 aa  183  9e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0874  RNA methyltransferase  56.49 
 
 		 159 aa  182  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.812063  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0099  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  56.58 
 
 		 157 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4034  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  56.58 
 
 		 157 aa  181  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3943  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  56.58 
 
 		 157 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0310  RNA methyltransferase TrmH, group 2  53.25 
 
 		 156 aa  181  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4812  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  54.61 
 
 		 157 aa  181  3e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.799981  hitchhiker  0.00015333 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0129  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  55.26 
 
 		 157 aa  181  3e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.253397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2343  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  57.24 
 
 		 159 aa  181  4.0000000000000006e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.2665  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3185  putative tRNA/rRNA methyltransferase protein  57.79 
 
 		 161 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.251629 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03464  predicted rRNA methylase  55.92 
 
 		 157 aa  180  7e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03415  hypothetical protein  55.92 
 
 		 157 aa  180  7e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1700  RNA methyltransferase  57.24 
 
 		 152 aa  180  7e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.295449  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0102  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  55.92 
 
 		 157 aa  180  7e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3818  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  55.92 
 
 		 157 aa  180  7e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1000  tRNA/rRNA methylase  52 
 
 		 155 aa  179  1e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0879  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  52 
 
 		 155 aa  179  1e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4135  RNA methyltransferase  54.14 
 
 		 162 aa  179  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.438164  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4110  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  55.92 
 
 		 157 aa  179  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1241  RNA methyltransferase TrmH, group 2  55.19 
 
 		 183 aa  178  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0081  RNA methyltransferase  54.14 
 
 		 162 aa  179  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0075  RNA methyltransferase  54.14 
 
 		 162 aa  179  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4979  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  55.92 
 
 		 157 aa  179  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4386  RNA methyltransferase  55.33 
 
 		 154 aa  177  2.9999999999999997e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03960  hypothetical tRNA/rRNA methyltransferase YibK  53.29 
 
 		 158 aa  178  2.9999999999999997e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0467  23S rRNA methyltransferase  56.58 
 
 		 152 aa  177  4e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1943  RNA methyltransferase  54.49 
 
 		 156 aa  177  4e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0616  RNA methyltransferase TrmH, group 2  55.26 
 
 		 154 aa  177  4.999999999999999e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0437  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  54.9 
 
 		 168 aa  176  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.463566 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0503  RNA methyltransferase  53.55 
 
 		 179 aa  175  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0257  RNA methyltransferase TrmH, group 2  52.6 
 
 		 156 aa  175  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2563  hypothetical protein  54.97 
 
 		 149 aa  174  3e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0485  RNA methyltransferase  53.55 
 
 		 179 aa  175  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0540  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  53.9 
 
 		 156 aa  174  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.699614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1648  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  54.55 
 
 		 156 aa  173  7e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.158148  normal  0.993753 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2845  RNA methyltransferase  53.25 
 
 		 156 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1418  RNA methyltransferase  53.25 
 
 		 156 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0174  RNA methyltransferase  53.25 
 
 		 156 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>