More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0770 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0770  preprotein translocase subunit SecY  100 
 
 
426 aa  840    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1374  preprotein translocase subunit SecY  62.04 
 
 
431 aa  538  9.999999999999999e-153  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0289241  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1118  preprotein translocase subunit SecY  61.31 
 
 
428 aa  521  1e-146  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.348488  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1312  preprotein translocase subunit SecY  62.27 
 
 
431 aa  520  1e-146  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000457849  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0973  preprotein translocase subunit SecY  59.67 
 
 
428 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0235  preprotein translocase subunit SecY  48.02 
 
 
419 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00849669  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0306  preprotein translocase subunit SecY  46.33 
 
 
421 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0894763  normal  0.194972 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2313  preprotein translocase subunit SecY  46.74 
 
 
421 aa  372  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0367996  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  46.06 
 
 
420 aa  369  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0245  preprotein translocase subunit SecY  46.9 
 
 
424 aa  366  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.101058  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  44.32 
 
 
435 aa  367  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  43.54 
 
 
437 aa  363  5.0000000000000005e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  43.86 
 
 
435 aa  361  1e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  0.000000811889 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  44.44 
 
 
435 aa  360  2e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  43.18 
 
 
435 aa  360  2e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1246  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  42.61 
 
 
463 aa  360  2e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.031052  hitchhiker  0.00314824 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  42.5 
 
 
435 aa  358  9e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000602472 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  45.05 
 
 
445 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1726  preprotein translocase, SecY subunit  44.1 
 
 
435 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000716119  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0886  preprotein translocase subunit SecY  45.09 
 
 
418 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.609907  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  44.16 
 
 
429 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1504  preprotein translocase subunit SecY  44.39 
 
 
419 aa  356  5e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1000  preprotein translocase, SecY subunit  44.29 
 
 
419 aa  355  6.999999999999999e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00382146  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  45.58 
 
 
447 aa  353  2e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  43.31 
 
 
435 aa  354  2e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  45.58 
 
 
447 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0700  preprotein translocase subunit SecY  44.77 
 
 
435 aa  350  2e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.418561  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2135  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  44.57 
 
 
428 aa  349  6e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233384  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1863  preprotein translocase subunit SecY  42.89 
 
 
446 aa  349  6e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0778  preprotein translocase, SecY subunit  45.29 
 
 
430 aa  347  3e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000100686  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2756  preprotein translocase, SecY subunit  41.42 
 
 
443 aa  346  5e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.373135  normal  0.477854 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1856  preprotein translocase, SecY subunit  42.67 
 
 
446 aa  346  5e-94  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0112849  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01360  preprotein translocase, SecY subunit  45.45 
 
 
422 aa  345  8.999999999999999e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000700723  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1976  preprotein translocase subunit SecY  43.28 
 
 
446 aa  345  1e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.923807  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  45.12 
 
 
447 aa  345  1e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1213  preprotein translocase subunit SecY  43.05 
 
 
446 aa  344  2e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1006  preprotein translocase subunit SecY  42.2 
 
 
446 aa  344  2e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38875  hitchhiker  0.00669682 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1176  preprotein translocase subunit SecY  43.05 
 
 
446 aa  343  4e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0379017  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0442  preprotein translocase subunit SecY  43.55 
 
 
429 aa  342  7e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  41.1 
 
 
437 aa  339  4e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0309  preprotein translocase subunit SecY  41.48 
 
 
443 aa  339  5e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0197098  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0333  preprotein translocase, SecY subunit  41.84 
 
 
445 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3885  preprotein translocase subunit SecY  42.76 
 
 
437 aa  338  9.999999999999999e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1352  preprotein translocase subunit SecY  42.07 
 
 
446 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0023208  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6029  preprotein translocase subunit SecY  42.13 
 
 
430 aa  336  3.9999999999999995e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  40.96 
 
 
443 aa  336  5e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2198  preprotein translocase, SecY subunit  42.86 
 
 
448 aa  335  7e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0470035  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2276  preprotein translocase subunit SecY  43.02 
 
 
441 aa  335  9e-91  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000725785  hitchhiker  0.00410487 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  42.49 
 
 
443 aa  335  1e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  42.49 
 
 
443 aa  335  1e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  0.0000000000266535 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1450  preprotein translocase subunit SecY  41.84 
 
 
446 aa  335  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337945  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  41.06 
 
 
437 aa  335  1e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  41.11 
 
 
442 aa  335  1e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1164  preprotein translocase, SecY subunit  46.03 
 
 
431 aa  334  2e-90  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0718  preprotein translocase subunit SecY  40.5 
 
