81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1851 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_0233  preprotein translocase, SecY subunit  68.37 
 
 		 489 aa  642    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.520667  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2241  preprotein translocase, SecY subunit  70.59 
 
 		 500 aa  642    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1851  preprotein translocase subunit SecY  100 
 
 		 504 aa  991    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.642367 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2315  preprotein translocase subunit SecY  72.71 
 
 		 491 aa  619  1e-176  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.368701  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2426  preprotein translocase subunit SecY  66.99 
 
 		 492 aa  609  1e-173  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0104  preprotein translocase subunit SecY  52.58 
 
 		 479 aa  482  1e-135  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2230  preprotein translocase subunit SecY  52.65 
 
 		 479 aa  483  1e-135  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.408121  normal  0.455137 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0555  preprotein translocase subunit SecY  51.59 
 
 		 477 aa  477  1e-133  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.323996 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0465  preprotein translocase subunit SecY  52.87 
 
 		 477 aa  473  1e-132  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0587  preprotein translocase subunit SecY  51.69 
 
 		 477 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00173275  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0087  preprotein translocase subunit SecY  50.78 
 
 		 492 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.023527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0024  preprotein translocase subunit SecY  51.55 
 
 		 492 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00318334  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1705  preprotein translocase subunit SecY  49.53 
 
 		 537 aa  420  1e-116  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.602032  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1498  preprotein translocase, SecY subunit  41.18 
 
 		 599 aa  355  1e-96  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.312314  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0667  preprotein translocase subunit SecY  40.4 
 
 		 442 aa  301  1e-80  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00940535 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1407  preprotein translocase subunit SecY  38.34 
 
 		 443 aa  294  2e-78  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.886151  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1251  preprotein translocase subunit SecY  39.6 
 
 		 442 aa  290  3e-77  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.05624  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0156  preprotein translocase subunit SecY  38.99 
 
 		 442 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0733  preprotein translocase subunit SecY  38.08 
 
 		 443 aa  283  6.000000000000001e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.581929  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_56443  transport protein Sec61 alpha subunit  31.98 
 
 		 559 aa  236  8e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07721  hypothetical protein similar to Sec61 (Broad)  32.18 
 
 		 478 aa  230  4e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0245702  normal  0.107035 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0402  preprotein translocase subunit SecY  31.41 
 
 		 476 aa  219  7e-56  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.144908 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00040  protein transporter, putative  30.58 
 
 		 478 aa  219  7.999999999999999e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27583  IISP family transporter: protein transport protein Sec61 alpha subunit  30.97 
 
 		 476 aa  219  1e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.527579  normal  0.285595 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0233  preprotein translocase subunit SecY  31.33 
 
 		 476 aa  216  8e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.745222  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1755  Translocon Sec61/SecY, plug domain protein  28.99 
 
 		 469 aa  205  2e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.227644  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68832  Protein transport protein SEC61 alpha subunit  29.94 
 
 		 478 aa  200  6e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0114  preprotein translocase subunit SecY  29.32 
 
 		 463 aa  189  1e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.000000000441427  hitchhiker  0.00000810769 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0964  preprotein translocase subunit SecY  28.24 
 
 		 460 aa  175  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.905411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1304  preprotein translocase subunit SecY  28.09 
 
 		 459 aa  173  5e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.783086 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1034  preprotein translocase subunit SecY  28.38 
 
 		 455 aa  146  9e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000391627 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1254  preprotein translocase subunit SecY  27.91 
 
 		 482 aa  146  9e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000145561 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1874  preprotein translocase subunit SecY  30.29 
 
 		 465 aa  104  3e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.653631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80530  protein involved in co-translational pathway of protein transport  25.44 
 
 		 501 aa  100  8e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.453921 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2691  preprotein translocase, SecY subunit  21.86 
 
 		 430 aa  57.8  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.803147  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5022  preprotein translocase subunit SecY  22.46 
 
 		 445 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0496  preprotein translocase, SecY subunit  22.85 
 
 		 456 aa  56.2  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.437531  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0735  preprotein translocase, SecY subunit  21.5 
 
 		 433 aa  56.2  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0797  preprotein translocase subunit SecY  23.33 
 
 		 457 aa  55.5  0.000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.14214  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29540  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  23.39 
 
