More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0104 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0104  preprotein translocase subunit SecY  100 
 
 
479 aa  959    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0555  preprotein translocase subunit SecY  71.88 
 
 
477 aa  714    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.323996 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0587  preprotein translocase subunit SecY  72.92 
 
 
477 aa  718    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00173275  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2230  preprotein translocase subunit SecY  72.5 
 
 
479 aa  737    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.408121  normal  0.455137 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0465  preprotein translocase subunit SecY  68.96 
 
 
477 aa  699    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0087  preprotein translocase subunit SecY  55.71 
 
 
492 aa  551  1e-156  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.023527  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0024  preprotein translocase subunit SecY  57.72 
 
 
492 aa  538  9.999999999999999e-153  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00318334  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2426  preprotein translocase subunit SecY  54.6 
 
 
492 aa  472  1e-132  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1705  preprotein translocase subunit SecY  51.33 
 
 
537 aa  471  1e-132  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.602032  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0233  preprotein translocase, SecY subunit  53.75 
 
 
489 aa  469  1.0000000000000001e-131  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.520667  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2241  preprotein translocase, SecY subunit  52.59 
 
 
500 aa  456  1e-127  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1851  preprotein translocase subunit SecY  52.58 
 
 
504 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.642367 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2315  preprotein translocase subunit SecY  54 
 
 
491 aa  432  1e-120  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.368701  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1498  preprotein translocase, SecY subunit  40.34 
 
 
599 aa  356  5.999999999999999e-97  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.312314  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0667  preprotein translocase subunit SecY  39.71 
 
 
442 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00940535 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1251  preprotein translocase subunit SecY  39.71 
 
 
442 aa  320  3e-86  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.05624  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0156  preprotein translocase subunit SecY  39.29 
 
 
442 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1407  preprotein translocase subunit SecY  38.67 
 
 
443 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.886151  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0733  preprotein translocase subunit SecY  38.89 
 
 
443 aa  310  4e-83  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.581929  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0402  preprotein translocase subunit SecY  30.83 
 
 
476 aa  228  1e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.144908 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0114  preprotein translocase subunit SecY  30.47 
 
 
463 aa  226  7e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.000000000441427  hitchhiker  0.00000810769 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_56443  transport protein Sec61 alpha subunit  30.8 
 
 
559 aa  219  7.999999999999999e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1755  Translocon Sec61/SecY, plug domain protein  30.35 
 
 
469 aa  219  1e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.227644  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0233  preprotein translocase subunit SecY  30.69 
 
 
476 aa  212  1e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.745222  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27583  IISP family transporter: protein transport protein Sec61 alpha subunit  30.2 
 
 
476 aa  211  3e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.527579  normal  0.285595 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00040  protein transporter, putative  28.69 
 
 
478 aa  203  7e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07721  hypothetical protein similar to Sec61 (Broad)  30.1 
 
 
478 aa  199  7e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0245702  normal  0.107035 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68832  Protein transport protein SEC61 alpha subunit  29.22 
 
 
478 aa  186  6e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1304  preprotein translocase subunit SecY  29.49 
 
 
459 aa  179  1e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.783086 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0964  preprotein translocase subunit SecY  27.99 
 
 
460 aa  172  1e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.905411  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1874  preprotein translocase subunit SecY  27.24 
 
 
465 aa  154  2e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.653631  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1034  preprotein translocase subunit SecY  27.45 
 
 
455 aa  154  4e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000391627 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1254  preprotein translocase subunit SecY  27.66 
 
 
482 aa  149  8e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000145561 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80530  protein involved in co-translational pathway of protein transport  25.71 
 
 
501 aa  114  4.0000000000000004e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.453921 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  23.47 
 
 
437 aa  83.6  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1165  preprotein translocase, SecY subunit  25.81 
 
 
450 aa  83.6  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000330141  normal  0.11389 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2691  preprotein translocase, SecY subunit  23.49 
 
 
430 aa  82.8  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.803147  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0080  preprotein translocase subunit SecY  24.14 
 
 
441 aa  80.1  0.00000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0404503  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0680  preprotein translocase subunit SecY  21.82 
 
 
437 aa  80.1  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4006  preprotein translocase, SecY subunit  24.6 
 
 
450 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000605815  hitchhiker  0.000026914 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0446  preprotein translocase subunit SecY  22.08 
 
 
443 aa  78.2  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000813945  hitchhiker  0.000170824 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20670  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  23.88 
 
 
439 aa  78.6  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  23.21 
 
 
443 aa  77.8  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  0.0000000000266535 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  23.21 
 
 
443 aa  77.8  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1685  preprotein translocase subunit SecY  24.02 
 
 
421 aa  77  0.0000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1399  preprotein translocase, SecY subunit  21.17 
 
 
446 aa  77  0.0000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0607  preprotein translocase, SecY subunit  24.89 
 
 
429 aa  76.6  0.0000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0598508  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1856  preprotein translocase subunit SecY  23.82 
 
 
421 aa  76.3  0.000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16970  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  24.41 
 