 
448 aa  334  2e-90  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.214912  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0721  preprotein translocase subunit SecY  40.91 
 
 
435 aa  333  3e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1831  preprotein translocase subunit SecY  41.63 
 
 
443 aa  333  3e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.321149  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1565  preprotein translocase subunit SecY  41.1 
 
 
443 aa  333  3e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.112443  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3686  preprotein translocase, SecY subunit  41.04 
 
 
441 aa  333  3e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000792509  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2986  preprotein translocase subunit SecY  39.59 
 
 
448 aa  332  6e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135734  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0602  preprotein translocase subunit SecY  41.3 
 
 
430 aa  332  8e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.637505  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0680  preprotein translocase subunit SecY  41.96 
 
 
437 aa  332  8e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1634  preprotein translocase subunit SecY  38.99 
 
 
452 aa  331  1e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0116955  normal  0.0410443 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2668  preprotein translocase subunit SecY  42.63 
 
 
447 aa  331  1e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2181  preprotein translocase, SecY subunit  42.3 
 
 
447 aa  330  3e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.318083 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0560  preprotein translocase, SecY subunit  42.17 
 
 
442 aa  330  3e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0214  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  43.59 
 
 
419 aa  330  3e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.32801  normal  0.494063 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2459  preprotein translocase, SecY subunit  42.3 
 
 
447 aa  330  3e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4487  preprotein translocase, SecY subunit  39.91 
 
 
436 aa  330  4e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3985  preprotein translocase, SecY subunit  43.18 
 
 
448 aa  329  5.0000000000000004e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00342615  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5022  preprotein translocase subunit SecY  40.36 
 
 
445 aa  329  6e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5050  preprotein translocase subunit SecY  40.79 
 
 
444 aa  329  7e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.478224  normal  0.981585 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0862  preprotein translocase, SecY subunit  41.91 
 
 
438 aa  329  7e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.148817  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5144  preprotein translocase, SecY subunit  40.09 
 
 
437 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.552257 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2144  preprotein translocase, SecY subunit  42.76 
 
 
447 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1928  preprotein translocase, SecY subunit  40.14 
 
 
445 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6594  preprotein translocase subunit SecY  39.55 
 
 
436 aa  327  2.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3903  preprotein translocase subunit SecY  39.05 
 
 
441 aa  327  3e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.340332  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4778  preprotein translocase subunit SecY  42.23 
 
 
444 aa  327  3e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000420552 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2315  preprotein translocase subunit SecY  39.63 
 
 
443 aa  326  5e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.775008  normal  0.296135 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4295  preprotein translocase subunit SecY  39.05 
 
 
441 aa  326  5e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00554636 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0582  preprotein translocase subunit SecY  40.83 
 
 
435 aa  325  7e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2923  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  45.1 
 
 
427 aa  325  8.000000000000001e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000208113  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0780  preprotein translocase subunit SecY  42.49 
 
 
457 aa  325  9e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2626  preprotein translocase subunit SecY  39.11 
 
 
442 aa  325  1e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.512513  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1374  preprotein translocase, SecY subunit  40.73 
 
 
444 aa  325  1e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285774  normal  0.105212 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0275  preprotein translocase subunit SecY  40.56 
 
 
454 aa  325  1e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0794912  normal  0.75706 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1106  protein translocase subunit SecY/sec61 alpha  39.91 
 
 
438 aa  324  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.105713 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3164  preprotein translocase subunit SecY  39.73 
 
 
443 aa  324  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0194839  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0326  preprotein translocase subunit SecY  39.91 
 
 
437 aa  323  2e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000568003 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3647  preprotein translocase subunit SecY  39.5 
 
 
443 aa  323  3e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10746  preprotein translocase subunit SecY  40.14 
 
 
441 aa  322  8e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.329828 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0607  preprotein translocase, SecY subunit  41 
 
 
429 aa  322  9.000000000000001e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0598508  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2209  preprotein translocase subunit SecY  40.77 
 
 
443 aa  321  9.999999999999999e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000211329  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0647  preprotein translocase, SecY subunit  40.78 
 
 
432 aa  322  9.999999999999999e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2237  preprotein translocase subunit SecY  40.91 
 
 
437 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.104557  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1926  preprotein translocase, SecY subunit  40.94 
 
 
449 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.796685  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1775  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  40.87 
 
 
446 aa  321  1.9999999999999998e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.152379  normal  0.149147 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2403  preprotein translocase subunit SecY  39.73 
 
 
443 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0193161  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04180  preprotein translocase subunit SecY  39.68 
 
 
435 aa  321  1.9999999999999998e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132635  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>