67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1874 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1304  preprotein translocase subunit SecY  79.14 
 
 		 459 aa  730    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.783086 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1874  preprotein translocase subunit SecY  100 
 
 		 465 aa  915    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.653631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1034  preprotein translocase subunit SecY  75.75 
 
 		 455 aa  669    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000391627 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0964  preprotein translocase subunit SecY  80.65 
 
 		 460 aa  704    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.905411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1254  preprotein translocase subunit SecY  43 
 
 		 482 aa  305  2.0000000000000002e-81  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000145561 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0233  preprotein translocase subunit SecY  38.72 
 
 		 476 aa  291  2e-77  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.745222  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1755  Translocon Sec61/SecY, plug domain protein  36.61 
 
 		 469 aa  265  8.999999999999999e-70  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.227644  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0114  preprotein translocase subunit SecY  35.21 
 
 		 463 aa  257  3e-67  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.000000000441427  hitchhiker  0.00000810769 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0402  preprotein translocase subunit SecY  33.06 
 
 		 476 aa  229  5e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.144908 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_56443  transport protein Sec61 alpha subunit  30.59 
 
 		 559 aa  206  7e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0465  preprotein translocase subunit SecY  28.69 
 
 		 477 aa  186  9e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1407  preprotein translocase subunit SecY  29.79 
 
 		 443 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.886151  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27583  IISP family transporter: protein transport protein Sec61 alpha subunit  30.13 
 
 		 476 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.527579  normal  0.285595 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00040  protein transporter, putative  28.12 
 
 		 478 aa  183  6e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2426  preprotein translocase subunit SecY  28.94 
 
 		 492 aa  181  2e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2230  preprotein translocase subunit SecY  28.57 
 
 		 479 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.408121  normal  0.455137 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0667  preprotein translocase subunit SecY  28.69 
 
 		 442 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00940535 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0555  preprotein translocase subunit SecY  28.02 
 
 		 477 aa  171  2e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.323996 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07721  hypothetical protein similar to Sec61 (Broad)  25.96 
 
 		 478 aa  171  3e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0245702  normal  0.107035 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0587  preprotein translocase subunit SecY  27.47 
 
 		 477 aa  171  3e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00173275  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0104  preprotein translocase subunit SecY  27.64 
 
 		 479 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0087  preprotein translocase subunit SecY  27.95 
 
 		 492 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.023527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1251  preprotein translocase subunit SecY  28.9 
 
 		 442 aa  162  1e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.05624  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1498  preprotein translocase, SecY subunit  26.94 
 
 		 599 aa  161  2e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.312314  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0156  preprotein translocase subunit SecY  28.69 
 
 		 442 aa  162  2e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68832  Protein transport protein SEC61 alpha subunit  26.1 
 
 		 478 aa  161  3e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0733  preprotein translocase subunit SecY  27.6 
 
 		 443 aa  158  3e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.581929  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0233  preprotein translocase, SecY subunit  27.95 
 
 		 489 aa  157  6e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.520667  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2241  preprotein translocase, SecY subunit  28.15 
 
 		 500 aa  148  3e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1851  preprotein translocase subunit SecY  28.82 
 
 		 504 aa  147  5e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.642367 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0024  preprotein translocase subunit SecY  26.42 
 
 		 492 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00318334  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2315  preprotein translocase subunit SecY  27.82 
 
 		 491 aa  134  3e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.368701  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1705  preprotein translocase subunit SecY  27.56 
 
 		 537 aa  106  9e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.602032  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80530  protein involved in co-translational pathway of protein transport  22.29 
 
 		 501 aa  87.4  5e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.453921 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2694  preprotein translocase subunit SecY  22.17 
 
 		 425 aa  55.5  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2379  preprotein translocase subunit SecY  22.81 
 
 		 425 aa  54.7  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1735  preprotein translocase subunit SecY  22.75 
 
 		 452 aa  53.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0381  preprotein translocase subunit SecY  22.1 
 
 		 452 aa  53.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2994  preprotein translocase subunit SecY  23.02 
 
 		 446 aa  53.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.389258  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0305  preprotein translocase subunit SecY  23.35 
 
 		 453 aa  51.6  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.398461 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1000  preprotein translocase, SecY subunit  22.74 
 
 		 419 aa  50.8  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00382146  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1811  preprotein translocase subunit SecY  24.13 
 
 		 430 aa  50.4  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.741103  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04180  preprotein translocase subunit SecY  21.93 
 
 		 435 aa  50.4  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1176  preprotein translocase subunit SecY  23.99 
 
 		 446 aa  50.1  0.00009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0379017  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0780  preprotein translocase subunit SecY  21.57 
 
 		 457 aa  49.7  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1976  preprotein translocase subunit SecY  24.01 
 
 		 446 aa  48.9  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.923807  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1949  preprotein translocase, SecY subunit  20.75 
 
 		 420 aa  48.5  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_436  preprotein translocase subunit SecY  21.72 
 
 		 438 aa  47.8  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0195945  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  20.93 
 
 		 420 aa  47.8  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  22.04 
 
 		 437 aa  47.4  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_004310  BR1213  preprotein translocase subunit SecY  24.2 
 
 		 446 aa  47.4  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0343  preprotein translocase, SecY subunit  28.8 
 
 		 444 aa  46.2  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000192463  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0471  preprotein translocase subunit SecY  20.77 
 
 		 438 aa  46.2  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00922913  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09800  preprotein translocase, SecY subunit  20.47 
 
 		 427 aa  46.6  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.141788  hitchhiker  0.0000395879 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4487  preprotein translocase, SecY subunit  22.8 
 
 		 436 aa  45.8  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0103  preprotein translocase subunit SecY  21.16 
 
 		 421 aa  46.2  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2062  preprotein translocase subunit SecY  22.48 
 
 		 421 aa  45.4  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2514  preprotein translocase subunit SecY  22.44 
 
 		 452 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0494  preprotein translocase subunit SecY  21.04 
 
 		 438 aa  45.8  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.443171  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1856  preprotein translocase subunit SecY  22.48 
 
 		 421 aa  44.3  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2135  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  28.89 
 
 		 428 aa  44.3  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233384  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23211  preprotein translocase subunit SecY  30 
 
 		 439 aa  43.9  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1685  preprotein translocase subunit SecY  22.48 
 
 		 421 aa  43.9  0.006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1206  preprotein translocase SecY subunit  23.32 
 
 		 457 aa  43.9  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533641  normal  0.0165275 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20670  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  23.08 
 
 		 439 aa  43.5  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3318  preprotein translocase subunit SecY  26.35 
 
 		 441 aa  43.9  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0862  preprotein translocase, SecY subunit  23.21 
 
 		 438 aa  43.5  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.148817  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>