More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1450 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_1976  preprotein translocase subunit SecY  81.17 
 
 		 446 aa  738    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.923807  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1213  preprotein translocase subunit SecY  80.94 
 
 		 446 aa  740    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0718  preprotein translocase subunit SecY  71.56 
 
 		 448 aa  660    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.214912  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2756  preprotein translocase, SecY subunit  73.2 
 
 		 443 aa  673    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.373135  normal  0.477854 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  72.07 
 
 		 443 aa  650    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1863  preprotein translocase subunit SecY  90.36 
 
 		 446 aa  812    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1450  preprotein translocase subunit SecY  100 
 
 		 446 aa  882    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337945  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3647  preprotein translocase subunit SecY  72.07 
 
 		 443 aa  637    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1374  preprotein translocase, SecY subunit  71.17 
 
 		 444 aa  643    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285774  normal  0.105212 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2315  preprotein translocase subunit SecY  72.07 
 
 		 443 aa  638    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.775008  normal  0.296135 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1006  preprotein translocase subunit SecY  89.01 
 
 		 446 aa  810    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38875  hitchhiker  0.00669682 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4778  preprotein translocase subunit SecY  71.17 
 
 		 444 aa  635    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000420552 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3428  preprotein translocase subunit SecY  72.3 
 
 		 443 aa  638    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452831  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1928  preprotein translocase, SecY subunit  72.3 
 
 		 445 aa  640    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1565  preprotein translocase subunit SecY  72.3 
 
 		 443 aa  650    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.112443  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0333  preprotein translocase, SecY subunit  72.07 
 
 		 445 aa  654    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1658  preprotein translocase subunit SecY  81.39 
 
 		 446 aa  710    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.398859  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1352  preprotein translocase subunit SecY  97.09 
 
 		 446 aa  841    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0023208  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0560  preprotein translocase, SecY subunit  70.56 
 
 		 442 aa  638    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5050  preprotein translocase subunit SecY  73.71 
 
 		 444 aa  667    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.478224  normal  0.981585 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2198  preprotein translocase, SecY subunit  72.11 
 
 		 448 aa  641    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0470035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1176  preprotein translocase subunit SecY  80.72 
 
 		 446 aa  738    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0379017  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3164  preprotein translocase subunit SecY  71.85 
 
 		 443 aa  632  1e-180  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0194839  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2668  preprotein translocase subunit SecY  70.6 
 
 		 447 aa  622  1e-177  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2459  preprotein translocase, SecY subunit  69.51 
 
 		 447 aa  620  1e-176  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2181  preprotein translocase, SecY subunit  69.51 
 
 		 447 aa  620  1e-176  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.318083 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2144  preprotein translocase, SecY subunit  69.51 
 
 		 447 aa  617  1e-175  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1634  preprotein translocase subunit SecY  66.67 
 
 		 452 aa  598  1e-170  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0116955  normal  0.0410443 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2986  preprotein translocase subunit SecY  62.05 
 
 		 448 aa  581  1.0000000000000001e-165  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1333  preprotein translocase subunit SecY  62.78 
 
 		 455 aa  566  1e-160  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.158258 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1926  preprotein translocase, SecY subunit  62.95 
 
 		 449 aa  554  1e-156  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.796685  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0381  preprotein translocase subunit SecY  60.67 
 
 		 452 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1735  preprotein translocase subunit SecY  60.67 
 
 		 452 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0339  preprotein translocase subunit SecY  60.76 
 
 		 440 aa  536  1e-151  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000142446  unclonable  0.0000000706243 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0780  preprotein translocase subunit SecY  59.73 
 
 		 457 aa  532  1e-150  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0305  preprotein translocase subunit SecY  60.23 
 
 		 453 aa  532  1e-150  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.398461 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0425  preprotein translocase subunit SecY  60.05 
 
 		 437 aa  529  1e-149  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.65116  normal  0.157207 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1775  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  60.84 
 
 		 446 aa  526  1e-148  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.152379  normal  0.149147 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1269  preprotein translocase subunit SecY  57.8 
 
 		 455 aa  522  1e-147  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0299  preprotein translocase subunit SecY  60 
 
 		 440 aa  522  1e-147  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000631755  hitchhiker  0.00000321163 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  60.23 
 
 		 442 aa  521  1e-147  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2514  preprotein translocase subunit SecY  59.78 
 
 		 452 aa  518  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0612  preprotein translocase subunit SecY  58.74 
 
 		 456 aa  516  1.0000000000000001e-145  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0275  preprotein translocase subunit SecY  58.61 
 
 		 454 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0794912  normal  0.75706 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3318  preprotein translocase subunit SecY  57.49 
 
 		 441 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2798  preprotein translocase subunit SecY  57.84 
 
 		 457 aa  514  1e-144  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.558016 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0787  preprotein translocase subunit SecY  59.43 
 
 		 442 aa  511  1e-143  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0142235  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3929  preprotein translocase subunit SecY  57.69 
 
 		 436 aa  505  9.999999999999999e-143  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3423  preprotein translocase subunit SecY  59.32 
 
