More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1926 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  98.21 
 
 
447 aa  876    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  84.27 
 
 
445 aa  734    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  98.66 
 
 
447 aa  878    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  100 
 
 
447 aa  885    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  64.16 
 
 
429 aa  568  1e-161  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  61.89 
 
 
435 aa  559  1e-158  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  0.000000811889 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  62.36 
 
 
435 aa  555  1e-157  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  62.3 
 
 
437 aa  555  1e-157  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  61.66 
 
 
435 aa  555  1e-157  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  60.41 
 
 
435 aa  549  1e-155  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  59.82 
 
 
435 aa  542  1e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000602472 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  60.05 
 
 
435 aa  544  1e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0700  preprotein translocase subunit SecY  62.24 
 
 
435 aa  544  1e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.418561  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3985  preprotein translocase, SecY subunit  61.42 
 
 
448 aa  536  1e-151  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00342615  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  57.95 
 
 
442 aa  502  1e-141  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  57.95 
 
 
437 aa  499  1e-140  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0721  preprotein translocase subunit SecY  57.27 
 
 
435 aa  493  9.999999999999999e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2237  preprotein translocase subunit SecY  57.05 
 
 
437 aa  484  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.104557  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  56.14 
 
 
437 aa  484  1e-135  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1006  preprotein translocase subunit SecY  57.18 
 
 
446 aa  472  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38875  hitchhiker  0.00669682 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2756  preprotein translocase, SecY subunit  55.89 
 
 
443 aa  469  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.373135  normal  0.477854 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2045  preprotein translocase, SecY subunit  56.54 
 
 
435 aa  464  1e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000027617  hitchhiker  0.00154147 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  56.53 
 
 
443 aa  462  1e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  56.53 
 
 
443 aa  462  1e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  0.0000000000266535 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5050  preprotein translocase subunit SecY  55.05 
 
 
444 aa  461  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.478224  normal  0.981585 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  54.93 
 
 
443 aa  458  9.999999999999999e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2754  preprotein translocase, SecY subunit  53.26 
 
 
437 aa  455  1e-127  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1565  preprotein translocase subunit SecY  55.03 
 
 
443 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.112443  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4778  preprotein translocase subunit SecY  55.76 
 
 
444 aa  454  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000420552 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0718  preprotein translocase subunit SecY  53.67 
 
 
448 aa  449  1e-125  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.214912  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  54.18 
 
 
420 aa  450  1e-125  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1246  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  52.59 
 
 
463 aa  449  1e-125  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.031052  hitchhiker  0.00314824 
 
 
-
 
NC_004310  BR1213  preprotein translocase subunit SecY  53.69 
 
 
446 aa  443  1e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0315  preprotein translocase subunit SecY  53.15 
 
 
437 aa  444  1e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0598799  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0560  preprotein translocase, SecY subunit  54.4 
 
 
442 aa  442  1e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3428  preprotein translocase subunit SecY  55.28 
 
 
443 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452831  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1176  preprotein translocase subunit SecY  53.69 
 
 
446 aa  442  1e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0379017  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1863  preprotein translocase subunit SecY  55.33 
 
 
446 aa  444  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0680  preprotein translocase subunit SecY  53.12 
 
 
437 aa  442  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1976  preprotein translocase subunit SecY  54.15 
 
 
446 aa  445  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.923807  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3647  preprotein translocase subunit SecY  54.13 
 
 
443 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1450  preprotein translocase subunit SecY  55.58 
 
 
446 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337945  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2315  preprotein translocase subunit SecY  54.13 
 
 
443 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.775008  normal  0.296135 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3164  preprotein translocase subunit SecY  54.82 
 
 
443 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0194839  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1374  preprotein translocase, SecY subunit  53.44 
 
 
444 aa  439  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285774  normal  0.105212 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0333  preprotein translocase, SecY subunit  53.21 
 
 
445 aa  436  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2305  preprotein translocase subunit SecY  52.74 
 
 
453 aa  437  1e-121  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0325321  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1352  preprotein translocase subunit SecY  56.49 
 
 
446 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0023208  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1926  preprotein translocase, SecY subunit  52.29 
 
 
449 aa  436  1e-121  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.796685  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0233  preprotein translocase subunit SecY  53.22 
 
 
446 aa  436  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000181445  unclonable  0.0000105897 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0339  preprotein translocase subunit SecY  52.14 
 
 
440 aa  434  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000142446  unclonable  0.0000000706243 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0425  preprotein translocase subunit SecY  52.26 
 
 
437 aa  432  1e-120  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.65116  normal  0.157207 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2668  preprotein translocase subunit SecY  54.09 
 
 
447 aa  432  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0178  preprotein translocase subunit SecY  52.74 
 
 
446 aa  431  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000408952  hitchhiker  0.00214614 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4670  preprotein translocase subunit SecY  52.63 
 
