More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1726 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1726  preprotein translocase, SecY subunit  100 
 
 
435 aa  858    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000716119  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0886  preprotein translocase subunit SecY  58.39 
 
 
418 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.609907  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  55.86 
 
 
420 aa  495  1e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0306  preprotein translocase subunit SecY  56.55 
 
 
421 aa  476  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0894763  normal  0.194972 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0778  preprotein translocase, SecY subunit  57.56 
 
 
430 aa  471  1e-132  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000100686  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0245  preprotein translocase subunit SecY  53 
 
 
424 aa  473  1e-132  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.101058  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1504  preprotein translocase subunit SecY  55.63 
 
 
419 aa  466  9.999999999999999e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0235  preprotein translocase subunit SecY  53.79 
 
 
419 aa  462  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00849669  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0442  preprotein translocase subunit SecY  53.88 
 
 
429 aa  457  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2313  preprotein translocase subunit SecY  54.36 
 
 
421 aa  453  1.0000000000000001e-126  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0367996  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2923  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  56.82 
 
 
427 aa  451  1e-125  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000208113  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0214  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  51.61 
 
 
419 aa  421  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.32801  normal  0.494063 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  48.52 
 
 
435 aa  417  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  47.49 
 
 
435 aa  414  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  47.61 
 
 
435 aa  414  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  0.000000811889 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  46.7 
 
 
435 aa  411  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  48.72 
 
 
447 aa  411  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  48.84 
 
 
447 aa  411  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  46.45 
 
 
437 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  48.84 
 
 
447 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  47.93 
 
 
445 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1164  preprotein translocase, SecY subunit  49.66 
 
 
431 aa  402  1e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  46.53 
 
 
429 aa  403  1e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  46 
 
 
435 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  46.22 
 
 
435 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000602472 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2694  preprotein translocase subunit SecY  45.43 
 
 
425 aa  392  1e-108  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0700  preprotein translocase subunit SecY  46.12 
 
 
435 aa  394  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.418561  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0721  preprotein translocase subunit SecY  45.68 
 
 
435 aa  389  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2379  preprotein translocase subunit SecY  45.21 
 
 
425 aa  391  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0309  preprotein translocase subunit SecY  45.68 
 
 
443 aa  385  1e-106  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0197098  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  45.83 
 
 
442 aa  386  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0130  preprotein translocase subunit SecY  47.15 
 
 
433 aa  382  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0066731  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2766  preprotein translocase subunit SecY  47.86 
 
 
434 aa  383  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00224272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0130  preprotein translocase subunit SecY  47.15 
 
 
433 aa  382  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00164171  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0126  preprotein translocase subunit SecY  47.15 
 
 
433 aa  382  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0265701  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2503  preprotein translocase subunit SecY  48.08 
 
 
434 aa  382  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000332806  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0124  preprotein translocase subunit SecY  47.15 
 
 
433 aa  382  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.64549  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0130  preprotein translocase subunit SecY  47.15 
 
 
433 aa  382  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00952483  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2545  preprotein translocase subunit SecY  47.86 
 
 
434 aa  382  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000778926 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2742  preprotein translocase subunit SecY  47.86 
 
 
434 aa  382  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53667e-23 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01360  preprotein translocase, SecY subunit  50.68 
 
 
422 aa  382  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000700723  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0161  preprotein translocase subunit SecY  47.15 
 
 
433 aa  382  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000198533  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0973  preprotein translocase subunit SecY  49.55 
 
 
428 aa  382  1e-105  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0151  preprotein translocase subunit SecY  46.92 
 
 
433 aa  381  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0158065  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2547  preprotein translocase subunit SecY  47.63 
 
 
434 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0673869  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2469  preprotein translocase subunit SecY  47.4 
 
 
434 aa  379  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0545369  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2734  preprotein translocase subunit SecY  47.63 
 
 
434 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.356112  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2412  preprotein translocase subunit SecY  47.18 
 
 
434 aa  379  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00625491  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2135  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  45.66 
 
 
428 aa  381  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233384  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5175  preprotein translocase subunit SecY  46.92 
 
 
433 aa  380  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000485174  unclonable  4.1263e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0125  preprotein translocase subunit SecY  46.92 
 
 
433 aa  380  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00395698  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2747  preprotein translocase subunit SecY  47.63 
 
 
434 aa  380  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.787541  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2044  preprotein translocase subunit SecY  45.45 
 
 
441 aa  377  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00113194  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1000  preprotein translocase, SecY subunit  46.82 
 
 
419 aa  378  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00382146  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0131  preprotein translocase subunit SecY  47.95 
 
