151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0402 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0402  preprotein translocase subunit SecY  100 
 
 		 476 aa  943    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.144908 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0233  preprotein translocase subunit SecY  40.56 
 
 		 476 aa  336  5.999999999999999e-91  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.745222  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_56443  transport protein Sec61 alpha subunit  36.24 
 
 		 559 aa  292  8e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27583  IISP family transporter: protein transport protein Sec61 alpha subunit  37.47 
 
 		 476 aa  288  1e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.527579  normal  0.285595 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1755  Translocon Sec61/SecY, plug domain protein  37.26 
 
 		 469 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.227644  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00040  protein transporter, putative  34.9 
 
 		 478 aa  283  5.000000000000001e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0114  preprotein translocase subunit SecY  37.17 
 
 		 463 aa  283  6.000000000000001e-75  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.000000000441427  hitchhiker  0.00000810769 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68832  Protein transport protein SEC61 alpha subunit  36.62 
 
 		 478 aa  282  1e-74  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1407  preprotein translocase subunit SecY  37.08 
 
 		 443 aa  281  1e-74  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.886151  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07721  hypothetical protein similar to Sec61 (Broad)  34.65 
 
 		 478 aa  281  2e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0245702  normal  0.107035 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0667  preprotein translocase subunit SecY  36.23 
 
 		 442 aa  263  6e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00940535 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0733  preprotein translocase subunit SecY  35.06 
 
 		 443 aa  262  8.999999999999999e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.581929  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1251  preprotein translocase subunit SecY  36.44 
 
 		 442 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.05624  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0156  preprotein translocase subunit SecY  36.23 
 
 		 442 aa  252  1e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1498  preprotein translocase, SecY subunit  34.25 
 
 		 599 aa  243  6e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.312314  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0087  preprotein translocase subunit SecY  32.53 
 
 		 492 aa  242  9e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.023527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1254  preprotein translocase subunit SecY  33.47 
 
 		 482 aa  239  5.999999999999999e-62  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000145561 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1304  preprotein translocase subunit SecY  33.06 
 
 		 459 aa  229  6e-59  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.783086 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0104  preprotein translocase subunit SecY  30.83 
 
 		 479 aa  228  1e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1705  preprotein translocase subunit SecY  31.53 
 
 		 537 aa  219  1e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.602032  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0964  preprotein translocase subunit SecY  31.9 
 
 		 460 aa  218  2e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.905411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0024  preprotein translocase subunit SecY  32.52 
 
 		 492 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00318334  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0465  preprotein translocase subunit SecY  30.06 
 
 		 477 aa  217  4e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1874  preprotein translocase subunit SecY  32.44 
 
 		 465 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.653631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2230  preprotein translocase subunit SecY  29.12 
 
 		 479 aa  210  5e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.408121  normal  0.455137 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0587  preprotein translocase subunit SecY  28.83 
 
 		 477 aa  206  6e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00173275  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0555  preprotein translocase subunit SecY  29.86 
 
 		 477 aa  203  5e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.323996 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2426  preprotein translocase subunit SecY  30.22 
 
 		 492 aa  200  3.9999999999999996e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1034  preprotein translocase subunit SecY  31.87 
 
 		 455 aa  196  7e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000391627 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0233  preprotein translocase, SecY subunit  29.35 
 
 		 489 aa  189  1e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.520667  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1851  preprotein translocase subunit SecY  30.82 
 
 		 504 aa  187  4e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.642367 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2241  preprotein translocase, SecY subunit  28.48 
 
 		 500 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2315  preprotein translocase subunit SecY  28.65 
 
 		 491 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.368701  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80530  protein involved in co-translational pathway of protein transport  27.96 
 
 		 501 aa  145  2e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.453921 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2381  preprotein translocase subunit SecY  23.84 
 
 		 439 aa  67  0.0000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00042664  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2469  preprotein translocase subunit SecY  26.91 
 
 		 434 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0545369  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2214  preprotein translocase subunit SecY  24.52 
 
 		 439 aa  59.3  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.180024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5022  preprotein translocase subunit SecY  23.95 
 
 		 445 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2503  preprotein translocase subunit SecY  26.65 
 
 		 434 aa  58.5  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000332806  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2742  preprotein translocase subunit SecY  26.65 
 
 		 434 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53667e-23 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2545  preprotein translocase subunit SecY  26.65 
 
 		 434 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000778926 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2412  preprotein translocase subunit SecY  26.39 
 
 		 434 aa  57.4  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00625491  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2766  preprotein translocase subunit SecY  26.65 
 
 		 434 aa  57.4  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00224272  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2691  preprotein translocase, SecY subunit  24.05 
 
 		 430 aa  57.4  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.803147  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2747  preprotein translocase subunit SecY  26.39 
 
 		 434 aa  57.4  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.787541  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1046  preprotein translocase subunit SecY  23.53 
 
 		 441 aa  57  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303562  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1062  preprotein translocase subunit SecY  23.53 
 
