More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0082 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0082  RNA methyltransferase  100 
 
 
276 aa  537  9.999999999999999e-153  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2757  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  64.07 
 
 
321 aa  265  8.999999999999999e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.611419 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2721  RNA methyltransferase  49.29 
 
 
288 aa  219  3e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0334114  normal  0.254549 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2062  RNA methyltransferase TrmH, group 3  48.18 
 
 
283 aa  207  2e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0229052  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2703  RNA methyltransferase TrmH, group 3  47.22 
 
 
348 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.224688  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2508  RNA methyltransferase TrmH, group 3  47.33 
 
 
283 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5155  putative rRNA methylase  45.76 
 
 
280 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.512859  normal  0.0887365 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2203  RNA methyltransferase TrmH, group 3  48.29 
 
 
273 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.524372  normal  0.0758016 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3230  RNA methyltransferase TrmH, group 3  50.21 
 
 
273 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.736956  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3844  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  50.42 
 
 
275 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3641  RNA methyltransferase TrmH, group 3  49.21 
 
 
275 aa  192  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.179566  normal  0.181036 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1084  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  45.32 
 
 
276 aa  188  7e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.235223  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1939  RNA methyltransferase  46.4 
 
 
286 aa  187  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1216  RNA methyltransferase  46.85 
 
 
303 aa  186  4e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1254  RNA methyltransferase  46.85 
 
 
286 aa  186  5e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.159804  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3354  RNA methyltransferase  49.33 
 
 
288 aa  185  6e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.454426 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1810  tRNA/rRNA metyltransferase  46.43 
 
 
293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0968  RNA methyltransferase  43.66 
 
 
291 aa  176  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0219055 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1412  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  45.53 
 
 
296 aa  175  9e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.908439  normal  0.353351 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1314  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  45.68 
 
 
296 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173371  normal  0.338994 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0558  RNA methyltransferase  46.55 
 
 
276 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000162254  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1336  RNA methyltransferase  44.36 
 
 
293 aa  173  2.9999999999999996e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.875783 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2571  RNA methyltransferase  49.15 
 
 
263 aa  172  5.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.387243  hitchhiker  0.000000145169 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0183  RNA methyltransferase  45.74 
 
 
268 aa  170  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0951  RNA methyltransferase  34.4 
 
 
254 aa  169  4e-41  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0125  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  44.19 
 
 
268 aa  169  4e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.903054  normal  0.365569 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0360  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  45.6 
 
 
293 aa  169  4e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.038397 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2905  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  44.74 
 
 
268 aa  169  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529691  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0107  hypothetical protein  42.91 
 
 
249 aa  167  2e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0404  RNA methyltransferase  34.44 
 
 
252 aa  167  2e-40  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.106461  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2801  RNA methyltransferase TrmH, group 3  43.85 
 
 
260 aa  167  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.785043 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2255  RNA methyltransferase  48.05 
 
 
261 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0110995  normal  0.147851 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0092  hypothetical protein  43.32 
 
 
249 aa  166  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0208  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  45.92 
 
 
269 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.335988  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0914  RNA methyltransferase  46.84 
 
 
261 aa  166  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.106416 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2239  tRNA/rRNA metyltransferase  46.84 
 
 
261 aa  166  5e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.695793  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2426  RNA methyltransferase  45.5 
 
 
247 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4216  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  42.86 
 
 
259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1027  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3826  RNA methyltransferase  50.88 
 
 
265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0615  RNA methyl transferase TrmH, group 3  33.89 
 
 
252 aa  162  6e-39  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.97869  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2049  RNA methyltransferase TrmH, group 3  44.07 
 
 
262 aa  162  7e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1606  RNA methyltransferase  46.54 
 
 
278 aa  158  7e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15011  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0262  RNA methyltransferase  35.71 
 
 
243 aa  155  8e-37  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000000295307  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1559  RNA methyltransferase  44.78 
 
 
281 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.12965  normal  0.228384 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0995  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  38.08 
 
 
246 aa  149  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0352  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  41 
 
 
268 aa  149  5e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.426039  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0152  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  39.75 
 
 
245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1817  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  38.38 
 
 
289 aa  147  3e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.503004 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1364  RNA methyltransferase TrmH, group 3  43.3 
 
