More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0778 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0778  preprotein translocase, SecY subunit  100 
 
 		 430 aa  850    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000100686  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2923  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  65.65 
 
 		 427 aa  536  1e-151  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000208113  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1726  preprotein translocase, SecY subunit  57.56 
 
 		 435 aa  482  1e-135  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000716119  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0245  preprotein translocase subunit SecY  54.78 
 
 		 424 aa  468  9.999999999999999e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.101058  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0886  preprotein translocase subunit SecY  56.02 
 
 		 418 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.609907  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0235  preprotein translocase subunit SecY  54.5 
 
 		 419 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00849669  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  54.31 
 
 		 420 aa  448  1e-125  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0306  preprotein translocase subunit SecY  53.97 
 
 		 421 aa  451  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0894763  normal  0.194972 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2313  preprotein translocase subunit SecY  53.36 
 
 		 421 aa  444  1e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0367996  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1504  preprotein translocase subunit SecY  53.74 
 
 		 419 aa  437  1e-121  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0442  preprotein translocase subunit SecY  50 
 
 		 429 aa  436  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0214  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  51.52 
 
 		 419 aa  410  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.32801  normal  0.494063 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  47.59 
 
 		 435 aa  403  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1000  preprotein translocase, SecY subunit  46.73 
 
 		 419 aa  396  1e-109  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00382146  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  49.18 
 
 		 429 aa  389  1e-107  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2379  preprotein translocase subunit SecY  49.31 
 
 		 425 aa  388  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2694  preprotein translocase subunit SecY  49.08 
 
 		 425 aa  388  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01360  preprotein translocase, SecY subunit  49.2 
 
 		 422 aa  383  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000700723  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2135  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  45.31 
 
 		 428 aa  380  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233384  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  47.02 
 
 		 447 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  46.79 
 
 		 447 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  47.2 
 
 		 445 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  44.32 
 
 		 435 aa  374  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5144  preprotein translocase, SecY subunit  43.4 
 
 		 437 aa  373  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.552257 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  44.27 
 
 		 437 aa  374  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  45.6 
 
 		 435 aa  375  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  0.000000811889 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1164  preprotein translocase, SecY subunit  45.43 
 
 		 431 aa  372  1e-102  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3885  preprotein translocase subunit SecY  46.21 
 
 		 437 aa  374  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0721  preprotein translocase subunit SecY  44.37 
 
 		 435 aa  371  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  46.65 
 
 		 447 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  44.2 
 
 		 435 aa  369  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3647  preprotein translocase, SecY subunit  45.29 
 
 		 442 aa  366  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00118801  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6029  preprotein translocase subunit SecY  44.24 
 
 		 430 aa  367  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0862  preprotein translocase, SecY subunit  45.43 
 
 		 438 aa  368  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.148817  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3985  preprotein translocase, SecY subunit  45.79 
 
 		 448 aa  368  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0326  preprotein translocase subunit SecY  44.52 
 
 		 437 aa  365  1e-100  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000568003 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0973  preprotein translocase subunit SecY  47.26 
 
 		 428 aa  364  1e-99  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0602  preprotein translocase subunit SecY  43.79 
 
 		 430 aa  362  5.0000000000000005e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.637505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3686  preprotein translocase, SecY subunit  44.57 
 
 		 441 aa  361  1e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000792509  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1106  protein translocase subunit SecY/sec61 alpha  43.46 
 
 		 438 aa  361  1e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.105713 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0700  preprotein translocase subunit SecY  44.5 
 
 		 435 aa  361  2e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.418561  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0309  preprotein translocase subunit SecY  44.77 
 
 		 443 aa  359  4e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0197098  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  43.99 
 
 		 435 aa  359  7e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29540  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  45.56 
 
 		 429 aa  358  9.999999999999999e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.498773  normal  0.844433 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0607  preprotein translocase, SecY subunit  46.01 
 
 		 429 aa  358  9.999999999999999e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0598508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1926  preprotein translocase, SecY subunit  43.62 
 
 		 449 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.796685  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3397  preprotein translocase, SecY subunit  45.43 
 
 		 439 aa  358  9.999999999999999e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0131  preprotein translocase subunit SecY  45.89 
 
 		 430 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.129381  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1374  preprotein translocase subunit SecY  43.15 
 
 		 431 aa  356  5e-97  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0289241  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1831  preprotein translocase subunit SecY  44.75 
 
 		 443 aa  355  5.999999999999999e-97  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.321149  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4934  preprotein translocase, SecY subunit  44.67 
 
 		 439 aa  355  7.999999999999999e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000290796  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6594  preprotein translocase subunit SecY  44.1 
 
 		 436 aa  355  7.999999999999999e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0735  preprotein translocase, SecY subunit  44.55 
 
 		 433 aa  354  1e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04180  preprotein translocase subunit SecY  44.3 
 
