More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0465 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0104  preprotein translocase subunit SecY  68.96 
 
 		 479 aa  699    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0465  preprotein translocase subunit SecY  100 
 
 		 477 aa  949    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2230  preprotein translocase subunit SecY  77.66 
 
 		 479 aa  777    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.408121  normal  0.455137 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0587  preprotein translocase subunit SecY  76.52 
 
 		 477 aa  758    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00173275  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0555  preprotein translocase subunit SecY  84.7 
 
 		 477 aa  825    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.323996 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0087  preprotein translocase subunit SecY  55.08 
 
 		 492 aa  526  1e-148  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.023527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0024  preprotein translocase subunit SecY  54.25 
 
 		 492 aa  503  1e-141  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00318334  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0233  preprotein translocase, SecY subunit  53.07 
 
 		 489 aa  474  1e-132  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.520667  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2426  preprotein translocase subunit SecY  52.66 
 
 		 492 aa  469  1.0000000000000001e-131  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1705  preprotein translocase subunit SecY  49.53 
 
 		 537 aa  450  1e-125  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.602032  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2241  preprotein translocase, SecY subunit  50.7 
 
 		 500 aa  446  1.0000000000000001e-124  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1851  preprotein translocase subunit SecY  52.87 
 
 		 504 aa  433  1e-120  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.642367 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2315  preprotein translocase subunit SecY  51.2 
 
 		 491 aa  417  9.999999999999999e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.368701  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1498  preprotein translocase, SecY subunit  40.23 
 
 		 599 aa  363  2e-99  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.312314  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0667  preprotein translocase subunit SecY  38.03 
 
 		 442 aa  320  3e-86  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00940535 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1251  preprotein translocase subunit SecY  38.03 
 
 		 442 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.05624  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0156  preprotein translocase subunit SecY  37.18 
 
 		 442 aa  301  1e-80  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0733  preprotein translocase subunit SecY  36.9 
 
 		 443 aa  299  7e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.581929  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1407  preprotein translocase subunit SecY  36.19 
 
 		 443 aa  295  1e-78  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.886151  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0114  preprotein translocase subunit SecY  31.76 
 
 		 463 aa  229  1e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.000000000441427  hitchhiker  0.00000810769 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27583  IISP family transporter: protein transport protein Sec61 alpha subunit  31.97 
 
 		 476 aa  228  2e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.527579  normal  0.285595 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0233  preprotein translocase subunit SecY  30.72 
 
 		 476 aa  218  2e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.745222  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0402  preprotein translocase subunit SecY  30.06 
 
 		 476 aa  217  4e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.144908 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_56443  transport protein Sec61 alpha subunit  28.87 
 
 		 559 aa  216  9e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1755  Translocon Sec61/SecY, plug domain protein  30.2 
 
 		 469 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.227644  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07721  hypothetical protein similar to Sec61 (Broad)  29.48 
 
 		 478 aa  209  8e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0245702  normal  0.107035 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00040  protein transporter, putative  29.29 
 
 		 478 aa  207  2e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68832  Protein transport protein SEC61 alpha subunit  29.38 
 
 		 478 aa  191  2e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0964  preprotein translocase subunit SecY  28.69 
 
 		 460 aa  186  9e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.905411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1304  preprotein translocase subunit SecY  28.89 
 
 		 459 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.783086 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1874  preprotein translocase subunit SecY  28.48 
 
 		 465 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.653631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1034  preprotein translocase subunit SecY  27.9 
 
 		 455 aa  161  3e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000391627 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1254  preprotein translocase subunit SecY  27.95 
 
 		 482 aa  159  1e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000145561 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80530  protein involved in co-translational pathway of protein transport  23.98 
 
 		 501 aa  115  2.0000000000000002e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.453921 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  25.37 
 
 		 437 aa  92.8  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2691  preprotein translocase, SecY subunit  23.73 
 
 		 430 aa  88.6  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.803147  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0680  preprotein translocase subunit SecY  22.39 
 
 		 437 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20670  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  24.17 
 
 		 439 aa  82  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0607  preprotein translocase, SecY subunit  24.39 
 
 		 429 aa  82  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0598508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0735  preprotein translocase, SecY subunit  25.77 
 
 		 433 aa  81.6  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_436  preprotein translocase subunit SecY  24.15 
 
 		 438 aa  80.5  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0195945  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5022  preprotein translocase subunit SecY  23 
 
 		 445 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3686  preprotein translocase, SecY subunit  21.43 
 
 		 441 aa  79  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000792509  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1685  preprotein translocase subunit SecY  24.52 
 
 		 421 aa  77.4  0.0000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29540  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  24.44 
 
 		 429 aa  77  0.0000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.498773  normal  0.844433 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1856  preprotein translocase subunit SecY  24.31 
 
 		 421 aa  77  0.0000000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16970  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  23.09 
 
 		 435 aa  77  0.0000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0174147  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0504  preprotein translocase subunit SecY  24.09 
 
 		 443 aa  75.9  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00015304  normal  0.032999 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2062  preprotein translocase subunit SecY  24.31 
 