 
446 aa  431  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000509869  unclonable  0.0000000121988 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0168  preprotein translocase subunit SecY  52.51 
 
 
446 aa  431  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000114541  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4298  preprotein translocase subunit SecY  52.63 
 
 
446 aa  431  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000258427  unclonable  0.0000000000837901 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0886  preprotein translocase subunit SecY  51.77 
 
 
418 aa  431  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.609907  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2352  preprotein translocase subunit SecY  51.74 
 
 
441 aa  428  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299181  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3318  preprotein translocase subunit SecY  52.01 
 
 
441 aa  427  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0190  preprotein translocase subunit SecY  52.74 
 
 
446 aa  426  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000711222  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2986  preprotein translocase subunit SecY  51.79 
 
 
448 aa  428  1e-118  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135734  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1928  preprotein translocase, SecY subunit  52.58 
 
 
445 aa  427  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00958  preprotein translocase subunit SecY  51.55 
 
 
434 aa  424  1e-117  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0058755  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0251  preprotein translocase subunit SecY  52.98 
 
 
446 aa  424  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04500  preprotein translocase subunit SecY  50 
 
 
454 aa  422  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.705639  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0787  preprotein translocase subunit SecY  52.53 
 
 
442 aa  425  1e-117  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0142235  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1658  preprotein translocase subunit SecY  54.21 
 
 
446 aa  422  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.398859  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0219  preprotein translocase subunit SecY  52.74 
 
 
446 aa  422  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000744124  unclonable  0.0000000000304117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0214  preprotein translocase subunit SecY  52.74 
 
 
446 aa  422  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000092283  hitchhiker  0.00772115 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0219  preprotein translocase subunit SecY  52.74 
 
 
446 aa  422  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000110874  hitchhiker  0.00000000176689 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0245  preprotein translocase subunit SecY  50.46 
 
 
424 aa  421  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.101058  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4150  preprotein translocase subunit SecY  52.51 
 
 
446 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000158721  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3739  preprotein translocase subunit SecY  52.87 
 
 
446 aa  421  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000605107  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0216  preprotein translocase subunit SecY  52.51 
 
 
446 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000065492  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4036  preprotein translocase subunit SecY  52.51 
 
 
446 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000184742  unclonable  0.00000000000435138 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0204  preprotein translocase subunit SecY  52.51 
 
 
446 aa  419  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000662692  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0306  preprotein translocase subunit SecY  52.58 
 
 
421 aa  419  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0894763  normal  0.194972 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0220  preprotein translocase subunit SecY  52.51 
 
 
446 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000798254  hitchhiker  0.00367272 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0739  preprotein translocase subunit SecY  50 
 
 
440 aa  419  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00521081  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0862  preprotein translocase, SecY subunit  50.11 
 
 
438 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.148817  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3423  preprotein translocase subunit SecY  52.59 
 
 
436 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.23916 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0309  preprotein translocase subunit SecY  48.21 
 
 
443 aa  417  9.999999999999999e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0197098  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0305  preprotein translocase subunit SecY  50.12 
 
 
453 aa  415  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.398461 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1831  preprotein translocase subunit SecY  48.21 
 
 
443 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.321149  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0299  preprotein translocase subunit SecY  52.49 
 
 
440 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000631755  hitchhiker  0.00000321163 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2313  preprotein translocase subunit SecY  52.58 
 
 
421 aa  417  9.999999999999999e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0367996  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2198  preprotein translocase, SecY subunit  51.93 
 
 
448 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0470035  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0343  preprotein translocase, SecY subunit  51.67 
 
 
444 aa  416  9.999999999999999e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000192463  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0340  preprotein translocase subunit SecY  52.49 
 
 
443 aa  414  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00542322  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1504  preprotein translocase subunit SecY  52.34 
 
 
419 aa  414  1e-114  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2154  preprotein translocase subunit SecY  51.9 
 
 
444 aa  414  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000317062  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00750  preprotein translocase subunit SecY  51.66 
 
 
444 aa  414  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2044  preprotein translocase subunit SecY  49.55 
 
 
441 aa  412  1e-114  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00113194  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1726  preprotein translocase, SecY subunit  48.84 
 
 
435 aa  412  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000716119  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3889  preprotein translocase subunit SecY  50.95 
 
 
442 aa  412  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000822061  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1009  preprotein translocase subunit SecY  50.6 
 
 
439 aa  414  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00114462  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0080  preprotein translocase subunit SecY  51.2 
 
 
441 aa  414  1e-114  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0404503  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001722  preprotein translocase SecY subunit  51.42 
 
 
444 aa  412  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000228975  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2209  preprotein translocase subunit SecY  49.1 
 
 
443 aa  414  1e-114  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000211329  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>