210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0233 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_0233  preprotein translocase, SecY subunit  100 
 
 		 489 aa  971    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.520667  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2241  preprotein translocase, SecY subunit  80.28 
 
 		 500 aa  759    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2426  preprotein translocase subunit SecY  70.94 
 
 		 492 aa  654    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1851  preprotein translocase subunit SecY  68.37 
 
 		 504 aa  621  1e-177  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.642367 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2315  preprotein translocase subunit SecY  68.07 
 
 		 491 aa  587  1e-166  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.368701  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0555  preprotein translocase subunit SecY  54.67 
 
 		 477 aa  498  1e-140  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.323996 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0587  preprotein translocase subunit SecY  54.6 
 
 		 477 aa  496  1e-139  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00173275  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0465  preprotein translocase subunit SecY  53.07 
 
 		 477 aa  491  9.999999999999999e-139  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2230  preprotein translocase subunit SecY  53.44 
 
 		 479 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.408121  normal  0.455137 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0104  preprotein translocase subunit SecY  53.75 
 
 		 479 aa  486  1e-136  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0087  preprotein translocase subunit SecY  52.13 
 
 		 492 aa  480  1e-134  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.023527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0024  preprotein translocase subunit SecY  53.14 
 
 		 492 aa  448  1e-125  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00318334  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1705  preprotein translocase subunit SecY  49.72 
 
 		 537 aa  425  1e-117  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.602032  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1498  preprotein translocase, SecY subunit  41.71 
 
 		 599 aa  360  3e-98  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.312314  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1407  preprotein translocase subunit SecY  38.17 
 
 		 443 aa  294  3e-78  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.886151  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0667  preprotein translocase subunit SecY  39.92 
 
 		 442 aa  291  1e-77  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00940535 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1251  preprotein translocase subunit SecY  39.71 
 
 		 442 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.05624  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0156  preprotein translocase subunit SecY  39.5 
 
 		 442 aa  280  3e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0733  preprotein translocase subunit SecY  38.43 
 
 		 443 aa  280  4e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.581929  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_56443  transport protein Sec61 alpha subunit  30.02 
 
 		 559 aa  232  1e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07721  hypothetical protein similar to Sec61 (Broad)  30.64 
 
 		 478 aa  226  1e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0245702  normal  0.107035 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27583  IISP family transporter: protein transport protein Sec61 alpha subunit  31.02 
 
 		 476 aa  217  4e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.527579  normal  0.285595 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00040  protein transporter, putative  30.33 
 
 		 478 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0233  preprotein translocase subunit SecY  31.31 
 
 		 476 aa  209  6e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.745222  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0402  preprotein translocase subunit SecY  29.35 
 
 		 476 aa  204  3e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.144908 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1755  Translocon Sec61/SecY, plug domain protein  28.86 
 
 		 469 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.227644  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68832  Protein transport protein SEC61 alpha subunit  28.04 
 
 		 478 aa  187  5e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0114  preprotein translocase subunit SecY  28.11 
 
 		 463 aa  186  1.0000000000000001e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.000000000441427  hitchhiker  0.00000810769 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1304  preprotein translocase subunit SecY  28.77 
 
 		 459 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.783086 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0964  preprotein translocase subunit SecY  28.51 
 
 		 460 aa  172  1e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.905411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1254  preprotein translocase subunit SecY  28.32 
 
 		 482 aa  154  2.9999999999999998e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000145561 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1874  preprotein translocase subunit SecY  27.72 
 
 		 465 aa  151  3e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.653631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1034  preprotein translocase subunit SecY  26.4 
 
 		 455 aa  144  5e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000391627 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80530  protein involved in co-translational pathway of protein transport  22.73 
 
 		 501 aa  101  3e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.453921 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0622  preprotein translocase, SecY subunit  21.97 
 
 		 444 aa  73.6  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.925436 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1831  preprotein translocase subunit SecY  22.66 
 
 		 443 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.321149  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  24.24 
 
 		 437 aa  67  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5022  preprotein translocase subunit SecY  24.35 
 
 		 445 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0201  preprotein translocase subunit SecY  22.49 
 
 		 443 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.124191  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0797  preprotein translocase subunit SecY  24.78 
 
 		 457 aa  65.1  0.000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.14214  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3686  preprotein translocase, SecY subunit  22.22 
 
 		 441 aa  65.1  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000792509  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2691  preprotein translocase, SecY subunit  21.24 
 
 		 430 aa  64.7  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.803147  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0735  preprotein translocase, SecY subunit  21.97 
 
 		 433 aa  63.9  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3397  preprotein translocase, SecY subunit  23.92 
 
 		 439 aa  62.8  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0305  preprotein translocase subunit SecY  22.91 
 
 		 420 aa  62.8  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1333  preprotein translocase subunit SecY  22.65 
 
 		 455 aa  62.8  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.158258 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1360  preprotein translocase, SecY subunit  22.82 
 
 		 423 aa  62.4  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0305  preprotein translocase subunit SecY  22.43 
 
 		 453 aa  61.2  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.398461 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  23.94 
 
