85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1254 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1254  preprotein translocase subunit SecY  100 
 
 		 482 aa  952    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000145561 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1304  preprotein translocase subunit SecY  44.19 
 
 		 459 aa  347  2e-94  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.783086 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0964  preprotein translocase subunit SecY  43.8 
 
 		 460 aa  342  1e-92  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.905411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1034  preprotein translocase subunit SecY  44.81 
 
 		 455 aa  334  2e-90  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000391627 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1874  preprotein translocase subunit SecY  43.21 
 
 		 465 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.653631  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1755  Translocon Sec61/SecY, plug domain protein  36.98 
 
 		 469 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.227644  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0402  preprotein translocase subunit SecY  33.47 
 
 		 476 aa  272  1e-71  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.144908 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0233  preprotein translocase subunit SecY  34.93 
 
 		 476 aa  261  2e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.745222  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0114  preprotein translocase subunit SecY  36.32 
 
 		 463 aa  255  1.0000000000000001e-66  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.000000000441427  hitchhiker  0.00000810769 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_56443  transport protein Sec61 alpha subunit  31.19 
 
 		 559 aa  228  2e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1407  preprotein translocase subunit SecY  31.21 
 
 		 443 aa  226  1e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.886151  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07721  hypothetical protein similar to Sec61 (Broad)  31.38 
 
 		 478 aa  219  8.999999999999998e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0245702  normal  0.107035 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0733  preprotein translocase subunit SecY  31.54 
 
 		 443 aa  218  2e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.581929  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00040  protein transporter, putative  29.94 
 
 		 478 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0667  preprotein translocase subunit SecY  30.71 
 
 		 442 aa  209  1e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00940535 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27583  IISP family transporter: protein transport protein Sec61 alpha subunit  30.27 
 
 		 476 aa  203  5e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.527579  normal  0.285595 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1251  preprotein translocase subunit SecY  30.71 
 
 		 442 aa  203  5e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.05624  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2426  preprotein translocase subunit SecY  29.27 
 
 		 492 aa  201  3e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0156  preprotein translocase subunit SecY  30.29 
 
 		 442 aa  200  5e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0087  preprotein translocase subunit SecY  28.06 
 
 		 492 aa  194  4e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.023527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68832  Protein transport protein SEC61 alpha subunit  29.34 
 
 		 478 aa  190  5.999999999999999e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1498  preprotein translocase, SecY subunit  29.87 
 
 		 599 aa  189  1e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.312314  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0465  preprotein translocase subunit SecY  27.95 
 
 		 477 aa  187  3e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2230  preprotein translocase subunit SecY  29.39 
 
 		 479 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.408121  normal  0.455137 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0555  preprotein translocase subunit SecY  27.67 
 
 		 477 aa  181  2e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.323996 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0104  preprotein translocase subunit SecY  27.66 
 
 		 479 aa  178  2e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0587  preprotein translocase subunit SecY  27.5 
 
 		 477 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00173275  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0233  preprotein translocase, SecY subunit  28.32 
 
 		 489 aa  174  2.9999999999999996e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.520667  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2241  preprotein translocase, SecY subunit  28.19 
 
 		 500 aa  171  3e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0024  preprotein translocase subunit SecY  26.76 
 
 		 492 aa  162  1e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00318334  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1705  preprotein translocase subunit SecY  26.9 
 
 		 537 aa  157  3e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.602032  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2315  preprotein translocase subunit SecY  29.3 
 
 		 491 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.368701  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1851  preprotein translocase subunit SecY  27.33 
 
 		 504 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.642367 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80530  protein involved in co-translational pathway of protein transport  23.03 
 
 		 501 aa  96.7  8e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.453921 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0680  preprotein translocase subunit SecY  24.52 
 
 		 437 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1074  preprotein translocase subunit SecY  22.99 
 
 		 441 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1062  preprotein translocase subunit SecY  22.99 
 
 		 441 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160681  normal  0.323313 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1046  preprotein translocase subunit SecY  22.99 
 
 		 441 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303562  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4487  preprotein translocase, SecY subunit  23.56 
 
 		 436 aa  57  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10746  preprotein translocase subunit SecY  22.28 
 
 		 441 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.329828 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1000  preprotein translocase, SecY subunit  22.95 
 
