114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2426 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_0233  preprotein translocase, SecY subunit  70.94 
 
 		 489 aa  654    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.520667  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2241  preprotein translocase, SecY subunit  71.12 
 
 		 500 aa  636    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2426  preprotein translocase subunit SecY  100 
 
 		 492 aa  969    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2315  preprotein translocase subunit SecY  67.47 
 
 		 491 aa  591  1e-167  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.368701  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1851  preprotein translocase subunit SecY  66.99 
 
 		 504 aa  586  1e-166  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.642367 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0555  preprotein translocase subunit SecY  54.19 
 
 		 477 aa  497  1e-139  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.323996 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2230  preprotein translocase subunit SecY  53.77 
 
 		 479 aa  494  9.999999999999999e-139  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.408121  normal  0.455137 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0587  preprotein translocase subunit SecY  55.49 
 
 		 477 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00173275  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0104  preprotein translocase subunit SecY  54.6 
 
 		 479 aa  489  1e-137  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0087  preprotein translocase subunit SecY  51.95 
 
 		 492 aa  482  1e-135  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.023527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0465  preprotein translocase subunit SecY  52.66 
 
 		 477 aa  484  1e-135  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0024  preprotein translocase subunit SecY  54.29 
 
 		 492 aa  464  1e-129  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00318334  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1705  preprotein translocase subunit SecY  50.47 
 
 		 537 aa  443  1e-123  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.602032  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1498  preprotein translocase, SecY subunit  42.77 
 
 		 599 aa  374  1e-102  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.312314  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0667  preprotein translocase subunit SecY  37.84 
 
 		 442 aa  291  2e-77  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00940535 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1407  preprotein translocase subunit SecY  37.45 
 
 		 443 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.886151  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1251  preprotein translocase subunit SecY  37.84 
 
 		 442 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.05624  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0733  preprotein translocase subunit SecY  38.14 
 
 		 443 aa  283  5.000000000000001e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.581929  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0156  preprotein translocase subunit SecY  37.84 
 
 		 442 aa  281  3e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_56443  transport protein Sec61 alpha subunit  30.67 
 
 		 559 aa  238  3e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07721  hypothetical protein similar to Sec61 (Broad)  32.92 
 
 		 478 aa  237  4e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0245702  normal  0.107035 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27583  IISP family transporter: protein transport protein Sec61 alpha subunit  31.22 
 
 		 476 aa  224  3e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.527579  normal  0.285595 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00040  protein transporter, putative  29.85 
 
 		 478 aa  220  5e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0402  preprotein translocase subunit SecY  30.22 
 
 		 476 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.144908 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0233  preprotein translocase subunit SecY  31.97 
 
 		 476 aa  210  6e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.745222  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68832  Protein transport protein SEC61 alpha subunit  30 
 
 		 478 aa  201  1.9999999999999998e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1755  Translocon Sec61/SecY, plug domain protein  28.19 
 
 		 469 aa  199  7e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.227644  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0114  preprotein translocase subunit SecY  28.81 
 
 		 463 aa  196  7e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.000000000441427  hitchhiker  0.00000810769 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0964  preprotein translocase subunit SecY  29.48 
 
 		 460 aa  194  3e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.905411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1304  preprotein translocase subunit SecY  29.82 
 
 		 459 aa  191  2e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.783086 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1254  preprotein translocase subunit SecY  29.27 
 
 		 482 aa  181  2.9999999999999997e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000145561 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1034  preprotein translocase subunit SecY  28.23 
 
 		 455 aa  171  3e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000391627 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1874  preprotein translocase subunit SecY  28.74 
 
 		 465 aa  170  5e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.653631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80530  protein involved in co-translational pathway of protein transport  25.41 
 
 		 501 aa  120  7e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.453921 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2691  preprotein translocase, SecY subunit  23.14 
 
 		 430 aa  69.3  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.803147  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5022  preprotein translocase subunit SecY  24.75 
 
 		 445 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1333  preprotein translocase subunit SecY  21.34 
 
 		 455 aa  60.8  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.158258 
 
 
-
 
NC_002620  TC0797  preprotein translocase subunit SecY  22.43 
 
 		 457 aa  58.2  0.0000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.14214  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0305  preprotein translocase subunit SecY  21.68 
 
 		 453 aa  57.8  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.398461 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  22.11 
 
 		 443 aa  57.8  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  0.0000000000266535 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  22.11 
 
 		 443 aa  57.8  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1347  preprotein translocase subunit SecY  24.85 
 
 		 445 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2986  preprotein translocase subunit SecY  22.83 
 
 		 448 aa  57.8  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2694  preprotein translocase subunit SecY  22.45 
 
 		 425 aa  57.4  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1269  preprotein translocase subunit SecY  23.33 
 
 		 455 aa  56.6  0.0000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2379  preprotein translocase subunit SecY  22.45 
 
 		 425 aa  56.2  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0245  preprotein translocase subunit SecY  21.27 
 
