More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_4740 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_04047  23S rRNA (Gm2251)-methyltransferase  100 
 
 
243 aa  498  1e-140  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3813  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  100 
 
 
243 aa  498  1e-140  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4424  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  100 
 
 
243 aa  498  1e-140  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4740  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  100 
 
 
243 aa  498  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.504113  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4651  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  100 
 
 
243 aa  498  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.326823 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5696  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  100 
 
 
243 aa  498  1e-140  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3833  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  100 
 
 
243 aa  498  1e-140  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000869352 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04009  hypothetical protein  100 
 
 
243 aa  498  1e-140  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4711  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  98.77 
 
 
243 aa  492  9.999999999999999e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4766  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  97.12 
 
 
243 aa  484  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4787  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  97.53 
 
 
243 aa  485  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.535347 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4637  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  97.53 
 
 
243 aa  485  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4730  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  97.53 
 
 
243 aa  485  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.653349  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4647  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  97.12 
 
 
243 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0363  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  94.24 
 
 
244 aa  476  1e-133  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0040389 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0768  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  85.19 
 
 
244 aa  432  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.311518  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0789  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  85.12 
 
 
244 aa  433  1e-120  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0439  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  84.36 
 
 
243 aa  431  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000546108 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3444  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  82.3 
 
 
243 aa  424  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.882432  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0690  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  81.82 
 
 
246 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3790  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  81.82 
 
 
246 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3644  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  81.82 
 
 
246 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3601  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  80.25 
 
 
243 aa  416  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2176  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  71.78 
 
 
247 aa  363  1e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000213076  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0152  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  71.19 
 
 
245 aa  356  1.9999999999999998e-97  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002269  23S rRNA (guanosine-2'-O-) -methyltransferase RlmB  71.78 
 
 
248 aa  351  5e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2767  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  67.77 
 
 
247 aa  347  1e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00084  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  70.54 
 
 
247 aa  345  3e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4616  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  64.9 
 
 
251 aa  345  4e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3418  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  68.18 
 
 
246 aa  342  2.9999999999999997e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.125093  normal  0.287966 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3263  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  66.67 
 
 
246 aa  333  1e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000357773  hitchhiker  0.0000120778 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3934  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  66.25 
 
 
246 aa  332  2e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0684  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  66.25 
 
 
246 aa  332  2e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000107401  hitchhiker  0.000276778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0698  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  66.25 
 
 
246 aa  331  5e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000126768  hitchhiker  0.000148247 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3589  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  64.17 
 
 
246 aa  330  2e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0124331  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0729  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  65.42 
 
 
246 aa  330  2e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00179168  hitchhiker  0.0000000825848 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0995  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  61.83 
 
 
246 aa  329  3e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3066  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  65.13 
 
 
240 aa  328  4e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0466903  normal  0.239328 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0738  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  65.42 
 
 
246 aa  328  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000750261  hitchhiker  0.000830683 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0708  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  65.42 
 
 
246 aa  328  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.106779  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3646  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  65.42 
 
 
246 aa  328  7e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0005449  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0512  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  64.17 
 
 
246 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.801962  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0750  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  65 
 
 
246 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.050001  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3354  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  63.75 
 
 
246 aa  322  3e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0824924  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03462  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  61.25 
 
 
246 aa  321  5e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4216  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  62.08 
 
 
245 aa  315  3e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000341805 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0753  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  61.25 
 
 
246 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0205206  hitchhiker  0.000134961 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3288  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  63.33 
 
 
246 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.679975  hitchhiker  0.00104761 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2387  RNA methyltransferase  61.83 
 
 
245 aa  313  1.9999999999999998e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0575  RNA methyltransferase  62.04 
 
 
248 aa  301  6.000000000000001e-81  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.221662  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0644  RNA methyltransferase  60.17 
 
 
250 aa  298  6e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000634261 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65190  TrmH family RNA methyltransferase , group 3  59.92 
 
 
248 aa  291  7e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5663  putative rRNA methylase  59.5 
 
 
248 aa  290  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1055  tyrosyl-tRNA synthetase, class Ib  54.77 
 
