More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0235 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0245  preprotein translocase subunit SecY  75.84 
 
 
424 aa  658    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.101058  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0235  preprotein translocase subunit SecY  100 
 
 
419 aa  833    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00849669  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0306  preprotein translocase subunit SecY  78.15 
 
 
421 aa  655    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0894763  normal  0.194972 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1504  preprotein translocase subunit SecY  71.84 
 
 
419 aa  605  9.999999999999999e-173  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  64.37 
 
 
420 aa  551  1e-156  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2313  preprotein translocase subunit SecY  66.35 
 
 
421 aa  544  1e-154  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0367996  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0886  preprotein translocase subunit SecY  60.38 
 
 
418 aa  538  9.999999999999999e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.609907  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0442  preprotein translocase subunit SecY  59.63 
 
 
429 aa  511  1e-144  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0214  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  59.52 
 
 
419 aa  469  1.0000000000000001e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.32801  normal  0.494063 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1726  preprotein translocase, SecY subunit  53.79 
 
 
435 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000716119  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0778  preprotein translocase, SecY subunit  54.97 
 
 
430 aa  461  9.999999999999999e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000100686  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  51.85 
 
 
435 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  52.18 
 
 
435 aa  448  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  0.000000811889 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  52.91 
 
 
435 aa  449  1e-125  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  52.53 
 
 
429 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  51.75 
 
 
435 aa  442  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1164  preprotein translocase, SecY subunit  55.24 
 
 
431 aa  442  1e-123  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  51.04 
 
 
437 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  53.86 
 
 
445 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2923  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  53.63 
 
 
427 aa  432  1e-120  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000208113  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  50.23 
 
 
435 aa  432  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  50 
 
 
435 aa  427  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000602472 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2135  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  51.52 
 
 
428 aa  421  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233384  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  51.67 
 
 
447 aa  419  1e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  49.66 
 
 
437 aa  419  1e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  51.43 
 
 
447 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  49.19 
 
 
437 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0700  preprotein translocase subunit SecY  50 
 
 
435 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.418561  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01360  preprotein translocase, SecY subunit  52.68 
 
 
422 aa  417  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000700723  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1856  preprotein translocase, SecY subunit  51.14 
 
 
446 aa  410  1e-113  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0112849  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  47.17 
 
 
443 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2756  preprotein translocase, SecY subunit  48.8 
 
 
443 aa  405  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.373135  normal  0.477854 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0721  preprotein translocase subunit SecY  46.65 
 
 
435 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  50.23 
 
 
447 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  47.17 
 
 
443 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  0.0000000000266535 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  48.33 
 
 
442 aa  408  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3985  preprotein translocase, SecY subunit  50.57 
 
 
448 aa  403  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00342615  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1000  preprotein translocase, SecY subunit  48.11 
 
 
419 aa  404  1e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00382146  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3889  preprotein translocase subunit SecY  49.76 
 
 
442 aa  403  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000822061  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0474  preprotein translocase subunit SecY  48.56 
 
 
443 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.733359  hitchhiker  0.00000433507 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  48.1 
 
 
443 aa  401  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5059  preprotein translocase subunit SecY  47.96 
 
 
442 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000898122  normal  0.284155 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00958  preprotein translocase subunit SecY  49.41 
 
 
434 aa  401  9.999999999999999e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0058755  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1565  preprotein translocase subunit SecY  47.87 
 
 
443 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.112443  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0504  preprotein translocase subunit SecY  48.56 
 
 
443 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390206  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1118  preprotein translocase subunit SecY  46.99 
 
 
428 aa  399  9.999999999999999e-111  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.348488  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0178  preprotein translocase subunit SecY  48.8 
 
 
446 aa  395  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000408952  hitchhiker  0.00214614 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0646  preprotein translocase, SecY subunit  47.84 
 
 
444 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.617938  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0857  preprotein translocase subunit SecY  48.56 
 
 
442 aa  398  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4528  preprotein translocase subunit SecY  47.84 
 
 
444 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.447133  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0507  preprotein translocase subunit SecY  48.32 
 
 
443 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0640452  normal  0.0135524 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5050  preprotein translocase subunit SecY  46.68 
 
 
444 aa  395  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.478224  normal  0.981585 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0441  preprotein translocase subunit SecY  49.52 
 
 
443 aa  396  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4729  preprotein translocase subunit SecY  48.32 
 
 
443 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0376135  normal  0.430849 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09050  preprotein translocase subunit SecY  48.56 
 
 
442 aa  398  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.224184 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0680  preprotein translocase subunit SecY  47 
 
 
437 aa  396  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3318  preprotein translocase subunit SecY  46.82 
 
