39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_56443 on replicon NC_011695
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009368  OSTLU_27583  IISP family transporter: protein transport protein Sec61 alpha subunit  70.35 
 
 		 476 aa  693    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.527579  normal  0.285595 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_56443  transport protein Sec61 alpha subunit  100 
 
 		 559 aa  1147    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00040  protein transporter, putative  61.83 
 
 		 478 aa  622  1e-177  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07721  hypothetical protein similar to Sec61 (Broad)  61.47 
 
 		 478 aa  615  1e-175  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0245702  normal  0.107035 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68832  Protein transport protein SEC61 alpha subunit  54.64 
 
 		 478 aa  535  1e-150  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0402  preprotein translocase subunit SecY  36.24 
 
 		 476 aa  292  1e-77  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.144908 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1407  preprotein translocase subunit SecY  37.71 
 
 		 443 aa  286  5.999999999999999e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.886151  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0667  preprotein translocase subunit SecY  35.1 
 
 		 442 aa  278  2e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00940535 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0733  preprotein translocase subunit SecY  36.72 
 
 		 443 aa  271  2e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.581929  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1251  preprotein translocase subunit SecY  35.31 
 
 		 442 aa  268  1e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.05624  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0156  preprotein translocase subunit SecY  34.88 
 
 		 442 aa  265  1e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0233  preprotein translocase subunit SecY  35.37 
 
 		 476 aa  259  8e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.745222  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1498  preprotein translocase, SecY subunit  33.66 
 
 		 599 aa  244  3e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.312314  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2426  preprotein translocase subunit SecY  30.67 
 
 		 492 aa  224  4e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0587  preprotein translocase subunit SecY  30.93 
 
 		 477 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00173275  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0104  preprotein translocase subunit SecY  30.8 
 
 		 479 aa  219  1e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0233  preprotein translocase, SecY subunit  30.28 
 
 		 489 aa  218  2e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.520667  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1755  Translocon Sec61/SecY, plug domain protein  31.79 
 
 		 469 aa  218  2e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.227644  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0087  preprotein translocase subunit SecY  30.82 
 
 		 492 aa  218  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.023527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2230  preprotein translocase subunit SecY  29.16 
 
 		 479 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.408121  normal  0.455137 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0555  preprotein translocase subunit SecY  29.98 
 
 		 477 aa  216  7e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.323996 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0465  preprotein translocase subunit SecY  28.87 
 
 		 477 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2241  preprotein translocase, SecY subunit  29.96 
 
 		 500 aa  215  1.9999999999999998e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80530  protein involved in co-translational pathway of protein transport  29.3 
 
 		 501 aa  207  3e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.453921 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0114  preprotein translocase subunit SecY  30.85 
 
 		 463 aa  206  7e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.000000000441427  hitchhiker  0.00000810769 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1304  preprotein translocase subunit SecY  29.72 
 
 		 459 aa  204  5e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.783086 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1851  preprotein translocase subunit SecY  30.75 
 
 		 504 aa  203  7e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.642367 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1254  preprotein translocase subunit SecY  31.19 
 
 		 482 aa  198  2.0000000000000003e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000145561 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0024  preprotein translocase subunit SecY  30.3 
 
 		 492 aa  195  2e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00318334  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1874  preprotein translocase subunit SecY  29.51 
 
 		 465 aa  191  2e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.653631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0964  preprotein translocase subunit SecY  29.85 
 
 		 460 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.905411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1034  preprotein translocase subunit SecY  29.34 
 
 		 455 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000391627 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2315  preprotein translocase subunit SecY  31.02 
 
 		 491 aa  179  1e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.368701  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1705  preprotein translocase subunit SecY  28.87 
 
 		 537 aa  178  2e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.602032  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3647  preprotein translocase, SecY subunit  27.62 
 
 		 442 aa  52.8  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00118801  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2691  preprotein translocase, SecY subunit  20.94 
 
 		 430 aa  47.4  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.803147  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0235  preprotein translocase subunit SecY  23.71 
 
 		 419 aa  45.4  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00849669  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  28.95 
 
 		 437 aa  43.9  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  27.23 
 
 		 437 aa  43.5  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>