More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1918 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1918  preprotein translocase subunit SecY  100 
 
 		 446 aa  889    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1635  preprotein translocase subunit SecY  61.76 
 
 		 447 aa  551  1e-156  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0622  preprotein translocase, SecY subunit  60.32 
 
 		 444 aa  522  1e-147  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.925436 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4363  preprotein translocase subunit SecY  58.17 
 
 		 437 aa  519  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0120386  normal  0.169527 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0862  preprotein translocase, SecY subunit  57.18 
 
 		 438 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.148817  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5767  preprotein translocase, SecY subunit  58.24 
 
 		 439 aa  486  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.800902 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0377  preprotein translocase subunit SecY  53.35 
 
 		 448 aa  481  1e-134  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3142  preprotein translocase subunit SecY  53.14 
 
 		 440 aa  478  1e-134  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0487569  normal  0.382691 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1167  preprotein translocase subunit SecY  55.33 
 
 		 447 aa  474  1e-132  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.221673  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0309  preprotein translocase subunit SecY  54.5 
 
 		 443 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0197098  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05820  preprotein translocase SecY  54.83 
 
 		 447 aa  470  1.0000000000000001e-131  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1831  preprotein translocase subunit SecY  53.14 
 
 		 443 aa  460  9.999999999999999e-129  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.321149  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2209  preprotein translocase subunit SecY  53.29 
 
 		 443 aa  461  9.999999999999999e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000211329  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2403  preprotein translocase subunit SecY  53.74 
 
 		 443 aa  459  9.999999999999999e-129  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0193161  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2276  preprotein translocase subunit SecY  52.7 
 
 		 441 aa  456  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000725785  hitchhiker  0.00410487 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2044  preprotein translocase subunit SecY  52.83 
 
 		 441 aa  453  1.0000000000000001e-126  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00113194  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0177  preprotein translocase subunit SecY  52.61 
 
 		 435 aa  449  1e-125  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.158062 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0201  preprotein translocase subunit SecY  52.15 
 
 		 443 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.124191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  47.17 
 
 		 447 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  45.77 
 
 		 429 aa  380  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  47.17 
 
 		 447 aa  378  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  47.95 
 
 		 445 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  46.24 
 
 		 447 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  44.52 
 
 		 420 aa  371  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  44.59 
 
 		 435 aa  370  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  42.6 
 
 		 437 aa  367  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1726  preprotein translocase, SecY subunit  43.18 
 
 		 435 aa  363  4e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000716119  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  42.37 
 
 		 435 aa  362  7.0000000000000005e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  0.000000811889 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0886  preprotein translocase subunit SecY  43.29 
 
 		 418 aa  360  2e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.609907  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  42.01 
 
 		 435 aa  360  2e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2313  preprotein translocase subunit SecY  44.27 
 
 		 421 aa  360  3e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0367996  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  41.5 
 
 		 435 aa  359  6e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000602472 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  42.14 
 
 		 435 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1926  preprotein translocase, SecY subunit  43.42 
 
 		 449 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.796685  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3985  preprotein translocase, SecY subunit  43.97 
 
 		 448 aa  357  1.9999999999999998e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  42.44 
 
 		 437 aa  356  5e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0207  preprotein translocase, SecY subunit  43.86 
 
 		 500 aa  355  7.999999999999999e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0305  preprotein translocase subunit SecY  44.76 
 
 		 453 aa  355  1e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.398461 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  41.27 
 
 		 435 aa  355  1e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0778  preprotein translocase, SecY subunit  43.91 
 
 		 430 aa  354  1e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000100686  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1856  preprotein translocase, SecY subunit  42.15 
 
 		 446 aa  354  2e-96  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0112849  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09800  preprotein translocase, SecY subunit  43.42 
 
 		 427 aa  353  4e-96  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.141788  hitchhiker  0.0000395879 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0700  preprotein translocase subunit SecY  42.89 
 
 		 435 aa  353  5e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.418561  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  43.34 
 
 		 442 aa  352  7e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1976  preprotein translocase subunit SecY  42.82 
 
 		 446 aa  352  8.999999999999999e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.923807  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1213  preprotein translocase subunit SecY  42.82 
 
 		 446 aa  351  2e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2756  preprotein translocase, SecY subunit  43.62 
 
 		 443 aa  350  2e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.373135  normal  0.477854 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1176  preprotein translocase subunit SecY  42.82 
 
 		 446 aa  350  3e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0379017  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0245  preprotein translocase subunit SecY  41.8 
 
 		 424 aa  349  7e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.101058  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2986  preprotein translocase subunit SecY  43.26 
 
 		 448 aa  348  9e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0315  preprotein translocase subunit SecY  42.66 
 
 		 437 aa  348  1e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0598799  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2668  preprotein translocase subunit SecY  43.09 
 
