More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_02967 on replicon BN001306
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001306  ANIA_02967  tRNA dihydrouridine synthase (Smm1), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08390)  100 
 
 
437 aa  899    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0155731  normal  0.608816 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_72127  predicted protein  42.15 
 
 
390 aa  249  7e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.585913  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02870  conserved hypothetical protein  45.03 
 
 
496 aa  223  6e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_86671  predicted protein  35.31 
 
 
345 aa  172  7.999999999999999e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.658611 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12384  predicted protein  35.41 
 
 
231 aa  145  2e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02240  conserved hypothetical protein  28.67 
 
 
407 aa  96.7  8e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.12016  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33532  dihydrouridine synthase  28.52 
 
 
369 aa  96.3  9e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.056699  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2132  TIM-barrel protein, nifR3 family  35.94 
 
 
347 aa  88.6  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2154  dihydrouridine synthase, DuS  28.79 
 
 
318 aa  87  5e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000009638  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2560  TIM-barrel protein, nifR3 family  37.09 
 
 
352 aa  86.7  7e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1088  nifR3 family TIM-barrel protein  28.29 
 
 
337 aa  86.3  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.267708  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl029  tRNA dihydrouridine synthetase  24.92 
 
 
325 aa  81.3  0.00000000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58121  predicted protein  25.77 
 
 
415 aa  81.3  0.00000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_3015  predicted protein  30 
 
 
233 aa  81.3  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.420944  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03937  tRNA-dihydrouridine synthase B  30.84 
 
 
332 aa  80.5  0.00000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.259416  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0154  TIM-barrel protein, nifR3 family  32 
 
 
351 aa  80.5  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.386223  normal  0.0859714 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2184  TIM-barrel protein, nifR3 family  36 
 
 
346 aa  79.7  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.067096  normal  0.397805 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2132  nitrogen regulation protein  26.34 
 
 
332 aa  78.2  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.296899  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1810  TIM-barrel protein, nifR3 family  28.9 
 
 
338 aa  78.2  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.752321  hitchhiker  0.00592071 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_3755  predicted protein  25.9 
 
 
307 aa  77.8  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.278 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1620  nifR3 family TIM-barrel protein  28.42 
 
 
354 aa  77  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1617  TIM-barrel protein, nifR3 family  29.53 
 
 
315 aa  76.6  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2936  TIM-barrel protein, nifR3 family  33.92 
 
 
342 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123806  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2288  nifR3 family TIM-barrel protein  35.14 
 
 
347 aa  76.3  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0386  tRNA-dihydrouridine synthase B  32.82 
 
 
321 aa  75.1  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000879086  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0453  tRNA-dihydrouridine synthase B  32.82 
 
 
321 aa  75.1  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000154281  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1211  tRNA-dihydrouridine synthase B  32.82 
 
 
355 aa  74.7  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000054155  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0276  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  28.35 
 
 
354 aa  74.7  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.211478 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2561  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  25.99 
 
 
324 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000534823 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3699  tRNA-dihydrouridine synthase B  28.85 
 
 
321 aa  74.3  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.426337  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03215  putative TIM-barrel enzyme, possible dehydrogenase  28.68 
 
 
330 aa  74.3  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1813  nifR3 family TIM-barrel protein  33.71 
 
 
352 aa  74.3  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.675437  normal  0.130606 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0808  cell division protein, FtsL -like  27.76 
 
 
336 aa  73.9  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.648535  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_23375  predicted protein  27.09 
 
 
323 aa  73.9  0.000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000883702  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0363  nifR3 family TIM-barrel protein  29.12 
 
 
327 aa  73.6  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3688  tRNA-dihydrouridine synthase B  32.31 
 
 
321 aa  73.6  0.000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.51601  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4423  tRNA-dihydrouridine synthase B  31.28 
 
 
321 aa  72  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000000618743  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2942  TIM-barrel protein, nifR3 family  24.62 
 
 
320 aa  72  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000172076  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0864  nifR3 family TIM-barrel protein  29.37 
 
 
349 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3215  tRNA-dihydrouridine synthase  28.12 
 
 
319 aa  70.9  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.618108 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04682  tRNA-dihydrouridine synthase B  26.46 
 
 
332 aa  70.9  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.965401  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0637  TIM-barrel protein, nifR3 family  26.54 
 
 
331 aa  71.2  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382547  normal  0.299268 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4937  probable tRNA-dihydrouridine synthase 2  26.74 
 
 
329 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00645235  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0312  dihydrouridine synthase DuS  27.98 
 
 
319 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3846  tRNA-dihydrouridine synthase B  30.26 
 
 
321 aa  70.5  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.123531  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0382  hypothetical protein  26.74 
 
 
329 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00282008  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03118  tRNA-dihydrouridine synthase B  28.46 
 
 
321 aa  70.1  0.00000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.220754  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0446  TIM-barrel protein, nifR3 family  28.46 
 
 
321 aa  70.1  0.00000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000559244  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3745  tRNA-dihydrouridine synthase B  28.46 
 