 		 471 aa  56.2  0.000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1046  preprotein translocase subunit SecY  21.84 
 
 		 441 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303562  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1062  preprotein translocase subunit SecY  21.84 
 
 		 441 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160681  normal  0.323313 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  21.53 
 
 		 437 aa  55.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1074  preprotein translocase subunit SecY  21.84 
 
 		 441 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3954  preprotein translocase, SecY subunit  23.65 
 
 		 434 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1360  preprotein translocase, SecY subunit  23.19 
 
 		 423 aa  55.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1504  preprotein translocase subunit SecY  22.49 
 
 		 419 aa  53.9  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0862  preprotein translocase, SecY subunit  20.2 
 
 		 438 aa  53.5  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.148817  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0315  preprotein translocase subunit SecY  23.94 
 
 		 437 aa  53.1  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0598799  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1976  preprotein translocase subunit SecY  22.38 
 
 		 446 aa  52.8  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.923807  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  24.01 
 
 		 447 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1213  preprotein translocase subunit SecY  21.56 
 
 		 446 aa  52.4  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3397  preprotein translocase, SecY subunit  23.26 
 
 		 439 aa  52  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  23.8 
 
 		 447 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0425  preprotein translocase subunit SecY  22.06 
 
 		 437 aa  52  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.65116  normal  0.157207 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  21.07 
 
 		 437 aa  51.6  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0612  preprotein translocase subunit SecY  21.68 
 
 		 456 aa  51.2  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29540  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  21.3 
 
 		 429 aa  50.8  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.498773  normal  0.844433 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0496  preprotein translocase, SecY subunit  23.89 
 
 		 456 aa  50.8  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.437531  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2956  preprotein translocase subunit SecY  24.15 
 
 		 436 aa  50.4  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.226026  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6594  preprotein translocase subunit SecY  23.06 
 
 		 436 aa  50.4  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1176  preprotein translocase subunit SecY  21.36 
 
 		 446 aa  50.4  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0379017  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1856  preprotein translocase, SecY subunit  21.59 
 
 		 446 aa  50.4  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0112849  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2668  preprotein translocase subunit SecY  24.21 
 
 		 436 aa  50.4  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1006  preprotein translocase subunit SecY  21.97 
 
 		 446 aa  49.3  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38875  hitchhiker  0.00669682 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23270  preprotein translocase, SecY subunit  22.66 
 
 		 426 aa  50.1  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.704414  hitchhiker  0.00000750325 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0275  preprotein translocase subunit SecY  20.61 
 
 		 454 aa  48.5  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0794912  normal  0.75706 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0446  preprotein translocase subunit SecY  21.34 
 
 		 443 aa  49.3  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000813945  hitchhiker  0.000170824 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10746  preprotein translocase subunit SecY  22.42 
 
 		 441 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.329828 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1926  preprotein translocase, SecY subunit  20.88 
 
 		 449 aa  48.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.796685  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04500  preprotein translocase subunit SecY  23.03 
 
 		 454 aa  48.5  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.705639  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4487  preprotein translocase, SecY subunit  21.95 
 
 		 436 aa  47.8  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3686  preprotein translocase, SecY subunit  22 
 
 		 441 aa  48.1  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000792509  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2756  preprotein translocase, SecY subunit  22.65 
 
 		 443 aa  47.4  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.373135  normal  0.477854 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0776  preprotein translocase subunit SecY  22.73 
 
 		 455 aa  47  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal  0.028717 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05820  preprotein translocase SecY  21.69 
 
 		 447 aa  47  0.0009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5767  preprotein translocase, SecY subunit  22.76 
 
 		 439 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.800902 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  22.07 
 
 		 420 aa  46.2  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3885  preprotein translocase subunit SecY  23.25 
 
 		 437 aa  46.2  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  23.06 
 
 		 445 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20670  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  20.84 
 
 		 439 aa  46.2  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0607  preprotein translocase, SecY subunit  20.32 
 
 		 429 aa  46.2  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0598508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2158  preprotein translocase, SecY subunit  21.29 
 
 		 426 aa  46.6  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00470545  normal  0.460281 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  20.88 
 
 		 435 aa  45.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  0.000000811889 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  22.22 
 
 		 447 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3318  preprotein translocase subunit SecY  21.22 
 
 		 441 aa  45.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4363  preprotein translocase subunit SecY  21.02 
 
 		 437 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0120386  normal  0.169527 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  19.28 
 
 		 435 aa  45.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2798  preprotein translocase subunit SecY  22.94 
 
 		 457 aa  45.1  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.558016 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0309  preprotein translocase subunit SecY  19.57 
 
 		 443 aa  45.4  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0197098  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0718  preprotein translocase subunit SecY  20.82 
 
 		 448 aa  44.3  0.004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.214912  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0377  preprotein translocase subunit SecY  25.68 
 
 		 448 aa  44.7  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1352  preprotein translocase subunit SecY  21.03 
 
 		 446 aa  44.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0023208  normal  0.481629 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>