127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0114 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1755  Translocon Sec61/SecY, plug domain protein  71.91 
 
 		 469 aa  667    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.227644  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0114  preprotein translocase subunit SecY  100 
 
 		 463 aa  900    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.000000000441427  hitchhiker  0.00000810769 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0233  preprotein translocase subunit SecY  37.66 
 
 		 476 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.745222  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0402  preprotein translocase subunit SecY  37.17 
 
 		 476 aa  288  1e-76  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.144908 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1304  preprotein translocase subunit SecY  35.17 
 
 		 459 aa  256  6e-67  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.783086 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1874  preprotein translocase subunit SecY  35.28 
 
 		 465 aa  249  1e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.653631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0964  preprotein translocase subunit SecY  33.62 
 
 		 460 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.905411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1034  preprotein translocase subunit SecY  35.41 
 
 		 455 aa  238  2e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000391627 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1407  preprotein translocase subunit SecY  32.83 
 
 		 443 aa  237  3e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.886151  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0104  preprotein translocase subunit SecY  30.88 
 
 		 479 aa  236  8e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0465  preprotein translocase subunit SecY  31.76 
 
 		 477 aa  233  6e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1254  preprotein translocase subunit SecY  36.25 
 
 		 482 aa  231  2e-59  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000145561 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0087  preprotein translocase subunit SecY  31.01 
 
 		 492 aa  224  3e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.023527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2230  preprotein translocase subunit SecY  29.3 
 
 		 479 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.408121  normal  0.455137 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0667  preprotein translocase subunit SecY  31.82 
 
 		 442 aa  216  5e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00940535 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07721  hypothetical protein similar to Sec61 (Broad)  32.91 
 
 		 478 aa  215  9.999999999999999e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0245702  normal  0.107035 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00040  protein transporter, putative  31.75 
 
 		 478 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_56443  transport protein Sec61 alpha subunit  30.95 
 
 		 559 aa  213  4.9999999999999996e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0555  preprotein translocase subunit SecY  29.1 
 
 		 477 aa  212  1e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.323996 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1251  preprotein translocase subunit SecY  31.81 
 
 		 442 aa  212  1e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.05624  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0733  preprotein translocase subunit SecY  30.13 
 
 		 443 aa  209  8e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.581929  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0587  preprotein translocase subunit SecY  28.31 
 
 		 477 aa  208  2e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00173275  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0156  preprotein translocase subunit SecY  30.94 
 
 		 442 aa  206  6e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0024  preprotein translocase subunit SecY  28.28 
 
 		 492 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00318334  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1498  preprotein translocase, SecY subunit  29.57 
 
 		 599 aa  199  6e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.312314  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27583  IISP family transporter: protein transport protein Sec61 alpha subunit  30.69 
 
 		 476 aa  199  6e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.527579  normal  0.285595 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68832  Protein transport protein SEC61 alpha subunit  30.42 
 
 		 478 aa  196  1e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2426  preprotein translocase subunit SecY  28.81 
 
 		 492 aa  186  5e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0233  preprotein translocase, SecY subunit  28.31 
 
 		 489 aa  179  1e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.520667  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2315  preprotein translocase subunit SecY  28.08 
 
 		 491 aa  166  8e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.368701  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2241  preprotein translocase, SecY subunit  26.76 
 
 		 500 aa  164  5.0000000000000005e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1705  preprotein translocase subunit SecY  34.1 
 
 		 537 aa  163  6e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.602032  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1851  preprotein translocase subunit SecY  28.93 
 
 		 504 aa  163  8.000000000000001e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.642367 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80530  protein involved in co-translational pathway of protein transport  25.81 
 
 		 501 aa  123  7e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.453921 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1000  preprotein translocase, SecY subunit  25.35 
 
 		 419 aa  67  0.0000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00382146  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2237  preprotein translocase subunit SecY  25.93 
 
 		 437 aa  65.5  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.104557  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  25.22 
 
 		 437 aa  65.9  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0496  preprotein translocase, SecY subunit  25.38 
 
 		 456 aa  63.2  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.437531  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2135  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  24.41 
 
 		 428 aa  62  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233384  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  24.67 
 
 		 437 aa  61.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0215  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  21.81 
 
 		 444 aa  58.5  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  24.66 
 
 		 420 aa  57.4  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  25.11 
 
 		 435 aa  57  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1374  preprotein translocase subunit SecY  21.51 
 
 		 431 aa  55.8  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0289241  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0680  preprotein translocase subunit SecY  23.55 
 
 		 437 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2158  preprotein translocase, SecY subunit  23.44 
 
 		 426 aa  55.5  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00470545  normal  0.460281 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5144  preprotein translocase, SecY subunit  23.45 
 
 		 437 aa  54.3  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.552257 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1312  preprotein translocase subunit SecY  22.57 
 
 		 431 aa  54.3  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000457849  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0509  preprotein translocase subunit SecY  25.24 
 
