More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0973 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1118  preprotein translocase subunit SecY  76.64 
 
 		 428 aa  685    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.348488  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0973  preprotein translocase subunit SecY  100 
 
 		 428 aa  844    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1374  preprotein translocase subunit SecY  66.36 
 
 		 431 aa  598  1e-170  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0289241  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1312  preprotein translocase subunit SecY  66.82 
 
 		 431 aa  589  1e-167  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000457849  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0770  preprotein translocase subunit SecY  59.67 
 
 		 426 aa  483  1e-135  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  49.88 
 
 		 420 aa  407  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0886  preprotein translocase subunit SecY  49.3 
 
 		 418 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.609907  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0306  preprotein translocase subunit SecY  50.69 
 
 		 421 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0894763  normal  0.194972 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0442  preprotein translocase subunit SecY  49.54 
 
 		 429 aa  394  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  46.88 
 
 		 429 aa  393  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  49.41 
 
 		 447 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  49.07 
 
 		 447 aa  385  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2313  preprotein translocase subunit SecY  48.96 
 
 		 421 aa  387  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0367996  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  44.65 
 
 		 435 aa  384  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1000  preprotein translocase, SecY subunit  47.67 
 
 		 419 aa  383  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00382146  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  43.74 
 
 		 435 aa  382  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  0.000000811889 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1726  preprotein translocase, SecY subunit  49.55 
 
 		 435 aa  382  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000716119  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  44.44 
 
 		 437 aa  383  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  43.74 
 
 		 435 aa  383  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0245  preprotein translocase subunit SecY  46.24 
 
 		 424 aa  380  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.101058  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  48.71 
 
 		 447 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0235  preprotein translocase subunit SecY  47.92 
 
 		 419 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00849669  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  45.56 
 
 		 435 aa  381  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01360  preprotein translocase, SecY subunit  46.98 
 
 		 422 aa  372  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000700723  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  47.1 
 
 		 445 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  42.37 
 
 		 435 aa  372  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2756  preprotein translocase, SecY subunit  44.76 
 
 		 443 aa  374  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.373135  normal  0.477854 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1006  preprotein translocase subunit SecY  45.12 
 
 		 446 aa  372  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38875  hitchhiker  0.00669682 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  44.93 
 
 		 442 aa  373  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1863  preprotein translocase subunit SecY  45.71 
 
 		 446 aa  369  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1450  preprotein translocase subunit SecY  44.42 
 
 		 446 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337945  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1504  preprotein translocase subunit SecY  48.38 
 
 		 419 aa  370  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  42.37 
 
 		 435 aa  370  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000602472 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0700  preprotein translocase subunit SecY  42.6 
 
 		 435 aa  365  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.418561  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  43.45 
 
 		 437 aa  365  1e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1246  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  43.38 
 
 		 463 aa  361  2e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.031052  hitchhiker  0.00314824 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1352  preprotein translocase subunit SecY  45.48 
 
 		 446 aa  359  5e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0023208  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1976  preprotein translocase subunit SecY  44.65 
 
 		 446 aa  359  7e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.923807  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1213  preprotein translocase subunit SecY  44.88 
 
 		 446 aa  358  9.999999999999999e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1176  preprotein translocase subunit SecY  44.88 
 
 		 446 aa  357  1.9999999999999998e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0379017  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2887  preprotein translocase, SecY subunit  43.54 
 
 		 441 aa  357  2.9999999999999997e-97  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0626195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0778  preprotein translocase, SecY subunit  47.26 
 
 		 430 aa  355  5.999999999999999e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000100686  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1831  preprotein translocase subunit SecY  44.44 
 
 		 443 aa  355  1e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.321149  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0214  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  46.03 
 
 		 419 aa  354  1e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.32801  normal  0.494063 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2144  preprotein translocase, SecY subunit  44.21 
 
 		 447 aa  354  2e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2986  preprotein translocase subunit SecY  43.82 
 
 		 448 aa  354  2e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2459  preprotein translocase, SecY subunit  43.98 
 
 		 447 aa  354  2e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2181  preprotein translocase, SecY subunit  43.98 
 
 		 447 aa  354  2e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.318083 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3985  preprotein translocase, SecY subunit  46.62 
 
 		 448 aa  353  2.9999999999999997e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0721  preprotein translocase subunit SecY  44.29 
 
 		 435 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4778  preprotein translocase subunit SecY  44.29 
 
 		 444 aa  352  1e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000420552 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0560  preprotein translocase, SecY subunit  44.06 
 
 		 442 aa  351  1e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  41.1 
 
 		 437 aa  350  2e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2668  preprotein translocase subunit SecY  44.21 
 
 		 447 aa  350  2e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2198  preprotein translocase, SecY subunit  43.93 
 
