More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_86671 on replicon NC_009357
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009357  OSTLU_86671  predicted protein  100 
 
 		 345 aa  718    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.658611 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02967  tRNA dihydrouridine synthase (Smm1), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08390)  35.31 
 
 		 437 aa  178  1e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0155731  normal  0.608816 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02870  conserved hypothetical protein  40.77 
 
 		 496 aa  178  1e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12384  predicted protein  42.5 
 
 		 231 aa  162  7e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_72127  predicted protein  33.68 
 
 		 390 aa  161  1e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.585913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33532  dihydrouridine synthase  32.23 
 
 		 369 aa  132  9e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.056699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0425  NifR3 family TIM-barrel protein  31.54 
 
 		 324 aa  112  7.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0176336  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2685  nifR3 family TIM-barrel protein  34.87 
 
 		 322 aa  112  8.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000366446  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0074  TIM-barrel protein, nifR3 family  29.97 
 
 		 333 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0172  nifR3 family TIM-barrel protein  32.92 
 
 		 319 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000224205  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1003  hypothetical protein  34.84 
 
 		 323 aa  110  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2783  putative dihydrouridine synthase  32.64 
 
 		 326 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2469  putative dihydrouridine synthase  32.64 
 
 		 326 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1650  TIM-barrel protein, nifR3 family  31.43 
 
 		 330 aa  109  6e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.464846  normal  0.0220296 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl029  tRNA dihydrouridine synthetase  30.52 
 
 		 325 aa  109  9.000000000000001e-23  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2942  TIM-barrel protein, nifR3 family  33.76 
 
 		 320 aa  108  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000172076  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02240  conserved hypothetical protein  32.34 
 
 		 407 aa  105  1e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.12016  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2154  dihydrouridine synthase, DuS  32.23 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000009638  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1786  dihydrouridine synthase DuS  31.91 
 
 		 315 aa  104  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000927227 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2287  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  32.51 
 
 		 343 aa  104  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0247  TIM-barrel protein, nifR3 family  32.64 
 
 		 322 aa  103  6e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0897176  normal  0.676091 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0273  nifR3 family TIM-barrel protein  30.8 
 
 		 347 aa  103  6e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1635  hypothetical protein  35.9 
 
 		 326 aa  102  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.270741 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2859  dihydrouridine synthase, DuS  33.84 
 
 		 308 aa  101  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.748261  hitchhiker  0.0000000322781 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1583  dihydrouridine synthase DuS  35.38 
 
 		 326 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.018372 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1169  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  28.12 
 
 		 318 aa  100  3e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0800  TIM-barrel protein, nifR3 family  31.82 
 
 		 363 aa  100  5e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.873611  normal  0.99103 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1912  dihydrouridine synthase DuS  34.87 
 
 		 318 aa  99.8  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.402938  normal  0.0330373 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0071  nifR3 family TIM-barrel protein  30.74 
 
 		 332 aa  99.8  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0071  nifR3 family TIM-barrel protein  30.34 
 
 		 332 aa  99.4  8e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1351  dihydrouridine synthase, DuS  32.82 
 
 		 324 aa  99.4  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2338  putative tRNA-dihydrouridine synthase C, DuS  30.04 
 
 		 340 aa  99.4  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.135158  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1867  TIM-barrel protein, nifR3 family  34.16 
 
 		 326 aa  99  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.712125  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0837  tRNA-dihydrouridine synthase  28.32 
 
 		 308 aa  98.2  2e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2221  tRNA-dihydrouridine synthase  32.77 
 
 		 334 aa  98.6  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3612  TIM-barrel protein, nifR3 family  31.58 
 
 		 357 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.807702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1847  dihydrouridine synthase DuS  35.33 
 
 		 340 aa  97.4  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.323112  normal  0.104761 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0270  nifR3 family TIM-barrel protein  32.07 
 
 		 333 aa  97.1  4e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000135334  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58121  predicted protein  28.35 
 
 		 415 aa  96.7  6e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2246  TIM-barrel protein, nifR3 family  34.63 
 
 		 330 aa  96.3  7e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.3377  normal  0.126861 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5233  putative TIM-barrel protein, NifR3 family  30.3 
 
 		 332 aa  96.3  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.471264  hitchhiker  0.000000472201 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3024  dihydrouridine synthase, DuS  34.29 
 
 		 335 aa  95.5  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167542  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10310  putative TIM-barrel protein, nifR3 family  28.87 
 
 		 341 aa  94.7  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.193475  unclonable  0.00000000180311 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1255  dihydrouridine synthase, DuS  33.81 
 
 		 323 aa  94.7  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0939064  normal  0.0146388 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0110  nifR3 family TIM-barrel protein  32 
 
 		 318 aa  94.7  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000348489  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0074  NifR3 family TIM-barrel protein  29.87 
 
 		 332 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0071  NifR3 family TIM-barrel protein  29.87 
 
 		 332 aa  94  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0071  NifR3 family TIM-barrel protein  29.87 
 
 		 332 aa  94  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0087  putative TIM-barrel protein, NifR3 family  29.87 
 
 		 332 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.811614  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0084  putative TIM-barrel protein, NifR3 family  29.87 
 
 		 332 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000319456 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0527  TIM-barrel protein, nifR3 family  32.33 
 
