More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1721 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1721  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  100 
 
 
178 aa  363  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0006  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  66.67 
 
 
180 aa  245  2e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.124143  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05145  putative SpoU rRNA methylase family protein  60.92 
 
 
178 aa  231  3e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0146  RNA methylase  56.57 
 
 
176 aa  221  3e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2133  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  56.9 
 
 
176 aa  214  7e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.482713  normal  0.100378 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0766  hypothetical protein  56.47 
 
 
177 aa  209  1e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4797  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  53.18 
 
 
178 aa  204  5e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00908011 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0514  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  55.23 
 
 
176 aa  200  7e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1901  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  51.5 
 
 
175 aa  200  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1157  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  49.14 
 
 
180 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1170  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  45.93 
 
 
179 aa  157  1e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000601734  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1290  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  41.28 
 
 
200 aa  152  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1381  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  41.28 
 
 
181 aa  152  2e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1087  SpoU rRNA methylase family protein  43.58 
 
 
184 aa  151  5.9999999999999996e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1097  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  40.7 
 
 
180 aa  150  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.734552  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1411  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  45.45 
 
 
180 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000159184  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1205  SpoU rRNA methylase family protein  40.7 
 
 
182 aa  140  9.999999999999999e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000205197  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1912  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  41.56 
 
 
161 aa  127  9.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.518038  normal  0.581509 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0491  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.18 
 
 
180 aa  95.9  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5505  putative tRNA/rRNA methyltransferase  32.53 
 
 
186 aa  90.9  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121467  normal  0.0712484 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0843  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.6 
 
 
280 aa  87.4  9e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.105002 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1822  rRNA methylase  32.2 
 
 
249 aa  86.7  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1616  RNA methyltransferase TrmH, group 3  29.22 
 
 
248 aa  84  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.439996 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1180  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.77 
 
 
282 aa  82  0.000000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.452059  decreased coverage  0.000681553 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13158  SpoU rRNA methylase family protein  31.21 
 
 
171 aa  81.6  0.000000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.153077  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0572  RNA methyltransferase  28.21 
 
 
252 aa  81.6  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2060  RNA methyltransferase  30.72 
 
 
277 aa  80.5  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2387  RNA methyltransferase  31.29 
 
 
245 aa  80.5  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0050  RNA methyltransferase  32.9 
 
 
262 aa  79.3  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0340  rRNA methylase  31.45 
 
 
251 aa  80.1  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000065422  hitchhiker  0.000000457527 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0784  RNA methyltransferase  31.82 
 
 
180 aa  78.6  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.632748  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4596  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.55 
 
 
165 aa  78.2  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.362437  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1489  RNA methyltransferase TrmH, group 3  26.19 
 
 
244 aa  78.2  0.00000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1952  RNA methyltransferase TrmH, group 3  32.47 
 
 
249 aa  77.8  0.00000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.192132  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1625  RNA methyltransferase TrmH, group 3  30.18 
 
 
251 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.117052  hitchhiker  0.00235214 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2255  RNA methyltransferase  27.85 
 
 
261 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0110995  normal  0.147851 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2239  tRNA/rRNA metyltransferase  29.11 
 
 
261 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.695793  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3320  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  30 
 
 
315 aa  76.3  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000334493  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0848  RNA methyltransferase  32.03 
 
 
247 aa  76.6  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000264025  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0416  RNA methyltransferase  27.85 
 
 
246 aa  76.6  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.896719  normal  0.93402 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0597  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  32.17 
 
 
250 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00512531  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1817  putative tRNA/rRNA methyltransferase protein  28.66 
 
 
247 aa  75.9  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.392601  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2232  RNA methyltransferase TrmH, group 3  27.75 
 
 
256 aa  75.1  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0914  RNA methyltransferase  28.48 
 
 
261 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.106416 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0147  RNA methyltransferase  30.36 
 
 
261 aa  75.1  0.0000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0305  RNA methyltransferase  29.75 
 
 
249 aa  75.1  0.0000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127836  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0953  RNA methyltransferase  28.57 
 
 
270 aa  74.7  0.0000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1061  23S rRNA Gm2251 methyltransferase  28.57 
 
 
270 aa  74.7  0.0000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1425  rRNA methylase  31.79 
 