 
248 aa  287  1e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.932424 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1408  RNA methyltransferase  57.32 
 
 
255 aa  285  7e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0243869  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07630  RNA methyltransferase TrmH, group 3  58.26 
 
 
247 aa  284  8e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4934  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  58.26 
 
 
250 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0580  RNA methyltransferase TrmH, group 3  58.26 
 
 
251 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.912866  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4935  RNA methyltransferase  58.09 
 
 
248 aa  280  1e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000134443 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4879  RNA methyltransferase  57.68 
 
 
248 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4759  RNA methyltransferase  57.68 
 
 
248 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0810768 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0533  RNA methyltransferase TrmH, group 3  58.09 
 
 
255 aa  279  3e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0666066 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4669  RNA methyltransferase  56.85 
 
 
248 aa  278  5e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0289755 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0906  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  55.69 
 
 
248 aa  277  9e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0887  RNA methyltransferase TrmH, group 3  57.79 
 
 
261 aa  268  5e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.986853  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2969  RNA methyltransferase TrmH, group 3  54.77 
 
 
243 aa  263  3e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0107  hypothetical protein  52.7 
 
 
249 aa  261  1e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0092  hypothetical protein  52.7 
 
 
249 aa  259  2e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1165  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  54.73 
 
 
250 aa  259  3e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0693312  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1067  RNA methyltransferase TrmH, group 3  55.19 
 
 
247 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1547  RNA methyltransferase  55.19 
 
 
247 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.844862  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1523  RNA methyltransferase  55.19 
 
 
247 aa  258  4e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.289763 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1073  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  54.73 
 
 
250 aa  258  6e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.5513  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1696  RNA methyltransferase  54.13 
 
 
247 aa  258  7e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1708  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  53.31 
 
 
247 aa  258  8e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.746509  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1229  putative tRNA/rRNA methyltransferase protein  54.73 
 
 
249 aa  257  1e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00902362  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4689  RNA methyltransferase TrmH, group 3  54.77 
 
 
247 aa  256  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196854  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2539  RNA methyltransferase TrmH, group 3  52.89 
 
 
247 aa  256  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0797344  normal  0.558378 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1685  RNA methyltransferase  55.19 
 
 
247 aa  256  3e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.282815 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3377  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  54.96 
 
 
251 aa  255  5e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2518  RNA methyltransferase  53.53 
 
 
247 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00110794  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1469  RNA methyltransferase  53.53 
 
 
247 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1448  RNA methyltransferase  53.53 
 
 
247 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2071  RNA methyltransferase TrmH, group 3  54.36 
 
 
256 aa  249  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2091  RNA methyltransferase TrmH, group 3  53.94 
 
 
247 aa  249  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.254713  normal  0.346719 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1020  RNA methyltransferase  52.7 
 
 
247 aa  249  4e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0199854  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1262  RNA methyltransferase  52.7 
 
 
247 aa  249  4e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1971  RNA methyltransferase  52.7 
 
 
260 aa  248  4e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1799  RNA methyltransferase  52.7 
 
 
247 aa  249  4e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.335408  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1625  RNA methyltransferase TrmH, group 3  55.37 
 
 
251 aa  248  4e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.117052  hitchhiker  0.00235214 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0146  RNA methyltransferase  52.7 
 
 
247 aa  249  4e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.277376  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1817  RNA methyltransferase  52.7 
 
 
247 aa  249  4e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.135393  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1746  RNA methyltransferase  52.7 
 
 
247 aa  249  4e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.248108  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2208  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  53.91 
 
 
248 aa  247  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.531626  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0416  RNA methyltransferase  52.92 
 
 
246 aa  247  2e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.896719  normal  0.93402 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4032  RNA methyltransferase  52.26 
 
 
263 aa  244  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.104893  normal  0.17996 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1061  23S rRNA Gm2251 methyltransferase  52.3 
 
 
270 aa  244  9.999999999999999e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0352  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  53.85 
 
 
268 aa  243  1.9999999999999999e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.426039  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0953  RNA methyltransferase  51.88 
 
 
270 aa  243  3e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0869  RNA methyltransferase  50.21 
 
 
249 aa  241  5e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>