37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_68832 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001304  ANIA_07721  hypothetical protein similar to Sec61 (Broad)  68.72 
 
 		 478 aa  687    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0245702  normal  0.107035 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68832  Protein transport protein SEC61 alpha subunit  100 
 
 		 478 aa  964    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00040  protein transporter, putative  63.79 
 
 		 478 aa  629  1e-179  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27583  IISP family transporter: protein transport protein Sec61 alpha subunit  54.62 
 
 		 476 aa  551  1e-155  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.527579  normal  0.285595 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_56443  transport protein Sec61 alpha subunit  54.64 
 
 		 559 aa  542  1e-153  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0402  preprotein translocase subunit SecY  36.62 
 
 		 476 aa  290  3e-77  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.144908 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1407  preprotein translocase subunit SecY  33.48 
 
 		 443 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.886151  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80530  protein involved in co-translational pathway of protein transport  34.24 
 
 		 501 aa  244  1.9999999999999999e-63  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.453921 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0233  preprotein translocase subunit SecY  33.69 
 
 		 476 aa  239  1e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.745222  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0667  preprotein translocase subunit SecY  31.91 
 
 		 442 aa  229  1e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00940535 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0733  preprotein translocase subunit SecY  33.04 
 
 		 443 aa  224  4e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.581929  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1251  preprotein translocase subunit SecY  32.62 
 
 		 442 aa  218  1e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.05624  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0156  preprotein translocase subunit SecY  32.62 
 
 		 442 aa  218  1e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1498  preprotein translocase, SecY subunit  32.22 
 
 		 599 aa  218  2e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.312314  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1755  Translocon Sec61/SecY, plug domain protein  31.57 
 
 		 469 aa  216  7e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.227644  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0587  preprotein translocase subunit SecY  30.98 
 
 		 477 aa  204  2e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00173275  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2230  preprotein translocase subunit SecY  28.11 
 
 		 479 aa  204  3e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.408121  normal  0.455137 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0465  preprotein translocase subunit SecY  29.58 
 
 		 477 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0087  preprotein translocase subunit SecY  30.36 
 
 		 492 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.023527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0114  preprotein translocase subunit SecY  29.67 
 
 		 463 aa  197  4.0000000000000005e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.000000000441427  hitchhiker  0.00000810769 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0104  preprotein translocase subunit SecY  29.84 
 
 		 479 aa  196  6e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0555  preprotein translocase subunit SecY  29.14 
 
 		 477 aa  196  7e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.323996 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2426  preprotein translocase subunit SecY  29.86 
 
 		 492 aa  195  1e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0233  preprotein translocase, SecY subunit  27.87 
 
 		 489 aa  182  1e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.520667  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1304  preprotein translocase subunit SecY  27.06 
 
 		 459 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.783086 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1034  preprotein translocase subunit SecY  29.35 
 
 		 455 aa  172  1e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000391627 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2241  preprotein translocase, SecY subunit  28.51 
 
 		 500 aa  172  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0024  preprotein translocase subunit SecY  28.02 
 
 		 492 aa  171  2e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00318334  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1851  preprotein translocase subunit SecY  28.74 
 
 		 504 aa  172  2e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.642367 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1254  preprotein translocase subunit SecY  29.34 
 
 		 482 aa  169  1e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000145561 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1705  preprotein translocase subunit SecY  27.84 
 
 		 537 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.602032  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0964  preprotein translocase subunit SecY  27 
 
 		 460 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.905411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1874  preprotein translocase subunit SecY  26.3 
 
 		 465 aa  152  1e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.653631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2315  preprotein translocase subunit SecY  28.94 
 
 		 491 aa  151  3e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.368701  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0496  preprotein translocase, SecY subunit  22.78 
 
 		 456 aa  50.1  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.437531  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0680  preprotein translocase subunit SecY  22.25 
 
 		 437 aa  43.9  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0207  preprotein translocase, SecY subunit  22.03 
 
 		 500 aa  43.5  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>