113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1498 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_1498  preprotein translocase, SecY subunit  100 
 
 		 599 aa  1201    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.312314  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0087  preprotein translocase subunit SecY  43.93 
 
 		 492 aa  403  1e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.023527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2230  preprotein translocase subunit SecY  41.54 
 
 		 479 aa  372  1e-101  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.408121  normal  0.455137 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0555  preprotein translocase subunit SecY  40.66 
 
 		 477 aa  372  1e-101  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.323996 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0465  preprotein translocase subunit SecY  40.23 
 
 		 477 aa  372  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2426  preprotein translocase subunit SecY  42.77 
 
 		 492 aa  371  1e-101  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0024  preprotein translocase subunit SecY  43.74 
 
 		 492 aa  368  1e-100  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00318334  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0104  preprotein translocase subunit SecY  40.34 
 
 		 479 aa  364  2e-99  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0587  preprotein translocase subunit SecY  41.04 
 
 		 477 aa  361  3e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00173275  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0233  preprotein translocase, SecY subunit  41.71 
 
 		 489 aa  358  9.999999999999999e-98  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.520667  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1705  preprotein translocase subunit SecY  40.55 
 
 		 537 aa  348  1e-94  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.602032  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2241  preprotein translocase, SecY subunit  39.29 
 
 		 500 aa  344  2.9999999999999997e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1851  preprotein translocase subunit SecY  41.18 
 
 		 504 aa  328  2.0000000000000001e-88  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.642367 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2315  preprotein translocase subunit SecY  41.32 
 
 		 491 aa  315  9.999999999999999e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.368701  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0667  preprotein translocase subunit SecY  37.45 
 
 		 442 aa  298  3e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00940535 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1407  preprotein translocase subunit SecY  36.33 
 
 		 443 aa  290  6e-77  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.886151  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1251  preprotein translocase subunit SecY  37.74 
 
 		 442 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.05624  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0156  preprotein translocase subunit SecY  37.36 
 
 		 442 aa  281  2e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0733  preprotein translocase subunit SecY  37.55 
 
 		 443 aa  282  2e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.581929  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_56443  transport protein Sec61 alpha subunit  33.66 
 
 		 559 aa  255  1.0000000000000001e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0402  preprotein translocase subunit SecY  34.25 
 
 		 476 aa  253  1e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.144908 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00040  protein transporter, putative  32.36 
 
 		 478 aa  234  5e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27583  IISP family transporter: protein transport protein Sec61 alpha subunit  31.26 
 
 		 476 aa  230  4e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.527579  normal  0.285595 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07721  hypothetical protein similar to Sec61 (Broad)  30.39 
 
 		 478 aa  223  9.999999999999999e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0245702  normal  0.107035 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0233  preprotein translocase subunit SecY  31.27 
 
 		 476 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.745222  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1755  Translocon Sec61/SecY, plug domain protein  30.58 
 
 		 469 aa  220  6e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.227644  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68832  Protein transport protein SEC61 alpha subunit  32.22 
 
 		 478 aa  218  2.9999999999999998e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0114  preprotein translocase subunit SecY  29.18 
 
 		 463 aa  199  2.0000000000000003e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.000000000441427  hitchhiker  0.00000810769 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1304  preprotein translocase subunit SecY  27.87 
 
 		 459 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.783086 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1254  preprotein translocase subunit SecY  29.87 
 
 		 482 aa  167  5.9999999999999996e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000145561 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0964  preprotein translocase subunit SecY  27.58 
 
 		 460 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.905411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1034  preprotein translocase subunit SecY  27.57 
 
 		 455 aa  153  8e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000391627 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80530  protein involved in co-translational pathway of protein transport  24.95 
 
 		 501 aa  110  6e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.453921 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1874  preprotein translocase subunit SecY  27.59 
 
 		 465 aa  104  4e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.653631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0735  preprotein translocase, SecY subunit  23.43 
 
 		 433 aa  59.3  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2754  preprotein translocase, SecY subunit  28.43 
 
 		 437 aa  58.2  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  25.93 
 
 		 437 aa  55.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00958  preprotein translocase subunit SecY  27.92 
 
 		 434 aa  55.5  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0058755  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0309  preprotein translocase subunit SecY  29.17 
 
 		 443 aa  54.3  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0197098  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0389  preprotein translocase subunit SecY  28.29 
 
 		 444 aa  52.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2237  preprotein translocase subunit SecY  26.3 
 
 		 437 aa  52.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.104557  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  29.15 
 
 		 437 aa  52  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1685  preprotein translocase subunit SecY  27.68 
 
 		 421 aa  52  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1856  preprotein translocase subunit SecY  27.68 
 
 		 421 aa  51.2  0.00005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0414  preprotein translocase subunit SecY  27.8 
 
 		 444 aa  50.8  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0306  preprotein translocase subunit SecY  26.29 
 
 		 421 aa  51.2  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0894763  normal  0.194972 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2691  preprotein translocase, SecY subunit  20.58 
 
 		 430 aa  50.8  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.803147  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0201  preprotein translocase subunit SecY  27.47 
 
 		 443 aa  50.8  0.00008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.124191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0233  preprotein translocase subunit SecY  26.6 
 
 		 446 aa  50.4  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000181445  unclonable  0.0000105897 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0418  preprotein translocase, SecY subunit  26.87 
 
 		 431 aa  50.4  0.00008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0509  preprotein translocase subunit SecY  23.35 
 