 
321 aa  70.1  0.00000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000491919  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0366  hypothetical protein  27.98 
 
 
329 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0426  hypothetical protein  27.98 
 
 
329 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3453  tRNA-dihydrouridine synthase B  28.46 
 
 
321 aa  70.1  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.247e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0319  hypothetical protein  27.98 
 
 
329 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0302  dihydrouridine synthase  27.98 
 
 
329 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0306  dihydrouridine synthase  27.98 
 
 
329 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0048  nifR3 family TIM-barrel protein  29.52 
 
 
335 aa  70.1  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11245  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3555  tRNA-dihydrouridine synthase B  28.46 
 
 
321 aa  70.1  0.00000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000446962  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3643  tRNA-dihydrouridine synthase B  28.46 
 
 
321 aa  70.1  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000124193  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00690  putative TIM-barrel protein, nifR3 family  24.62 
 
 
333 aa  70.1  0.00000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03069  hypothetical protein  28.46 
 
 
321 aa  70.1  0.00000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.249652  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0237  tRNA-dihydrouridine synthase B  30.77 
 
 
321 aa  70.1  0.00000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0334  hypothetical protein  27.98 
 
 
329 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217194  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3225  tRNA-dihydrouridine synthase B  25.97 
 
 
323 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000851136  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4577  tRNA-dihydrouridine synthase B  28.46 
 
 
321 aa  70.1  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000029753  normal  0.0792821 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0446  tRNA-dihydrouridine synthase B  28.46 
 
 
321 aa  70.1  0.00000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000179057  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1867  TIM-barrel protein, nifR3 family  27.34 
 
 
326 aa  70.1  0.00000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.712125  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0161  TIM-barrel protein, nifR3 family  31.67 
 
 
321 aa  69.7  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000141339  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2818  NifR3 family TIM-barrel protein  32.34 
 
 
342 aa  69.7  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.758509  normal  0.404964 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1399  nifR3 family TIM-barrel protein  26.34 
 
 
356 aa  69.7  0.00000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.372686 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3576  tRNA-dihydrouridine synthase B  28.85 
 
 
321 aa  69.7  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000997743  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_86070  predicted protein  24.03 
 
 
608 aa  69.7  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3648  tRNA-dihydrouridine synthase B  28.85 
 
 
321 aa  69.7  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00267806  hitchhiker  0.000397185 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0241  tRNA-dihydrouridine synthase B  30.77 
 
 
321 aa  69.3  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0914  nifR3 family TIM-barrel protein  28.57 
 
 
347 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.106236  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3575  tRNA-dihydrouridine synthase B  28.85 
 
 
321 aa  69.7  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000520187  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3192  dihydrouridine synthase, DuS  26.38 
 
 
342 aa  69.3  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.742064  normal  0.427148 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1443  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  32.88 
 
 
349 aa  69.3  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.915684 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3682  tRNA-dihydrouridine synthase B  28.85 
 
 
321 aa  69.7  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0164412  normal  0.105701 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3745  tRNA-dihydrouridine synthase B  28.85 
 
 
321 aa  69.7  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000576344  normal  0.0689485 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0408  hypothetical protein  27.52 
 
 
329 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1252  dihydrouridine synthase  30.21 
 
 
355 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2685  nifR3 family TIM-barrel protein  25.58 
 
 
322 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000366446  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0270  nifR3 family TIM-barrel protein  28.34 
 
 
333 aa  68.9  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0169584  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2731  NifR3 family TIM-barrel protein  25.65 
 
 
333 aa  68.2  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00411092  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0025  NifR3 family protein  26.88 
 
 
320 aa  68.2  0.0000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2300  TIM-barrel protein, nifR3 family  31.76 
 
 
351 aa  68.2  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0905985  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0314  dihydrouridine synthase DuS  26.84 
 
 
329 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1005  dihydrouridine synthase family protein  28.25 
 
 
325 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.667167  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0429  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  30.37 
 
 
381 aa  67.8  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.244047  normal  0.096876 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0479  TIM-barrel protein, nifR3 family  28.02 
 
 
327 aa  67.4  0.0000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0020045  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3089  dihydrouridine synthase family protein  22.66 
 
 
376 aa  67  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0403  TIM-barrel protein, nifR3 family  25.89 
 
 
358 aa  67  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000189855  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_4048  predicted protein  26.25 
 
 
229 aa  67  0.0000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.413268  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_4049  predicted protein  26.25 
 
 
229 aa  67  0.0000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0150728  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1277  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  28.46 
 
 
332 aa  66.6  0.0000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.360448  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0245  nifR3 family TIM-barrel protein  27.94 
 
 
333 aa  66.6  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0172  nifR3 family TIM-barrel protein  25.39 
 
 
319 aa  66.6  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000224205  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2884  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein NifR3  27.37 
 
 
354 aa  66.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.423298  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2691  NifR3 family TIM-barrel protein  30.48 
 
 
354 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5809  TIM-barrel protein, nifR3 family  28.57 
 
 
345 aa  66.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0243889 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>