More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0867 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  100 
 
 		 442 aa  884    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2756  preprotein translocase, SecY subunit  65.81 
 
 		 443 aa  573  1.0000000000000001e-162  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.373135  normal  0.477854 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  65.58 
 
 		 443 aa  568  1e-161  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  0.0000000000266535 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  65.58 
 
 		 443 aa  568  1e-161  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  62.61 
 
 		 435 aa  565  1e-160  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0339  preprotein translocase subunit SecY  62.42 
 
 		 440 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000142446  unclonable  0.0000000706243 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0425  preprotein translocase subunit SecY  65.43 
 
 		 437 aa  561  1.0000000000000001e-159  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.65116  normal  0.157207 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  61.63 
 
 		 435 aa  558  1e-158  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3318  preprotein translocase subunit SecY  62.87 
 
 		 441 aa  560  1e-158  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  62.88 
 
 		 429 aa  556  1e-157  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  61.95 
 
 		 435 aa  558  1e-157  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  0.000000811889 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  62.41 
 
 		 435 aa  556  1e-157  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2305  preprotein translocase subunit SecY  64.04 
 
 		 453 aa  552  1e-156  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0325321  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  61.47 
 
 		 437 aa  553  1e-156  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  61.25 
 
 		 435 aa  552  1e-156  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  61.02 
 
 		 435 aa  545  1e-154  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000602472 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0299  preprotein translocase subunit SecY  64.29 
 
 		 440 aa  546  1e-154  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000631755  hitchhiker  0.00000321163 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5050  preprotein translocase subunit SecY  62.5 
 
 		 444 aa  544  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.478224  normal  0.981585 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0721  preprotein translocase subunit SecY  61.63 
 
 		 435 aa  544  1e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0700  preprotein translocase subunit SecY  61.93 
 
 		 435 aa  539  9.999999999999999e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.418561  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  59.54 
 
 		 437 aa  538  1e-151  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3647  preprotein translocase subunit SecY  63.72 
 
 		 443 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0315  preprotein translocase subunit SecY  62.3 
 
 		 437 aa  536  1e-151  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0598799  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  61.45 
 
 		 443 aa  532  1e-150  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2352  preprotein translocase subunit SecY  60.42 
 
 		 441 aa  530  1e-149  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299181  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3423  preprotein translocase subunit SecY  63.99 
 
 		 436 aa  530  1e-149  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.23916 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2986  preprotein translocase subunit SecY  61.45 
 
 		 448 aa  530  1e-149  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1976  preprotein translocase subunit SecY  62.24 
 
 		 446 aa  530  1e-149  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.923807  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2668  preprotein translocase subunit SecY  61.81 
 
 		 447 aa  528  1e-149  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1565  preprotein translocase subunit SecY  61.45 
 
 		 443 aa  529  1e-149  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.112443  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4778  preprotein translocase subunit SecY  62.88 
 
 		 444 aa  530  1e-149  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000420552 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  58.62 
 
 		 437 aa  528  1e-149  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1213  preprotein translocase subunit SecY  61.77 
 
 		 446 aa  528  1e-148  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1176  preprotein translocase subunit SecY  61.77 
 
 		 446 aa  526  1e-148  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0379017  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0787  preprotein translocase subunit SecY  63.11 
 
 		 442 aa  527  1e-148  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0142235  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0333  preprotein translocase, SecY subunit  60.42 
 
 		 445 aa  526  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2237  preprotein translocase subunit SecY  60.46 
 
 		 437 aa  521  1e-147  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.104557  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1006  preprotein translocase subunit SecY  60.93 
 
 		 446 aa  521  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38875  hitchhiker  0.00669682 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2315  preprotein translocase subunit SecY  61.86 
 
 		 443 aa  523  1e-147  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.775008  normal  0.296135 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4223  preprotein translocase subunit SecY  62.77 
 
 		 436 aa  522  1e-147  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0505149  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2149  preprotein translocase, SecY subunit  61.98 
 
 		 448 aa  522  1e-147  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0576412  normal  0.122998 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0621  preprotein translocase subunit SecY  61.7 
 
 		 439 aa  524  1e-147  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1863  preprotein translocase subunit SecY  60.51 
 
 		 446 aa  520  1e-146  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2305  preprotein translocase subunit SecY  62.38 
 
 		 437 aa  519  1e-146  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.773218 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0401  preprotein translocase subunit SecY  61.93 
 
 		 439 aa  520  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2304  preprotein translocase subunit SecY  62.25 
 
 		 451 aa  521  1e-146  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3428  preprotein translocase subunit SecY  61.86 
 
 		 443 aa  521  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452831  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3164  preprotein translocase subunit SecY  62.33 
 
 		 443 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0194839  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0393  preprotein translocase subunit SecY  61.93 
 
 		 439 aa  520  1e-146  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0413341  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5050  preprotein translocase subunit SecY  62.93 
 
 		 437 aa  516  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.34117  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1042  preprotein translocase subunit SecY  62.29 
 
 		 439 aa  516  1.0000000000000001e-145  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3929  preprotein translocase subunit SecY  61.5 
 