 		 327 aa  93.6  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2886  dihydrouridine synthase, DuS  34.39 
 
 		 319 aa  94  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.014767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00690  putative TIM-barrel protein, nifR3 family  29.41 
 
 		 333 aa  93.6  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0083  putative TIM-barrel protein, NifR3 family  29.44 
 
 		 332 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.419375  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2561  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  33.2 
 
 		 324 aa  93.2  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000534823 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23640  hypothetical protein  34.62 
 
 		 319 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.963568  hitchhiker  0.00882346 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2242  dihydrouridine synthase, DuS  29.06 
 
 		 309 aa  92.4  9e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000197491  hitchhiker  0.000869385 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0075  NifR3 family TIM-barrel protein  29.44 
 
 		 324 aa  92.4  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0075  NifR3 family TIM-barrel protein  29.44 
 
 		 324 aa  92.4  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3425  dihydrouridine synthase, DuS  34.39 
 
 		 344 aa  92  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3447  TIM-barrel protein, nifR3 family  34.67 
 
 		 337 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1325  nifR3 family TIM-barrel protein  34.93 
 
 		 334 aa  92  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.544118  normal  0.772005 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_23375  predicted protein  29.37 
 
 		 323 aa  91.3  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000883702  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0906  NifR3/Smm1 family protein  32.58 
 
 		 310 aa  90.5  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0645  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  30.6 
 
 		 350 aa  90.9  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.446085  normal  0.634764 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1303  NifR3/Smm1 family protein  35.98 
 
 		 322 aa  90.9  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0734085 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1950  TIM-barrel protein, nifR3 family  31.95 
 
 		 347 aa  90.9  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3448  nifR3 family TIM-barrel protein  28.92 
 
 		 332 aa  90.9  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002975  tRNA-dihydrouridine synthase C  34.46 
 
 		 319 aa  90.9  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.386043  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2003  hypothetical protein  34.07 
 
 		 319 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.265323  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1302  dihydrouridine synthase, DuS  34.62 
 
 		 318 aa  90.5  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.905498  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0394  hypothetical protein  29.51 
 
 		 322 aa  90.1  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0914  nifR3 family TIM-barrel protein  30.29 
 
 		 347 aa  89.7  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.106236  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04682  tRNA-dihydrouridine synthase B  30.58 
 
 		 332 aa  89.7  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.965401  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2184  TIM-barrel protein, nifR3 family  28.69 
 
 		 346 aa  89.7  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.067096  normal  0.397805 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2279  dihydrouridine synthase, DuS  36.76 
 
 		 314 aa  89.7  7e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0400  nifR3 family TIM-barrel protein  29.51 
 
 		 322 aa  89.4  8e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000147464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3625  nifR3 family TIM-barrel protein  29.51 
 
 		 322 aa  89.4  8e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000178028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0399  nifR3 family TIM-barrel protein  29.51 
 
 		 322 aa  89.4  8e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000108898  normal  0.147817 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3225  tRNA-dihydrouridine synthase B  31.28 
 
 		 323 aa  89.4  9e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000851136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1399  nifR3 family TIM-barrel protein  30.86 
 
 		 356 aa  89.4  9e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.372686 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_3755  predicted protein  28.57 
 
 		 307 aa  89  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.278 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2838  tRNA-dihydrouridine synthase B  29.39 
 
 		 322 aa  89  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00370185  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34320  tRNA-dihydrouridine synthase C  39.26 
 
 		 326 aa  89  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1440  nifR3 family TIM-barrel protein  32.64 
 
 		 356 aa  89  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0100604  hitchhiker  0.0000369781 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0279  tRNA-dihydrouridine synthase  29.88 
 
 		 335 aa  89  1e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.690235  hitchhiker  0.007193 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02933  hypothetical protein  34.46 
 
 		 319 aa  89  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2727  dihydrouridine synthase, DuS  36.57 
 
 		 318 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.165844  normal  0.161387 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0241  tRNA-dihydrouridine synthase B  32.52 
 
 		 321 aa  88.2  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0237  tRNA-dihydrouridine synthase B  32.11 
 
 		 321 aa  88.2  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0626  TIM-barrel protein, nifR3 family  26.78 
 
 		 326 aa  88.2  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3964  nifR3 family TIM-barrel protein  28.69 
 
 		 322 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000968701  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3887  TIM-barrel protein, nifR3 family  28.69 
 
 		 322 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000216775  hitchhiker  0.0000134738 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3939  nifR3 family TIM-barrel protein  28.69 
 
 		 322 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000494088  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3215  tRNA-dihydrouridine synthase  32.64 
 
 		 319 aa  88.2  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.618108 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4080  NifR3 family TIM-barrel protein  28.69 
 
 		 322 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000239113  decreased coverage  0.00475521 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2152  tRNA-dihydrouridine synthase C  32.35 
 
 		 315 aa  87.8  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1304  RecR protein  29.71 
 
 		 318 aa  87.4  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00113352  normal  0.0322688 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0386  tRNA-dihydrouridine synthase B  31.8 
 
 		 321 aa  87.4  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000879086  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2333  dihydrouridine synthase, DuS  34.15 
 
 		 315 aa  87.4  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.108163  normal  0.0297059 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>