 		 420 aa  62  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0245  preprotein translocase subunit SecY  22.99 
 
 		 471 aa  60.8  0.00000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0377  preprotein translocase subunit SecY  26.4 
 
 		 448 aa  60.8  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0309  preprotein translocase subunit SecY  20.87 
 
 		 443 aa  60.5  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0197098  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  24.24 
 
 		 437 aa  60.1  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2276  preprotein translocase subunit SecY  21.98 
 
 		 441 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000725785  hitchhiker  0.00410487 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10746  preprotein translocase subunit SecY  22.83 
 
 		 441 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.329828 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1565  preprotein translocase subunit SecY  21.75 
 
 		 443 aa  59.3  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.112443  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2198  preprotein translocase, SecY subunit  22.61 
 
 		 448 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0470035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1347  preprotein translocase subunit SecY  22.78 
 
 		 445 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3954  preprotein translocase, SecY subunit  24.13 
 
 		 434 aa  58.2  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  20.9 
 
 		 443 aa  57.4  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2158  preprotein translocase, SecY subunit  22.11 
 
 		 426 aa  57.4  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00470545  normal  0.460281 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00958  preprotein translocase subunit SecY  23.6 
 
 		 434 aa  57.4  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0058755  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05820  preprotein translocase SecY  22.81 
 
 		 447 aa  57.4  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0680  preprotein translocase subunit SecY  20.58 
 
 		 437 aa  57.4  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4487  preprotein translocase, SecY subunit  22.59 
 
 		 436 aa  57.4  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  22.61 
 
 		 429 aa  57  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1167  preprotein translocase subunit SecY  24.41 
 
 		 447 aa  57  0.0000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.221673  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09800  preprotein translocase, SecY subunit  22.31 
 
 		 427 aa  57  0.0000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.141788  hitchhiker  0.0000395879 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1046  preprotein translocase subunit SecY  22.31 
 
 		 441 aa  57  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303562  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0053  preprotein translocase subunit SecY  26.33 
 
 		 420 aa  57  0.0000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1062  preprotein translocase subunit SecY  22.31 
 
 		 441 aa  57  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160681  normal  0.323313 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1074  preprotein translocase subunit SecY  22.31 
 
 		 441 aa  57  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  22.01 
 
 		 435 aa  56.6  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0103  preprotein translocase subunit SecY  25 
 
 		 421 aa  56.6  0.0000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0496  preprotein translocase, SecY subunit  23.82 
 
 		 456 aa  57  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.437531  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1141  preprotein translocase, SecY subunit  23.13 
 
 		 426 aa  56.6  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000440606  normal  0.0147779 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2379  preprotein translocase subunit SecY  19.92 
 
 		 425 aa  56.2  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6594  preprotein translocase subunit SecY  22.95 
 
 		 436 aa  56.2  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0339  preprotein translocase subunit SecY  21.87 
 
 		 440 aa  55.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000142446  unclonable  0.0000000706243 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3428  preprotein translocase subunit SecY  21.69 
 
 		 443 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452831  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0504  preprotein translocase subunit SecY  23.8 
 
 		 443 aa  55.8  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00015304  normal  0.032999 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2694  preprotein translocase subunit SecY  19.92 
 
 		 425 aa  55.8  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3142  preprotein translocase subunit SecY  21.25 
 
 		 440 aa  54.7  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0487569  normal  0.382691 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0078  preprotein translocase subunit SecY  22.22 
 
 		 420 aa  54.7  0.000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1009  preprotein translocase subunit SecY  23.06 
 
 		 439 aa  54.3  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00114462  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0235  preprotein translocase subunit SecY  22.49 
 
 		 419 aa  54.3  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00849669  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0560  preprotein translocase, SecY subunit  21.34 
 
 		 442 aa  53.9  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0862  preprotein translocase, SecY subunit  22.38 
 
 		 438 aa  53.9  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.148817  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2062  preprotein translocase subunit SecY  21.97 
 
 		 421 aa  53.9  0.000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1949  preprotein translocase, SecY subunit  25.08 
 
 		 420 aa  53.9  0.000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0315  preprotein translocase subunit SecY  23.06 
 
 		 437 aa  53.5  0.000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0598799  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1726  preprotein translocase, SecY subunit  23.67 
 
 		 435 aa  52.8  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000716119  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0602  preprotein translocase subunit SecY  24.09 
 
 		 430 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.637505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2209  preprotein translocase subunit SecY  21.12 
 
 		 443 aa  52.8  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000211329  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0979  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  22.01 
 
 		 447 aa  53.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000479753  hitchhiker  0.00549319 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  21.68 
 
 		 437 aa  52.8  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5050  preprotein translocase subunit SecY  19.96 
 
 		 444 aa  53.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.478224  normal  0.981585 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1352  preprotein translocase subunit SecY  21.99 
 
 		 446 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0023208  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_002936  DET0494  preprotein translocase subunit SecY  25.68 
 
 		 438 aa  52  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.443171  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2459  preprotein translocase, SecY subunit  22.29 
 
 		 447 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>