99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1034 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_0964  preprotein translocase subunit SecY  77.44 
 
 		 460 aa  678    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.905411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1034  preprotein translocase subunit SecY  100 
 
 		 455 aa  892    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000391627 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1874  preprotein translocase subunit SecY  75.54 
 
 		 465 aa  656    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.653631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1304  preprotein translocase subunit SecY  76.79 
 
 		 459 aa  696    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.783086 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1254  preprotein translocase subunit SecY  44.26 
 
 		 482 aa  327  3e-88  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000145561 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0233  preprotein translocase subunit SecY  37.74 
 
 		 476 aa  278  1e-73  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.745222  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1755  Translocon Sec61/SecY, plug domain protein  37.05 
 
 		 469 aa  265  8.999999999999999e-70  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.227644  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0114  preprotein translocase subunit SecY  35.74 
 
 		 463 aa  253  5.000000000000001e-66  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.000000000441427  hitchhiker  0.00000810769 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0402  preprotein translocase subunit SecY  31.87 
 
 		 476 aa  217  4e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.144908 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_56443  transport protein Sec61 alpha subunit  29.34 
 
 		 559 aa  194  2e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1407  preprotein translocase subunit SecY  30.82 
 
 		 443 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.886151  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0667  preprotein translocase subunit SecY  28.97 
 
 		 442 aa  188  1e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00940535 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00040  protein transporter, putative  27.99 
 
 		 478 aa  183  7e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2426  preprotein translocase subunit SecY  28.63 
 
 		 492 aa  178  2e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0587  preprotein translocase subunit SecY  28.19 
 
 		 477 aa  177  5e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00173275  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0465  preprotein translocase subunit SecY  28.11 
 
 		 477 aa  176  7e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27583  IISP family transporter: protein transport protein Sec61 alpha subunit  28.66 
 
 		 476 aa  176  9e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.527579  normal  0.285595 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0104  preprotein translocase subunit SecY  28.06 
 
 		 479 aa  173  5e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2230  preprotein translocase subunit SecY  26.77 
 
 		 479 aa  173  5e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.408121  normal  0.455137 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68832  Protein transport protein SEC61 alpha subunit  29.15 
 
 		 478 aa  173  5.999999999999999e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1251  preprotein translocase subunit SecY  28.76 
 
 		 442 aa  172  2e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.05624  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0156  preprotein translocase subunit SecY  28.54 
 
 		 442 aa  170  5e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07721  hypothetical protein similar to Sec61 (Broad)  27.41 
 
 		 478 aa  168  1e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0245702  normal  0.107035 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0733  preprotein translocase subunit SecY  27.25 
 
 		 443 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.581929  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0555  preprotein translocase subunit SecY  27.33 
 
 		 477 aa  164  3e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.323996 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0087  preprotein translocase subunit SecY  27.47 
 
 		 492 aa  164  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.023527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1498  preprotein translocase, SecY subunit  27.76 
 
 		 599 aa  161  2e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.312314  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0233  preprotein translocase, SecY subunit  26.8 
 
 		 489 aa  150  6e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.520667  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2241  preprotein translocase, SecY subunit  27.11 
 
 		 500 aa  146  7.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1851  preprotein translocase subunit SecY  27.98 
 
 		 504 aa  138  3.0000000000000003e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.642367 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0024  preprotein translocase subunit SecY  27 
 
 		 492 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00318334  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2315  preprotein translocase subunit SecY  28.08 
 
 		 491 aa  130  7.000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.368701  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1705  preprotein translocase subunit SecY  29.55 
 
 		 537 aa  107  5e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.602032  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80530  protein involved in co-translational pathway of protein transport  23.64 
 
 		 501 aa  96.7  9e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.453921 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09800  preprotein translocase, SecY subunit  24.08 
 
 		 427 aa  65.1  0.000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.141788  hitchhiker  0.0000395879 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1949  preprotein translocase, SecY subunit  23.24 
 
 		 420 aa  62.4  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0103  preprotein translocase subunit SecY  24.33 
 
 		 421 aa  59.7  0.00000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2694  preprotein translocase subunit SecY  21.98 
 
 		 425 aa  59.3  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2379  preprotein translocase subunit SecY  21.98 
 
 		 425 aa  58.5  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2503  preprotein translocase subunit SecY  24.27 
 
 		 434 aa  57.8  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000332806  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04180  preprotein translocase subunit SecY  22.69 
 
 		 435 aa  57.8  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132635  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2766  preprotein translocase subunit SecY  24.07 
 
 		 434 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00224272  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  23.06 
 
 		 420 aa  57  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2747  preprotein translocase subunit SecY  24.49 
 
 		 434 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.787541  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2545  preprotein translocase subunit SecY  24.49 
 
 		 434 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000778926 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2742  preprotein translocase subunit SecY  24.07 
 
 		 434 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53667e-23 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2469  preprotein translocase subunit SecY  23.85 
 
