More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1167 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0377  preprotein translocase subunit SecY  71.05 
 
 
448 aa  646    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05820  preprotein translocase SecY  74.16 
 
 
447 aa  660    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1167  preprotein translocase subunit SecY  100 
 
 
447 aa  892    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.221673  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0622  preprotein translocase, SecY subunit  55.83 
 
 
444 aa  489  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.925436 
 
 
-
 
NC_002950  PG1918  preprotein translocase subunit SecY  55.33 
 
 
446 aa  463  1e-129  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4363  preprotein translocase subunit SecY  51.35 
 
 
437 aa  461  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0120386  normal  0.169527 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3142  preprotein translocase subunit SecY  50.45 
 
 
440 aa  449  1e-125  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0487569  normal  0.382691 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5767  preprotein translocase, SecY subunit  53.15 
 
 
439 aa  444  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.800902 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1635  preprotein translocase subunit SecY  50.99 
 
 
447 aa  439  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0862  preprotein translocase, SecY subunit  49.78 
 
 
438 aa  435  1e-121  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.148817  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0177  preprotein translocase subunit SecY  47.52 
 
 
435 aa  412  1e-114  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.158062 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1831  preprotein translocase subunit SecY  48.78 
 
 
443 aa  414  1e-114  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.321149  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0309  preprotein translocase subunit SecY  47.88 
 
 
443 aa  410  1e-113  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0197098  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2209  preprotein translocase subunit SecY  47.44 
 
 
443 aa  402  1e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000211329  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2276  preprotein translocase subunit SecY  47.69 
 
 
441 aa  402  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000725785  hitchhiker  0.00410487 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2403  preprotein translocase subunit SecY  47.25 
 
 
443 aa  402  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0193161  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2044  preprotein translocase subunit SecY  48.56 
 
 
441 aa  399  9.999999999999999e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00113194  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0201  preprotein translocase subunit SecY  46.34 
 
 
443 aa  391  1e-107  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.124191  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  43.41 
 
 
429 aa  367  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  44.75 
 
 
442 aa  362  7.0000000000000005e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1856  preprotein translocase, SecY subunit  42.73 
 
 
446 aa  353  2e-96  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0112849  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  43.08 
 
 
445 aa  345  8e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  42.76 
 
 
435 aa  343  4e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  0.000000811889 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  42.73 
 
 
447 aa  342  7e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  41.72 
 
 
435 aa  342  1e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  41.5 
 
 
437 aa  341  1e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  42.57 
 
 
447 aa  341  2e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0721  preprotein translocase subunit SecY  42.17 
 
 
435 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  41.35 
 
 
435 aa  338  9.999999999999999e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3985  preprotein translocase, SecY subunit  42.47 
 
 
448 aa  336  5e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00342615  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  42.47 
 
 
420 aa  336  5.999999999999999e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  42.34 
 
 
447 aa  336  5.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  40.83 
 
 
435 aa  335  1e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0207  preprotein translocase, SecY subunit  41.21 
 
 
500 aa  333  3e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  41.55 
 
 
435 aa  332  1e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0305  preprotein translocase subunit SecY  43.51 
 
 
453 aa  331  2e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.398461 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1976  preprotein translocase subunit SecY  43.67 
 
 
446 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.923807  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2986  preprotein translocase subunit SecY  40.59 
 
 
448 aa  327  2.0000000000000001e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135734  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  41.1 
 
 
435 aa  326  5e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000602472 
 
 
-
 
NC_004310  BR1213  preprotein translocase subunit SecY  43.21 
 
 
446 aa  325  9e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1176  preprotein translocase subunit SecY  43.21 
 
 
446 aa  325  1e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0379017  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0235  preprotein translocase subunit SecY  41.74 
 
 
419 aa  324  2e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00849669  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0245  preprotein translocase subunit SecY  41.72 
 
 
424 aa  323  4e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.101058  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  39.68 
 
 
437 aa  322  7e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2144  preprotein translocase, SecY subunit  40.32 
 
 
447 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2459  preprotein translocase, SecY subunit  40.32 
 
 
447 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2181  preprotein translocase, SecY subunit  40.32 
 
 
447 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.318083 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0700  preprotein translocase subunit SecY  41.42 
 
 
435 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.418561  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  40.14 
 
 
443 aa  320  3e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  40.14 
 
 
443 aa  320  3e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  0.0000000000266535 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1269  preprotein translocase subunit SecY  41.93 
 
 
455 aa  320  3e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1726  preprotein translocase, SecY subunit  41.12 
 
 
435 aa  320  3e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000716119  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09800  preprotein translocase, SecY subunit  40.82 
 
 
427 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.141788  hitchhiker  0.0000395879 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0333  preprotein translocase, SecY subunit  40.5 
 
 
445 aa  319  7.999999999999999e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0275  preprotein translocase subunit SecY  41.65 
 