 		 436 aa  516  1.0000000000000001e-145  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2045  preprotein translocase, SecY subunit  62.24 
 
 		 435 aa  517  1.0000000000000001e-145  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000027617  hitchhiker  0.00154147 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00958  preprotein translocase subunit SecY  58.37 
 
 		 434 aa  511  1e-144  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0058755  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2144  preprotein translocase, SecY subunit  60.19 
 
 		 447 aa  513  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2181  preprotein translocase, SecY subunit  60.19 
 
 		 447 aa  513  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.318083 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2459  preprotein translocase, SecY subunit  60.19 
 
 		 447 aa  513  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1928  preprotein translocase, SecY subunit  59.95 
 
 		 445 aa  514  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1374  preprotein translocase, SecY subunit  58.52 
 
 		 444 aa  510  1e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285774  normal  0.105212 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0718  preprotein translocase subunit SecY  58.45 
 
 		 448 aa  508  1e-143  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.214912  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0343  preprotein translocase, SecY subunit  57.82 
 
 		 444 aa  508  1e-143  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000192463  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1352  preprotein translocase subunit SecY  60.51 
 
 		 446 aa  510  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0023208  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0560  preprotein translocase, SecY subunit  60.05 
 
 		 442 aa  509  1e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1009  preprotein translocase subunit SecY  58.97 
 
 		 439 aa  511  1e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00114462  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0838  preprotein translocase subunit SecY  62.41 
 
 		 434 aa  511  1e-143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0739  preprotein translocase subunit SecY  56.6 
 
 		 440 aa  508  1e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00521081  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1926  preprotein translocase, SecY subunit  58.78 
 
 		 449 aa  505  9.999999999999999e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.796685  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2198  preprotein translocase, SecY subunit  58.99 
 
 		 448 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0470035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1450  preprotein translocase subunit SecY  60.23 
 
 		 446 aa  503  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337945  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3159  preprotein translocase subunit SecY  59.96 
 
 		 447 aa  504  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.453709  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3297  preprotein translocase subunit SecY  59.73 
 
 		 447 aa  503  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2999  preprotein translocase subunit SecY  59.6 
 
 		 448 aa  501  1e-140  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0377089  normal  0.071315 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2930  preprotein translocase subunit SecY  59.86 
 
 		 440 aa  499  1e-140  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000799077 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0178  preprotein translocase subunit SecY  56.94 
 
 		 446 aa  501  1e-140  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000408952  hitchhiker  0.00214614 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0680  preprotein translocase subunit SecY  56 
 
 		 437 aa  498  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0340  preprotein translocase subunit SecY  60.09 
 
 		 435 aa  499  1e-140  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.670272  hitchhiker  0.000594925 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4298  preprotein translocase subunit SecY  56.71 
 
 		 446 aa  500  1e-140  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000258427  unclonable  0.0000000000837901 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  58.64 
 
 		 447 aa  500  1e-140  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0340  preprotein translocase subunit SecY  58.74 
 
 		 443 aa  498  1e-140  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00542322  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0478  preprotein translocase subunit SecY  60.5 
 
 		 447 aa  499  1e-140  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  58.64 
 
 		 447 aa  500  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3277  preprotein translocase subunit SecY  59.64 
 
 		 440 aa  498  1e-140  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.821024  hitchhiker  0.000244814 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0233  preprotein translocase subunit SecY  57.11 
 
 		 446 aa  499  1e-140  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000181445  unclonable  0.0000105897 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4670  preprotein translocase subunit SecY  56.71 
 
 		 446 aa  499  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000509869  unclonable  0.0000000121988 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0073  preprotein translocase, SecY subunit  59.24 
 
 		 445 aa  496  1e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.867918  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0495  preprotein translocase subunit SecY  60.09 
 
 		 439 aa  498  1e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0441  preprotein translocase subunit SecY  56.25 
 
 		 443 aa  497  1e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  58.45 
 
 		 445 aa  496  1e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1658  preprotein translocase subunit SecY  61.63 
 
 		 446 aa  495  1e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.398859  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0219  preprotein translocase subunit SecY  57.41 
 
 		 446 aa  494  1e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000744124  unclonable  0.0000000000304117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0214  preprotein translocase subunit SecY  57.41 
 
 		 446 aa  494  1e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000092283  hitchhiker  0.00772115 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0219  preprotein translocase subunit SecY  57.41 
 
 		 446 aa  494  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000110874  hitchhiker  0.00000000176689 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0251  preprotein translocase subunit SecY  57.18 
 
 		 446 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2754  preprotein translocase, SecY subunit  57.08 
 
 		 437 aa  491  9.999999999999999e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  58.88 
 
 		 447 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0216  preprotein translocase subunit SecY  57.18 
 
 		 446 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000065492  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4150  preprotein translocase subunit SecY  57.18 
 
 		 446 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000158721  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0168  preprotein translocase subunit SecY  56.71 
 
 		 446 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000114541  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4036  preprotein translocase subunit SecY  57.18 
 
 		 446 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000184742  unclonable  0.00000000000435138 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0204  preprotein translocase subunit SecY  57.18 
 
 		 446 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000662692  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>