 		 441 aa  57  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160681  normal  0.323313 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1074  preprotein translocase subunit SecY  23.53 
 
 		 441 aa  57  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0496  preprotein translocase, SecY subunit  23.49 
 
 		 456 aa  56.6  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.437531  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10746  preprotein translocase subunit SecY  25 
 
 		 441 aa  56.6  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.329828 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0886  preprotein translocase subunit SecY  24.87 
 
 		 418 aa  55.5  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.609907  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2547  preprotein translocase subunit SecY  26.39 
 
 		 434 aa  55.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0673869  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1735  preprotein translocase subunit SecY  24.15 
 
 		 452 aa  55.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2734  preprotein translocase subunit SecY  26.39 
 
 		 434 aa  55.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.356112  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0275  preprotein translocase subunit SecY  23.41 
 
 		 454 aa  55.8  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0794912  normal  0.75706 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0381  preprotein translocase subunit SecY  24.57 
 
 		 452 aa  55.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  25.05 
 
 		 437 aa  55.1  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3954  preprotein translocase, SecY subunit  24.93 
 
 		 434 aa  54.7  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  23.16 
 
 		 437 aa  54.7  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2790  preprotein translocase subunit SecY  26.61 
 
 		 434 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000168645  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0441  preprotein translocase subunit SecY  23.79 
 
 		 443 aa  53.9  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6594  preprotein translocase subunit SecY  25.4 
 
 		 436 aa  53.9  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0305  preprotein translocase subunit SecY  23.4 
 
 		 453 aa  54.3  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.398461 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0245  preprotein translocase subunit SecY  23.23 
 
 		 424 aa  53.1  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.101058  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09050  preprotein translocase subunit SecY  22.66 
 
 		 442 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.224184 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3885  preprotein translocase subunit SecY  24.27 
 
 		 437 aa  52.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2514  preprotein translocase subunit SecY  25.37 
 
 		 452 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0857  preprotein translocase subunit SecY  22.66 
 
 		 442 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0979  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  23.46 
 
 		 447 aa  52.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000479753  hitchhiker  0.00549319 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3397  preprotein translocase, SecY subunit  24.73 
 
 		 439 aa  52  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0708  preprotein translocase, SecY subunit  24.87 
 
 		 438 aa  52  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.274333 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1856  preprotein translocase subunit SecY  25.66 
 
 		 421 aa  51.2  0.00004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0780  preprotein translocase subunit SecY  24.03 
 
 		 457 aa  51.2  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1310  preprotein translocase subunit SecY  25.89 
 
 		 436 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4487  preprotein translocase, SecY subunit  25 
 
 		 436 aa  51.2  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  23.54 
 
 		 442 aa  50.8  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1347  preprotein translocase subunit SecY  22.96 
 
 		 445 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1685  preprotein translocase subunit SecY  25.66 
 
 		 421 aa  50.4  0.00006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0215  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  26.29 
 
 		 444 aa  50.4  0.00007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0680  preprotein translocase subunit SecY  23.06 
 
 		 437 aa  50.1  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1863  preprotein translocase subunit SecY  28.08 
 
 		 446 aa  50.1  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0333  preprotein translocase, SecY subunit  23.24 
 
 		 445 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2181  preprotein translocase, SecY subunit  22.96 
 
 		 447 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.318083 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0340  preprotein translocase subunit SecY  23.53 
 
 		 443 aa  49.3  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00542322  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2062  preprotein translocase subunit SecY  25.53 
 
 		 421 aa  49.7  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2459  preprotein translocase, SecY subunit  22.96 
 
 		 447 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1632  preprotein translocase subunit SecY  24.11 
 
 		 439 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0326  preprotein translocase subunit SecY  23.84 
 
 		 437 aa  48.9  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000568003 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0446  preprotein translocase subunit SecY  21.64 
 
 		 443 aa  49.3  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000813945  hitchhiker  0.000170824 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  24 
 
 		 429 aa  49.3  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3929  preprotein translocase subunit SecY  24.58 
 
 		 436 aa  48.5  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0339  preprotein translocase subunit SecY  23.72 
 
 		 440 aa  48.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000142446  unclonable  0.0000000706243 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5059  preprotein translocase subunit SecY  22.8 
 
 		 442 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000898122  normal  0.284155 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0315  preprotein translocase subunit SecY  25.76 
 
 		 437 aa  48.1  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0598799  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3318  preprotein translocase subunit SecY  23.19 
 
 		 441 aa  48.5  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0504  preprotein translocase subunit SecY  22.56 
 
 		 443 aa  48.5  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00015304  normal  0.032999 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2144  preprotein translocase, SecY subunit  23.21 
 
 		 447 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2577  preprotein translocase subunit SecY  22.84 
 
 		 437 aa  47.8  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.477892  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1009  preprotein translocase subunit SecY  21.38 
 
 		 439 aa  47.8  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00114462  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17311  preprotein translocase subunit SecY  24.9 
 
 		 439 aa  47.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>