 		 448 aa  350  4e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0470035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2923  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  48.28 
 
 		 427 aa  349  5e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000208113  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4006  preprotein translocase, SecY subunit  44.4 
 
 		 450 aa  349  5e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000605815  hitchhiker  0.000026914 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1374  preprotein translocase, SecY subunit  43.49 
 
 		 444 aa  349  5e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285774  normal  0.105212 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2599  preprotein translocase subunit SecY  45.93 
 
 		 440 aa  349  6e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0785292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0333  preprotein translocase, SecY subunit  43.49 
 
 		 445 aa  349  6e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5050  preprotein translocase subunit SecY  43.02 
 
 		 444 aa  349  7e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.478224  normal  0.981585 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1565  preprotein translocase subunit SecY  42.42 
 
 		 443 aa  348  7e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.112443  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1165  preprotein translocase, SecY subunit  43.64 
 
 		 450 aa  349  7e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000330141  normal  0.11389 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0862  preprotein translocase, SecY subunit  43.81 
 
 		 438 aa  348  8e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.148817  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  42.19 
 
 		 443 aa  347  2e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2209  preprotein translocase subunit SecY  43.31 
 
 		 443 aa  347  3e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000211329  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0309  preprotein translocase subunit SecY  43.31 
 
 		 443 aa  346  4e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0197098  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1928  preprotein translocase, SecY subunit  43.72 
 
 		 445 aa  346  5e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2315  preprotein translocase subunit SecY  42.66 
 
 		 443 aa  345  6e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.775008  normal  0.296135 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3647  preprotein translocase subunit SecY  42.66 
 
 		 443 aa  344  2e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1658  preprotein translocase subunit SecY  43.26 
 
 		 446 aa  344  2e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.398859  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0680  preprotein translocase subunit SecY  40.19 
 
 		 437 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1856  preprotein translocase, SecY subunit  43.5 
 
 		 446 aa  343  4e-93  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0112849  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3164  preprotein translocase subunit SecY  42.66 
 
 		 443 aa  343  4e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0194839  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0718  preprotein translocase subunit SecY  43.22 
 
 		 448 aa  342  5e-93  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.214912  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2694  preprotein translocase subunit SecY  43.48 
 
 		 425 aa  342  5e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2379  preprotein translocase subunit SecY  43.48 
 
 		 425 aa  342  5e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0305  preprotein translocase subunit SecY  43.05 
 
 		 453 aa  342  8e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.398461 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1164  preprotein translocase, SecY subunit  44.91 
 
 		 431 aa  340  2e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  43.18 
 
 		 443 aa  340  2e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  0.0000000000266535 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  43.18 
 
 		 443 aa  340  2e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2276  preprotein translocase subunit SecY  42.86 
 
 		 441 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000725785  hitchhiker  0.00410487 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2403  preprotein translocase subunit SecY  43.08 
 
 		 443 aa  339  5.9999999999999996e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0193161  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2044  preprotein translocase subunit SecY  44.12 
 
 		 441 aa  339  7e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00113194  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4487  preprotein translocase, SecY subunit  43.79 
 
 		 436 aa  338  9.999999999999999e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2045  preprotein translocase, SecY subunit  44.26 
 
 		 435 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000027617  hitchhiker  0.00154147 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3428  preprotein translocase subunit SecY  41.49 
 
 		 443 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452831  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2237  preprotein translocase subunit SecY  41.36 
 
 		 437 aa  336  3.9999999999999995e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.104557  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0381  preprotein translocase subunit SecY  41.95 
 
 		 452 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0326  preprotein translocase subunit SecY  42.53 
 
 		 437 aa  336  3.9999999999999995e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000568003 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0780  preprotein translocase subunit SecY  42.95 
 
 		 457 aa  335  5.999999999999999e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1735  preprotein translocase subunit SecY  41.95 
 
 		 452 aa  335  1e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6594  preprotein translocase subunit SecY  44.34 
 
 		 436 aa  334  2e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4934  preprotein translocase, SecY subunit  40.44 
 
 		 439 aa  334  2e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000290796  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2754  preprotein translocase, SecY subunit  40.47 
 
 		 437 aa  333  4e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0201  preprotein translocase subunit SecY  42.63 
 
 		 443 aa  333  5e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.124191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1106  protein translocase subunit SecY/sec61 alpha  41.5 
 
 		 438 aa  332  5e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.105713 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0275  preprotein translocase subunit SecY  41.27 
 
 		 454 aa  332  5e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0794912  normal  0.75706 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2469  preprotein translocase subunit SecY  42.92 
 
 		 434 aa  331  1e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0545369  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4301  preprotein translocase, SecY subunit  42.26 
 
 		 432 aa  331  1e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>