159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2315 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2315  preprotein translocase subunit SecY  100 
 
 		 491 aa  968    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.368701  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1851  preprotein translocase subunit SecY  72.71 
 
 		 504 aa  630  1e-179  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.642367 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2426  preprotein translocase subunit SecY  67.47 
 
 		 492 aa  622  1e-177  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0233  preprotein translocase, SecY subunit  68.07 
 
 		 489 aa  619  1e-176  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.520667  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2241  preprotein translocase, SecY subunit  66.93 
 
 		 500 aa  602  1.0000000000000001e-171  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0104  preprotein translocase subunit SecY  54 
 
 		 479 aa  479  1e-134  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0087  preprotein translocase subunit SecY  50.29 
 
 		 492 aa  465  9.999999999999999e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.023527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2230  preprotein translocase subunit SecY  49.8 
 
 		 479 aa  465  9.999999999999999e-131  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.408121  normal  0.455137 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0465  preprotein translocase subunit SecY  51.2 
 
 		 477 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0555  preprotein translocase subunit SecY  51.01 
 
 		 477 aa  460  9.999999999999999e-129  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.323996 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0587  preprotein translocase subunit SecY  50.71 
 
 		 477 aa  456  1e-127  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00173275  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0024  preprotein translocase subunit SecY  50.88 
 
 		 492 aa  438  1e-121  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00318334  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1705  preprotein translocase subunit SecY  47.6 
 
 		 537 aa  421  1e-116  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.602032  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1498  preprotein translocase, SecY subunit  40.94 
 
 		 599 aa  350  3e-95  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.312314  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1407  preprotein translocase subunit SecY  39.46 
 
 		 443 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.886151  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0667  preprotein translocase subunit SecY  40.29 
 
 		 442 aa  295  9e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00940535 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1251  preprotein translocase subunit SecY  40.7 
 
 		 442 aa  292  7e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.05624  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0156  preprotein translocase subunit SecY  39.88 
 
 		 442 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0733  preprotein translocase subunit SecY  39.05 
 
 		 443 aa  282  7.000000000000001e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.581929  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_56443  transport protein Sec61 alpha subunit  31.63 
 
 		 559 aa  221  1.9999999999999999e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07721  hypothetical protein similar to Sec61 (Broad)  30.12 
 
 		 478 aa  210  5e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0245702  normal  0.107035 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00040  protein transporter, putative  30 
 
 		 478 aa  208  2e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0402  preprotein translocase subunit SecY  29.57 
 
 		 476 aa  204  2e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.144908 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27583  IISP family transporter: protein transport protein Sec61 alpha subunit  30.45 
 
 		 476 aa  202  8e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.527579  normal  0.285595 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0114  preprotein translocase subunit SecY  28.69 
 
 		 463 aa  200  5e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.000000000441427  hitchhiker  0.00000810769 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0233  preprotein translocase subunit SecY  30.92 
 
 		 476 aa  199  7e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.745222  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1755  Translocon Sec61/SecY, plug domain protein  27.78 
 
 		 469 aa  197  5.000000000000001e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.227644  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68832  Protein transport protein SEC61 alpha subunit  30.69 
 
 		 478 aa  182  1e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1304  preprotein translocase subunit SecY  29.9 
 
 		 459 aa  171  2e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.783086 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0964  preprotein translocase subunit SecY  28.03 
 
 		 460 aa  159  8e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.905411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1254  preprotein translocase subunit SecY  29.49 
 
 		 482 aa  154  2.9999999999999998e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000145561 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1874  preprotein translocase subunit SecY  27.91 
 
 		 465 aa  152  1e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.653631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1034  preprotein translocase subunit SecY  28.08 
 
 		 455 aa  144  2e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000391627 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80530  protein involved in co-translational pathway of protein transport  23.45 
 
 		 501 aa  97.1  7e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.453921 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2691  preprotein translocase, SecY subunit  22.8 
 
 		 430 aa  68.9  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.803147  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15058  IISP family transporter: preprotein translocase SecY subunit  24.2 
 
 		 423 aa  66.2  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0295736  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0797  preprotein translocase subunit SecY  22.87 
 
 		 457 aa  64.7  0.000000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.14214  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0245  preprotein translocase subunit SecY  21.93 
 
 		 471 aa  58.9  0.0000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0442  preprotein translocase subunit SecY  23.31 
 
 		 429 aa  58.5  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0315  preprotein translocase subunit SecY  23.76 
 
 		 437 aa  58.5  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0598799  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0504  preprotein translocase subunit SecY  24.45 
 
 		 443 aa  58.5  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00015304  normal  0.032999 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0103  preprotein translocase subunit SecY  22.56 
 
 		 421 aa  58.2  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6594  preprotein translocase subunit SecY  22.87 
 
 		 436 aa  58.5  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0235  preprotein translocase subunit SecY  23.38 
 
 		 419 aa  57.8  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00849669  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6029  preprotein translocase subunit SecY  24.49 
 
 		 430 aa  57  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2313  preprotein translocase subunit SecY  24.69 
 
 		 421 aa  56.6  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0367996  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1141  preprotein translocase, SecY subunit  22.96 
 