 		 443 aa  50.1  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0470282  hitchhiker  0.00397274 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1831  preprotein translocase subunit SecY  30.85 
 
 		 443 aa  50.1  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.321149  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1009  preprotein translocase subunit SecY  26.02 
 
 		 439 aa  50.1  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00114462  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0168  preprotein translocase subunit SecY  28.08 
 
 		 446 aa  49.7  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000114541  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1360  preprotein translocase, SecY subunit  30.77 
 
 		 423 aa  49.7  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2062  preprotein translocase subunit SecY  27.68 
 
 		 421 aa  50.1  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0340  preprotein translocase subunit SecY  26.7 
 
 		 443 aa  50.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00542322  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2668  preprotein translocase subunit SecY  27.78 
 
 		 447 aa  49.3  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  29.08 
 
 		 420 aa  49.3  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0190  preprotein translocase subunit SecY  27.59 
 
 		 446 aa  49.7  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000711222  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0504  preprotein translocase subunit SecY  23.35 
 
 		 443 aa  49.3  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00015304  normal  0.032999 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2403  preprotein translocase subunit SecY  28.12 
 
 		 443 aa  49.3  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0193161  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0305  preprotein translocase subunit SecY  30.05 
 
 		 420 aa  48.9  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0979  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  25.84 
 
 		 447 aa  48.5  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000479753  hitchhiker  0.00549319 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0739  preprotein translocase subunit SecY  26.6 
 
 		 440 aa  48.9  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00521081  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0219  preprotein translocase subunit SecY  27.09 
 
 		 446 aa  48.5  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000744124  unclonable  0.0000000000304117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0214  preprotein translocase subunit SecY  27.09 
 
 		 446 aa  48.5  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000092283  hitchhiker  0.00772115 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0219  preprotein translocase subunit SecY  27.09 
 
 		 446 aa  48.5  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000110874  hitchhiker  0.00000000176689 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4150  preprotein translocase subunit SecY  27.09 
 
 		 446 aa  48.1  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000158721  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0216  preprotein translocase subunit SecY  27.09 
 
 		 446 aa  48.1  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000065492  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0220  preprotein translocase subunit SecY  27.09 
 
 		 446 aa  48.1  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000798254  hitchhiker  0.00367272 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2209  preprotein translocase subunit SecY  28.12 
 
 		 443 aa  48.1  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000211329  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4036  preprotein translocase subunit SecY  27.09 
 
 		 446 aa  48.1  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000184742  unclonable  0.00000000000435138 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2313  preprotein translocase subunit SecY  26.02 
 
 		 421 aa  48.1  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0367996  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1554  preprotein translocase, SecY subunit  22.33 
 
 		 424 aa  48.1  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0492066  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2694  preprotein translocase subunit SecY  29.51 
 
 		 425 aa  47.8  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0680  preprotein translocase subunit SecY  24.76 
 
 		 437 aa  47.8  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0776  preprotein translocase subunit SecY  25.25 
 
 		 455 aa  47.4  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal  0.028717 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0251  preprotein translocase subunit SecY  28.08 
 
 		 446 aa  47.4  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0315  preprotein translocase subunit SecY  25.09 
 
 		 437 aa  47  0.0009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0598799  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2044  preprotein translocase subunit SecY  28.65 
 
 		 441 aa  47.4  0.0009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00113194  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2379  preprotein translocase subunit SecY  29.51 
 
 		 425 aa  47  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0614  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  26 
 
 		 448 aa  46.6  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00397866  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0178  preprotein translocase subunit SecY  26.6 
 
 		 446 aa  47  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000408952  hitchhiker  0.00214614 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0127  preprotein translocase subunit SecY  25.54 
 
 		 430 aa  46.6  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4934  preprotein translocase, SecY subunit  21.62 
 
 		 439 aa  46.6  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000290796  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2276  preprotein translocase subunit SecY  28.12 
 
 		 441 aa  47  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000725785  hitchhiker  0.00410487 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2469  preprotein translocase subunit SecY  24.46 
 
 		 434 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0545369  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3739  preprotein translocase subunit SecY  28.08 
 
 		 446 aa  46.2  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000605107  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0507  preprotein translocase subunit SecY  25.56 
 
 		 443 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0640452  normal  0.0135524 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4298  preprotein translocase subunit SecY  26.6 
 
 		 446 aa  46.2  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000258427  unclonable  0.0000000000837901 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0204  preprotein translocase subunit SecY  26.21 
 
 		 446 aa  45.8  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000662692  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4729  preprotein translocase subunit SecY  25.56 
 
 		 443 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0376135  normal  0.430849 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4670  preprotein translocase subunit SecY  26.6 
 
 		 446 aa  45.8  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000509869  unclonable  0.0000000121988 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0245  preprotein translocase subunit SecY  25.5 
 
 		 471 aa  46.2  0.002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1167  preprotein translocase subunit SecY  27.37 
 
 		 447 aa  46.2  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.221673  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001722  preprotein translocase SecY subunit  26.73 
 
 		 444 aa  45.1  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000228975  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2994  preprotein translocase subunit SecY  25.4 
 
 		 446 aa  45.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.389258  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4256  preprotein translocase subunit SecY  25 
 
 		 443 aa  45.1  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193642  unclonable  0.00000000000448849 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3647  preprotein translocase, SecY subunit  24.61 
 
 		 442 aa  45.1  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00118801  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>