 		 429 aa  52.8  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.498773  normal  0.844433 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2158  preprotein translocase, SecY subunit  23.05 
 
 		 426 aa  51.6  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00470545  normal  0.460281 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1949  preprotein translocase, SecY subunit  31.18 
 
 		 420 aa  50.8  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05820  preprotein translocase SecY  22.57 
 
 		 447 aa  50.1  0.00009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0377  preprotein translocase subunit SecY  25.74 
 
 		 448 aa  50.1  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3686  preprotein translocase, SecY subunit  22.18 
 
 		 441 aa  50.1  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000792509  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0602  preprotein translocase subunit SecY  25.68 
 
 		 430 aa  49.3  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.637505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0622  preprotein translocase, SecY subunit  21.51 
 
 		 444 aa  48.9  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.925436 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09800  preprotein translocase, SecY subunit  22.77 
 
 		 427 aa  48.9  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.141788  hitchhiker  0.0000395879 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1046  preprotein translocase subunit SecY  21.14 
 
 		 441 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303562  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1074  preprotein translocase subunit SecY  21.14 
 
 		 441 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0215  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  22.62 
 
 		 444 aa  48.1  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1062  preprotein translocase subunit SecY  21.14 
 
 		 441 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160681  normal  0.323313 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16970  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  23.92 
 
 		 435 aa  47.4  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0174147  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0718  preprotein translocase subunit SecY  22.47 
 
 		 448 aa  47.4  0.0006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.214912  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4934  preprotein translocase, SecY subunit  22.74 
 
 		 439 aa  47.4  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000290796  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3397  preprotein translocase, SecY subunit  21.62 
 
 		 439 aa  47.4  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0125  preprotein translocase subunit SecY  20.31 
 
 		 433 aa  47  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00395698  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23270  preprotein translocase, SecY subunit  21.55 
 
 		 426 aa  47.4  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.704414  hitchhiker  0.00000750325 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1167  preprotein translocase subunit SecY  24.92 
 
 		 447 aa  47.4  0.0007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.221673  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0151  preprotein translocase subunit SecY  20.31 
 
 		 433 aa  47  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0158065  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5175  preprotein translocase subunit SecY  20.31 
 
 		 433 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000485174  unclonable  4.1263e-25 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6029  preprotein translocase subunit SecY  26.43 
 
 		 430 aa  46.2  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0103  preprotein translocase subunit SecY  32.12 
 
 		 421 aa  46.6  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0235  preprotein translocase subunit SecY  21.62 
 
 		 419 aa  46.6  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00849669  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0124  preprotein translocase subunit SecY  20.31 
 
 		 433 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.64549  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0130  preprotein translocase subunit SecY  20.31 
 
 		 433 aa  46.2  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00952483  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0130  preprotein translocase subunit SecY  20.31 
 
 		 433 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0066731  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0126  preprotein translocase subunit SecY  20.31 
 
 		 433 aa  46.2  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0265701  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0130  preprotein translocase subunit SecY  20.31 
 
 		 433 aa  46.2  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00164171  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0161  preprotein translocase subunit SecY  20.31 
 
 		 433 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000198533  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0381  preprotein translocase subunit SecY  22.52 
 
 		 452 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0306  preprotein translocase subunit SecY  28.57 
 
 		 421 aa  45.1  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0894763  normal  0.194972 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0614  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  21.88 
 
 		 448 aa  45.1  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00397866  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0886  preprotein translocase subunit SecY  20.8 
 
 		 418 aa  45.4  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.609907  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0275  preprotein translocase subunit SecY  22.36 
 
 		 454 aa  44.7  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0794912  normal  0.75706 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4487  preprotein translocase, SecY subunit  23.15 
 
 		 436 aa  44.7  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3142  preprotein translocase subunit SecY  22.54 
 
 		 440 aa  44.7  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0487569  normal  0.382691 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3885  preprotein translocase subunit SecY  24.68 
 
 		 437 aa  44.3  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0315  preprotein translocase subunit SecY  23.3 
 
 		 437 aa  43.9  0.008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0598799  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1735  preprotein translocase subunit SecY  22.31 
 
 		 452 aa  43.5  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0509  preprotein translocase subunit SecY  22.15 
 
 		 443 aa  43.5  0.009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0470282  hitchhiker  0.00397274 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>