44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNI00040 on replicon NC_006694
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001304  ANIA_07721  hypothetical protein similar to Sec61 (Broad)  74.51 
 
 		 478 aa  727    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0245702  normal  0.107035 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00040  protein transporter, putative  100 
 
 		 478 aa  967    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_56443  transport protein Sec61 alpha subunit  61.83 
 
 		 559 aa  622  1e-177  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68832  Protein transport protein SEC61 alpha subunit  63.79 
 
 		 478 aa  607  9.999999999999999e-173  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27583  IISP family transporter: protein transport protein Sec61 alpha subunit  60 
 
 		 476 aa  588  1e-167  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.527579  normal  0.285595 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0402  preprotein translocase subunit SecY  34.9 
 
 		 476 aa  283  5.000000000000001e-75  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.144908 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1407  preprotein translocase subunit SecY  35.36 
 
 		 443 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.886151  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0667  preprotein translocase subunit SecY  33.62 
 
 		 442 aa  268  1e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00940535 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0733  preprotein translocase subunit SecY  35.1 
 
 		 443 aa  263  4e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.581929  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1251  preprotein translocase subunit SecY  33.83 
 
 		 442 aa  258  2e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.05624  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0156  preprotein translocase subunit SecY  33.83 
 
 		 442 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80530  protein involved in co-translational pathway of protein transport  32.01 
 
 		 501 aa  253  5.000000000000001e-66  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.453921 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0233  preprotein translocase subunit SecY  33.19 
 
 		 476 aa  239  1e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.745222  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0087  preprotein translocase subunit SecY  33.06 
 
 		 492 aa  227  3e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.023527  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1755  Translocon Sec61/SecY, plug domain protein  33.48 
 
 		 469 aa  225  1e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.227644  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1498  preprotein translocase, SecY subunit  32.36 
 
 		 599 aa  224  2e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.312314  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0587  preprotein translocase subunit SecY  31.66 
 
 		 477 aa  213  5.999999999999999e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00173275  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0114  preprotein translocase subunit SecY  31.9 
 
 		 463 aa  213  7.999999999999999e-54  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.000000000441427  hitchhiker  0.00000810769 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0465  preprotein translocase subunit SecY  29.29 
 
 		 477 aa  207  2e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2230  preprotein translocase subunit SecY  29.4 
 
 		 479 aa  206  1e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.408121  normal  0.455137 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2426  preprotein translocase subunit SecY  30.27 
 
 		 492 aa  204  3e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0104  preprotein translocase subunit SecY  28.69 
 
 		 479 aa  203  7e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0024  preprotein translocase subunit SecY  31.3 
 
 		 492 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00318334  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0233  preprotein translocase, SecY subunit  30.33 
 
 		 489 aa  199  1.0000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.520667  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2241  preprotein translocase, SecY subunit  30.3 
 
 		 500 aa  197  3e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0555  preprotein translocase subunit SecY  28.63 
 
 		 477 aa  197  4.0000000000000005e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.323996 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1705  preprotein translocase subunit SecY  29.8 
 
 		 537 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.602032  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1254  preprotein translocase subunit SecY  29.36 
 
 		 482 aa  184  4.0000000000000006e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000145561 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1851  preprotein translocase subunit SecY  29.93 
 
 		 504 aa  183  5.0000000000000004e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.642367 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1304  preprotein translocase subunit SecY  27.95 
 
 		 459 aa  179  9e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.783086 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2315  preprotein translocase subunit SecY  30.18 
 
 		 491 aa  173  6.999999999999999e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.368701  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1034  preprotein translocase subunit SecY  27.99 
 
 		 455 aa  167  4e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000391627 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1874  preprotein translocase subunit SecY  27.7 
 
 		 465 aa  166  9e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.653631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0964  preprotein translocase subunit SecY  26.48 
 
 		 460 aa  163  6e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.905411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2135  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  24.22 
 
 		 428 aa  51.2  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233384  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0496  preprotein translocase, SecY subunit  21.91 
 
 		 456 aa  48.9  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.437531  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0504  preprotein translocase subunit SecY  20.87 
 
 		 443 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390206  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0474  preprotein translocase subunit SecY  20.87 
 
 		 443 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.733359  hitchhiker  0.00000433507 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0680  preprotein translocase subunit SecY  21.6 
 
 		 437 aa  44.7  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  23.16 
 
 		 435 aa  44.3  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4729  preprotein translocase subunit SecY  20.87 
 
 		 443 aa  43.9  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0376135  normal  0.430849 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0507  preprotein translocase subunit SecY  20.87 
 
 		 443 aa  43.9  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0640452  normal  0.0135524 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0857  preprotein translocase subunit SecY  22.16 
 
 		 442 aa  43.5  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09050  preprotein translocase subunit SecY  22.16 
 
 		 442 aa  43.5  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.224184 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>