More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_12053 on replicon NC_011675
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011675  PHATRDRAFT_12053  predicted protein  100 
 
 
169 aa  353  6.999999999999999e-97  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00023289  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28928  predicted protein  39.35 
 
 
207 aa  110  8.000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.145159  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3469  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU) family protein  34.44 
 
 
161 aa  82.4  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.029361 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1411  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  29.75 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000159184  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4394  RNA methyltransferase  33.76 
 
 
248 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.528228  normal  0.180351 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1381  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  28.48 
 
 
181 aa  63.5  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1097  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  29.61 
 
 
180 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.734552  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1170  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  26.99 
 
 
179 aa  63.2  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000601734  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0065  RNA methyltransferase TrmH, group 3  27.39 
 
 
256 aa  63.2  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000946676  normal  0.572135 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0848  RNA methyltransferase  26.8 
 
 
247 aa  60.1  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000264025  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0060  RNA methyltransferase  26.11 
 
 
256 aa  60.5  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.024169  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3458  RNA methyltransferase  30.86 
 
 
252 aa  60.5  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0147  RNA methyltransferase  27.81 
 
 
261 aa  59.3  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2692  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  29.37 
 
 
252 aa  59.3  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.107399  normal  0.310165 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2170  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  30.43 
 
 
202 aa  59.7  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.904611 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5505  putative tRNA/rRNA methyltransferase  25.97 
 
 
186 aa  59.7  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121467  normal  0.0712484 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1528  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.09 
 
 
220 aa  58.9  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.16942  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0733  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  27.56 
 
 
207 aa  58.9  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.329217 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2352  putative tRNA/rRNA methyltransferase YacO  26.11 
 
 
248 aa  58.9  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.177652  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0678  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  27.56 
 
 
207 aa  58.5  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.435122  normal  0.171519 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3914  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  25.52 
 
 
250 aa  58.2  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0187406  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0597  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  30.26 
 
 
250 aa  57.8  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00512531  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21660  rRNA methylase  27.63 
 
 
271 aa  57.4  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1614  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.32 
 
 
272 aa  57.4  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.329704  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5159  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  26.09 
 
 
224 aa  57.4  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1677  RNA methyltransferase  29.03 
 
 
251 aa  57.4  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4596  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.32 
 
 
165 aa  56.6  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.362437  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1799  tRNA/rRNA methyltransferase SpoU  29.5 
 
 
184 aa  56.6  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.823319  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7648  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  26.06 
 
 
292 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04211  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  29.59 
 
 
229 aa  56.6  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1484  tRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  30.3 
 
 
196 aa  55.8  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000054837  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0482  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  26.09 
 
 
214 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0416  RNA methyltransferase  28.03 
 
 
246 aa  55.8  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.896719  normal  0.93402 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0493  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  26.09 
 
 
214 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.490005 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02030  rRNA methylase  23.84 
 
 
234 aa  55.8  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0242  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  26.32 
 
 
215 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0974  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  25.48 
 
 
316 aa  55.1  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0793749  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11883  spoU protein (spoU)  26.71 
 
 
238 aa  55.1  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0174  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  26.62 
 
 
247 aa  54.7  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000034032  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0471  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  25.47 
 
 
214 aa  54.7  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1616  RNA methyltransferase TrmH, group 3  27.45 
 
 
248 aa  54.3  0.0000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.439996 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3982  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  25.64 
 
 
213 aa  54.7  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.549052  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5337  RNA methyltransferase  27.44 
 
 
314 aa  54.3  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2835  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.76 
 
 
277 aa  53.9  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1828  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  26.67 
 
 
264 aa  54.3  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13158  SpoU rRNA methylase family protein  28.19 
 
 
171 aa  53.5  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.153077  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0590  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  25.49 
 
 
247 aa  53.9  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0629521 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38470  rRNA methylase  24.84 
 