 		 426 aa  56.2  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000440606  normal  0.0147779 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0509  preprotein translocase subunit SecY  24.03 
 
 		 443 aa  55.8  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0470282  hitchhiker  0.00397274 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0735  preprotein translocase, SecY subunit  21.26 
 
 		 433 aa  55.1  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0446  preprotein translocase subunit SecY  21.98 
 
 		 443 aa  55.1  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000813945  hitchhiker  0.000170824 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1949  preprotein translocase, SecY subunit  23.86 
 
 		 420 aa  54.3  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0973  preprotein translocase subunit SecY  21.98 
 
 		 428 aa  54.7  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1685  preprotein translocase subunit SecY  22.67 
 
 		 421 aa  54.3  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1856  preprotein translocase subunit SecY  22.67 
 
 		 421 aa  53.9  0.000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05820  preprotein translocase SecY  22.99 
 
 		 447 aa  53.9  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2887  preprotein translocase, SecY subunit  24.54 
 
 		 441 aa  53.5  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0626195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0979  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  22.74 
 
 		 447 aa  53.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000479753  hitchhiker  0.00549319 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2062  preprotein translocase subunit SecY  22.44 
 
 		 421 aa  52.8  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23270  preprotein translocase, SecY subunit  21.91 
 
 		 426 aa  52.4  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.704414  hitchhiker  0.00000750325 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0496  preprotein translocase, SecY subunit  22.41 
 
 		 456 aa  52.4  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.437531  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0231  preprotein translocase subunit SecY  22.17 
 
 		 438 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.832784  normal  0.264762 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1000  preprotein translocase, SecY subunit  21.89 
 
 		 419 aa  51.6  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00382146  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3686  preprotein translocase, SecY subunit  23.25 
 
 		 441 aa  51.6  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000792509  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0234  preprotein translocase subunit SecY  22.17 
 
 		 438 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1269  preprotein translocase subunit SecY  23.05 
 
 		 455 aa  51.2  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0507  preprotein translocase subunit SecY  23.26 
 
 		 443 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0640452  normal  0.0135524 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4729  preprotein translocase subunit SecY  23.26 
 
 		 443 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0376135  normal  0.430849 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0680  preprotein translocase subunit SecY  19.59 
 
 		 437 aa  50.8  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3889  preprotein translocase subunit SecY  23.95 
 
 		 442 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000822061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0709  preprotein translocase subunit SecY  21.56 
 
 		 437 aa  50.4  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1831  preprotein translocase subunit SecY  21.84 
 
 		 443 aa  50.4  0.00007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.321149  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0305  preprotein translocase subunit SecY  24.66 
 
 		 420 aa  50.4  0.00007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1333  preprotein translocase subunit SecY  22.4 
 
 		 455 aa  50.4  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.158258 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0474  preprotein translocase subunit SecY  23.26 
 
 		 443 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.733359  hitchhiker  0.00000433507 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3954  preprotein translocase, SecY subunit  24.03 
 
 		 434 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2469  preprotein translocase subunit SecY  20.23 
 
 		 434 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0545369  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0309  preprotein translocase subunit SecY  20.91 
 
 		 443 aa  49.7  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0197098  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0602  preprotein translocase subunit SecY  23.79 
 
 		 430 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.637505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5022  preprotein translocase subunit SecY  22.53 
 
 		 445 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  22.12 
 
 		 429 aa  49.7  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0504  preprotein translocase subunit SecY  23.26 
 
 		 443 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390206  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0646  preprotein translocase, SecY subunit  23.26 
 
 		 444 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.617938  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4528  preprotein translocase subunit SecY  23.26 
 
 		 444 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.447133  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  21.16 
 
 		 420 aa  48.9  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3397  preprotein translocase, SecY subunit  22.57 
 
 		 439 aa  49.3  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  20.48 
 
 		 442 aa  48.9  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3885  preprotein translocase subunit SecY  23.21 
 
 		 437 aa  48.9  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3318  preprotein translocase subunit SecY  21.65 
 
 		 441 aa  48.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0078  preprotein translocase subunit SecY  21.32 
 
 		 420 aa  48.5  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5059  preprotein translocase subunit SecY  23.11 
 
 		 442 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000898122  normal  0.284155 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  20.23 
 
 		 437 aa  48.5  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0305  preprotein translocase subunit SecY  22.32 
 
 		 453 aa  48.5  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.398461 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  22.6 
 
 		 447 aa  48.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1374  preprotein translocase subunit SecY  21.99 
 
 		 431 aa  47.8  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0289241  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5767  preprotein translocase, SecY subunit  24.32 
 
 		 439 aa  47.8  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.800902 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0933  preprotein translocase, SecY subunit  23.64 
 
 		 500 aa  47.4  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.262242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4363  preprotein translocase subunit SecY  22.25 
 
 		 437 aa  47.4  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0120386  normal  0.169527 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0607  preprotein translocase, SecY subunit  21.79 
 
 		 429 aa  47.4  0.0007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0598508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  22.3 
 
 		 447 aa  47  0.0009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2545  preprotein translocase subunit SecY  21.04 
 
 		 434 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000778926 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>