More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1831 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2276  preprotein translocase subunit SecY  86.85 
 
 		 441 aa  783    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000725785  hitchhiker  0.00410487 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0201  preprotein translocase subunit SecY  86.46 
 
 		 443 aa  753    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.124191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1831  preprotein translocase subunit SecY  100 
 
 		 443 aa  886    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.321149  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0309  preprotein translocase subunit SecY  88.94 
 
 		 443 aa  811    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0197098  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2209  preprotein translocase subunit SecY  88.44 
 
 		 443 aa  780    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000211329  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2044  preprotein translocase subunit SecY  88.66 
 
 		 441 aa  769    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00113194  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2403  preprotein translocase subunit SecY  88.21 
 
 		 443 aa  776    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0193161  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0862  preprotein translocase, SecY subunit  62.59 
 
 		 438 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.148817  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4363  preprotein translocase subunit SecY  50.67 
 
 		 437 aa  449  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0120386  normal  0.169527 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0622  preprotein translocase, SecY subunit  51.02 
 
 		 444 aa  444  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.925436 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  51.26 
 
 		 435 aa  445  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1918  preprotein translocase subunit SecY  53.14 
 
 		 446 aa  439  9.999999999999999e-123  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  48.42 
 
 		 437 aa  435  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1635  preprotein translocase subunit SecY  52.47 
 
 		 447 aa  437  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  47.51 
 
 		 435 aa  426  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  0.000000811889 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  47.73 
 
 		 435 aa  426  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  47.29 
 
 		 435 aa  427  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  49.54 
 
 		 429 aa  425  1e-118  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  48.84 
 
 		 420 aa  422  1e-117  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  46.83 
 
 		 435 aa  423  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000602472 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0377  preprotein translocase subunit SecY  47.54 
 
 		 448 aa  419  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  45.91 
 
 		 435 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5767  preprotein translocase, SecY subunit  52.7 
 
 		 439 aa  416  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.800902 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  49.31 
 
 		 447 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  50.7 
 
 		 445 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  49.31 
 
 		 447 aa  418  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  48.53 
 
 		 437 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  48.29 
 
 		 437 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0700  preprotein translocase subunit SecY  47.74 
 
 		 435 aa  414  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.418561  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1167  preprotein translocase subunit SecY  48.78 
 
 		 447 aa  409  1e-113  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.221673  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  48.85 
 
 		 447 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3142  preprotein translocase subunit SecY  47.85 
 
 		 440 aa  409  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0487569  normal  0.382691 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0721  preprotein translocase subunit SecY  48.17 
 
 		 435 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2237  preprotein translocase subunit SecY  48.75 
 
 		 437 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.104557  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05820  preprotein translocase SecY  49.1 
 
 		 447 aa  406  1.0000000000000001e-112  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0177  preprotein translocase subunit SecY  48.08 
 
 		 435 aa  407  1.0000000000000001e-112  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.158062 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3985  preprotein translocase, SecY subunit  47.98 
 
 		 448 aa  402  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  46.19 
 
 		 442 aa  400  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_004310  BR1213  preprotein translocase subunit SecY  46.5 
 
 		 446 aa  397  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1976  preprotein translocase subunit SecY  46.05 
 
 		 446 aa  395  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.923807  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0245  preprotein translocase subunit SecY  47.62 
 
 		 424 aa  398  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.101058  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1176  preprotein translocase subunit SecY  46.5 
 
 		 446 aa  397  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0379017  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1006  preprotein translocase subunit SecY  45.64 
 
 		 446 aa  394  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38875  hitchhiker  0.00669682 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2045  preprotein translocase, SecY subunit  48.51 
 
 		 435 aa  392  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000027617  hitchhiker  0.00154147 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2754  preprotein translocase, SecY subunit  46.99 
 
 		 437 aa  395  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2313  preprotein translocase subunit SecY  46.99 
 
 		 421 aa  392  1e-108  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0367996  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0680  preprotein translocase subunit SecY  45.48 
 
 		 437 aa  389  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  44.5 
 
 		 443 aa  385  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  0.0000000000266535 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  44.5 
 
 		 443 aa  385  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0235  preprotein translocase subunit SecY  46.77 
 
 		 419 aa  385  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00849669  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0718  preprotein translocase subunit SecY  45.39 
 
 		 448 aa  382  1e-105  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.214912  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2756  preprotein translocase, SecY subunit  44.91 
 
 		 443 aa  384  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.373135  normal  0.477854 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1863  preprotein translocase subunit SecY  44.98 
 