 		 419 aa  55.5  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00382146  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6594  preprotein translocase subunit SecY  24.29 
 
 		 436 aa  54.3  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5022  preprotein translocase subunit SecY  22.91 
 
 		 445 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20670  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  22.31 
 
 		 439 aa  53.5  0.000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0339  preprotein translocase subunit SecY  22.12 
 
 		 440 aa  52.8  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000142446  unclonable  0.0000000706243 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  20.95 
 
 		 443 aa  52.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  20.95 
 
 		 443 aa  52.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  0.0000000000266535 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  22.14 
 
 		 420 aa  53.1  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04180  preprotein translocase subunit SecY  21.98 
 
 		 435 aa  51.6  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  24.71 
 
 		 437 aa  50.8  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3686  preprotein translocase, SecY subunit  23.92 
 
 		 441 aa  50.1  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000792509  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1856  preprotein translocase, SecY subunit  22.95 
 
 		 446 aa  49.7  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0112849  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0709  preprotein translocase subunit SecY  26.72 
 
 		 437 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0721  preprotein translocase subunit SecY  25.08 
 
 		 435 aa  49.7  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1246  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  23.43 
 
 		 463 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.031052  hitchhiker  0.00314824 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4006  preprotein translocase, SecY subunit  23.48 
 
 		 450 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000605815  hitchhiker  0.000026914 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3318  preprotein translocase subunit SecY  21.31 
 
 		 441 aa  48.5  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0285  preprotein translocase subunit SecY  28.95 
 
 		 430 aa  47.8  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000550268  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0739  preprotein translocase subunit SecY  25.26 
 
 		 440 aa  48.1  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00521081  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1347  preprotein translocase subunit SecY  22.25 
 
 		 445 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0787  preprotein translocase subunit SecY  23.27 
 
 		 438 aa  47.4  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000240861  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1310  preprotein translocase subunit SecY  24.49 
 
 		 436 aa  47  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0315  preprotein translocase subunit SecY  24.66 
 
 		 437 aa  46.6  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0598799  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0245  preprotein translocase subunit SecY  26 
 
 		 471 aa  46.2  0.001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0326  preprotein translocase subunit SecY  22.77 
 
 		 437 aa  45.8  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000568003 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0446  preprotein translocase subunit SecY  19.86 
 
 		 443 aa  45.4  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000813945  hitchhiker  0.000170824 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4729  preprotein translocase subunit SecY  26.9 
 
 		 443 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0376135  normal  0.430849 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0504  preprotein translocase subunit SecY  26.87 
 
 		 443 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390206  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0474  preprotein translocase subunit SecY  26.87 
 
 		 443 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.733359  hitchhiker  0.00000433507 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0507  preprotein translocase subunit SecY  26.9 
 
 		 443 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0640452  normal  0.0135524 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2214  preprotein translocase subunit SecY  25.14 
 
 		 439 aa  45.8  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.180024  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5144  preprotein translocase, SecY subunit  22.68 
 
 		 437 aa  45.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.552257 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1165  preprotein translocase, SecY subunit  22.53 
 
 		 450 aa  45.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000330141  normal  0.11389 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2158  preprotein translocase, SecY subunit  23.41 
 
 		 426 aa  44.7  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00470545  normal  0.460281 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0778  preprotein translocase, SecY subunit  26.77 
 
 		 430 aa  44.7  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000100686  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0735  preprotein translocase, SecY subunit  23.15 
 
 		 433 aa  44.3  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1685  preprotein translocase subunit SecY  22.68 
 
 		 421 aa  44.3  0.006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1856  preprotein translocase subunit SecY  22.45 
 
 		 421 aa  43.9  0.006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1360  preprotein translocase, SecY subunit  22.87 
 
 		 423 aa  43.9  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0979  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  24.05 
 
 		 447 aa  43.5  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000479753  hitchhiker  0.00549319 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0607  preprotein translocase, SecY subunit  21.36 
 
 		 429 aa  43.5  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0598508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0207  preprotein translocase, SecY subunit  25.39 
 
 		 500 aa  43.5  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2956  preprotein translocase subunit SecY  21.6 
 
 		 436 aa  43.1  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.226026  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0305  preprotein translocase subunit SecY  26.81 
 
 		 420 aa  43.1  0.01  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  23.89 
 
 		 429 aa  43.5  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>