142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2241 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1851  preprotein translocase subunit SecY  70.59 
 
 		 504 aa  634    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.642367 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0233  preprotein translocase, SecY subunit  80.28 
 
 		 489 aa  779    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.520667  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2426  preprotein translocase subunit SecY  71.12 
 
 		 492 aa  652    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2241  preprotein translocase, SecY subunit  100 
 
 		 500 aa  988    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2315  preprotein translocase subunit SecY  66.93 
 
 		 491 aa  583  1.0000000000000001e-165  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.368701  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0587  preprotein translocase subunit SecY  53.21 
 
 		 477 aa  490  1e-137  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00173275  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0104  preprotein translocase subunit SecY  52.59 
 
 		 479 aa  484  1e-135  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2230  preprotein translocase subunit SecY  52.38 
 
 		 479 aa  479  1e-134  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.408121  normal  0.455137 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0087  preprotein translocase subunit SecY  49.71 
 
 		 492 aa  477  1e-133  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.023527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0555  preprotein translocase subunit SecY  51 
 
 		 477 aa  475  1e-133  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.323996 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0465  preprotein translocase subunit SecY  51.31 
 
 		 477 aa  473  1e-132  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0024  preprotein translocase subunit SecY  51.08 
 
 		 492 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00318334  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1705  preprotein translocase subunit SecY  48.69 
 
 		 537 aa  422  1e-117  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.602032  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1498  preprotein translocase, SecY subunit  40.38 
 
 		 599 aa  355  1e-96  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.312314  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0667  preprotein translocase subunit SecY  39.38 
 
 		 442 aa  302  8.000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00940535 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1407  preprotein translocase subunit SecY  36.96 
 
 		 443 aa  298  2e-79  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.886151  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1251  preprotein translocase subunit SecY  39.18 
 
 		 442 aa  296  8e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.05624  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0156  preprotein translocase subunit SecY  39.06 
 
 		 442 aa  290  3e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0733  preprotein translocase subunit SecY  38.95 
 
 		 443 aa  290  3e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.581929  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_56443  transport protein Sec61 alpha subunit  30.53 
 
 		 559 aa  239  9e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27583  IISP family transporter: protein transport protein Sec61 alpha subunit  32.19 
 
 		 476 aa  231  2e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.527579  normal  0.285595 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07721  hypothetical protein similar to Sec61 (Broad)  30.88 
 
 		 478 aa  224  2e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0245702  normal  0.107035 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00040  protein transporter, putative  30.3 
 
 		 478 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0233  preprotein translocase subunit SecY  30.08 
 
 		 476 aa  209  6e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.745222  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0402  preprotein translocase subunit SecY  28.48 
 
 		 476 aa  205  2e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.144908 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68832  Protein transport protein SEC61 alpha subunit  28.51 
 
 		 478 aa  188  2e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1755  Translocon Sec61/SecY, plug domain protein  27 
 
 		 469 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.227644  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0114  preprotein translocase subunit SecY  27.16 
 
 		 463 aa  180  5.999999999999999e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.000000000441427  hitchhiker  0.00000810769 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0964  preprotein translocase subunit SecY  27.96 
 
 		 460 aa  169  1e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.905411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1304  preprotein translocase subunit SecY  28.35 
 
 		 459 aa  167  4e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.783086 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1254  preprotein translocase subunit SecY  27.99 
 
 		 482 aa  159  1e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000145561 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1874  preprotein translocase subunit SecY  27.36 
 
 		 465 aa  151  3e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.653631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1034  preprotein translocase subunit SecY  27.4 
 
 		 455 aa  144  3e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000391627 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80530  protein involved in co-translational pathway of protein transport  23.22 
 
 		 501 aa  97.8  4e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.453921 
 
 
-
 
NC_002620  TC0797  preprotein translocase subunit SecY  24.45 
 
 		 457 aa  66.6  0.000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.14214  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2691  preprotein translocase, SecY subunit  23.14 
 
 		 430 aa  65.9  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.803147  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0315  preprotein translocase subunit SecY  24.4 
 
 		 437 aa  63.9  0.000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0598799  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5022  preprotein translocase subunit SecY  22.55 
 
 		 445 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  22.52 
 
 		 420 aa  61.6  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1046  preprotein translocase subunit SecY  21.77 
 
 		 441 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303562  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1062  preprotein translocase subunit SecY  21.77 
 
 		 441 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160681  normal  0.323313 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1074  preprotein translocase subunit SecY  21.77 
 
 		 441 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0496  preprotein translocase, SecY subunit  22.39 
 
 		 456 aa  60.5  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.437531  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1269  preprotein translocase subunit SecY  21.66 
 
 		 455 aa  58.5  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0446  preprotein translocase subunit SecY  22.18 
 
 		 443 aa  59.3  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000813945  hitchhiker  0.000170824 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3397  preprotein translocase, SecY subunit  22.31 
 
 		 439 aa  58.9  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0735  preprotein translocase, SecY subunit  21.34 
 
 		 433 aa  56.2  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4487  preprotein translocase, SecY subunit  21.86 
 
 		 436 aa  56.6  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0053  preprotein translocase subunit SecY  27.21 
 
 		 420 aa  56.6  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0339  preprotein translocase subunit SecY  22.81 
 
