More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0776 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0453  preprotein translocase subunit SecY  76.94 
 
 		 457 aa  711    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.124481  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0514  preprotein translocase subunit SecY  77.38 
 
 		 457 aa  712    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.27475  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04500  preprotein translocase subunit SecY  87.91 
 
 		 454 aa  789    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.705639  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0776  preprotein translocase subunit SecY  100 
 
 		 455 aa  909    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal  0.028717 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0339  preprotein translocase subunit SecY  59.91 
 
 		 440 aa  525  1e-148  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000142446  unclonable  0.0000000706243 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2352  preprotein translocase subunit SecY  60.88 
 
 		 441 aa  522  1e-147  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299181  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3318  preprotein translocase subunit SecY  59.28 
 
 		 441 aa  518  1e-146  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0343  preprotein translocase, SecY subunit  59.28 
 
 		 444 aa  515  1.0000000000000001e-145  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000192463  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0425  preprotein translocase subunit SecY  59.63 
 
 		 437 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.65116  normal  0.157207 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00958  preprotein translocase subunit SecY  57.95 
 
 		 434 aa  514  1e-144  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0058755  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4670  preprotein translocase subunit SecY  57.46 
 
 		 446 aa  514  1e-144  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000509869  unclonable  0.0000000121988 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4298  preprotein translocase subunit SecY  57.46 
 
 		 446 aa  514  1e-144  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000258427  unclonable  0.0000000000837901 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0233  preprotein translocase subunit SecY  57.02 
 
 		 446 aa  511  1e-144  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000181445  unclonable  0.0000105897 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2149  preprotein translocase, SecY subunit  60.09 
 
 		 448 aa  513  1e-144  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0576412  normal  0.122998 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1009  preprotein translocase subunit SecY  57.79 
 
 		 439 aa  511  1e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00114462  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0178  preprotein translocase subunit SecY  57.02 
 
 		 446 aa  509  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000408952  hitchhiker  0.00214614 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0474  preprotein translocase subunit SecY  57.08 
 
 		 443 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.733359  hitchhiker  0.00000433507 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0507  preprotein translocase subunit SecY  57.08 
 
 		 443 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0640452  normal  0.0135524 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0299  preprotein translocase subunit SecY  59.77 
 
 		 440 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000631755  hitchhiker  0.00000321163 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2304  preprotein translocase subunit SecY  62.61 
 
 		 451 aa  508  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4729  preprotein translocase subunit SecY  57.08 
 
 		 443 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0376135  normal  0.430849 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0504  preprotein translocase subunit SecY  57.08 
 
 		 443 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0739  preprotein translocase subunit SecY  56.79 
 
 		 440 aa  508  9.999999999999999e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00521081  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2154  preprotein translocase subunit SecY  59.35 
 
 		 444 aa  504  1e-141  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000317062  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0646  preprotein translocase, SecY subunit  56.95 
 
 		 444 aa  503  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.617938  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4528  preprotein translocase subunit SecY  56.95 
 
 		 444 aa  503  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.447133  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0787  preprotein translocase subunit SecY  59.28 
 
 		 442 aa  504  1e-141  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0142235  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0441  preprotein translocase subunit SecY  56.35 
 
 		 443 aa  503  1e-141  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0857  preprotein translocase subunit SecY  57.86 
 
 		 442 aa  503  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09050  preprotein translocase subunit SecY  57.86 
 
 		 442 aa  503  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.224184 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001722  preprotein translocase SecY subunit  59.58 
 
 		 444 aa  503  1e-141  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000228975  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00750  preprotein translocase subunit SecY  59.58 
 
 		 444 aa  503  1e-141  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0251  preprotein translocase subunit SecY  56.8 
 
 		 446 aa  499  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3739  preprotein translocase subunit SecY  57.24 
 
 		 446 aa  501  1e-140  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000605107  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2305  preprotein translocase subunit SecY  57.74 
 
 		 453 aa  501  1e-140  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0325321  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5059  preprotein translocase subunit SecY  56.92 
 
 		 442 aa  499  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000898122  normal  0.284155 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3889  preprotein translocase subunit SecY  56.22 
 
 		 442 aa  500  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000822061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0340  preprotein translocase subunit SecY  60.05 
 
 		 443 aa  500  1e-140  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00542322  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0219  preprotein translocase subunit SecY  56.8 
 
 		 446 aa  498  1e-140  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000744124  unclonable  0.0000000000304117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0214  preprotein translocase subunit SecY  56.8 
 
 		 446 aa  498  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000092283  hitchhiker  0.00772115 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0219  preprotein translocase subunit SecY  56.8 
 
 		 446 aa  498  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000110874  hitchhiker  0.00000000176689 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5050  preprotein translocase subunit SecY  60.87 
 
 		 437 aa  498  1e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.34117  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0168  preprotein translocase subunit SecY  57.53 
 
 		 446 aa  496  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000114541  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0204  preprotein translocase subunit SecY  56.58 
 
 		 446 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000662692  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4256  preprotein translocase subunit SecY  57.24 
 
 		 443 aa  492  9.999999999999999e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193642  unclonable  0.00000000000448849 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0216  preprotein translocase subunit SecY  56.8 
 
 		 446 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000065492  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  54.88 
 
 		 443 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  54.88 
 
 		 443 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  0.0000000000266535 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0190  preprotein translocase subunit SecY  56.8 
 
