263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2230 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2230  preprotein translocase subunit SecY  100 
 
 		 479 aa  954    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.408121  normal  0.455137 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0465  preprotein translocase subunit SecY  77.66 
 
 		 477 aa  777    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0104  preprotein translocase subunit SecY  72.5 
 
 		 479 aa  737    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0555  preprotein translocase subunit SecY  81.42 
 
 		 477 aa  800    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.323996 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0587  preprotein translocase subunit SecY  74.32 
 
 		 477 aa  755    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00173275  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0087  preprotein translocase subunit SecY  55.49 
 
 		 492 aa  542  1e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.023527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0024  preprotein translocase subunit SecY  55.92 
 
 		 492 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00318334  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2426  preprotein translocase subunit SecY  53.77 
 
 		 492 aa  478  1e-133  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0233  preprotein translocase, SecY subunit  53.44 
 
 		 489 aa  475  1e-133  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.520667  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1705  preprotein translocase subunit SecY  49.25 
 
 		 537 aa  460  9.999999999999999e-129  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.602032  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2241  preprotein translocase, SecY subunit  51.19 
 
 		 500 aa  449  1e-125  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1851  preprotein translocase subunit SecY  52.65 
 
 		 504 aa  442  1e-123  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.642367 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2315  preprotein translocase subunit SecY  49.8 
 
 		 491 aa  415  9.999999999999999e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.368701  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1498  preprotein translocase, SecY subunit  41.54 
 
 		 599 aa  365  1e-99  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.312314  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0667  preprotein translocase subunit SecY  36.88 
 
 		 442 aa  300  3e-80  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00940535 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1407  preprotein translocase subunit SecY  37.14 
 
 		 443 aa  299  7e-80  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.886151  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0733  preprotein translocase subunit SecY  37.27 
 
 		 443 aa  290  3e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.581929  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1251  preprotein translocase subunit SecY  36.72 
 
 		 442 aa  287  2e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.05624  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0156  preprotein translocase subunit SecY  36.72 
 
 		 442 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0114  preprotein translocase subunit SecY  29.3 
 
 		 463 aa  218  2e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.000000000441427  hitchhiker  0.00000810769 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_56443  transport protein Sec61 alpha subunit  29.16 
 
 		 559 aa  216  5e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27583  IISP family transporter: protein transport protein Sec61 alpha subunit  31.84 
 
 		 476 aa  216  7e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.527579  normal  0.285595 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0233  preprotein translocase subunit SecY  29.01 
 
 		 476 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.745222  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0402  preprotein translocase subunit SecY  29.12 
 
 		 476 aa  210  5e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.144908 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1755  Translocon Sec61/SecY, plug domain protein  29.33 
 
 		 469 aa  208  2e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.227644  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00040  protein transporter, putative  29.4 
 
 		 478 aa  206  1e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07721  hypothetical protein similar to Sec61 (Broad)  28.57 
 
 		 478 aa  197  5.000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0245702  normal  0.107035 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68832  Protein transport protein SEC61 alpha subunit  28.31 
 
 		 478 aa  195  1e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1304  preprotein translocase subunit SecY  28.48 
 
 		 459 aa  182  1e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.783086 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0964  preprotein translocase subunit SecY  28.37 
 
 		 460 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.905411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1874  preprotein translocase subunit SecY  28.17 
 
 		 465 aa  162  2e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.653631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1034  preprotein translocase subunit SecY  26.37 
 
 		 455 aa  158  3e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000391627 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1254  preprotein translocase subunit SecY  29.27 
 
 		 482 aa  157  6e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000145561 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80530  protein involved in co-translational pathway of protein transport  24.9 
 
 		 501 aa  123  6e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.453921 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1333  preprotein translocase subunit SecY  24.69 
 
 		 455 aa  80.5  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.158258 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  24.23 
 
 		 437 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2691  preprotein translocase, SecY subunit  23.53 
 
 		 430 aa  77.4  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.803147  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0735  preprotein translocase, SecY subunit  24.36 
 
 		 433 aa  73.6  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0680  preprotein translocase subunit SecY  22.92 
 
 		 437 aa  73.2  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0235  preprotein translocase subunit SecY  23.99 
 
 		 419 aa  68.2  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00849669  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2798  preprotein translocase subunit SecY  24.9 
 
 		 457 aa  67.8  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.558016 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4006  preprotein translocase, SecY subunit  23.78 
 
 		 450 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000605815  hitchhiker  0.000026914 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5022  preprotein translocase subunit SecY  23.28 
 
 		 445 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1165  preprotein translocase, SecY subunit  23.87 
 
 		 450 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000330141  normal  0.11389 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1685  preprotein translocase subunit SecY  21.82 
 
 		 421 aa  65.1  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0309  preprotein translocase subunit SecY  20.93 
 
 		 443 aa  64.7  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0197098  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1856  preprotein translocase subunit SecY  21.61 
 
 		 421 aa  64.3  0.000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0103  preprotein translocase subunit SecY  23.31 
 
 		 421 aa  63.9  0.000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2062  preprotein translocase subunit SecY  22.25 
 