 		 421 aa  76.3  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0494  preprotein translocase subunit SecY  23.5 
 
 		 438 aa  75.1  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.443171  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2694  preprotein translocase subunit SecY  23.81 
 
 		 425 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2379  preprotein translocase subunit SecY  23.81 
 
 		 425 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0509  preprotein translocase subunit SecY  23.58 
 
 		 443 aa  75.1  0.000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0470282  hitchhiker  0.00397274 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0446  preprotein translocase subunit SecY  22.48 
 
 		 443 aa  75.1  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000813945  hitchhiker  0.000170824 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0739  preprotein translocase subunit SecY  22.96 
 
 		 440 aa  74.3  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00521081  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0339  preprotein translocase subunit SecY  22.38 
 
 		 440 aa  74.3  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000142446  unclonable  0.0000000706243 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1333  preprotein translocase subunit SecY  24.59 
 
 		 455 aa  73.9  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.158258 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3397  preprotein translocase, SecY subunit  24.15 
 
 		 439 aa  73.6  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0471  preprotein translocase subunit SecY  23.08 
 
 		 438 aa  73.6  0.000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00922913  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1074  preprotein translocase subunit SecY  21.99 
 
 		 441 aa  73.6  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1046  preprotein translocase subunit SecY  21.99 
 
 		 441 aa  73.6  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303562  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6594  preprotein translocase subunit SecY  22.7 
 
 		 436 aa  73.6  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1062  preprotein translocase subunit SecY  21.99 
 
 		 441 aa  73.6  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160681  normal  0.323313 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  22.85 
 
 		 437 aa  72.8  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  23.81 
 
 		 435 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0309  preprotein translocase subunit SecY  21.93 
 
 		 443 aa  72  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0197098  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4006  preprotein translocase, SecY subunit  23.28 
 
 		 450 aa  72.4  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000605815  hitchhiker  0.000026914 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0078  preprotein translocase subunit SecY  23.37 
 
 		 420 aa  72  0.00000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3954  preprotein translocase, SecY subunit  22.92 
 
 		 434 aa  72  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  24.53 
 
 		 435 aa  72  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2237  preprotein translocase subunit SecY  25.26 
 
 		 437 aa  71.6  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.104557  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0496  preprotein translocase, SecY subunit  25.17 
 
 		 456 aa  71.6  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.437531  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0602  preprotein translocase subunit SecY  22.58 
 
 		 430 aa  71.6  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.637505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  23.76 
 
 		 437 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6029  preprotein translocase subunit SecY  23.02 
 
 		 430 aa  71.2  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0103  preprotein translocase subunit SecY  24.27 
 
 		 421 aa  70.5  0.00000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00958  preprotein translocase subunit SecY  22.31 
 
 		 434 aa  70.5  0.00000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0058755  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  22.78 
 
 		 429 aa  70.1  0.00000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001722  preprotein translocase SecY subunit  22.87 
 
 		 444 aa  70.1  0.00000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000228975  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0979  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  23.49 
 
 		 447 aa  69.3  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000479753  hitchhiker  0.00549319 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  23.14 
 
 		 443 aa  69.7  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  23.14 
 
 		 443 aa  69.7  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  0.0000000000266535 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3318  preprotein translocase subunit SecY  22.06 
 
 		 441 aa  69.3  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1167  preprotein translocase subunit SecY  24.01 
 
 		 447 aa  69.7  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.221673  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0507  preprotein translocase subunit SecY  22.37 
 
 		 443 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0640452  normal  0.0135524 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4729  preprotein translocase subunit SecY  22.37 
 
 		 443 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0376135  normal  0.430849 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3889  preprotein translocase subunit SecY  22.37 
 
 		 442 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000822061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1165  preprotein translocase, SecY subunit  22.66 
 
 		 450 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000330141  normal  0.11389 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0053  preprotein translocase subunit SecY  24.07 
 
 		 420 aa  68.9  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1949  preprotein translocase, SecY subunit  23.99 
 
 		 420 aa  68.9  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3885  preprotein translocase subunit SecY  23.49 
 
 		 437 aa  68.9  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1347  preprotein translocase subunit SecY  23 
 
 		 445 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0474  preprotein translocase subunit SecY  22.59 
 
 		 443 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.733359  hitchhiker  0.00000433507 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0425  preprotein translocase subunit SecY  22.78 
 
 		 437 aa  68.6  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.65116  normal  0.157207 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0708  preprotein translocase, SecY subunit  25.55 
 
 		 438 aa  68.6  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.274333 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0504  preprotein translocase subunit SecY  22.59 
 
 		 443 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5050  preprotein translocase subunit SecY  22.17 
 
 		 444 aa  67.8  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.478224  normal  0.981585 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0862  preprotein translocase, SecY subunit  24.19 
 
 		 438 aa  67.8  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.148817  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2756  preprotein translocase, SecY subunit  23.67 
 
 		 443 aa  67.8  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.373135  normal  0.477854 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0305  preprotein translocase subunit SecY  23.73 
 
 		 420 aa  67.8  0.0000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>