 		 435 aa  355  1e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1006  preprotein translocase subunit SecY  46.01 
 
 		 446 aa  355  1e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38875  hitchhiker  0.00669682 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  43.76 
 
 		 435 aa  354  1e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000602472 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0582  preprotein translocase subunit SecY  43.97 
 
 		 435 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  46.14 
 
 		 443 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0127  preprotein translocase subunit SecY  45.21 
 
 		 430 aa  353  4e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1118  preprotein translocase subunit SecY  44.39 
 
 		 428 aa  353  4e-96  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.348488  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1165  preprotein translocase, SecY subunit  42.95 
 
 		 450 aa  352  5.9999999999999994e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000330141  normal  0.11389 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0151  preprotein translocase subunit SecY  44.67 
 
 		 433 aa  352  8.999999999999999e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0158065  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5022  preprotein translocase subunit SecY  44.18 
 
 		 445 aa  351  1e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1856  preprotein translocase, SecY subunit  45.62 
 
 		 446 aa  351  1e-95  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0112849  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0125  preprotein translocase subunit SecY  44.67 
 
 		 433 aa  352  1e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00395698  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5175  preprotein translocase subunit SecY  44.67 
 
 		 433 aa  352  1e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000485174  unclonable  4.1263e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0130  preprotein translocase subunit SecY  44.44 
 
 		 433 aa  350  2e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0066731  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0130  preprotein translocase subunit SecY  44.44 
 
 		 433 aa  350  2e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00164171  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0126  preprotein translocase subunit SecY  44.44 
 
 		 433 aa  350  2e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0265701  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0124  preprotein translocase subunit SecY  44.44 
 
 		 433 aa  350  2e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.64549  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0130  preprotein translocase subunit SecY  44.44 
 
 		 433 aa  350  2e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00952483  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1565  preprotein translocase subunit SecY  45.9 
 
 		 443 aa  351  2e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.112443  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4006  preprotein translocase, SecY subunit  42.38 
 
 		 450 aa  350  2e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000605815  hitchhiker  0.000026914 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0161  preprotein translocase subunit SecY  44.44 
 
 		 433 aa  350  2e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000198533  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1635  preprotein translocase subunit SecY  45.72 
 
 		 447 aa  351  2e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4301  preprotein translocase, SecY subunit  43.02 
 
 		 432 aa  351  2e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1074  preprotein translocase subunit SecY  42.04 
 
 		 441 aa  350  3e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1046  preprotein translocase subunit SecY  42.04 
 
 		 441 aa  350  3e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303562  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2403  preprotein translocase subunit SecY  43.96 
 
 		 443 aa  350  3e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0193161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1062  preprotein translocase subunit SecY  42.04 
 
 		 441 aa  350  3e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160681  normal  0.323313 
 
 
-
 
NC_004310  BR1213  preprotein translocase subunit SecY  44.26 
 
 		 446 aa  350  4e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  44.39 
 
 		 442 aa  349  5e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2209  preprotein translocase subunit SecY  44.87 
 
 		 443 aa  349  6e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000211329  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10746  preprotein translocase subunit SecY  42.83 
 
 		 441 aa  349  6e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.329828 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1176  preprotein translocase subunit SecY  44.26 
 
 		 446 aa  349  7e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0379017  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2626  preprotein translocase subunit SecY  40.93 
 
 		 442 aa  348  8e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.512513  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1918  preprotein translocase subunit SecY  43.91 
 
 		 446 aa  348  1e-94  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0647  preprotein translocase, SecY subunit  44.39 
 
 		 432 aa  348  1e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1246  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  44.66 
 
 		 463 aa  348  1e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.031052  hitchhiker  0.00314824 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4363  preprotein translocase subunit SecY  45.18 
 
 		 437 aa  348  1e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0120386  normal  0.169527 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2545  preprotein translocase subunit SecY  43.76 
 
 		 434 aa  348  2e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000778926 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1976  preprotein translocase subunit SecY  44.03 
 
 		 446 aa  348  2e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.923807  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0201  preprotein translocase subunit SecY  44.75 
 
 		 443 aa  347  2e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.124191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2742  preprotein translocase subunit SecY  43.54 
 
 		 434 aa  347  3e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53667e-23 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2691  preprotein translocase, SecY subunit  43.24 
 
 		 430 aa  347  3e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.803147  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2044  preprotein translocase subunit SecY  45.08 
 
 		 441 aa  347  3e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00113194  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1312  preprotein translocase subunit SecY  44.52 
 
 		 431 aa  347  3e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000457849  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1863  preprotein translocase subunit SecY  45.07 
 
 		 446 aa  347  3e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0951  preprotein translocase, SecY subunit  44.54 
 
 		 448 aa  346  4e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.830582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2747  preprotein translocase subunit SecY  43.31 
 
 		 434 aa  346  5e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.787541  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>