More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_14671 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_14671  SpoU family tRNA/rRNA methyltransferase  100 
 
 
166 aa  339  1e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.120716 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1327  SpoU family tRNA/rRNA methyltransferase  70.99 
 
 
163 aa  236  1e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0858796 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1147  SpoU family tRNA/rRNA methyltransferase  67.47 
 
 
166 aa  231  4.0000000000000004e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.303231  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09021  SpoU family tRNA/rRNA methyltransferase  60.67 
 
 
162 aa  189  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.149348  decreased coverage  0.000000259965 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0939  SpoU family tRNA/rRNA methyltransferase  53.85 
 
 
160 aa  172  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.113139  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10001  SpoU family tRNA/rRNA methyltransferase  51.59 
 
 
160 aa  169  1e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.437921  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09981  SpoU family tRNA/rRNA methyltransferase  51.59 
 
 
160 aa  169  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.582415  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0346  SpoU family tRNA/rRNA methyltransferase  49.03 
 
 
166 aa  163  9e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.519168  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10191  SpoU family tRNA/rRNA methyltransferase  49.03 
 
 
166 aa  163  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.349898  hitchhiker  0.000072924 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09431  SpoU family tRNA/rRNA methyltransferase  50.96 
 
 
160 aa  155  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1874  RNA methyltransferase TrmH, group 2  53.9 
 
 
156 aa  151  4e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2268  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  50.63 
 
 
152 aa  147  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00048141  hitchhiker  0.0001006 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2205  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  50.63 
 
 
152 aa  147  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1836  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  51.92 
 
 
152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.646648  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0238  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  48.39 
 
 
153 aa  143  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.460006  normal  0.0379576 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2090  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  50 
 
 
153 aa  143  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000512947 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0450  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  46.45 
 
 
152 aa  142  3e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0834  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  47.74 
 
 
152 aa  136  1e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0618819 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3194  RNA methyltransferase TrmH, group 2  48.39 
 
 
153 aa  135  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00355106  hitchhiker  0.0000259155 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4609  TrmA family RNA methyltransferase  46.45 
 
 
153 aa  135  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00112922  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1004  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  47.33 
 
 
188 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1528  RNA methyltransferase  45.33 
 
 
152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130723  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33322  predicted protein  48.15 
 
 
183 aa  130  7.999999999999999e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1700  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  46.25 
 
 
157 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000455125  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3322  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  42.86 
 
 
158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000129205  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0924  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  42.86 
 
 
158 aa  124  6e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.73808e-35 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0026  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  46.45 
 
 
160 aa  124  6e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0505  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  45.57 
 
 
157 aa  124  7e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2885  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  43.87 
 
 
158 aa  124  8.000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.938343  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3498  RNA methyltransferase  45.51 
 
 
154 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.584508  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0580  RNA methyltransferase  42.86 
 
 
169 aa  123  9e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4247  RNA methyltransferase  44.87 
 
 
154 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0108586  hitchhiker  0.00213899 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0211  RNA methyltransferase  45.45 
 
 
154 aa  121  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000450191  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3440  RNA methyltransferase TrmH, group 2  45 
 
 
158 aa  122  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0213  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  45.45 
 
 
154 aa  121  4e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.653568  normal  0.505987 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1687  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  46.2 
 
 
164 aa  121  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2141  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  46.3 
 
 
160 aa  121  5e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4126  RNA methyltransferase  44.81 
 
 
154 aa  120  8e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00837599  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3736  RNA methyltransferase  44.23 
 
 
154 aa  120  8e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.607715 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3934  RNA methyltransferase  44.23 
 
 
154 aa  120  8e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000097835  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3807  RNA methyltransferase  44.23 
 
 
154 aa  120  9e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.509614  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4529  RNA methyltransferase  43.59 
 
 
154 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1370  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  44.94 
 
 
157 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3293  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  44.03 
 
 
160 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.212145  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0307  RNA methyltransferase  44.23 
 
 
154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2088  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  42.59 
 