 		 440 aa  55.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000142446  unclonable  0.0000000706243 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0504  preprotein translocase subunit SecY  23.11 
 
 		 443 aa  55.5  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00015304  normal  0.032999 
 
 
-
 
NC_002936  DET0494  preprotein translocase subunit SecY  24.91 
 
 		 438 aa  55.1  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.443171  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1333  preprotein translocase subunit SecY  20.36 
 
 		 455 aa  54.7  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.158258 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0862  preprotein translocase, SecY subunit  23.25 
 
 		 438 aa  54.3  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.148817  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_436  preprotein translocase subunit SecY  24.91 
 
 		 438 aa  54.3  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0195945  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2379  preprotein translocase subunit SecY  20.4 
 
 		 425 aa  54.3  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1360  preprotein translocase, SecY subunit  21.66 
 
 		 423 aa  54.3  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0509  preprotein translocase subunit SecY  22.9 
 
 		 443 aa  53.9  0.000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0470282  hitchhiker  0.00397274 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2694  preprotein translocase subunit SecY  20.4 
 
 		 425 aa  53.5  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0425  preprotein translocase subunit SecY  22.94 
 
 		 437 aa  53.1  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.65116  normal  0.157207 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3686  preprotein translocase, SecY subunit  21.5 
 
 		 441 aa  53.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000792509  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3647  preprotein translocase, SecY subunit  22.04 
 
 		 442 aa  53.1  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00118801  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2599  preprotein translocase subunit SecY  22.24 
 
 		 440 aa  52  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0785292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0471  preprotein translocase subunit SecY  21.06 
 
 		 438 aa  52  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00922913  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6029  preprotein translocase subunit SecY  23.77 
 
 		 430 aa  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1831  preprotein translocase subunit SecY  21.74 
 
 		 443 aa  51.6  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.321149  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3954  preprotein translocase, SecY subunit  22.17 
 
 		 434 aa  51.2  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2062  preprotein translocase subunit SecY  26.32 
 
 		 421 aa  51.2  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0103  preprotein translocase subunit SecY  25.16 
 
 		 421 aa  51.2  0.00004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09800  preprotein translocase, SecY subunit  21.95 
 
 		 427 aa  51.2  0.00004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.141788  hitchhiker  0.0000395879 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05820  preprotein translocase SecY  25.16 
 
 		 447 aa  50.8  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  20.87 
 
 		 437 aa  51.2  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0235  preprotein translocase subunit SecY  21.84 
 
 		 419 aa  50.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00849669  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1949  preprotein translocase, SecY subunit  24.75 
 
 		 420 aa  50.8  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1000  preprotein translocase, SecY subunit  20.04 
 
 		 419 aa  50.8  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00382146  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1141  preprotein translocase, SecY subunit  22.48 
 
 		 426 aa  50.4  0.00006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000440606  normal  0.0147779 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0622  preprotein translocase, SecY subunit  21.34 
 
 		 444 aa  50.8  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.925436 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1167  preprotein translocase subunit SecY  25.41 
 
 		 447 aa  50.8  0.00006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.221673  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  21.02 
 
 		 437 aa  50.4  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2158  preprotein translocase, SecY subunit  20.68 
 
 		 426 aa  49.3  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00470545  normal  0.460281 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1685  preprotein translocase subunit SecY  25.91 
 
 		 421 aa  49.3  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0377  preprotein translocase subunit SecY  24.41 
 
 		 448 aa  50.1  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4934  preprotein translocase, SecY subunit  23.23 
 
 		 439 aa  50.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000290796  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2276  preprotein translocase subunit SecY  26.89 
 
 		 441 aa  49.7  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000725785  hitchhiker  0.00410487 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0309  preprotein translocase subunit SecY  20.11 
 
 		 443 aa  50.1  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0197098  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1856  preprotein translocase subunit SecY  25.91 
 
 		 421 aa  48.9  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2956  preprotein translocase subunit SecY  26.18 
 
 		 436 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.226026  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2403  preprotein translocase subunit SecY  25.7 
 
 		 443 aa  48.9  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0193161  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10746  preprotein translocase subunit SecY  21.24 
 
 		 441 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.329828 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0886  preprotein translocase subunit SecY  20.98 
 
 		 418 aa  49.3  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.609907  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2668  preprotein translocase subunit SecY  23.79 
 
 		 436 aa  49.3  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0602  preprotein translocase subunit SecY  22.95 
 
 		 430 aa  48.5  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.637505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0979  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  22.07 
 
 		 447 aa  48.5  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000479753  hitchhiker  0.00549319 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1347  preprotein translocase subunit SecY  26.15 
 
 		 445 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00958  preprotein translocase subunit SecY  22.73 
 
 		 434 aa  48.5  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0058755  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0305  preprotein translocase subunit SecY  23.57 
 
 		 420 aa  47.8  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4006  preprotein translocase, SecY subunit  22.58 
 
 		 450 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000605815  hitchhiker  0.000026914 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2209  preprotein translocase subunit SecY  26.17 
 
 		 443 aa  48.1  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000211329  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0607  preprotein translocase, SecY subunit  22.22 
 
 		 429 aa  47.8  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0598508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0245  preprotein translocase subunit SecY  21.37 
 
 		 471 aa  47.8  0.0004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>