 		 446 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000711222  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0621  preprotein translocase subunit SecY  58.8 
 
 		 439 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0220  preprotein translocase subunit SecY  56.8 
 
 		 446 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000798254  hitchhiker  0.00367272 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4036  preprotein translocase subunit SecY  56.8 
 
 		 446 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000184742  unclonable  0.00000000000435138 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4150  preprotein translocase subunit SecY  56.8 
 
 		 446 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000158721  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0838  preprotein translocase subunit SecY  59 
 
 		 434 aa  490  1e-137  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1042  preprotein translocase subunit SecY  58.8 
 
 		 439 aa  491  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0315  preprotein translocase subunit SecY  57.24 
 
 		 437 aa  489  1e-137  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0598799  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0401  preprotein translocase subunit SecY  59.03 
 
 		 439 aa  489  1e-137  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3423  preprotein translocase subunit SecY  58.33 
 
 		 436 aa  489  1e-137  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.23916 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0393  preprotein translocase subunit SecY  59.03 
 
 		 439 aa  489  1e-137  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0413341  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0080  preprotein translocase subunit SecY  57.08 
 
 		 441 aa  489  1e-137  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0404503  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2305  preprotein translocase subunit SecY  58.29 
 
 		 437 aa  488  1e-136  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.773218 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4223  preprotein translocase subunit SecY  58.8 
 
 		 436 aa  485  1e-136  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0505149  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0478  preprotein translocase subunit SecY  59.82 
 
 		 447 aa  486  1e-136  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3929  preprotein translocase subunit SecY  57.21 
 
 		 436 aa  486  1e-136  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0073  preprotein translocase, SecY subunit  57.57 
 
 		 445 aa  483  1e-135  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.867918  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0333  preprotein translocase, SecY subunit  54.44 
 
 		 445 aa  484  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0621  preprotein translocase, SecY subunit  57.65 
 
 		 445 aa  479  1e-134  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.104459  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3159  preprotein translocase subunit SecY  57.44 
 
 		 447 aa  479  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.453709  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0979  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  55.51 
 
 		 447 aa  480  1e-134  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000479753  hitchhiker  0.00549319 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3297  preprotein translocase subunit SecY  56.75 
 
 		 447 aa  479  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3802  preprotein translocase subunit SecY  59.68 
 
 		 443 aa  476  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0290035  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3731  preprotein translocase subunit SecY  59.5 
 
 		 443 aa  475  1e-133  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00374977  hitchhiker  0.00528746 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2459  preprotein translocase, SecY subunit  54.79 
 
 		 447 aa  476  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2181  preprotein translocase, SecY subunit  54.79 
 
 		 447 aa  476  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.318083 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0602  preprotein translocase subunit SecY  59.68 
 
 		 443 aa  477  1e-133  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129742  normal  0.608925 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0425  preprotein translocase subunit SecY  60.14 
 
 		 443 aa  476  1e-133  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0561363  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4524  preprotein translocase subunit SecY  59.91 
 
 		 443 aa  478  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000295503  hitchhiker  0.00000897343 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0303  preprotein translocase subunit SecY  59.68 
 
 		 443 aa  477  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000136571  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3981  preprotein translocase subunit SecY  59.45 
 
 		 443 aa  474  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.192366  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3894  preprotein translocase subunit SecY  59.68 
 
 		 443 aa  477  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000749966  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03151  protein translocase subunit SecY  59.68 
 
 		 443 aa  472  1e-132  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0325718  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0413  preprotein translocase, SecY subunit  59.68 
 
 		 443 aa  472  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000043612  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3494  preprotein translocase subunit SecY  59.68 
 
 		 443 aa  472  1e-132  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000269315  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3616  preprotein translocase subunit SecY  59.68 
 
 		 443 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00028758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3689  preprotein translocase subunit SecY  59.68 
 
 		 443 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.159408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2819  preprotein translocase subunit SecY  57.97 
 
 		 448 aa  474  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.83211  normal  0.30071 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0343  preprotein translocase subunit SecY  59.45 
 
 		 443 aa  473  1e-132  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0283563  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1928  preprotein translocase, SecY subunit  54.44 
 
 		 445 aa  472  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03102  hypothetical protein  59.68 
 
 		 443 aa  472  1e-132  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0208671  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3048  preprotein translocase subunit SecY  58.06 
 
 		 448 aa  473  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.20022  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0495  preprotein translocase subunit SecY  58.06 
 
 		 439 aa  473  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3595  preprotein translocase subunit SecY  59.68 
 
 		 443 aa  472  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0292752  normal  0.0168396 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3783  preprotein translocase subunit SecY  59.68 
 
 		 443 aa  472  1e-132  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000351768  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2144  preprotein translocase, SecY subunit  55.02 
 
 		 447 aa  473  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3724  preprotein translocase subunit SecY  59.68 
 
 		 443 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.493226  normal  0.165543 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4623  preprotein translocase subunit SecY  59.68 
 
 		 443 aa  472  1e-132  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000434636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3616  preprotein translocase subunit SecY  59.68 
 
 		 443 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000240741  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3787  preprotein translocase subunit SecY  59.68 
 
 		 443 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.013355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3685  preprotein translocase subunit SecY  59.68 
 
 		 443 aa  472  1e-132  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123554  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0413  preprotein translocase subunit SecY  59.68 
 
 		 443 aa  472  1e-132  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000127015  unclonable  0.0000000211657 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>