 		 443 aa  53.5  0.000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0470282  hitchhiker  0.00397274 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  22.89 
 
 		 437 aa  53.5  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0339  preprotein translocase subunit SecY  29.48 
 
 		 440 aa  53.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000142446  unclonable  0.0000000706243 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  23.62 
 
 		 435 aa  53.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  0.000000811889 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0504  preprotein translocase subunit SecY  24.82 
 
 		 443 aa  53.1  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00015304  normal  0.032999 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0326  preprotein translocase subunit SecY  25.42 
 
 		 437 aa  52.8  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000568003 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0446  preprotein translocase subunit SecY  24.3 
 
 		 443 aa  53.1  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000813945  hitchhiker  0.000170824 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0414  preprotein translocase subunit SecY  27.75 
 
 		 444 aa  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0582  preprotein translocase subunit SecY  29.33 
 
 		 435 aa  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1856  preprotein translocase, SecY subunit  23.18 
 
 		 446 aa  52.4  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0112849  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1106  protein translocase subunit SecY/sec61 alpha  24.31 
 
 		 438 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.105713 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0389  preprotein translocase subunit SecY  27.17 
 
 		 444 aa  51.6  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1360  preprotein translocase, SecY subunit  25.51 
 
 		 423 aa  52  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  26.01 
 
 		 442 aa  51.2  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1269  preprotein translocase subunit SecY  25.36 
 
 		 455 aa  51.2  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1246  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  27.12 
 
 		 463 aa  50.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.031052  hitchhiker  0.00314824 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2923  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  26.04 
 
 		 427 aa  50.4  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000208113  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2045  preprotein translocase, SecY subunit  23.5 
 
 		 435 aa  50.4  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000027617  hitchhiker  0.00154147 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1165  preprotein translocase, SecY subunit  23.99 
 
 		 450 aa  50.1  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000330141  normal  0.11389 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1399  preprotein translocase, SecY subunit  22.41 
 
 		 446 aa  50.1  0.00009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0797  preprotein translocase subunit SecY  23.41 
 
 		 457 aa  49.3  0.0001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.14214  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0494  preprotein translocase subunit SecY  23.26 
 
 		 438 aa  49.3  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.443171  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0721  preprotein translocase subunit SecY  24.36 
 
 		 435 aa  49.3  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3885  preprotein translocase subunit SecY  25.78 
 
 		 437 aa  50.1  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1118  preprotein translocase subunit SecY  27.84 
 
 		 428 aa  49.3  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.348488  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4006  preprotein translocase, SecY subunit  24.67 
 
 		 450 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000605815  hitchhiker  0.000026914 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  21.71 
 
 		 443 aa  49.7  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  0.0000000000266535 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3318  preprotein translocase subunit SecY  26.2 
 
 		 441 aa  49.7  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  21.71 
 
 		 443 aa  49.7  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  22.84 
 
 		 435 aa  48.9  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  23.19 
 
 		 429 aa  48.9  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  22 
 
 		 435 aa  48.5  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23211  preprotein translocase subunit SecY  23.74 
 
 		 439 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0306  preprotein translocase subunit SecY  27.33 
 
 		 421 aa  48.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0894763  normal  0.194972 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1565  preprotein translocase subunit SecY  22.22 
 
 		 443 aa  48.1  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.112443  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  21.93 
 
 		 435 aa  47.8  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000602472 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2379  preprotein translocase subunit SecY  20.65 
 
 		 425 aa  47.8  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3647  preprotein translocase, SecY subunit  26.06 
 
 		 442 aa  47.4  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00118801  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00958  preprotein translocase subunit SecY  23.77 
 
 		 434 aa  47.4  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0058755  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_436  preprotein translocase subunit SecY  23.2 
 
 		 438 aa  47  0.0006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0195945  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2694  preprotein translocase subunit SecY  20.65 
 
 		 425 aa  47  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0979  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  22.37 
 
 		 447 aa  46.2  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000479753  hitchhiker  0.00549319 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3686  preprotein translocase, SecY subunit  29.17 
 
 		 441 aa  46.2  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000792509  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0471  preprotein translocase subunit SecY  23.02 
 
 		 438 aa  46.2  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00922913  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3929  preprotein translocase subunit SecY  23.33 
 
 		 436 aa  46.6  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0245  preprotein translocase subunit SecY  28.26 
 
 		 471 aa  46.2  0.001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  22.25 
 
 		 443 aa  45.8  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2313  preprotein translocase subunit SecY  28.82 
 
 		 421 aa  45.8  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0367996  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2257  preprotein translocase subunit SecY  22.62 
 
 		 430 aa  45.8  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0110363  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2298  preprotein translocase subunit SecY  22.62 
 
 		 430 aa  45.8  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  24.67 
 
 		 445 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0442  preprotein translocase subunit SecY  24.1 
 
 		 429 aa  45.8  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>