 
154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.227987  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0132  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  44.94 
 
 
154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0124  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  44.94 
 
 
154 aa  119  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0658  rRNA methylase (SpoU class)  43.59 
 
 
170 aa  117  6e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000212975  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1197  RNA methyltransferase  43.31 
 
 
164 aa  117  7e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.188758  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2133  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  43.67 
 
 
154 aa  117  7e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2379  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  42.5 
 
 
158 aa  117  7e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00313017  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2332  RNA methyltransferase  43.51 
 
 
152 aa  117  7e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1268  rRNA methylase (SpoU class)  41.03 
 
 
169 aa  117  7.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000665769  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3163  RNA methyltransferase  43.67 
 
 
154 aa  116  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0264  RNA methyltransferase  43.04 
 
 
154 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000114775 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0233  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  43.31 
 
 
156 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0188294 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0265  RNA methyltransferase  41.03 
 
 
154 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.13438  normal  0.0255655 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0138  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  41.94 
 
 
153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0147773  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0194  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  41.14 
 
 
156 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.141115  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1943  RNA methyltransferase  41.29 
 
 
156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.158878  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1909  RNA methyltransferase  41.29 
 
 
156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0507641  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00152  RNA methyltransferase  43.67 
 
 
159 aa  116  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3946  RNA methyltransferase  44.23 
 
 
153 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1346  rRNA methylase (SpoU class)  41.14 
 
 
209 aa  115  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1620  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  43.23 
 
 
180 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.236894  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2563  hypothetical protein  41.67 
 
 
149 aa  115  3e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4242  RNA methyltransferase  43.04 
 
 
154 aa  115  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.175929 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2343  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  42.76 
 
 
159 aa  114  3.9999999999999997e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.2665  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1880  RNA methyltransferase TrmH, group 2  44.23 
 
 
155 aa  114  5e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000892134  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002216  tRNA (cytosine34-2'-O-)-methyltransferase  43.04 
 
 
159 aa  114  5e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1546  RNA methyltransferase  42.58 
 
 
159 aa  114  7.999999999999999e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1495  RNA methyltransferase  42.58 
 
 
159 aa  114  7.999999999999999e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1391  RNA methyltransferase  38.46 
 
 
156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.444743  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0214  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  42.68 
 
 
156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.163476 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0241  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  44.94 
 
 
171 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1670  RNA methyltransferase  40.26 
 
 
165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1700  RNA methyltransferase  38.46 
 
 
152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.295449  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0417  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  44.94 
 
 
171 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.897811  hitchhiker  0.000103614 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0467  23S rRNA methyltransferase  38.46 
 
 
152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1518  RNA methyltransferase  35.26 
 
 
153 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0462  RNA methyltransferase  40.76 
 
 
162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0602  RNA methyltransferase  40.76 
 
 
162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.863015  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4386  RNA methyltransferase  41.03 
 
 
154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0516  RNA methyltransferase  40.76 
 
 
162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0459  RNA methyltransferase  40.76 
 
 
162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.172229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0455  RNA methyltransferase  40.76 
 
 
162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2417  hypothetical protein  41.03 
 
 
149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0623  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  40.76 
 
 
162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0547  RNA methyltransferase  40.76 
 
 
162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0694927  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0584  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  40.76 
 
 
162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4754  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  40.76 
 
 
162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0101258  hitchhiker  0.00000000000898658 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0470  RNA methyltransferase  41.4 
 
 
162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0313  rRNA methyltransferase, TrmH family  39.13 
 
 
169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000102446  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0548  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  40.76 
 
 
162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.67047e-31 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04710  RNA methyltransferase TrmH, group 2  42.41 
 
 
153 aa  111  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.187102  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2823  RNA methyltransferase TrmH, group 2  44.3 
 
 
161 aa  112  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00419688  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11010  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  38.22 
 
 
162 aa  111  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0271045  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2721  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  39.74 
 
 
160 aa  111  4.0000000000000004e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.647154 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4979  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  42.68 
 
 
157 aa  111  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>