 
233 aa  74.7  0.0000000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022514  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3136  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  25.61 
 
 
276 aa  74.7  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1165  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  28.29 
 
 
250 aa  74.3  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0693312  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1975  RNA methyltransferase  26.29 
 
 
250 aa  73.6  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.602495  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4032  RNA methyltransferase  28.67 
 
 
263 aa  73.9  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.104893  normal  0.17996 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1799  tRNA/rRNA methyltransferase SpoU  29.8 
 
 
184 aa  73.6  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.823319  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00157  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  27.67 
 
 
235 aa  73.9  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1606  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  28.95 
 
 
248 aa  73.9  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07630  RNA methyltransferase TrmH, group 3  26.22 
 
 
247 aa  73.6  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1073  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  28.29 
 
 
250 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.5513  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1890  RNA methyltransferase  28.48 
 
 
253 aa  73.9  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.575059 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2268  RNA methyltransferase  28.95 
 
 
248 aa  73.9  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.144304  normal  0.908224 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1336  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  29.81 
 
 
249 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000822091 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0092  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  29.27 
 
 
245 aa  72.8  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607271  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2176  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  27.38 
 
 
247 aa  73.2  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000213076  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1443  RNA methyltransferase  29.94 
 
 
258 aa  72.8  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1229  putative tRNA/rRNA methyltransferase protein  28.48 
 
 
249 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00902362  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4616  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  29.49 
 
 
251 aa  73.2  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2254  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  26.44 
 
 
279 aa  72.8  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3524  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.58 
 
 
247 aa  73.6  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1484  tRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  31.47 
 
 
196 aa  72.8  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000054837  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2375  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  27.11 
 
 
186 aa  72.8  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00412579  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0575  RNA methyltransferase  29.14 
 
 
248 aa  73.2  0.000000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.221662  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1003  RNA methyltransferase TrmH, group 3  30.06 
 
 
261 aa  73.2  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60779  normal  0.0289199 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2172  RNA methyltransferase TrmH, group 3  27.44 
 
 
237 aa  73.2  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0146478  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0351  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  28.22 
 
 
250 aa  73.2  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2208  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  28 
 
 
248 aa  73.2  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.531626  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1408  RNA methyltransferase  24.68 
 
 
255 aa  72.8  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0243869  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0209  RNA methyltransferase  31.45 
 
 
251 aa  72.4  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12700  rRNA methylase, putative, group 3  30.61 
 
 
320 aa  72.4  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0554  RNA methyltransferase  29.49 
 
 
248 aa  72.4  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.850775  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2352  putative tRNA/rRNA methyltransferase YacO  27.53 
 
 
248 aa  72.8  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.177652  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0568  RNA methyltransferase  29.49 
 
 
248 aa  72.4  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.927994  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3018  RNA methyltransferase  28 
 
 
250 aa  72.8  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.231678 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3414  RNA methyltransferase  28 
 
 
248 aa  72.4  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.377337  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0439  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  28.49 
 
 
243 aa  72.4  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000546108 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0172  RNA methyltransferase  28.21 
 
 
249 aa  72  0.000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0806813  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0609  RNA methyltransferase TrmH  30 
 
 
254 aa  72  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0802048 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1222  RNA methyltransferase  25.49 
 
 
267 aa  72  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0117794  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2126  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  24.71 
 
 
269 aa  72  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0768131  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4711  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  26.19 
 
 
243 aa  72.4  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0696  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  30 
 
 
248 aa  71.6  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3029  RNA methyltransferase TrmH, group 3  28 
 
 
264 aa  71.6  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.068461  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2420  RNA methyltransferase  28.07 
 
 
289 aa  72  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00228978  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0929  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  28.77 
 
 
216 aa  71.6  0.000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3813  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  26.19 
 
 
243 aa  71.2  0.000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4424  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  26.19 
 
 
243 aa  71.2  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4740  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  26.19 
 
 
243 aa  71.2  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.504113  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5696  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  26.19 
 
 
243 aa  71.2  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4651  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  26.19 
 
 
243 aa  71.2  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.326823 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04009  hypothetical protein  26.19 
 
 
243 aa  71.2  0.000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1677  RNA methyltransferase  28.82 
 
 
251 aa  71.2  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>