136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0233 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0233  preprotein translocase subunit SecY  100 
 
 		 476 aa  936    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.745222  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0402  preprotein translocase subunit SecY  40.77 
 
 		 476 aa  347  2e-94  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.144908 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1755  Translocon Sec61/SecY, plug domain protein  38.92 
 
 		 469 aa  330  4e-89  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.227644  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0114  preprotein translocase subunit SecY  39.12 
 
 		 463 aa  318  1e-85  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.000000000441427  hitchhiker  0.00000810769 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1407  preprotein translocase subunit SecY  37.53 
 
 		 443 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.886151  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1304  preprotein translocase subunit SecY  37.37 
 
 		 459 aa  295  1e-78  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.783086 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0667  preprotein translocase subunit SecY  37.37 
 
 		 442 aa  289  8e-77  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00940535 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1874  preprotein translocase subunit SecY  38.72 
 
 		 465 aa  286  4e-76  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.653631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1034  preprotein translocase subunit SecY  37.74 
 
 		 455 aa  281  2e-74  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000391627 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0964  preprotein translocase subunit SecY  36.83 
 
 		 460 aa  279  7e-74  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.905411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1251  preprotein translocase subunit SecY  38.06 
 
 		 442 aa  279  9e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.05624  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27583  IISP family transporter: protein transport protein Sec61 alpha subunit  35.28 
 
 		 476 aa  276  8e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.527579  normal  0.285595 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0156  preprotein translocase subunit SecY  36.73 
 
 		 442 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_56443  transport protein Sec61 alpha subunit  35.37 
 
 		 559 aa  275  2.0000000000000002e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0733  preprotein translocase subunit SecY  35.01 
 
 		 443 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.581929  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07721  hypothetical protein similar to Sec61 (Broad)  35.43 
 
 		 478 aa  258  1e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0245702  normal  0.107035 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00040  protein transporter, putative  33.19 
 
 		 478 aa  249  7e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1254  preprotein translocase subunit SecY  34.93 
 
 		 482 aa  248  2e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000145561 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68832  Protein transport protein SEC61 alpha subunit  33.69 
 
 		 478 aa  245  9.999999999999999e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0465  preprotein translocase subunit SecY  30.72 
 
 		 477 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2230  preprotein translocase subunit SecY  29.01 
 
 		 479 aa  231  2e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.408121  normal  0.455137 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0087  preprotein translocase subunit SecY  32.12 
 
 		 492 aa  230  4e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.023527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0587  preprotein translocase subunit SecY  30.82 
 
 		 477 aa  230  4e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00173275  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0104  preprotein translocase subunit SecY  30.69 
 
 		 479 aa  229  9e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1498  preprotein translocase, SecY subunit  31.27 
 
 		 599 aa  229  1e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.312314  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0555  preprotein translocase subunit SecY  30.02 
 
 		 477 aa  222  9e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.323996 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0233  preprotein translocase, SecY subunit  31.7 
 
 		 489 aa  216  5.9999999999999996e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.520667  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0024  preprotein translocase subunit SecY  32.11 
 
 		 492 aa  216  7e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00318334  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2426  preprotein translocase subunit SecY  31.97 
 
 		 492 aa  215  1.9999999999999998e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2241  preprotein translocase, SecY subunit  30.47 
 
 		 500 aa  212  1e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1851  preprotein translocase subunit SecY  30.75 
 
 		 504 aa  198  2.0000000000000003e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.642367 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1705  preprotein translocase subunit SecY  31.53 
 
 		 537 aa  195  2e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.602032  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2315  preprotein translocase subunit SecY  30.33 
 
 		 491 aa  175  1.9999999999999998e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.368701  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80530  protein involved in co-translational pathway of protein transport  28.35 
 
 		 501 aa  137  3.0000000000000003e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.453921 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1000  preprotein translocase, SecY subunit  23.49 
 
 		 419 aa  74.3  0.000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00382146  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0622  preprotein translocase, SecY subunit  22.76 
 
 		 444 aa  63.2  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.925436 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  22.83 
 
 		 437 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2237  preprotein translocase subunit SecY  23.65 
 
 		 437 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.104557  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  23.83 
 
 		 437 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0326  preprotein translocase subunit SecY  24.6 
 
 		 437 aa  61.6  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000568003 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4295  preprotein translocase subunit SecY  22.52 
 
 		 441 aa  61.2  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00554636 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0680  preprotein translocase subunit SecY  22.84 
 
 		 437 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1811  preprotein translocase subunit SecY  21.88 
 
 		 430 aa  58.5  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.741103  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3903  preprotein translocase subunit SecY  22.11 
 
 		 441 aa  58.5  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.340332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3885  preprotein translocase subunit SecY  23.41 
 
 		 437 aa  57.8  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  21.77 
 
 		 420 aa  57.4  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  22.58 
 
 		 435 aa  55.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2691  preprotein translocase, SecY subunit  20.82 
 