 		 421 aa  63.9  0.000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3686  preprotein translocase, SecY subunit  22.35 
 
 		 441 aa  63.9  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000792509  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1634  preprotein translocase subunit SecY  24.22 
 
 		 452 aa  63.5  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0116955  normal  0.0410443 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04500  preprotein translocase subunit SecY  22.71 
 
 		 454 aa  62.8  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.705639  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3954  preprotein translocase, SecY subunit  24.26 
 
 		 434 aa  62.8  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1269  preprotein translocase subunit SecY  26.13 
 
 		 455 aa  63.2  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20670  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  23.41 
 
 		 439 aa  63.2  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3142  preprotein translocase subunit SecY  23.63 
 
 		 440 aa  62.8  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0487569  normal  0.382691 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  21.64 
 
 		 443 aa  62  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  21.64 
 
 		 443 aa  62  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  0.0000000000266535 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29540  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  22.83 
 
 		 429 aa  62  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.498773  normal  0.844433 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3397  preprotein translocase, SecY subunit  22.54 
 
 		 439 aa  62  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  22.15 
 
 		 437 aa  61.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16970  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  23.08 
 
 		 435 aa  60.8  0.00000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0174147  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0339  preprotein translocase subunit SecY  21.23 
 
 		 440 aa  60.5  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000142446  unclonable  0.0000000706243 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0306  preprotein translocase subunit SecY  23.17 
 
 		 421 aa  60.8  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0894763  normal  0.194972 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0607  preprotein translocase, SecY subunit  22.65 
 
 		 429 aa  60.5  0.00000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0598508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6029  preprotein translocase subunit SecY  22.75 
 
 		 430 aa  60.5  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2412  preprotein translocase subunit SecY  21.74 
 
 		 434 aa  59.7  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00625491  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0504  preprotein translocase subunit SecY  22.69 
 
 		 443 aa  59.7  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00015304  normal  0.032999 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2135  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  23.31 
 
 		 428 aa  60.1  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233384  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  23.21 
 
 		 435 aa  59.3  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1843  preprotein translocase subunit SecY  23.16 
 
 		 434 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.019643  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2403  preprotein translocase subunit SecY  22.52 
 
 		 443 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0193161  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1147  preprotein translocase, SecY subunit  21.86 
 
 		 445 aa  58.9  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2545  preprotein translocase subunit SecY  22.47 
 
 		 434 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000778926 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2469  preprotein translocase subunit SecY  22.27 
 
 		 434 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0545369  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0509  preprotein translocase subunit SecY  22.67 
 
 		 443 aa  58.9  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0470282  hitchhiker  0.00397274 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0778  preprotein translocase, SecY subunit  21.83 
 
 		 430 aa  58.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000100686  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0245  preprotein translocase subunit SecY  24.05 
 
 		 471 aa  58.9  0.0000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0979  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  24.51 
 
 		 447 aa  58.9  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000479753  hitchhiker  0.00549319 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2756  preprotein translocase, SecY subunit  23.38 
 
 		 443 aa  58.9  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.373135  normal  0.477854 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0776  preprotein translocase subunit SecY  22.57 
 
 		 455 aa  58.9  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal  0.028717 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2599  preprotein translocase subunit SecY  25.17 
 
 		 440 aa  58.2  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0785292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4729  preprotein translocase subunit SecY  23.09 
 
 		 443 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0376135  normal  0.430849 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15058  IISP family transporter: preprotein translocase SecY subunit  24.15 
 
 		 423 aa  58.2  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0295736  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0507  preprotein translocase subunit SecY  23.09 
 
 		 443 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0640452  normal  0.0135524 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2209  preprotein translocase subunit SecY  22.36 
 
 		 443 aa  58.2  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000211329  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3885  preprotein translocase subunit SecY  24.11 
 
 		 437 aa  58.2  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5050  preprotein translocase subunit SecY  22.74 
 
 		 444 aa  57.8  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.478224  normal  0.981585 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2747  preprotein translocase subunit SecY  22.27 
 
 		 434 aa  57.8  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.787541  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0305  preprotein translocase subunit SecY  25.93 
 
 		 420 aa  57.4  0.0000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3889  preprotein translocase subunit SecY  22.88 
 
 		 442 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000822061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2742  preprotein translocase subunit SecY  21.97 
 
 		 434 aa  57  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53667e-23 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1374  preprotein translocase subunit SecY  23.22 
 
 		 431 aa  57  0.0000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0289241  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0446  preprotein translocase subunit SecY  21.91 
 
 		 443 aa  57  0.0000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000813945  hitchhiker  0.000170824 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1504  preprotein translocase subunit SecY  21.83 
 
 		 419 aa  57  0.0000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10746  preprotein translocase subunit SecY  22.2 
 
 		 441 aa  56.6  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.329828 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2503  preprotein translocase subunit SecY  21.97 
 
 		 434 aa  56.6  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000332806  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0646  preprotein translocase, SecY subunit  22.73 
 
 		 444 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.617938  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0078  preprotein translocase subunit SecY  22.01 
 
 		 420 aa  56.6  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1046  preprotein translocase subunit SecY  20.82 
 
 		 441 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303562  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>