59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0964 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1034  preprotein translocase subunit SecY  78.09 
 
 		 455 aa  684    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000391627 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1874  preprotein translocase subunit SecY  80.65 
 
 		 465 aa  693    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.653631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0964  preprotein translocase subunit SecY  100 
 
 		 460 aa  900    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.905411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1304  preprotein translocase subunit SecY  85.22 
 
 		 459 aa  774    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.783086 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1254  preprotein translocase subunit SecY  43.8 
 
 		 482 aa  315  9.999999999999999e-85  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000145561 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0233  preprotein translocase subunit SecY  37.45 
 
 		 476 aa  281  1e-74  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.745222  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1755  Translocon Sec61/SecY, plug domain protein  35.15 
 
 		 469 aa  250  4e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.227644  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0114  preprotein translocase subunit SecY  33.47 
 
 		 463 aa  246  6e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.000000000441427  hitchhiker  0.00000810769 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0402  preprotein translocase subunit SecY  32.3 
 
 		 476 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.144908 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2426  preprotein translocase subunit SecY  30.48 
 
 		 492 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_56443  transport protein Sec61 alpha subunit  29.38 
 
 		 559 aa  194  2e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0465  preprotein translocase subunit SecY  28.89 
 
 		 477 aa  193  4e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1407  preprotein translocase subunit SecY  29.13 
 
 		 443 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.886151  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2230  preprotein translocase subunit SecY  28.97 
 
 		 479 aa  184  3e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.408121  normal  0.455137 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27583  IISP family transporter: protein transport protein Sec61 alpha subunit  29.58 
 
 		 476 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.527579  normal  0.285595 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0555  preprotein translocase subunit SecY  28.08 
 
 		 477 aa  177  4e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.323996 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0667  preprotein translocase subunit SecY  29.5 
 
 		 442 aa  176  5e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00940535 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0104  preprotein translocase subunit SecY  27.99 
 
 		 479 aa  176  6e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07721  hypothetical protein similar to Sec61 (Broad)  27.12 
 
 		 478 aa  174  2.9999999999999996e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0245702  normal  0.107035 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0587  preprotein translocase subunit SecY  27.8 
 
 		 477 aa  173  5e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00173275  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00040  protein transporter, putative  27.33 
 
 		 478 aa  171  2e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0233  preprotein translocase, SecY subunit  28.74 
 
 		 489 aa  170  4e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.520667  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0733  preprotein translocase subunit SecY  30.57 
 
 		 443 aa  169  8e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.581929  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0087  preprotein translocase subunit SecY  27.5 
 
 		 492 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.023527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68832  Protein transport protein SEC61 alpha subunit  27.64 
 
 		 478 aa  163  6e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0156  preprotein translocase subunit SecY  29.51 
 
 		 442 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1251  preprotein translocase subunit SecY  29.5 
 
 		 442 aa  162  1e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.05624  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1498  preprotein translocase, SecY subunit  28.14 
 
 		 599 aa  162  2e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.312314  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2241  preprotein translocase, SecY subunit  28.35 
 
 		 500 aa  155  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1851  preprotein translocase subunit SecY  28.18 
 
 		 504 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.642367 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0024  preprotein translocase subunit SecY  27.11 
 
 		 492 aa  144  5e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00318334  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2315  preprotein translocase subunit SecY  28.03 
 
 		 491 aa  133  6e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.368701  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1705  preprotein translocase subunit SecY  27.83 
 
 		 537 aa  108  3e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.602032  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80530  protein involved in co-translational pathway of protein transport  22.09 
 
 		 501 aa  82  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.453921 
 
 
-
 
NC_002936  DET0494  preprotein translocase subunit SecY  23.26 
 
 		 438 aa  55.8  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.443171  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_436  preprotein translocase subunit SecY  23.02 
 
 		 438 aa  55.5  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0195945  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1949  preprotein translocase, SecY subunit  22.25 
 
 		 420 aa  54.7  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2694  preprotein translocase subunit SecY  21.49 
 
 		 425 aa  53.9  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2379  preprotein translocase subunit SecY  21.49 
 
 		 425 aa  52.8  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0471  preprotein translocase subunit SecY  23.26 
 
 		 438 aa  52  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00922913  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0103  preprotein translocase subunit SecY  23.37 
 
 		 421 aa  50.8  0.00005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0496  preprotein translocase, SecY subunit  22.06 
 
 		 456 aa  49.7  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.437531  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2135  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  24.12 
 
 		 428 aa  49.7  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233384  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0381  preprotein translocase subunit SecY  22.8 
 
 		 452 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4487  preprotein translocase, SecY subunit  22.55 
 
 		 436 aa  48.9  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1000  preprotein translocase, SecY subunit  22.96 
 
 		 419 aa  48.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00382146  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1735  preprotein translocase subunit SecY  22.8 
 
 		 452 aa  47.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  21.79 
 
 		 420 aa  47.8  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04180  preprotein translocase subunit SecY  21.4 
 
 		 435 aa  47  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0780  preprotein translocase subunit SecY  23.46 
 
 		 457 aa  47  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3318  preprotein translocase subunit SecY  24.33 
 
 		 441 aa  45.8  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0305  preprotein translocase subunit SecY  24.76 
 
 		 453 aa  45.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.398461 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1811  preprotein translocase subunit SecY  23.46 
 
 		 430 aa  45.8  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.741103  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0862  preprotein translocase, SecY subunit  28.65 
 
 		 438 aa  45.1  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.148817  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2062  preprotein translocase subunit SecY  22.41 
 
 		 421 aa  44.3  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09800  preprotein translocase, SecY subunit  25.58 
 
 		 427 aa  44.3  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.141788  hitchhiker  0.0000395879 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2198  preprotein translocase, SecY subunit  23.34 
 
 		 448 aa  43.9  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0470035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0680  preprotein translocase subunit SecY  22.27 
 
 		 437 aa  43.1  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0787  preprotein translocase subunit SecY  26.89 
 
 		 438 aa  43.1  0.01  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000240861  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>