More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2923 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2923  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  100 
 
 		 427 aa  845    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000208113  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0778  preprotein translocase, SecY subunit  65.65 
 
 		 430 aa  572  1.0000000000000001e-162  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000100686  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1726  preprotein translocase, SecY subunit  56.82 
 
 		 435 aa  476  1e-133  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000716119  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  55.37 
 
 		 420 aa  456  1e-127  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0886  preprotein translocase subunit SecY  55.53 
 
 		 418 aa  456  1e-127  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.609907  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0245  preprotein translocase subunit SecY  52.91 
 
 		 424 aa  447  1.0000000000000001e-124  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.101058  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0306  preprotein translocase subunit SecY  53.15 
 
 		 421 aa  443  1e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0894763  normal  0.194972 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0235  preprotein translocase subunit SecY  52.93 
 
 		 419 aa  444  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00849669  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1504  preprotein translocase subunit SecY  52.46 
 
 		 419 aa  435  1e-121  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2313  preprotein translocase subunit SecY  53.61 
 
 		 421 aa  432  1e-120  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0367996  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0442  preprotein translocase subunit SecY  52.33 
 
 		 429 aa  425  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0214  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  53.15 
 
 		 419 aa  415  9.999999999999999e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.32801  normal  0.494063 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  49.43 
 
 		 447 aa  388  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2694  preprotein translocase subunit SecY  47.33 
 
 		 425 aa  385  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  49.2 
 
 		 447 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  49.43 
 
 		 447 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2379  preprotein translocase subunit SecY  47.1 
 
 		 425 aa  385  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  48.24 
 
 		 445 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  46.93 
 
 		 429 aa  379  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  45.81 
 
 		 435 aa  375  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0973  preprotein translocase subunit SecY  48.86 
 
 		 428 aa  375  1e-102  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5144  preprotein translocase, SecY subunit  46.15 
 
 		 437 aa  373  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.552257 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6029  preprotein translocase subunit SecY  46.28 
 
 		 430 aa  372  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3985  preprotein translocase, SecY subunit  47.94 
 
 		 448 aa  369  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1164  preprotein translocase, SecY subunit  45.31 
 
 		 431 aa  369  1e-101  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01360  preprotein translocase, SecY subunit  47.47 
 
 		 422 aa  369  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000700723  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  45.7 
 
 		 435 aa  371  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0131  preprotein translocase subunit SecY  48.42 
 
 		 430 aa  368  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.129381  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3885  preprotein translocase subunit SecY  47.88 
 
 		 437 aa  370  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  44.78 
 
 		 435 aa  367  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  0.000000811889 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  44.37 
 
 		 435 aa  365  1e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1106  protein translocase subunit SecY/sec61 alpha  44.93 
 
 		 438 aa  364  2e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.105713 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2691  preprotein translocase, SecY subunit  45.5 
 
 		 430 aa  363  3e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.803147  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  44.65 
 
 		 435 aa  363  3e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000602472 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  44.8 
 
 		 437 aa  363  4e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0602  preprotein translocase subunit SecY  45.19 
 
 		 430 aa  363  4e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.637505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1000  preprotein translocase, SecY subunit  44.49 
 
 		 419 aa  363  5.0000000000000005e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00382146  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0127  preprotein translocase subunit SecY  47.07 
 
 		 430 aa  362  6e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  44.42 
 
 		 435 aa  361  2e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4301  preprotein translocase, SecY subunit  45.74 
 
 		 432 aa  360  3e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2135  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  44.72 
 
 		 428 aa  359  5e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233384  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  45.92 
 
 		 442 aa  359  5e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6594  preprotein translocase subunit SecY  46.73 
 
 		 436 aa  358  7e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0700  preprotein translocase subunit SecY  44.37 
 
 		 435 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.418561  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0607  preprotein translocase, SecY subunit  46.44 
 
 		 429 aa  357  1.9999999999999998e-97  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0598508  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0582  preprotein translocase subunit SecY  45.98 
 
 		 435 aa  355  7.999999999999999e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2742  preprotein translocase subunit SecY  44.01 
 
 		 434 aa  355  1e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53667e-23 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0326  preprotein translocase subunit SecY  45.76 
 
 		 437 aa  355  1e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000568003 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2503  preprotein translocase subunit SecY  44.16 
 
 		 434 aa  354  2e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000332806  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4487  preprotein translocase, SecY subunit  45.17 
 
 		 436 aa  354  2e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0647  preprotein translocase, SecY subunit  45.02 
 
 		 432 aa  354  2e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0309  preprotein translocase subunit SecY  43.99 
 
 		 443 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0197098  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3647  preprotein translocase, SecY subunit  43.3 
 
 		 442 aa  353  4e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00118801  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2547  preprotein translocase subunit SecY  43.78 
 
