276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_01575 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_01575  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  322  2e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3896  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  70.27 
 
 
152 aa  235  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_88222  predicted protein  46.1 
 
 
311 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0289002 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3372  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  38.57 
 
 
203 aa  115  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212963  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0026  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.55 
 
 
178 aa  100  6e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3418  hypothetical protein  32.37 
 
 
177 aa  90.1  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0544122 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1642  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.03 
 
 
177 aa  86.7  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00428557  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2584  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.34 
 
 
174 aa  84.7  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3075  RNA methyltransferase  31.21 
 
 
203 aa  84.7  5e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3916  hypothetical protein  33.57 
 
 
165 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.919251  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1420  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.5 
 
 
202 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0134713  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1485  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.5 
 
 
202 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0129545  normal  0.548122 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1473  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.5 
 
 
202 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.137824  normal  0.253583 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1287  putative RNA methyltransferase  31.94 
 
 
152 aa  80.5  0.000000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000276682  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1569  hypothetical protein  32.86 
 
 
166 aa  80.5  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.702393  hitchhiker  0.00445287 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0567  putative rRNA methylase  32.87 
 
 
170 aa  79  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.96226  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0754  rRNA methylase (SpoU_methylase)  29.93 
 
 
171 aa  78.2  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1395  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.58 
 
 
178 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.502759  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4113  RNA methyltransferase  29.87 
 
 
194 aa  76.6  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1304  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.78 
 
 
156 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2233  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  29.79 
 
 
198 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.237391  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2330  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  28.87 
 
 
162 aa  75.9  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18358  hitchhiker  0.00000314878 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4585  RNA methyltransferase  32.85 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4108  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.06 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07014  23S rRNA methyltransferase  31.39 
 
 
175 aa  73.6  0.0000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1568  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  26.57 
 
 
176 aa  73.6  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000175269 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3116  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  29.58 
 
 
164 aa  72  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01885  putative cold-shock RNA methyltransferase  29.5 
 
 
182 aa  72.4  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1541  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  28.87 
 
 
200 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.145291  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2842  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  27.46 
 
 
254 aa  70.9  0.000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.002241  decreased coverage  0.0000781436 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1611  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  27.46 
 
 
249 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050624  normal  0.825884 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2765  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  27.46 
 
 
241 aa  70.5  0.000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000737812  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2748  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  27.46 
 
 
254 aa  70.5  0.000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.20465  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2447  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  27.46 
 
 
257 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000932167  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2663  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  28.87 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.299064  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2719  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  27.34 
 
 
175 aa  69.3  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.159423 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3013  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  28.17 
 
 
177 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0108117  normal  0.339909 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2412  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  29.58 
 
 
174 aa  67.8  0.00000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0294882  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4608  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.11 
 
 
172 aa  64.3  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.443527 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4394  RNA methyltransferase  32.84 
 
 
248 aa  61.6  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.528228  normal  0.180351 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3458  RNA methyltransferase  32.84 
 
 
252 aa  61.2  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2692  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  30 
 
 
252 aa  60.5  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.107399  normal  0.310165 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4172  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  29.46 
 
 
212 aa  57.8  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.541165  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3894  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.58 
 
 
133 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4069  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  27.21 
 
 
229 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.351215  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4023  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  27.21 
 
 
229 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.608794  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4130  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  27.21 
 
 
229 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3960  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  27.21 
 
 
229 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3951  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  27.21 
 
 
229 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.339816  normal  0.0254174 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3986  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  26.47 
 
 
229 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3469  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU) family protein  26.43 
 
 
161 aa  55.5  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.029361 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2520  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.81 
 
 
173 aa  55.1  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38470  rRNA methylase  28.78 
 
 
238 aa  54.7  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2288  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.25 
 
 
180 aa  54.3  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000472239  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4102  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  25.74 
 
 
229 aa  54.3  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03508  tRNA (Guanosine-2'-O-)-methyltransferase  25.74 
 
 
229 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0054  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  25.74 
 
 
229 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03460  hypothetical protein  25.74 
 
 
229 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0060  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  25.74 
 
 
229 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000232977 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4154  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  25.74 
 
 
229 aa  54.3  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3862  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  25.74 
 
 
229 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5023  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  25.74 
 
 
229 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0504  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  28.87 
 
 
232 aa  53.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3561  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  32.03 
 
 
168 aa  53.5  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1374  RNA methyltransferase  30 
 
 
274 aa  52.4  0.000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0715  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  27.46 
 
 
205 aa  52  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0678  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  27.46 
 
 
207 aa  51.6  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.435122  normal  0.171519 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4585  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  25.74 
 
 
231 aa  51.6  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0102229  unclonable  0.0000000288798 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4212  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  26.47 
 
 
230 aa  51.6  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3773  RNA methyltransferase  29.1 
 
 
246 aa  51.6  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0099  RNA methyltransferase, TrmH family  29.33 
 
 
268 aa  51.2  0.000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.167605 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2518  RNA methyltransferase  30.34 
 
 
247 aa  50.8  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00110794  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35250  rRNA methylase  30.83 
 
 
237 aa  50.8  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.925094 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4616  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  33.11 
 
 
251 aa  50.8  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1061  23S rRNA Gm2251 methyltransferase  32.89 
 
 
270 aa  50.8  0.000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0953  RNA methyltransferase  32.89 
 
 
270 aa  50.8  0.000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5159  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  26.62 
 
 
224 aa  50.4  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0088  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  25 
 
 
229 aa  50.4  0.000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1614  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  25.37 
 
 
272 aa  50.4  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.329704  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1799  RNA methyltransferase  29.66 
 
 
247 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.335408  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1262  RNA methyltransferase  29.66 
 
 
247 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1971  RNA methyltransferase  29.66 
 
 
260 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1817  RNA methyltransferase  29.66 
 
 
247 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.135393  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02030  rRNA methylase  26.76 
 
 
234 aa  49.7  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4068  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  28.77 
 
 
225 aa  50.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.640405  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0242  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  24.44 
 
 
215 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4495  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  26.47 
 
 
230 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1020  RNA methyltransferase  29.66 
 
 
247 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0199854  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1746  RNA methyltransferase  29.66 
 
 
247 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.248108  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0146  RNA methyltransferase  29.66 
 
 
247 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.277376  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3951  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  23.91 
 
 
230 aa  49.3  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.545722  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3982  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  28.17 
 
 
213 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.549052  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0733  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  26.76 
 
 
207 aa  49.3  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.329217 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2091  RNA methyltransferase TrmH, group 3  28.77 
 
 
247 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.254713  normal  0.346719 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0146  RNA methylase  28.78 
 
 
176 aa  48.9  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0817  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  24.83 
 
 
219 aa  48.5  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00157  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  24.14 
 
 
235 aa  48.5  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1721  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  25.56 
 
 
178 aa  48.5  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0657  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  29.55 
 
 
229 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0418  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  28.99 
 
 
223 aa  48.9  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>