 		 434 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0545369  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4487  preprotein translocase, SecY subunit  22.58 
 
 		 436 aa  54.3  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0305  preprotein translocase subunit SecY  22.73 
 
 		 453 aa  54.3  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.398461 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2412  preprotein translocase subunit SecY  23.6 
 
 		 434 aa  53.9  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00625491  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2734  preprotein translocase subunit SecY  23.86 
 
 		 434 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.356112  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2547  preprotein translocase subunit SecY  23.86 
 
 		 434 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0673869  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2158  preprotein translocase, SecY subunit  23.23 
 
 		 426 aa  52.4  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00470545  normal  0.460281 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0053  preprotein translocase subunit SecY  23.66 
 
 		 420 aa  53.1  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0680  preprotein translocase subunit SecY  22.53 
 
 		 437 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0780  preprotein translocase subunit SecY  23.18 
 
 		 457 aa  52.4  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1176  preprotein translocase subunit SecY  24.89 
 
 		 446 aa  51.2  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0379017  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1735  preprotein translocase subunit SecY  22.37 
 
 		 452 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2062  preprotein translocase subunit SecY  22.82 
 
 		 421 aa  49.7  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0381  preprotein translocase subunit SecY  22.37 
 
 		 452 aa  49.7  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  21.29 
 
 		 437 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1976  preprotein translocase subunit SecY  24.46 
 
 		 446 aa  48.5  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.923807  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29540  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  23.24 
 
 		 429 aa  48.9  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.498773  normal  0.844433 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0787  preprotein translocase subunit SecY  23.44 
 
 		 438 aa  48.9  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000240861  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0778  preprotein translocase, SecY subunit  23.06 
 
 		 430 aa  48.9  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000100686  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_436  preprotein translocase subunit SecY  24.16 
 
 		 438 aa  48.5  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0195945  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1213  preprotein translocase subunit SecY  24.68 
 
 		 446 aa  48.5  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1685  preprotein translocase subunit SecY  22.82 
 
 		 421 aa  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2790  preprotein translocase subunit SecY  23.35 
 
 		 434 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000168645  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1856  preprotein translocase subunit SecY  23.24 
 
 		 421 aa  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0494  preprotein translocase subunit SecY  23.6 
 
 		 438 aa  47.8  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.443171  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  21.68 
 
 		 437 aa  47.8  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3903  preprotein translocase subunit SecY  22.61 
 
 		 441 aa  47.8  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.340332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0471  preprotein translocase subunit SecY  24.01 
 
 		 438 aa  47.8  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00922913  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5050  preprotein translocase subunit SecY  22.9 
 
 		 437 aa  47.4  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.34117  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3423  preprotein translocase subunit SecY  22.79 
 
 		 436 aa  47  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.23916 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2691  preprotein translocase, SecY subunit  21.43 
 
 		 430 aa  46.6  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.803147  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3318  preprotein translocase subunit SecY  24.08 
 
 		 441 aa  46.6  0.0009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1000  preprotein translocase, SecY subunit  22.64 
 
 		 419 aa  46.2  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00382146  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0214  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  24.77 
 
 		 419 aa  46.2  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.32801  normal  0.494063 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2198  preprotein translocase, SecY subunit  27.27 
 
 		 448 aa  46.6  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0470035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0979  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  23.54 
 
 		 447 aa  46.2  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000479753  hitchhiker  0.00549319 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0078  preprotein translocase subunit SecY  21.9 
 
 		 420 aa  46.2  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4295  preprotein translocase subunit SecY  21.99 
 
 		 441 aa  46.6  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00554636 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2214  preprotein translocase subunit SecY  24.74 
 
 		 439 aa  46.2  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.180024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1757  preprotein translocase subunit SecY  23.51 
 
 		 352 aa  45.4  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.148623  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20670  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  23.89 
 
 		 439 aa  45.1  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2994  preprotein translocase subunit SecY  23.37 
 
 		 446 aa  45.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.389258  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0393  preprotein translocase subunit SecY  23.73 
 
 		 439 aa  44.7  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0413341  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0401  preprotein translocase subunit SecY  23.73 
 
 		 439 aa  44.7  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2754  preprotein translocase, SecY subunit  21.29 
 
 		 437 aa  44.3  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  19.91 
 
 		 429 aa  43.9  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2514  preprotein translocase subunit SecY  22.39 
 
 		 452 aa  44.3  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0285  preprotein translocase subunit SecY  25.68 
 
 		 430 aa  44.3  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000550268  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3929  preprotein translocase subunit SecY  21.39 
 
 		 436 aa  43.9  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0245  preprotein translocase subunit SecY  22.08 
 
 		 424 aa  43.9  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.101058  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2135  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  23.85 
 
 		 428 aa  43.1  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233384  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0607  preprotein translocase, SecY subunit  20.34 
 
 		 429 aa  43.1  0.01  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0598508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0343  preprotein translocase, SecY subunit  27.17 
 
 		 444 aa  43.1  0.01  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000192463  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>