190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0667 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1251  preprotein translocase subunit SecY  98.87 
 
 		 442 aa  869    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.05624  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0156  preprotein translocase subunit SecY  98.19 
 
 		 442 aa  862    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0733  preprotein translocase subunit SecY  88.46 
 
 		 443 aa  774    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.581929  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1407  preprotein translocase subunit SecY  74.94 
 
 		 443 aa  685    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.886151  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0667  preprotein translocase subunit SecY  100 
 
 		 442 aa  874    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00940535 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0104  preprotein translocase subunit SecY  39.71 
 
 		 479 aa  330  4e-89  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0087  preprotein translocase subunit SecY  41.29 
 
 		 492 aa  323  4e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.023527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0465  preprotein translocase subunit SecY  38.03 
 
 		 477 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0587  preprotein translocase subunit SecY  37.87 
 
 		 477 aa  309  8e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00173275  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2230  preprotein translocase subunit SecY  36.88 
 
 		 479 aa  300  2e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.408121  normal  0.455137 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0024  preprotein translocase subunit SecY  40.79 
 
 		 492 aa  301  2e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00318334  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0555  preprotein translocase subunit SecY  37.18 
 
 		 477 aa  300  3e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.323996 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1498  preprotein translocase, SecY subunit  37.26 
 
 		 599 aa  286  5.999999999999999e-76  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.312314  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2241  preprotein translocase, SecY subunit  39.3 
 
 		 500 aa  281  2e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0233  preprotein translocase, SecY subunit  39.92 
 
 		 489 aa  278  1e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.520667  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2426  preprotein translocase subunit SecY  38.16 
 
 		 492 aa  277  2e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_56443  transport protein Sec61 alpha subunit  35.1 
 
 		 559 aa  278  2e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0233  preprotein translocase subunit SecY  37.69 
 
 		 476 aa  277  3e-73  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.745222  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1705  preprotein translocase subunit SecY  37.17 
 
 		 537 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.602032  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00040  protein transporter, putative  33.62 
 
 		 478 aa  268  1e-70  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1851  preprotein translocase subunit SecY  39.8 
 
 		 504 aa  267  2.9999999999999995e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.642367 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27583  IISP family transporter: protein transport protein Sec61 alpha subunit  35.06 
 
 		 476 aa  265  1e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.527579  normal  0.285595 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0402  preprotein translocase subunit SecY  36.23 
 
 		 476 aa  263  4.999999999999999e-69  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.144908 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07721  hypothetical protein similar to Sec61 (Broad)  33.12 
 
 		 478 aa  260  4e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0245702  normal  0.107035 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2315  preprotein translocase subunit SecY  39.17 
 
 		 491 aa  253  5.000000000000001e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.368701  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68832  Protein transport protein SEC61 alpha subunit  31.91 
 
 		 478 aa  218  2e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1755  Translocon Sec61/SecY, plug domain protein  32.78 
 
 		 469 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.227644  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0114  preprotein translocase subunit SecY  30.85 
 
 		 463 aa  210  5e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.000000000441427  hitchhiker  0.00000810769 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1254  preprotein translocase subunit SecY  30.71 
 
 		 482 aa  178  2e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000145561 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1304  preprotein translocase subunit SecY  28.3 
 
 		 459 aa  176  5e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.783086 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1034  preprotein translocase subunit SecY  28.97 
 
 		 455 aa  173  6.999999999999999e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000391627 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0964  preprotein translocase subunit SecY  28.09 
 
 		 460 aa  169  1e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.905411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1874  preprotein translocase subunit SecY  28.21 
 
 		 465 aa  161  2e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.653631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80530  protein involved in co-translational pathway of protein transport  27.04 
 
 		 501 aa  123  5e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.453921 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0979  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  24.76 
 
 		 447 aa  70.9  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000479753  hitchhiker  0.00549319 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  23.64 
 
 		 437 aa  69.3  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0607  preprotein translocase, SecY subunit  24.89 
 
 		 429 aa  65.5  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0598508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0245  preprotein translocase subunit SecY  23.28 
 
 		 471 aa  64.3  0.000000004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0680  preprotein translocase subunit SecY  21.34 
 
 		 437 aa  63.5  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  23.28 
 
 		 437 aa  63.5  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2691  preprotein translocase, SecY subunit  23.35 
 
 		 430 aa  63.2  0.000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.803147  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0778  preprotein translocase, SecY subunit  25.64 
 
 		 430 aa  62.8  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000100686  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0494  preprotein translocase subunit SecY  25.07 
 
 		 438 aa  62.4  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.443171  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1333  preprotein translocase subunit SecY  22.32 
 
 		 455 aa  62  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.158258 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6594  preprotein translocase subunit SecY  23.97 
 
 		 436 aa  61.6  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0797  preprotein translocase subunit SecY  24.29 
 
 		 457 aa  60.8  0.00000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.14214  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0315  preprotein translocase subunit SecY  24.15 
 
 		 437 aa  60.5  0.00000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0598799  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1360  preprotein translocase, SecY subunit  22.63 
 