 
441 aa  392  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1863  preprotein translocase subunit SecY  47.06 
 
 
446 aa  393  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1106  protein translocase subunit SecY/sec61 alpha  47.86 
 
 
438 aa  392  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.105713 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1831  preprotein translocase subunit SecY  47.59 
 
 
443 aa  394  1e-108  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.321149  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2237  preprotein translocase subunit SecY  50.47 
 
 
437 aa  393  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.104557  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4298  preprotein translocase subunit SecY  48.33 
 
 
446 aa  394  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000258427  unclonable  0.0000000000837901 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0233  preprotein translocase subunit SecY  48.22 
 
 
446 aa  392  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000181445  unclonable  0.0000105897 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0739  preprotein translocase subunit SecY  48.92 
 
 
440 aa  394  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00521081  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4670  preprotein translocase subunit SecY  48.09 
 
 
446 aa  394  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000509869  unclonable  0.0000000121988 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0309  preprotein translocase subunit SecY  47.29 
 
 
443 aa  394  1e-108  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0197098  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1006  preprotein translocase subunit SecY  46.82 
 
 
446 aa  389  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38875  hitchhiker  0.00669682 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4778  preprotein translocase subunit SecY  49.28 
 
 
444 aa  390  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000420552 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0787  preprotein translocase subunit SecY  48.33 
 
 
442 aa  389  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0142235  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0333  preprotein translocase, SecY subunit  48.33 
 
 
445 aa  390  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0299  preprotein translocase subunit SecY  49.52 
 
 
440 aa  389  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000631755  hitchhiker  0.00000321163 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4487  preprotein translocase, SecY subunit  48.65 
 
 
436 aa  390  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0168  preprotein translocase subunit SecY  48.69 
 
 
446 aa  389  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000114541  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0973  preprotein translocase subunit SecY  47.92 
 
 
428 aa  390  1e-107  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4256  preprotein translocase subunit SecY  49.76 
 
 
443 aa  387  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193642  unclonable  0.00000000000448849 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0130  preprotein translocase subunit SecY  47.82 
 
 
433 aa  385  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0066731  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0130  preprotein translocase subunit SecY  47.82 
 
 
433 aa  385  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00164171  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2158  preprotein translocase, SecY subunit  48.38 
 
 
426 aa  386  1e-106  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00470545  normal  0.460281 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0126  preprotein translocase subunit SecY  47.82 
 
 
433 aa  385  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0265701  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0124  preprotein translocase subunit SecY  47.82 
 
 
433 aa  385  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.64549  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0862  preprotein translocase, SecY subunit  47.58 
 
 
438 aa  385  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.148817  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0339  preprotein translocase subunit SecY  45.65 
 
 
440 aa  385  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000142446  unclonable  0.0000000706243 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1352  preprotein translocase subunit SecY  47.88 
 
 
446 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0023208  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0130  preprotein translocase subunit SecY  47.82 
 
 
433 aa  385  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00952483  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0602  preprotein translocase subunit SecY  47.13 
 
 
430 aa  385  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.637505  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1009  preprotein translocase subunit SecY  48.93 
 
 
439 aa  386  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00114462  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6029  preprotein translocase subunit SecY  46.9 
 
 
430 aa  386  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1374  preprotein translocase subunit SecY  46.54 
 
 
431 aa  385  1e-106  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0289241  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0161  preprotein translocase subunit SecY  47.82 
 
 
433 aa  385  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000198533  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6594  preprotein translocase subunit SecY  48.2 
 
 
436 aa  388  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0131  preprotein translocase subunit SecY  48.27 
 
 
430 aa  385  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.129381  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0425  preprotein translocase subunit SecY  47.37 
 
 
437 aa  385  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.65116  normal  0.157207 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2668  preprotein translocase subunit SecY  47.87 
 
 
447 aa  382  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0190  preprotein translocase subunit SecY  48.93 
 
 
446 aa  384  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000711222  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0340  preprotein translocase subunit SecY  47.53 
 
 
443 aa  383  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00542322  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2276  preprotein translocase subunit SecY  46.77 
 
 
441 aa  385  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000725785  hitchhiker  0.00410487 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2742  preprotein translocase subunit SecY  47.69 
 
 
434 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53667e-23 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2198  preprotein translocase, SecY subunit  49.05 
 
 
448 aa  382  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0470035  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1312  preprotein translocase subunit SecY  47.47 
 
 
431 aa  382  1e-105  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000457849  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09800  preprotein translocase, SecY subunit  47.45 
 
 
427 aa  384  1e-105  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.141788  hitchhiker  0.0000395879 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>