 		 447 aa  348  2e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  41.31 
 
 		 437 aa  347  3e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0612  preprotein translocase subunit SecY  43.75 
 
 		 456 aa  346  4e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0780  preprotein translocase subunit SecY  41.78 
 
 		 457 aa  346  5e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  41.15 
 
 		 443 aa  346  6e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0441  preprotein translocase subunit SecY  42.42 
 
 		 443 aa  345  1e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2198  preprotein translocase, SecY subunit  41.78 
 
 		 448 aa  344  2e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0470035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1565  preprotein translocase subunit SecY  41.61 
 
 		 443 aa  344  2e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.112443  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0680  preprotein translocase subunit SecY  41.7 
 
 		 437 aa  344  2e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1006  preprotein translocase subunit SecY  43.29 
 
 		 446 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38875  hitchhiker  0.00669682 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3903  preprotein translocase subunit SecY  42.95 
 
 		 441 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.340332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1164  preprotein translocase, SecY subunit  44.32 
 
 		 431 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4295  preprotein translocase subunit SecY  42.95 
 
 		 441 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00554636 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0333  preprotein translocase, SecY subunit  39.82 
 
 		 445 aa  342  9e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1360  preprotein translocase, SecY subunit  43.71 
 
 		 423 aa  342  1e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0721  preprotein translocase subunit SecY  41.76 
 
 		 435 aa  342  1e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2459  preprotein translocase, SecY subunit  41.15 
 
 		 447 aa  342  1e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1504  preprotein translocase subunit SecY  43.33 
 
 		 419 aa  341  1e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2181  preprotein translocase, SecY subunit  41.15 
 
 		 447 aa  342  1e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.318083 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3397  preprotein translocase, SecY subunit  44.37 
 
 		 439 aa  341  2e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0285  preprotein translocase subunit SecY  42.56 
 
 		 430 aa  340  2e-92  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000550268  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1735  preprotein translocase subunit SecY  42.36 
 
 		 452 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0275  preprotein translocase subunit SecY  41.9 
 
 		 454 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0794912  normal  0.75706 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0235  preprotein translocase subunit SecY  42.19 
 
 		 419 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00849669  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0381  preprotein translocase subunit SecY  42.13 
 
 		 452 aa  340  4e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1863  preprotein translocase subunit SecY  42.69 
 
 		 446 aa  340  4e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1269  preprotein translocase subunit SecY  40.67 
 
 		 455 aa  339  5.9999999999999996e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3686  preprotein translocase, SecY subunit  42.27 
 
 		 441 aa  339  5.9999999999999996e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000792509  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2754  preprotein translocase, SecY subunit  42.01 
 
 		 437 aa  338  8e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0326  preprotein translocase subunit SecY  41.95 
 
 		 437 aa  338  9e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000568003 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3318  preprotein translocase subunit SecY  41.97 
 
 		 441 aa  338  9.999999999999999e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0560  preprotein translocase, SecY subunit  42.59 
 
 		 442 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2237  preprotein translocase subunit SecY  42.25 
 
 		 437 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.104557  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  41.24 
 
 		 443 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  41.24 
 
 		 443 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  0.0000000000266535 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2144  preprotein translocase, SecY subunit  41.01 
 
 		 447 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0607  preprotein translocase, SecY subunit  41.94 
 
 		 429 aa  337  2.9999999999999997e-91  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0598508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1374  preprotein translocase, SecY subunit  41.53 
 
 		 444 aa  337  2.9999999999999997e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285774  normal  0.105212 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0442  preprotein translocase subunit SecY  43.25 
 
 		 429 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5144  preprotein translocase, SecY subunit  40.18 
 
 		 437 aa  336  3.9999999999999995e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.552257 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0718  preprotein translocase subunit SecY  41.28 
 
 		 448 aa  335  7e-91  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.214912  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1246  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  39.91 
 
 		 463 aa  335  7e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.031052  hitchhiker  0.00314824 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5050  preprotein translocase subunit SecY  41.24 
 
 		 444 aa  335  9e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.478224  normal  0.981585 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0306  preprotein translocase subunit SecY  43.56 
 
 		 421 aa  335  1e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0894763  normal  0.194972 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2626  preprotein translocase subunit SecY  40.99 
 
 		 442 aa  335  1e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.512513  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1928  preprotein translocase, SecY subunit  39.82 
 
 		 445 aa  335  1e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0973  preprotein translocase subunit SecY  42.12 
 
 		 428 aa  335  1e-90  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0339  preprotein translocase subunit SecY  42 
 
 		 440 aa  334  2e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000142446  unclonable  0.0000000706243 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0425  preprotein translocase subunit SecY  41.91 
 
 		 437 aa  334  2e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.65116  normal  0.157207 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>