More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2756 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1374  preprotein translocase, SecY subunit  70.72 
 
 		 444 aa  640    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285774  normal  0.105212 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0560  preprotein translocase, SecY subunit  71.11 
 
 		 442 aa  636    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1176  preprotein translocase subunit SecY  74.32 
 
 		 446 aa  680    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0379017  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1352  preprotein translocase subunit SecY  73.87 
 
 		 446 aa  660    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0023208  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_004310  BR1213  preprotein translocase subunit SecY  74.55 
 
 		 446 aa  682    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2756  preprotein translocase, SecY subunit  100 
 
 		 443 aa  884    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.373135  normal  0.477854 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  75.4 
 
 		 443 aa  690    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2198  preprotein translocase, SecY subunit  71.66 
 
 		 448 aa  635    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0470035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2668  preprotein translocase subunit SecY  74.89 
 
 		 447 aa  672    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0333  preprotein translocase, SecY subunit  72.97 
 
 		 445 aa  661    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2315  preprotein translocase subunit SecY  76.52 
 
 		 443 aa  679    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.775008  normal  0.296135 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4778  preprotein translocase subunit SecY  75.85 
 
 		 444 aa  676    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000420552 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1006  preprotein translocase subunit SecY  76.13 
 
 		 446 aa  689    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38875  hitchhiker  0.00669682 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3428  preprotein translocase subunit SecY  76.3 
 
 		 443 aa  679    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452831  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3164  preprotein translocase subunit SecY  76.52 
 
 		 443 aa  677    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0194839  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1565  preprotein translocase subunit SecY  75.4 
 
 		 443 aa  687    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.112443  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1976  preprotein translocase subunit SecY  74.32 
 
 		 446 aa  684    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.923807  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3647  preprotein translocase subunit SecY  76.98 
 
 		 443 aa  684    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1658  preprotein translocase subunit SecY  76.13 
 
 		 446 aa  661    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.398859  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1863  preprotein translocase subunit SecY  73.87 
 
 		 446 aa  671    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1450  preprotein translocase subunit SecY  73.2 
 
 		 446 aa  659    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337945  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1928  preprotein translocase, SecY subunit  72.75 
 
 		 445 aa  647    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5050  preprotein translocase subunit SecY  76.98 
 
 		 444 aa  701    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.478224  normal  0.981585 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0718  preprotein translocase subunit SecY  69.13 
 
 		 448 aa  629  1e-179  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.214912  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2459  preprotein translocase, SecY subunit  70.29 
 
 		 447 aa  619  1e-176  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2181  preprotein translocase, SecY subunit  70.29 
 
 		 447 aa  619  1e-176  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.318083 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2144  preprotein translocase, SecY subunit  70.98 
 
 		 447 aa  619  1e-176  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2986  preprotein translocase subunit SecY  65.85 
 
 		 448 aa  607  1e-173  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1926  preprotein translocase, SecY subunit  65.15 
 
 		 449 aa  595  1e-169  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.796685  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1634  preprotein translocase subunit SecY  64.89 
 
 		 452 aa  581  1e-164  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0116955  normal  0.0410443 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1333  preprotein translocase subunit SecY  62.64 
 
 		 455 aa  580  1e-164  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.158258 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0381  preprotein translocase subunit SecY  63.96 
 
 		 452 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1735  preprotein translocase subunit SecY  63.96 
 
 		 452 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0780  preprotein translocase subunit SecY  63.43 
 
 		 457 aa  575  1.0000000000000001e-163  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  65.81 
 
 		 442 aa  573  1.0000000000000001e-162  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0305  preprotein translocase subunit SecY  63.78 
 
 		 453 aa  565  1e-160  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.398461 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0339  preprotein translocase subunit SecY  61.61 
 
 		 440 aa  558  1e-158  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000142446  unclonable  0.0000000706243 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0425  preprotein translocase subunit SecY  63.53 
 
 		 437 aa  560  1e-158  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.65116  normal  0.157207 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0299  preprotein translocase subunit SecY  63.22 
 
 		 440 aa  555  1e-157  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000631755  hitchhiker  0.00000321163 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2514  preprotein translocase subunit SecY  64.41 
 
 		 452 aa  557  1e-157  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2798  preprotein translocase subunit SecY  61.37 
 
 		 457 aa  549  1e-155  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.558016 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1269  preprotein translocase subunit SecY  57.58 
 
 		 455 aa  546  1e-154  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3318  preprotein translocase subunit SecY  59.64 
 
 		 441 aa  541  1e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0275  preprotein translocase subunit SecY  62.25 
 
 		 454 aa  542  1e-153  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0794912  normal  0.75706 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0612  preprotein translocase subunit SecY  61.35 
 
 		 456 aa  536  1e-151  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1775  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  60.75 
 
 		 446 aa  536  1e-151  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.152379  normal  0.149147 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0787  preprotein translocase subunit SecY  61.56 
 
 		 442 aa  533  1e-150  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0142235  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2305  preprotein translocase subunit SecY  58.65 
 
 		 453 aa  526  1e-148  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0325321  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0621  preprotein translocase subunit SecY  60.84 
 
 		 439 aa  522  1e-147  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0393  preprotein translocase subunit SecY  61.63 
 
 		 439 aa  524  1e-147  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0413341  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0401  preprotein translocase subunit SecY  61.63 
 