 
238 aa  53.5  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0504  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  24.68 
 
 
232 aa  53.1  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4310  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  26.06 
 
 
225 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1877  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  30.2 
 
 
269 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0232601 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1061  23S rRNA Gm2251 methyltransferase  25.45 
 
 
270 aa  53.1  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1035  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.75 
 
 
262 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2952  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  24.84 
 
 
327 aa  53.1  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.844398  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0953  RNA methyltransferase  25.45 
 
 
270 aa  53.1  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3859  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  22.67 
 
 
267 aa  53.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  0.0729978 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0663  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  26.09 
 
 
214 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.509405 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1157  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  28.39 
 
 
180 aa  53.1  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1899  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  28.57 
 
 
251 aa  53.1  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.342149  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1942  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  27.7 
 
 
221 aa  52.4  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0337713  normal  0.0831069 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1205  SpoU rRNA methylase family protein  27.45 
 
 
182 aa  52  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000205197  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4325  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  25.45 
 
 
239 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.282082 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5009  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  22.73 
 
 
220 aa  52  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_88222  predicted protein  22.39 
 
 
311 aa  52  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0289002 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2387  RNA methyltransferase  27.15 
 
 
245 aa  52  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4179  tRNA/rRNA methyltransferase, SpoU  26.67 
 
 
225 aa  51.6  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0240712  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0092  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  23.95 
 
 
245 aa  51.6  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607271  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10385  RNA methyltransferase  26.09 
 
 
220 aa  51.6  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.85641e-18  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4146  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  25.64 
 
 
310 aa  51.6  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0082  RNA methyltransferase  25 
 
 
276 aa  51.2  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2160  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  28.93 
 
 
256 aa  51.2  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2876  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  28.76 
 
 
201 aa  51.2  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2065  rRNA methylase  25.34 
 
 
242 aa  51.2  0.000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4332  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  26.06 
 
 
225 aa  51.2  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03770  rRNA methylase, putative, group 3  23.87 
 
 
323 aa  50.8  0.000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.1456 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0929  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  28.57 
 
 
216 aa  50.8  0.000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1263  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  27.67 
 
 
273 aa  50.8  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.143361  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0568  RNA methyltransferase  26.35 
 
 
248 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.927994  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1975  RNA methyltransferase  26.8 
 
 
250 aa  50.1  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.602495  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0657  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  22.07 
 
 
229 aa  50.4  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2449  tRNA/rRNA methyltransferase  24.26 
 
 
227 aa  50.4  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1254  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.4 
 
 
284 aa  50.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0554  RNA methyltransferase  26.35 
 
 
248 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.850775  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1447  RNA methyltransferase  25.79 
 
 
314 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.812422 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2126  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  29.53 
 
 
269 aa  50.4  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0768131  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0083  RNA methyltransferase  25.15 
 
 
250 aa  50.4  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2601  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  29.61 
 
 
267 aa  50.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.220558  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0906  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  29.61 
 
 
196 aa  50.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00000238079  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0784  RNA methyltransferase  30.46 
 
 
180 aa  49.7  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.632748  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1606  RNA methyltransferase  26.97 
 
 
247 aa  49.3  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0012787  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0107  hypothetical protein  25.47 
 
 
249 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0092  hypothetical protein  26.09 
 
 
249 aa  50.1  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1255  tRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  29.81 
 
 
219 aa  49.3  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.87838  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4068  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  27.33 
 
 
225 aa  50.1  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.640405  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0766  hypothetical protein  28.3 
 
 
177 aa  49.7  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2313  RNA methyltransferase  24.34 
 
 
288 aa  49.7  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0536  tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase  27.5 
 
 
220 aa  49.7  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.528971  normal  0.0365793 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0405  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  23.57 
 
 
254 aa  50.1  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0083776  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3388  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  28.75 
 
 
237 aa  49.7  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0573  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  31.15 
 
 
272 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.264618 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>