 
435 aa  76.6  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0174147  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3954  preprotein translocase, SecY subunit  23.2 
 
 
434 aa  75.5  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2062  preprotein translocase subunit SecY  23.82 
 
 
421 aa  75.9  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0496  preprotein translocase, SecY subunit  26.08 
 
 
456 aa  75.1  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.437531  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04500  preprotein translocase subunit SecY  24.17 
 
 
454 aa  75.1  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.705639  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00958  preprotein translocase subunit SecY  21.92 
 
 
434 aa  75.1  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0058755  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0339  preprotein translocase subunit SecY  24.46 
 
 
440 aa  75.1  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000142446  unclonable  0.0000000706243 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0309  preprotein translocase subunit SecY  23.35 
 
 
443 aa  74.7  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0197098  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3318  preprotein translocase subunit SecY  23.01 
 
 
441 aa  74.3  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0735  preprotein translocase, SecY subunit  22.41 
 
 
433 aa  73.9  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  22.9 
 
 
437 aa  73.9  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0453  preprotein translocase subunit SecY  24.69 
 
 
457 aa  73.6  0.000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.124481  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0103  preprotein translocase subunit SecY  22.08 
 
 
421 aa  73.6  0.000000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0776  preprotein translocase subunit SecY  23.9 
 
 
455 aa  73.2  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal  0.028717 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1831  preprotein translocase subunit SecY  23.59 
 
 
443 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.321149  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0797  preprotein translocase subunit SecY  23.12 
 
 
457 aa  72  0.00000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.14214  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15058  IISP family transporter: preprotein translocase SecY subunit  24.84 
 
 
423 aa  72.4  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0295736  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1074  preprotein translocase subunit SecY  22.2 
 
 
441 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0504  preprotein translocase subunit SecY  22.01 
 
 
443 aa  72  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00015304  normal  0.032999 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1062  preprotein translocase subunit SecY  22.2 
 
 
441 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160681  normal  0.323313 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1046  preprotein translocase subunit SecY  22.2 
 
 
441 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303562  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5050  preprotein translocase subunit SecY  24.58 
 
 
437 aa  72  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.34117  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2305  preprotein translocase subunit SecY  24.82 
 
 
437 aa  72  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.773218 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3686  preprotein translocase, SecY subunit  22.36 
 
 
441 aa  72  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000792509  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1856  preprotein translocase, SecY subunit  20.9 
 
 
446 aa  71.2  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0112849  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0514  preprotein translocase subunit SecY  24.29 
 
 
457 aa  70.9  0.00000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.27475  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1863  preprotein translocase subunit SecY  24.79 
 
 
446 aa  71.2  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0509  preprotein translocase subunit SecY  21.7 
 
 
443 aa  71.2  0.00000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0470282  hitchhiker  0.00397274 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4223  preprotein translocase subunit SecY  24.57 
 
 
436 aa  70.9  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0505149  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09800  preprotein translocase, SecY subunit  21.78 
 
 
427 aa  70.9  0.00000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.141788  hitchhiker  0.0000395879 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5022  preprotein translocase subunit SecY  21.86 
 
 
445 aa  70.5  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  23.78 
 
 
435 aa  70.5  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10746  preprotein translocase subunit SecY  22.54 
 
 
441 aa  70.5  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.329828 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2237  preprotein translocase subunit SecY  24.19 
 
 
437 aa  70.5  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.104557  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0393  preprotein translocase subunit SecY  23.61 
 
 
439 aa  70.5  0.00000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0413341  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0401  preprotein translocase subunit SecY  23.61 
 
 
439 aa  70.5  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0207  preprotein translocase, SecY subunit  24.7 
 
 
500 aa  70.5  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0708  preprotein translocase, SecY subunit  24.44 
 
 
438 aa  69.3  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.274333 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  21.34 
 
 
435 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0621  preprotein translocase subunit SecY  23.86 
 
 
439 aa  69.7  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.468859  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0245  preprotein translocase subunit SecY  21.95 
 
 
471 aa  69.7  0.0000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0862  preprotein translocase, SecY subunit  24.22 
 
 
438 aa  69.3  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.148817  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1949  preprotein translocase, SecY subunit  23.21 
 
 
420 aa  69.3  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0886  preprotein translocase subunit SecY  22.2 
 
 
418 aa  69.7  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.609907  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0235  preprotein translocase subunit SecY  22.81 
 
 
419 aa  69.3  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00849669  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0612  preprotein translocase subunit SecY  23.6 
 
 
456 aa  69.7  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0441  preprotein translocase subunit SecY  23.24 
 
 
443 aa  69.7  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1246  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  24.44 
 
 
463 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.031052  hitchhiker  0.00314824 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0721  preprotein translocase subunit SecY  21.5 
 
 
435 aa  68.6  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3142  preprotein translocase subunit SecY  22.22 
 
 
440 aa  68.9  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0487569  normal  0.382691 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5050  preprotein translocase subunit SecY  21.8 
 
 
444 aa  68.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.478224  normal  0.981585 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0190  preprotein translocase subunit SecY  21.62 
 
 
446 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000711222  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>