 
271 aa  145  6e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.84942  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0846  RNA methyltransferase TrmH, group 3  39.23 
 
 
272 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.139402  normal  0.265264 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03462  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  38.91 
 
 
246 aa  144  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0363  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  38.91 
 
 
244 aa  143  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0040389 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1408  RNA methyltransferase  36.33 
 
 
255 aa  142  5e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0243869  normal  0.695011 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04047  23S rRNA (Gm2251)-methyltransferase  38.08 
 
 
243 aa  142  7e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3813  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.08 
 
 
243 aa  142  7e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4740  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  38.08 
 
 
243 aa  142  7e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.504113  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4651  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  38.08 
 
 
243 aa  142  7e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.326823 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04009  hypothetical protein  38.08 
 
 
243 aa  142  7e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3833  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  38.08 
 
 
243 aa  142  7e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000869352 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4424  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  38.08 
 
 
243 aa  142  7e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5696  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  38.08 
 
 
243 aa  142  7e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2730  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  44.27 
 
 
255 aa  142  8e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.751116  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03770  rRNA methylase, putative, group 3  46.32 
 
 
323 aa  141  9.999999999999999e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.1456 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4766  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  38.24 
 
 
243 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0712  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  44.79 
 
 
306 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4730  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  38.24 
 
 
243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.653349  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4637  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  38.24 
 
 
243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4787  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  38.24 
 
 
243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.535347 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4647  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  38.24 
 
 
243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1937  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  43.51 
 
 
251 aa  140  3e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.177305  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2767  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  36.51 
 
 
247 aa  139  3.9999999999999997e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0060  RNA methyltransferase  39.27 
 
 
256 aa  139  4.999999999999999e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.024169  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12700  rRNA methylase, putative, group 3  46.52 
 
 
320 aa  139  4.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0609  RNA methyltransferase TrmH  39.08 
 
 
254 aa  139  7e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0802048 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1685  RNA methyltransferase  39.29 
 
 
247 aa  139  7e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.282815 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1828  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.44 
 
 
264 aa  138  7.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2285  TrmA family RNA methyltransferase  36.96 
 
 
323 aa  138  7.999999999999999e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.240402  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4689  RNA methyltransferase TrmH, group 3  38.49 
 
 
247 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196854  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4221  RNA methyltransferase  44.74 
 
 
373 aa  138  7.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0416  RNA methyltransferase  46.7 
 
 
246 aa  138  7.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.896719  normal  0.93402 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4711  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  37.24 
 
 
243 aa  138  8.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0065  RNA methyltransferase TrmH, group 3  38.87 
 
 
256 aa  138  1e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000946676  normal  0.572135 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2091  RNA methyltransferase TrmH, group 3  40.34 
 
 
247 aa  138  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.254713  normal  0.346719 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1067  RNA methyltransferase TrmH, group 3  39.04 
 
 
247 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1547  RNA methyltransferase  39.04 
 
 
247 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.844862  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1696  RNA methyltransferase  40.08 
 
 
247 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0644  RNA methyltransferase  40.91 
 
 
250 aa  137  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000634261 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1469  RNA methyltransferase  38.49 
 
 
247 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1448  RNA methyltransferase  38.49 
 
 
247 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3418  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  37.6 
 
 
246 aa  137  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.125093  normal  0.287966 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1523  RNA methyltransferase  39.04 
 
 
247 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.289763 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2518  RNA methyltransferase  38.89 
 
 
247 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00110794  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4658  RNA methyltransferase  44.74 
 
 
372 aa  136  4e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.277573  normal  0.477344 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2071  RNA methyltransferase TrmH, group 3  40.76 
 
 
256 aa  136  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1625  RNA methyltransferase TrmH, group 3  39.83 
 
 
251 aa  136  4e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.117052  hitchhiker  0.00235214 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1020  RNA methyltransferase  38.49 
 
 
247 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0199854  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1746  RNA methyltransferase  38.49 
 
 
247 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.248108  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1262  RNA methyltransferase  38.49 
 
 
247 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0146  RNA methyltransferase  38.49 
 
 
247 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.277376  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1799  RNA methyltransferase  38.49 
 
 
247 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.335408  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>