 		 434 aa  352  5e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0673869  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0721  preprotein translocase subunit SecY  43.68 
 
 		 435 aa  352  5e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2734  preprotein translocase subunit SecY  43.78 
 
 		 434 aa  352  5e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.356112  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2545  preprotein translocase subunit SecY  43.55 
 
 		 434 aa  352  5e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000778926 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1118  preprotein translocase subunit SecY  44.62 
 
 		 428 aa  352  5.9999999999999994e-96  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.348488  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1006  preprotein translocase subunit SecY  45.35 
 
 		 446 aa  352  8e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38875  hitchhiker  0.00669682 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2747  preprotein translocase subunit SecY  43.32 
 
 		 434 aa  352  8.999999999999999e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.787541  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29540  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  45.45 
 
 		 429 aa  351  1e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.498773  normal  0.844433 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2766  preprotein translocase subunit SecY  43.32 
 
 		 434 aa  350  2e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00224272  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2469  preprotein translocase subunit SecY  43.55 
 
 		 434 aa  351  2e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0545369  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1147  preprotein translocase, SecY subunit  44.81 
 
 		 445 aa  349  6e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  44.6 
 
 		 443 aa  349  6e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  43.81 
 
 		 437 aa  348  9e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5022  preprotein translocase subunit SecY  44.81 
 
 		 445 aa  348  9e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  43.91 
 
 		 437 aa  348  9e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1863  preprotein translocase subunit SecY  45.15 
 
 		 446 aa  348  1e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2412  preprotein translocase subunit SecY  42.86 
 
 		 434 aa  348  1e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00625491  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0862  preprotein translocase, SecY subunit  44.87 
 
 		 438 aa  348  1e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.148817  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0130  preprotein translocase subunit SecY  44.16 
 
 		 433 aa  347  2e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0066731  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0130  preprotein translocase subunit SecY  44.16 
 
 		 433 aa  347  2e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00164171  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0126  preprotein translocase subunit SecY  44.16 
 
 		 433 aa  347  2e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0265701  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0124  preprotein translocase subunit SecY  44.16 
 
 		 433 aa  347  2e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.64549  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0161  preprotein translocase subunit SecY  44.16 
 
 		 433 aa  347  2e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000198533  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0130  preprotein translocase subunit SecY  44.16 
 
 		 433 aa  347  2e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00952483  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1565  preprotein translocase subunit SecY  44.6 
 
 		 443 aa  347  2e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.112443  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3686  preprotein translocase, SecY subunit  43.88 
 
 		 441 aa  347  2e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000792509  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1074  preprotein translocase subunit SecY  43.21 
 
 		 441 aa  347  3e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0125  preprotein translocase subunit SecY  43.94 
 
 		 433 aa  347  3e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00395698  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0333  preprotein translocase, SecY subunit  44.21 
 
 		 445 aa  347  3e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1046  preprotein translocase subunit SecY  43.21 
 
 		 441 aa  347  3e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303562  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1062  preprotein translocase subunit SecY  43.21 
 
 		 441 aa  347  3e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160681  normal  0.323313 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5175  preprotein translocase subunit SecY  43.94 
 
 		 433 aa  346  4e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000485174  unclonable  4.1263e-25 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4295  preprotein translocase subunit SecY  44.52 
 
 		 441 aa  346  4e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00554636 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2790  preprotein translocase subunit SecY  44.01 
 
 		 434 aa  346  4e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000168645  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1976  preprotein translocase subunit SecY  44.71 
 
 		 446 aa  346  4e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.923807  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0151  preprotein translocase subunit SecY  43.94 
 
 		 433 aa  346  5e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0158065  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1374  preprotein translocase subunit SecY  41.55 
 
 		 431 aa  345  7e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0289241  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2626  preprotein translocase subunit SecY  43.4 
 
 		 442 aa  345  8.999999999999999e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.512513  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  44.29 
 
 		 443 aa  345  1e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  0.0000000000266535 
 
 
-
 
NC_004310  BR1213  preprotein translocase subunit SecY  44.47 
 
 		 446 aa  345  1e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3903  preprotein translocase subunit SecY  44.86 
 
 		 441 aa  345  1e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.340332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10746  preprotein translocase subunit SecY  43.43 
 
 		 441 aa  345  1e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.329828 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  44.29 
 
 		 443 aa  345  1e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1176  preprotein translocase subunit SecY  44 
 
 		 446 aa  344  2e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0379017  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04180  preprotein translocase subunit SecY  44.67 
 
 		 435 aa  344  2e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2756  preprotein translocase, SecY subunit  44.81 
 
 		 443 aa  344  2e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.373135  normal  0.477854 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09050  preprotein translocase subunit SecY  44.37 
 
 		 442 aa  343  4e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.224184 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>