More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2181 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2198  preprotein translocase, SecY subunit  90.16 
 
 
448 aa  821    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0470035  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3647  preprotein translocase subunit SecY  72.79 
 
 
443 aa  638    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1213  preprotein translocase subunit SecY  70.18 
 
 
446 aa  634    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2459  preprotein translocase, SecY subunit  100 
 
 
447 aa  891    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2181  preprotein translocase, SecY subunit  100 
 
 
447 aa  891    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.318083 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  72.99 
 
 
443 aa  654    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0333  preprotein translocase, SecY subunit  81.03 
 
 
445 aa  739    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1928  preprotein translocase, SecY subunit  80.8 
 
 
445 aa  731    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2315  preprotein translocase subunit SecY  72.56 
 
 
443 aa  640    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.775008  normal  0.296135 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3428  preprotein translocase subunit SecY  73.21 
 
 
443 aa  645    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452831  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1565  preprotein translocase subunit SecY  73.44 
 
 
443 aa  656    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.112443  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2144  preprotein translocase, SecY subunit  98.88 
 
 
447 aa  885    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0560  preprotein translocase, SecY subunit  74.11 
 
 
442 aa  665    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5050  preprotein translocase subunit SecY  73.66 
 
 
444 aa  656    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.478224  normal  0.981585 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1374  preprotein translocase, SecY subunit  74.15 
 
 
444 aa  671    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285774  normal  0.105212 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4778  preprotein translocase subunit SecY  74.11 
 
 
444 aa  647    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000420552 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3164  preprotein translocase subunit SecY  72.34 
 
 
443 aa  633  1e-180  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0194839  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1976  preprotein translocase subunit SecY  69.51 
 
 
446 aa  631  1e-180  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.923807  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1176  preprotein translocase subunit SecY  69.96 
 
 
446 aa  632  1e-180  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0379017  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1863  preprotein translocase subunit SecY  70.18 
 
 
446 aa  625  1e-178  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1006  preprotein translocase subunit SecY  69.96 
 
 
446 aa  623  1e-177  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38875  hitchhiker  0.00669682 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2756  preprotein translocase, SecY subunit  70.29 
 
 
443 aa  619  1e-176  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.373135  normal  0.477854 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1352  preprotein translocase subunit SecY  69.96 
 
 
446 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0023208  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1658  preprotein translocase subunit SecY  71.3 
 
 
446 aa  606  9.999999999999999e-173  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.398859  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1450  preprotein translocase subunit SecY  69.51 
 
 
446 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337945  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2668  preprotein translocase subunit SecY  67.87 
 
 
447 aa  590  1e-167  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1634  preprotein translocase subunit SecY  66.07 
 
 
452 aa  578  1e-164  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0116955  normal  0.0410443 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1926  preprotein translocase, SecY subunit  66.36 
 
 
449 aa  576  1.0000000000000001e-163  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.796685  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2986  preprotein translocase subunit SecY  62.7 
 
 
448 aa  565  1e-160  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135734  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0718  preprotein translocase subunit SecY  62.67 
 
 
448 aa  566  1e-160  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.214912  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0780  preprotein translocase subunit SecY  60.95 
 
 
457 aa  538  1e-151  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1333  preprotein translocase subunit SecY  59.82 
 
 
455 aa  526  1e-148  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.158258 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1735  preprotein translocase subunit SecY  57.71 
 
 
452 aa  526  1e-148  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0381  preprotein translocase subunit SecY  57.71 
 
 
452 aa  526  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0305  preprotein translocase subunit SecY  60.32 
 
 
453 aa  526  1e-148  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.398461 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1775  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  59.74 
 
 
446 aa  517  1.0000000000000001e-145  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.152379  normal  0.149147 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  60.19 
 
 
442 aa  513  1e-144  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0339  preprotein translocase subunit SecY  57.95 
 
 
440 aa  508  1e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000142446  unclonable  0.0000000706243 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1269  preprotein translocase subunit SecY  57.74 
 
 
455 aa  511  1e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0612  preprotein translocase subunit SecY  56.92 
 
 
456 aa  506  9.999999999999999e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0275  preprotein translocase subunit SecY  56.57 
 
 
454 aa  505  9.999999999999999e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0794912  normal  0.75706 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2514  preprotein translocase subunit SecY  57.49 
 
 
452 aa  501  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0425  preprotein translocase subunit SecY  58.64 
 
 
437 aa  498  1e-140  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.65116  normal  0.157207 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0299  preprotein translocase subunit SecY  58.86 
 
 
440 aa  498  1e-140  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000631755  hitchhiker  0.00000321163 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2798  preprotein translocase subunit SecY  57.55 
 
 
457 aa  499  1e-140  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.558016 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3318  preprotein translocase subunit SecY  56.38 
 
 
441 aa  494  1e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0787  preprotein translocase subunit SecY  58.31 
 
 
442 aa  494  9.999999999999999e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0142235  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  57.38 
 
 
443 aa  483  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  0.0000000000266535 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2305  preprotein translocase subunit SecY  57.64 
 
 
453 aa  483  1e-135  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0325321  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  57.38 
 
 
443 aa  483  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00958  preprotein translocase subunit SecY  56.15 
 
 
434 aa  479  1e-134  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0058755  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3423  preprotein translocase subunit SecY  57.47 
 