 		 423 aa  60.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1856  preprotein translocase, SecY subunit  24.31 
 
 		 446 aa  59.3  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0112849  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2237  preprotein translocase subunit SecY  23.82 
 
 		 437 aa  59.7  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.104557  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0780  preprotein translocase subunit SecY  25 
 
 		 457 aa  59.7  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2599  preprotein translocase subunit SecY  25.19 
 
 		 440 aa  59.3  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0785292  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2633  preprotein translocase, SecY subunit  24.68 
 
 		 431 aa  58.9  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3954  preprotein translocase, SecY subunit  21.96 
 
 		 434 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0381  preprotein translocase subunit SecY  23.42 
 
 		 452 aa  58.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10746  preprotein translocase subunit SecY  23.56 
 
 		 441 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.329828 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0305  preprotein translocase subunit SecY  22.97 
 
 		 453 aa  57.4  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.398461 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1735  preprotein translocase subunit SecY  23.42 
 
 		 452 aa  57.8  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3397  preprotein translocase, SecY subunit  22.22 
 
 		 439 aa  57.8  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_436  preprotein translocase subunit SecY  23.47 
 
 		 438 aa  57  0.0000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0195945  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20670  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  21.92 
 
 		 439 aa  56.6  0.0000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2887  preprotein translocase, SecY subunit  24.94 
 
 		 441 aa  56.6  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0626195  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1726  preprotein translocase, SecY subunit  22.59 
 
 		 435 aa  55.1  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000716119  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0245  preprotein translocase subunit SecY  24.66 
 
 		 424 aa  55.8  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.101058  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2135  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  24.61 
 
 		 428 aa  55.5  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233384  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2694  preprotein translocase subunit SecY  20.22 
 
 		 425 aa  55.5  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2379  preprotein translocase subunit SecY  20.22 
 
 		 425 aa  55.1  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29540  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  23.79 
 
 		 429 aa  55.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.498773  normal  0.844433 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23600  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  22.78 
 
 		 434 aa  54.7  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4487  preprotein translocase, SecY subunit  23.72 
 
 		 436 aa  54.7  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  24.62 
 
 		 420 aa  54.3  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1046  preprotein translocase subunit SecY  21.13 
 
 		 441 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303562  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1504  preprotein translocase subunit SecY  25.06 
 
 		 419 aa  54.3  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1062  preprotein translocase subunit SecY  21.13 
 
 		 441 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160681  normal  0.323313 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1074  preprotein translocase subunit SecY  21.13 
 
 		 441 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3686  preprotein translocase, SecY subunit  24.39 
 
 		 441 aa  54.3  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000792509  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0496  preprotein translocase, SecY subunit  25.88 
 
 		 456 aa  53.9  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.437531  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0471  preprotein translocase subunit SecY  22.37 
 
 		 438 aa  54.3  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00922913  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1811  preprotein translocase subunit SecY  22.48 
 
 		 430 aa  53.5  0.000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.741103  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2214  preprotein translocase subunit SecY  21.45 
 
 		 439 aa  53.1  0.000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.180024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1000  preprotein translocase, SecY subunit  23.04 
 
 		 419 aa  52.8  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00382146  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0151  preprotein translocase subunit SecY  22.78 
 
 		 433 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0158065  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0125  preprotein translocase subunit SecY  22.53 
 
 		 433 aa  52.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00395698  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0130  preprotein translocase subunit SecY  22.78 
 
 		 433 aa  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0066731  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5175  preprotein translocase subunit SecY  22.53 
 
 		 433 aa  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000485174  unclonable  4.1263e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0130  preprotein translocase subunit SecY  22.78 
 
 		 433 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00164171  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0126  preprotein translocase subunit SecY  22.78 
 
 		 433 aa  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0265701  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0124  preprotein translocase subunit SecY  22.78 
 
 		 433 aa  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.64549  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0509  preprotein translocase subunit SecY  20.78 
 
 		 443 aa  52  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0470282  hitchhiker  0.00397274 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0130  preprotein translocase subunit SecY  22.78 
 
 		 433 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00952483  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0504  preprotein translocase subunit SecY  20.78 
 
 		 443 aa  52  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00015304  normal  0.032999 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5022  preprotein translocase subunit SecY  21.94 
 
 		 445 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1463  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  21.36 
 
 		 438 aa  52.4  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000110167  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0161  preprotein translocase subunit SecY  22.78 
 
 		 433 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000198533  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0951  preprotein translocase, SecY subunit  22.35 
 
 		 448 aa  51.6  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.830582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2062  preprotein translocase subunit SecY  24.69 
 
 		 421 aa  51.6  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1176  preprotein translocase subunit SecY  23.88 
 
 		 446 aa  51.2  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0379017  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0310  preprotein translocase subunit SecY  21.59 
 
 		 431 aa  51.2  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  8.823840000000001e-28 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1887  preprotein translocase subunit SecY  22.7 
 
 		 431 aa  51.2  0.00004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.729916  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1685  preprotein translocase subunit SecY  24.69 
 
 		 421 aa  51.2  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>