 
454 aa  318  9e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0794912  normal  0.75706 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0886  preprotein translocase subunit SecY  41.65 
 
 
418 aa  318  9e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.609907  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1360  preprotein translocase, SecY subunit  39.86 
 
 
423 aa  318  1e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2198  preprotein translocase, SecY subunit  40.54 
 
 
448 aa  318  1e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0470035  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1006  preprotein translocase subunit SecY  41.63 
 
 
446 aa  317  2e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38875  hitchhiker  0.00669682 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0306  preprotein translocase subunit SecY  40.55 
 
 
421 aa  317  3e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0894763  normal  0.194972 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1863  preprotein translocase subunit SecY  42.18 
 
 
446 aa  317  3e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1565  preprotein translocase subunit SecY  40.44 
 
 
443 aa  316  4e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.112443  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  40.22 
 
 
443 aa  316  5e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0778  preprotein translocase, SecY subunit  40.94 
 
 
430 aa  315  7e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000100686  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0680  preprotein translocase subunit SecY  39.03 
 
 
437 aa  315  9e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1926  preprotein translocase, SecY subunit  40.23 
 
 
449 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.796685  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0178  preprotein translocase subunit SecY  41.84 
 
 
446 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000408952  hitchhiker  0.00214614 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0780  preprotein translocase subunit SecY  41.04 
 
 
457 aa  315  9.999999999999999e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4670  preprotein translocase subunit SecY  41.51 
 
 
446 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000509869  unclonable  0.0000000121988 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4298  preprotein translocase subunit SecY  41.51 
 
 
446 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000258427  unclonable  0.0000000000837901 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  38.78 
 
 
437 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0251  preprotein translocase subunit SecY  42.09 
 
 
446 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2756  preprotein translocase, SecY subunit  40.5 
 
 
443 aa  313  2.9999999999999996e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.373135  normal  0.477854 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2313  preprotein translocase subunit SecY  40.91 
 
 
421 aa  313  2.9999999999999996e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0367996  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3739  preprotein translocase subunit SecY  42.19 
 
 
446 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000605107  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0219  preprotein translocase subunit SecY  42.09 
 
 
446 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000744124  unclonable  0.0000000000304117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0214  preprotein translocase subunit SecY  42.09 
 
 
446 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000092283  hitchhiker  0.00772115 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0219  preprotein translocase subunit SecY  42.09 
 
 
446 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000110874  hitchhiker  0.00000000176689 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1735  preprotein translocase subunit SecY  40.09 
 
 
452 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0979  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  41.76 
 
 
447 aa  313  4.999999999999999e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000479753  hitchhiker  0.00549319 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0381  preprotein translocase subunit SecY  39.86 
 
 
452 aa  312  6.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0233  preprotein translocase subunit SecY  41.53 
 
 
446 aa  312  9e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000181445  unclonable  0.0000105897 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0220  preprotein translocase subunit SecY  41.86 
 
 
446 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000798254  hitchhiker  0.00367272 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4150  preprotein translocase subunit SecY  41.86 
 
 
446 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000158721  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0216  preprotein translocase subunit SecY  41.86 
 
 
446 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000065492  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1928  preprotein translocase, SecY subunit  40.27 
 
 
445 aa  311  1e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4036  preprotein translocase subunit SecY  41.86 
 
 
446 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000184742  unclonable  0.00000000000435138 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2352  preprotein translocase subunit SecY  39.72 
 
 
441 aa  311  2e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299181  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3318  preprotein translocase subunit SecY  41.9 
 
 
441 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1352  preprotein translocase subunit SecY  42.76 
 
 
446 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0023208  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0442  preprotein translocase subunit SecY  41.29 
 
 
429 aa  310  4e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0718  preprotein translocase subunit SecY  40.36 
 
 
448 aa  310  5e-83  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.214912  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5050  preprotein translocase subunit SecY  40.72 
 
 
444 aa  309  5e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.478224  normal  0.981585 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00958  preprotein translocase subunit SecY  40.78 
 
 
434 aa  309  5.9999999999999995e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0058755  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0787  preprotein translocase subunit SecY  42.4 
 
 
442 aa  309  6.999999999999999e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0142235  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0425  preprotein translocase subunit SecY  42.56 
 
 
437 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.65116  normal  0.157207 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1246  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  37.42 
 
 
463 aa  308  1.0000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.031052  hitchhiker  0.00314824 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3686  preprotein translocase, SecY subunit  39.05 
 
 
441 aa  308  1.0000000000000001e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000792509  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01360  preprotein translocase, SecY subunit  42.56 
 
 
422 aa  308  2.0000000000000002e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000700723  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0607  preprotein translocase, SecY subunit  38.48 
 
 
429 aa  307  2.0000000000000002e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0598508  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>