 
436 aa  475  1e-133  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.23916 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1042  preprotein translocase subunit SecY  57.05 
 
 
439 aa  475  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0776  preprotein translocase subunit SecY  54.79 
 
 
455 aa  476  1e-133  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal  0.028717 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0621  preprotein translocase subunit SecY  57.91 
 
 
439 aa  476  1e-133  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.468859  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2352  preprotein translocase subunit SecY  56.5 
 
 
441 aa  473  1e-132  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299181  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0401  preprotein translocase subunit SecY  57.05 
 
 
439 aa  473  1e-132  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0393  preprotein translocase subunit SecY  57.05 
 
 
439 aa  473  1e-132  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0413341  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4223  preprotein translocase subunit SecY  57.47 
 
 
436 aa  473  1e-132  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0505149  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0441  preprotein translocase subunit SecY  54.87 
 
 
443 aa  473  1e-132  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0233  preprotein translocase subunit SecY  55.84 
 
 
446 aa  472  1e-132  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000181445  unclonable  0.0000105897 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2154  preprotein translocase subunit SecY  56.47 
 
 
444 aa  469  1.0000000000000001e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000317062  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1009  preprotein translocase subunit SecY  55.81 
 
 
439 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00114462  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2149  preprotein translocase, SecY subunit  56.85 
 
 
448 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0576412  normal  0.122998 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4670  preprotein translocase subunit SecY  55.84 
 
 
446 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000509869  unclonable  0.0000000121988 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3929  preprotein translocase subunit SecY  55.45 
 
 
436 aa  467  9.999999999999999e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2305  preprotein translocase subunit SecY  57 
 
 
437 aa  466  9.999999999999999e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.773218 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4298  preprotein translocase subunit SecY  55.84 
 
 
446 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000258427  unclonable  0.0000000000837901 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04500  preprotein translocase subunit SecY  54.5 
 
 
454 aa  466  9.999999999999999e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.705639  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001722  preprotein translocase SecY subunit  56.47 
 
 
444 aa  466  9.999999999999999e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000228975  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5050  preprotein translocase subunit SecY  57.28 
 
 
437 aa  465  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.34117  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0739  preprotein translocase subunit SecY  53.83 
 
 
440 aa  466  9.999999999999999e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00521081  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00750  preprotein translocase subunit SecY  56.24 
 
 
444 aa  464  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0178  preprotein translocase subunit SecY  55.61 
 
 
446 aa  464  1e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000408952  hitchhiker  0.00214614 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0168  preprotein translocase subunit SecY  55.61 
 
 
446 aa  462  1e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000114541  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0251  preprotein translocase subunit SecY  55.84 
 
 
446 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0204  preprotein translocase subunit SecY  55.84 
 
 
446 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000662692  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3159  preprotein translocase subunit SecY  56.12 
 
 
447 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.453709  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3739  preprotein translocase subunit SecY  55.61 
 
 
446 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000605107  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0495  preprotein translocase subunit SecY  55.68 
 
 
439 aa  461  9.999999999999999e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0340  preprotein translocase subunit SecY  56.5 
 
 
443 aa  460  9.999999999999999e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00542322  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0340  preprotein translocase subunit SecY  55.91 
 
 
435 aa  461  9.999999999999999e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.670272  hitchhiker  0.000594925 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2304  preprotein translocase subunit SecY  57.75 
 
 
451 aa  459  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0838  preprotein translocase subunit SecY  55.63 
 
 
434 aa  458  9.999999999999999e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0220  preprotein translocase subunit SecY  55.61 
 
 
446 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000798254  hitchhiker  0.00367272 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4150  preprotein translocase subunit SecY  55.61 
 
 
446 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000158721  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4036  preprotein translocase subunit SecY  55.61 
 
 
446 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000184742  unclonable  0.00000000000435138 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0216  preprotein translocase subunit SecY  55.61 
 
 
446 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000065492  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0190  preprotein translocase subunit SecY  55.61 
 
 
446 aa  456  1e-127  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000711222  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3297  preprotein translocase subunit SecY  54.86 
 
 
447 aa  457  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0219  preprotein translocase subunit SecY  55.61 
 
 
446 aa  456  1e-127  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000744124  unclonable  0.0000000000304117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0214  preprotein translocase subunit SecY  55.61 
 
 
446 aa  456  1e-127  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000092283  hitchhiker  0.00772115 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0478  preprotein translocase subunit SecY  56.67 
 
 
447 aa  456  1e-127  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0219  preprotein translocase subunit SecY  55.61 
 
 
446 aa  456  1e-127  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000110874  hitchhiker  0.00000000176689 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0453  preprotein translocase subunit SecY  51.45 
 
 
457 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.124481  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0357  preprotein translocase subunit SecY  52.39 
 
 
442 aa  452  1.0000000000000001e-126  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000838517  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0315  preprotein translocase subunit SecY  55.19 
 
 
437 aa  451  1.0000000000000001e-126  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0598799  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1834  preprotein translocase subunit SecY  52.39 
 
 
442 aa  452  1.0000000000000001e-126  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00171083  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0979  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  52.14 
 
 
447 aa  449  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000479753  hitchhiker  0.00549319 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  55.42 
 
 
429 aa  451  1e-125  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>