 		 430 aa  55.1  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.803147  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09800  preprotein translocase, SecY subunit  22.36 
 
 		 427 aa  54.7  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.141788  hitchhiker  0.0000395879 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  22.2 
 
 		 435 aa  54.3  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  0.000000811889 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2257  preprotein translocase subunit SecY  22.29 
 
 		 430 aa  54.3  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0110363  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10746  preprotein translocase subunit SecY  22.75 
 
 		 441 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.329828 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2298  preprotein translocase subunit SecY  22.29 
 
 		 430 aa  54.3  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4301  preprotein translocase, SecY subunit  22.33 
 
 		 432 aa  53.9  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1856  preprotein translocase, SecY subunit  22.56 
 
 		 446 aa  53.5  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0112849  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4487  preprotein translocase, SecY subunit  25.59 
 
 		 436 aa  53.5  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0078  preprotein translocase subunit SecY  20.21 
 
 		 434 aa  52  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0917629  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1046  preprotein translocase subunit SecY  22.19 
 
 		 441 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303562  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1062  preprotein translocase subunit SecY  22.19 
 
 		 441 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160681  normal  0.323313 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1074  preprotein translocase subunit SecY  22.19 
 
 		 441 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5022  preprotein translocase subunit SecY  24.19 
 
 		 445 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  21.34 
 
 		 435 aa  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  22.53 
 
 		 437 aa  52  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6594  preprotein translocase subunit SecY  21.59 
 
 		 436 aa  51.6  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0607  preprotein translocase, SecY subunit  23.01 
 
 		 429 aa  51.6  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0598508  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2503  preprotein translocase subunit SecY  21.53 
 
 		 434 aa  51.2  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000332806  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2158  preprotein translocase, SecY subunit  21.77 
 
 		 426 aa  51.2  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00470545  normal  0.460281 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0778  preprotein translocase, SecY subunit  22.46 
 
 		 430 aa  50.8  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000100686  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3954  preprotein translocase, SecY subunit  21.5 
 
 		 434 aa  50.8  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1269  preprotein translocase subunit SecY  22.24 
 
 		 455 aa  50.4  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0125  preprotein translocase subunit SecY  21.4 
 
 		 433 aa  50.4  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00395698  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0207  preprotein translocase, SecY subunit  23.77 
 
 		 500 aa  50.1  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0739  preprotein translocase subunit SecY  20.75 
 
 		 440 aa  49.3  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00521081  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5175  preprotein translocase subunit SecY  21.19 
 
 		 433 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000485174  unclonable  4.1263e-25 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0787  preprotein translocase subunit SecY  22.67 
 
 		 438 aa  48.9  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000240861  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2135  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  21 
 
 		 428 aa  49.3  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233384  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0700  preprotein translocase subunit SecY  22.92 
 
 		 435 aa  48.5  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.418561  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16970  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  24.57 
 
 		 435 aa  49.3  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0174147  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2747  preprotein translocase subunit SecY  20.27 
 
 		 434 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.787541  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2545  preprotein translocase subunit SecY  19.95 
 
 		 434 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000778926 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2742  preprotein translocase subunit SecY  21.3 
 
 		 434 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53667e-23 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29540  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  23.98 
 
 		 429 aa  48.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.498773  normal  0.844433 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0151  preprotein translocase subunit SecY  21.36 
 
 		 433 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0158065  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0130  preprotein translocase subunit SecY  21.36 
 
 		 433 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0066731  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0130  preprotein translocase subunit SecY  21.36 
 
 		 433 aa  48.1  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00164171  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0126  preprotein translocase subunit SecY  21.36 
 
 		 433 aa  48.1  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0265701  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0124  preprotein translocase subunit SecY  21.36 
 
 		 433 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.64549  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0130  preprotein translocase subunit SecY  21.36 
 
 		 433 aa  48.1  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00952483  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01360  preprotein translocase, SecY subunit  26.39 
 
 		 422 aa  48.1  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000700723  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1347  preprotein translocase subunit SecY  24.39 
 
 		 445 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1554  preprotein translocase, SecY subunit  26.26 
 
 		 424 aa  47.8  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0492066  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0161  preprotein translocase subunit SecY  21.36 
 
 		 433 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000198533  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20670  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  21.99 
 
 		 439 aa  47.4  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0215  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  21.23 
 
 		 444 aa  47  0.0007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0593  preprotein translocase subunit SecY  22.29 
 
 		 436 aa  47  0.0008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00290187  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2412  preprotein translocase subunit SecY  20.05 
 
 		 434 aa  46.6  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00625491  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0245  preprotein translocase subunit SecY  23.31 
 
 		 424 aa  46.6  0.0009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.101058  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2887  preprotein translocase, SecY subunit  24.11 
 
 		 441 aa  46.6  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0626195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2734  preprotein translocase subunit SecY  21.06 
 
 		 434 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.356112  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0787  preprotein translocase subunit SecY  22.08 
 
 		 442 aa  46.2  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0142235  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>