 
430 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.129381  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0862  preprotein translocase, SecY subunit  45.15 
 
 
438 aa  374  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.148817  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2209  preprotein translocase subunit SecY  45.58 
 
 
443 aa  372  1e-102  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000211329  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  44.83 
 
 
437 aa  373  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1831  preprotein translocase subunit SecY  44.57 
 
 
443 aa  372  1e-102  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.321149  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1374  preprotein translocase subunit SecY  44.92 
 
 
431 aa  374  1e-102  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0289241  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1165  preprotein translocase, SecY subunit  46.52 
 
 
450 aa  370  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000330141  normal  0.11389 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  45.16 
 
 
443 aa  370  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  0.0000000000266535 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  45.16 
 
 
443 aa  370  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2276  preprotein translocase subunit SecY  45.7 
 
 
441 aa  369  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000725785  hitchhiker  0.00410487 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2790  preprotein translocase subunit SecY  47.76 
 
 
434 aa  371  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000168645  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0127  preprotein translocase subunit SecY  46.91 
 
 
430 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2403  preprotein translocase subunit SecY  45.23 
 
 
443 aa  369  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0193161  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0124  preprotein translocase subunit SecY  47.15 
 
 
433 aa  367  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0201  preprotein translocase subunit SecY  45.68 
 
 
443 aa  367  1e-100  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.124191  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6029  preprotein translocase subunit SecY  43.21 
 
 
430 aa  365  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3647  preprotein translocase, SecY subunit  44.27 
 
 
442 aa  368  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00118801  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  43.55 
 
 
437 aa  368  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1118  preprotein translocase subunit SecY  48.42 
 
 
428 aa  364  1e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.348488  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4301  preprotein translocase, SecY subunit  42.05 
 
 
432 aa  365  1e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1312  preprotein translocase subunit SecY  45.82 
 
 
431 aa  364  2e-99  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000457849  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1246  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  42.39 
 
 
463 aa  363  2e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.031052  hitchhiker  0.00314824 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0602  preprotein translocase subunit SecY  43.86 
 
 
430 aa  361  1e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.637505  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1360  preprotein translocase, SecY subunit  43.48 
 
 
423 aa  361  1e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4006  preprotein translocase, SecY subunit  45.87 
 
 
450 aa  360  3e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000605815  hitchhiker  0.000026914 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2756  preprotein translocase, SecY subunit  45.2 
 
 
443 aa  358  9.999999999999999e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.373135  normal  0.477854 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1843  preprotein translocase subunit SecY  45.74 
 
 
434 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.019643  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0178  preprotein translocase subunit SecY  44.78 
 
 
446 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000408952  hitchhiker  0.00214614 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3985  preprotein translocase, SecY subunit  43.96 
 
 
448 aa  356  5e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00342615  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2237  preprotein translocase subunit SecY  42.4 
 
 
437 aa  355  5.999999999999999e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.104557  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3885  preprotein translocase subunit SecY  43.18 
 
 
437 aa  356  5.999999999999999e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4670  preprotein translocase subunit SecY  44.76 
 
 
446 aa  356  5.999999999999999e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000509869  unclonable  0.0000000121988 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4298  preprotein translocase subunit SecY  44.52 
 
 
446 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000258427  unclonable  0.0000000000837901 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2986  preprotein translocase subunit SecY  42.05 
 
 
448 aa  355  8.999999999999999e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135734  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5144  preprotein translocase, SecY subunit  43.31 
 
 
437 aa  355  1e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.552257 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  44.42 
 
 
443 aa  355  1e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29540  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  43.51 
 
 
429 aa  354  2e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.498773  normal  0.844433 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0622  preprotein translocase, SecY subunit  43.51 
 
 
444 aa  353  2e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.925436 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0333  preprotein translocase, SecY subunit  44.55 
 
 
445 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0735  preprotein translocase, SecY subunit  44.24 
 
 
433 aa  353  5e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2691  preprotein translocase, SecY subunit  44.39 
 
 
430 aa  353  5e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.803147  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1565  preprotein translocase subunit SecY  43.72 
 
 
443 aa  352  5.9999999999999994e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.112443  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0680  preprotein translocase subunit SecY  42.39 
 
 
437 aa  352  5.9999999999999994e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1006  preprotein translocase subunit SecY  42.46 
 
 
446 aa  352  7e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38875  hitchhiker  0.00669682 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0326  preprotein translocase subunit SecY  43.68 
 
 
437 aa  351  1e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000568003 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0204  preprotein translocase subunit SecY  44.65 
 
 
446 aa  350  3e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000662692  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>