 		 436 aa  504  1e-141  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.23916 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0401  preprotein translocase subunit SecY  57.95 
 
 		 439 aa  502  1e-141  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4223  preprotein translocase subunit SecY  57.73 
 
 		 436 aa  504  1e-141  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0505149  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0393  preprotein translocase subunit SecY  57.95 
 
 		 439 aa  502  1e-141  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0413341  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2305  preprotein translocase subunit SecY  56.85 
 
 		 453 aa  499  1e-140  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0325321  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1042  preprotein translocase subunit SecY  57.05 
 
 		 439 aa  501  1e-140  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0621  preprotein translocase subunit SecY  56.82 
 
 		 439 aa  501  1e-140  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0507  preprotein translocase subunit SecY  57.24 
 
 		 443 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0640452  normal  0.0135524 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4729  preprotein translocase subunit SecY  57.24 
 
 		 443 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0376135  normal  0.430849 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  56.78 
 
 		 435 aa  497  1e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0504  preprotein translocase subunit SecY  57.01 
 
 		 443 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390206  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0474  preprotein translocase subunit SecY  56.77 
 
 		 443 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.733359  hitchhiker  0.00000433507 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2305  preprotein translocase subunit SecY  56.56 
 
 		 437 aa  491  9.999999999999999e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.773218 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0739  preprotein translocase subunit SecY  57.18 
 
 		 440 aa  493  9.999999999999999e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00521081  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0646  preprotein translocase, SecY subunit  56.29 
 
 		 444 aa  488  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.617938  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0340  preprotein translocase subunit SecY  56.82 
 
 		 435 aa  491  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.670272  hitchhiker  0.000594925 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4528  preprotein translocase subunit SecY  56.29 
 
 		 444 aa  488  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.447133  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5059  preprotein translocase subunit SecY  56.06 
 
 		 442 aa  488  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000898122  normal  0.284155 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0495  preprotein translocase subunit SecY  56.36 
 
 		 439 aa  489  1e-137  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0441  preprotein translocase subunit SecY  55.92 
 
 		 443 aa  489  1e-137  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5050  preprotein translocase subunit SecY  57.53 
 
 		 437 aa  491  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.34117  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3889  preprotein translocase subunit SecY  56.06 
 
 		 442 aa  489  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000822061  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2352  preprotein translocase subunit SecY  57.45 
 
 		 441 aa  485  1e-136  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299181  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  54.97 
 
 		 429 aa  485  1e-136  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3159  preprotein translocase subunit SecY  57.94 
 
 		 447 aa  486  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.453709  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  56.54 
 
 		 443 aa  485  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3297  preprotein translocase subunit SecY  57.24 
 
 		 447 aa  485  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0857  preprotein translocase subunit SecY  56.29 
 
 		 442 aa  486  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  56.54 
 
 		 443 aa  485  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  0.0000000000266535 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09050  preprotein translocase subunit SecY  56.29 
 
 		 442 aa  486  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.224184 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2999  preprotein translocase subunit SecY  57.58 
 
 		 448 aa  478  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0377089  normal  0.071315 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3048  preprotein translocase subunit SecY  57.67 
 
 		 448 aa  480  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.20022  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3277  preprotein translocase subunit SecY  58.04 
 
 		 440 aa  478  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.821024  hitchhiker  0.000244814 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  55.17 
 
 		 435 aa  478  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4298  preprotein translocase subunit SecY  55.24 
 
 		 446 aa  478  1e-133  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000258427  unclonable  0.0000000000837901 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00958  preprotein translocase subunit SecY  53.41 
 
 		 434 aa  475  1e-133  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0058755  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  54.94 
 
 		 435 aa  476  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  0.000000811889 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0315  preprotein translocase subunit SecY  55.56 
 
 		 437 aa  477  1e-133  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0598799  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0178  preprotein translocase subunit SecY  55.24 
 
 		 446 aa  475  1e-133  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000408952  hitchhiker  0.00214614 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4670  preprotein translocase subunit SecY  55.24 
 
 		 446 aa  478  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000509869  unclonable  0.0000000121988 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0073  preprotein translocase, SecY subunit  57.11 
 
 		 445 aa  475  1e-133  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.867918  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2930  preprotein translocase subunit SecY  57.81 
 
 		 440 aa  478  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000799077 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0233  preprotein translocase subunit SecY  55 
 
 		 446 aa  476  1e-133  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000181445  unclonable  0.0000105897 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  55.15 
 
 		 437 aa  473  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0269  preprotein translocase subunit SecY  57.77 
 
 		 449 aa  472  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.432413  normal  0.0196675 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3784  preprotein translocase subunit SecY  57.44 
 
 		 448 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2612  preprotein translocase subunit SecY  57.44 
 
 		 448 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.227089  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3498  preprotein translocase subunit SecY  57.44 
 
 		 448 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1944  preprotein translocase subunit SecY  57.44 
 
 		 448 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0347  preprotein translocase subunit SecY  57.77 
 
 		 449 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.85548  normal  0.204606 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0287  preprotein translocase subunit SecY  57.77 
 
 		 449 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.464033  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0368  preprotein translocase subunit SecY  57.77 
 
 		 449 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>