 		 446 aa  379  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  43.88 
 
 		 443 aa  380  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2986  preprotein translocase subunit SecY  44.29 
 
 		 448 aa  376  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0305  preprotein translocase subunit SecY  44.65 
 
 		 453 aa  377  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.398461 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0315  preprotein translocase subunit SecY  44.32 
 
 		 437 aa  377  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0598799  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0306  preprotein translocase subunit SecY  45.62 
 
 		 421 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0894763  normal  0.194972 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0787  preprotein translocase subunit SecY  43.95 
 
 		 442 aa  378  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0142235  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4301  preprotein translocase, SecY subunit  45.35 
 
 		 432 aa  375  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1565  preprotein translocase subunit SecY  43.98 
 
 		 443 aa  378  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.112443  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0333  preprotein translocase, SecY subunit  43.25 
 
 		 445 aa  376  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0214  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  46.62 
 
 		 419 aa  375  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.32801  normal  0.494063 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0442  preprotein translocase subunit SecY  47.29 
 
 		 429 aa  376  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0886  preprotein translocase subunit SecY  46.15 
 
 		 418 aa  375  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.609907  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1352  preprotein translocase subunit SecY  45.31 
 
 		 446 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0023208  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0339  preprotein translocase subunit SecY  43.15 
 
 		 440 aa  373  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000142446  unclonable  0.0000000706243 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1450  preprotein translocase subunit SecY  44.27 
 
 		 446 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337945  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1246  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  43.75 
 
 		 463 aa  375  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.031052  hitchhiker  0.00314824 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1726  preprotein translocase, SecY subunit  44.57 
 
 		 435 aa  372  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000716119  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1856  preprotein translocase, SecY subunit  43.85 
 
 		 446 aa  373  1e-102  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0112849  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1926  preprotein translocase, SecY subunit  42.92 
 
 		 449 aa  370  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.796685  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0857  preprotein translocase subunit SecY  45.35 
 
 		 442 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0646  preprotein translocase, SecY subunit  45.27 
 
 		 444 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.617938  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5050  preprotein translocase subunit SecY  42.59 
 
 		 444 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.478224  normal  0.981585 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4528  preprotein translocase subunit SecY  45.27 
 
 		 444 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.447133  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2198  preprotein translocase, SecY subunit  43.81 
 
 		 448 aa  369  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0470035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0425  preprotein translocase subunit SecY  43.99 
 
 		 437 aa  369  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.65116  normal  0.157207 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1735  preprotein translocase subunit SecY  44.5 
 
 		 452 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2668  preprotein translocase subunit SecY  44.8 
 
 		 447 aa  370  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1504  preprotein translocase subunit SecY  44.7 
 
 		 419 aa  370  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0381  preprotein translocase subunit SecY  44.5 
 
 		 452 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09050  preprotein translocase subunit SecY  45.35 
 
 		 442 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.224184 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1374  preprotein translocase, SecY subunit  44.16 
 
 		 444 aa  370  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285774  normal  0.105212 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0207  preprotein translocase, SecY subunit  42.89 
 
 		 500 aa  371  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1164  preprotein translocase, SecY subunit  45.79 
 
 		 431 aa  370  1e-101  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3889  preprotein translocase subunit SecY  45.12 
 
 		 442 aa  367  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000822061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4778  preprotein translocase subunit SecY  43.35 
 
 		 444 aa  368  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000420552 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5059  preprotein translocase subunit SecY  44.65 
 
 		 442 aa  365  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000898122  normal  0.284155 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2315  preprotein translocase subunit SecY  43.55 
 
 		 443 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.775008  normal  0.296135 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1928  preprotein translocase, SecY subunit  43.18 
 
 		 445 aa  368  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0560  preprotein translocase, SecY subunit  43.96 
 
 		 442 aa  368  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01360  preprotein translocase, SecY subunit  46.99 
 
 		 422 aa  365  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000700723  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3647  preprotein translocase subunit SecY  43.32 
 
 		 443 aa  365  1e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0780  preprotein translocase subunit SecY  43.54 
 
 		 457 aa  365  1e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0275  preprotein translocase subunit SecY  44.54 
 
 		 454 aa  364  2e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0794912  normal  0.75706 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4729  preprotein translocase subunit SecY  43.88 
 
 		 443 aa  364  2e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0376135  normal  0.430849 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0507  preprotein translocase subunit SecY  43.88 
 
 		 443 aa  364  2e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0640452  normal  0.0135524 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3164  preprotein translocase subunit SecY  43.32 
 
 		 443 aa  363  3e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0194839  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0504  preprotein translocase subunit SecY  43.88 
 
 		 443 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390206  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>