 		 439 aa  524  1e-147  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4223  preprotein translocase subunit SecY  59.55 
 
 		 436 aa  520  1e-146  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0505149  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2305  preprotein translocase subunit SecY  60.1 
 
 		 437 aa  519  1e-146  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.773218 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3423  preprotein translocase subunit SecY  60.89 
 
 		 436 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.23916 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  59.72 
 
 		 443 aa  515  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  0.0000000000266535 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  59.72 
 
 		 443 aa  515  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0315  preprotein translocase subunit SecY  59.91 
 
 		 437 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0598799  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1042  preprotein translocase subunit SecY  60.15 
 
 		 439 aa  514  1e-144  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2149  preprotein translocase, SecY subunit  60.94 
 
 		 448 aa  510  1e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0576412  normal  0.122998 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0441  preprotein translocase subunit SecY  58.41 
 
 		 443 aa  510  1e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1009  preprotein translocase subunit SecY  56.58 
 
 		 439 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00114462  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3929  preprotein translocase subunit SecY  57.47 
 
 		 436 aa  505  9.999999999999999e-143  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0233  preprotein translocase subunit SecY  57.38 
 
 		 446 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000181445  unclonable  0.0000105897 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0739  preprotein translocase subunit SecY  57.08 
 
 		 440 aa  506  9.999999999999999e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00521081  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4670  preprotein translocase subunit SecY  57.62 
 
 		 446 aa  503  1e-141  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000509869  unclonable  0.0000000121988 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00958  preprotein translocase subunit SecY  55.99 
 
 		 434 aa  504  1e-141  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0058755  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4298  preprotein translocase subunit SecY  57.62 
 
 		 446 aa  503  1e-141  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000258427  unclonable  0.0000000000837901 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  56.45 
 
 		 435 aa  504  1e-141  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0178  preprotein translocase subunit SecY  57.86 
 
 		 446 aa  504  1e-141  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000408952  hitchhiker  0.00214614 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5050  preprotein translocase subunit SecY  59.01 
 
 		 437 aa  499  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.34117  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0168  preprotein translocase subunit SecY  58.33 
 
 		 446 aa  498  1e-140  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000114541  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2352  preprotein translocase subunit SecY  57.98 
 
 		 441 aa  496  1e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299181  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0838  preprotein translocase subunit SecY  60.56 
 
 		 434 aa  496  1e-139  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2154  preprotein translocase subunit SecY  57.24 
 
 		 444 aa  497  1e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000317062  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  56.22 
 
 		 435 aa  497  1e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  0.000000811889 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0495  preprotein translocase subunit SecY  57.27 
 
 		 439 aa  497  1e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0340  preprotein translocase subunit SecY  57.73 
 
 		 435 aa  497  1e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.670272  hitchhiker  0.000594925 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  55.3 
 
 		 435 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0646  preprotein translocase, SecY subunit  56.77 
 
 		 444 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.617938  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4528  preprotein translocase subunit SecY  56.77 
 
 		 444 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.447133  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3159  preprotein translocase subunit SecY  57.88 
 
 		 447 aa  494  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.453709  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0340  preprotein translocase subunit SecY  56.35 
 
 		 443 aa  492  9.999999999999999e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00542322  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0190  preprotein translocase subunit SecY  58.1 
 
 		 446 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000711222  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0474  preprotein translocase subunit SecY  56.53 
 
 		 443 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.733359  hitchhiker  0.00000433507 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0251  preprotein translocase subunit SecY  57.62 
 
 		 446 aa  490  1e-137  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001722  preprotein translocase SecY subunit  55.99 
 
 		 444 aa  489  1e-137  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000228975  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4729  preprotein translocase subunit SecY  56.29 
 
 		 443 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0376135  normal  0.430849 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5059  preprotein translocase subunit SecY  56.77 
 
 		 442 aa  490  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000898122  normal  0.284155 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0357  preprotein translocase subunit SecY  57.45 
 
 		 442 aa  490  1e-137  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000838517  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0507  preprotein translocase subunit SecY  56.29 
 
 		 443 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0640452  normal  0.0135524 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3297  preprotein translocase subunit SecY  57.3 
 
 		 447 aa  488  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0857  preprotein translocase subunit SecY  56.53 
 
 		 442 aa  491  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2304  preprotein translocase subunit SecY  60.45 
 
 		 451 aa  490  1e-137  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0219  preprotein translocase subunit SecY  57.62 
 
 		 446 aa  491  1e-137  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000744124  unclonable  0.0000000000304117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0214  preprotein translocase subunit SecY  57.62 
 
 		 446 aa  491  1e-137  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000092283  hitchhiker  0.00772115 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09050  preprotein translocase subunit SecY  56.53 
 
 		 442 aa  491  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.224184 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0204  preprotein translocase subunit SecY  57.86 
 
 		 446 aa  489  1e-137  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000662692  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0219  preprotein translocase subunit SecY  57.62 
 
 		 446 aa  491  1e-137  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000110874  hitchhiker  0.00000000176689 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0343  preprotein translocase, SecY subunit  56.45 
 
 		 444 aa  491  1e-137  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000192463  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1834  preprotein translocase subunit SecY  57.45 
 
 		 442 aa  490  1e-137  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00171083  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>