More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_01360 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_01360  preprotein translocase, SecY subunit  100 
 
 		 422 aa  845    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000700723  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  55.79 
 
 		 420 aa  493  9.999999999999999e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0886  preprotein translocase subunit SecY  55.4 
 
 		 418 aa  456  1e-127  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.609907  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0214  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  55.92 
 
 		 419 aa  457  1e-127  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.32801  normal  0.494063 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0442  preprotein translocase subunit SecY  53.13 
 
 		 429 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  49.07 
 
 		 435 aa  436  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  0.000000811889 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0235  preprotein translocase subunit SecY  52.68 
 
 		 419 aa  436  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00849669  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0306  preprotein translocase subunit SecY  51.75 
 
 		 421 aa  437  1e-121  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0894763  normal  0.194972 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2313  preprotein translocase subunit SecY  53.41 
 
 		 421 aa  437  1e-121  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0367996  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  49.4 
 
 		 429 aa  438  1e-121  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0245  preprotein translocase subunit SecY  50 
 
 		 424 aa  432  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.101058  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  49.65 
 
 		 435 aa  434  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  49.42 
 
 		 442 aa  433  1e-120  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  47.45 
 
 		 435 aa  430  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  48.96 
 
 		 435 aa  429  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000602472 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  48.15 
 
 		 435 aa  426  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1504  preprotein translocase subunit SecY  50.82 
 
 		 419 aa  423  1e-117  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  47.54 
 
 		 445 aa  419  1e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  47.21 
 
 		 435 aa  418  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  47.31 
 
 		 447 aa  412  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0721  preprotein translocase subunit SecY  46.37 
 
 		 435 aa  414  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  46.65 
 
 		 437 aa  413  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1726  preprotein translocase, SecY subunit  50.68 
 
 		 435 aa  412  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000716119  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1000  preprotein translocase, SecY subunit  48.47 
 
 		 419 aa  410  1e-113  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00382146  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6594  preprotein translocase subunit SecY  47.51 
 
 		 436 aa  410  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  47.07 
 
 		 447 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3318  preprotein translocase subunit SecY  47.53 
 
 		 441 aa  409  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0700  preprotein translocase subunit SecY  46.98 
 
 		 435 aa  410  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.418561  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3985  preprotein translocase, SecY subunit  46.98 
 
 		 448 aa  407  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  47.33 
 
 		 443 aa  403  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  47.33 
 
 		 443 aa  403  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  0.0000000000266535 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3686  preprotein translocase, SecY subunit  47.09 
 
 		 441 aa  400  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000792509  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1374  preprotein translocase subunit SecY  45.48 
 
 		 431 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0289241  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6029  preprotein translocase subunit SecY  48.05 
 
 		 430 aa  401  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0425  preprotein translocase subunit SecY  46.65 
 
 		 437 aa  400  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.65116  normal  0.157207 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0787  preprotein translocase subunit SecY  48.09 
 
 		 442 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0142235  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  47.31 
 
 		 447 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0973  preprotein translocase subunit SecY  46.98 
 
 		 428 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0778  preprotein translocase, SecY subunit  49.2 
 
 		 430 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000100686  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1164  preprotein translocase, SecY subunit  47.28 
 
 		 431 aa  398  1e-109  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2756  preprotein translocase, SecY subunit  46.04 
 
 		 443 aa  396  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.373135  normal  0.477854 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3885  preprotein translocase subunit SecY  47.06 
 
 		 437 aa  397  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0621  preprotein translocase subunit SecY  48.51 
 
 		 439 aa  397  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4301  preprotein translocase, SecY subunit  46 
 
 		 432 aa  398  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0339  preprotein translocase subunit SecY  46.41 
 
 		 440 aa  394  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000142446  unclonable  0.0000000706243 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4295  preprotein translocase subunit SecY  45.66 
 
 		 441 aa  393  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00554636 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1042  preprotein translocase subunit SecY  47.75 
 
 		 439 aa  392  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0315  preprotein translocase subunit SecY  47.13 
 
 		 437 aa  394  1e-108  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0598799  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3929  preprotein translocase subunit SecY  48.01 
 
 		 436 aa  392  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0602  preprotein translocase subunit SecY  47.14 
 
 		 430 aa  393  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.637505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0299  preprotein translocase subunit SecY  48.33 
 
 		 440 aa  393  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000631755  hitchhiker  0.00000321163 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1312  preprotein translocase subunit SecY  46.4 
 
 		 431 aa  394  1e-108  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000457849  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0393  preprotein translocase subunit SecY  48.25 
 
 		 439 aa  393  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0413341  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0401  preprotein translocase subunit SecY  48.25 
 
 		 439 aa  393  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1118  preprotein translocase subunit SecY  44.86 
 
 		 428 aa  392  1e-108  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.348488  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0607  preprotein translocase, SecY subunit  47.93 
 
 		 429 aa  391  1e-107  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0598508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2158  preprotein translocase, SecY subunit  48.5 
 
 		 426 aa  390  1e-107  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00470545  normal  0.460281 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1831  preprotein translocase subunit SecY  46.3 
 
 		 443 aa  391  1e-107  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.321149  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0857  preprotein translocase subunit SecY  44.24 
 
 		 442 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0309  preprotein translocase subunit SecY  45.81 
 
 		 443 aa  389  1e-107  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0197098  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04180  preprotein translocase subunit SecY  46.36 
 
 		 435 aa  390  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132635  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3397  preprotein translocase, SecY subunit  47.3 
 
 		 439 aa  390  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1360  preprotein translocase, SecY subunit  47.66 
 
 		 423 aa  389  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09050  preprotein translocase subunit SecY  44.24 
 
 		 442 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.224184 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  43.69 
 
 		 437 aa  389  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3903  preprotein translocase subunit SecY  45.21 
 
 		 441 aa  391  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.340332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4487  preprotein translocase, SecY subunit  45.23 
 
 		 436 aa  387  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0646  preprotein translocase, SecY subunit  44 
 
 		 444 aa  386  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.617938  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3423  preprotein translocase subunit SecY  47.5 
 
 		 436 aa  385  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.23916 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4528  preprotein translocase subunit SecY  44 
 
 		 444 aa  386  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.447133  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  46.52 
 
 		 443 aa  386  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2305  preprotein translocase subunit SecY  45.77 
 
 		 453 aa  388  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0325321  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4223  preprotein translocase subunit SecY  47 
 
 		 436 aa  386  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0505149  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10746  preprotein translocase subunit SecY  44.84 
 
 		 441 aa  387  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.329828 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4298  preprotein translocase subunit SecY  47.17 
 
 		 446 aa  385  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000258427  unclonable  0.0000000000837901 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5022  preprotein translocase subunit SecY  45.11 
 
 		 445 aa  386  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4670  preprotein translocase subunit SecY  47.17 
 
 		 446 aa  385  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000509869  unclonable  0.0000000121988 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0739  preprotein translocase subunit SecY  44.2 
 
 		 440 aa  385  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00521081  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2305  preprotein translocase subunit SecY  47.25 
 
 		 437 aa  388  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.773218 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5050  preprotein translocase subunit SecY  46.52 
 
 		 444 aa  385  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.478224  normal  0.981585 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2352  preprotein translocase subunit SecY  44.55 
 
 		 441 aa  383  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299181  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1213  preprotein translocase subunit SecY  44.87 
 
 		 446 aa  382  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2986  preprotein translocase subunit SecY  45.14 
 
 		 448 aa  382  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29540  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  46.31 
 
 		 429 aa  382  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.498773  normal  0.844433 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5059  preprotein translocase subunit SecY  43.76 
 
 		 442 aa  383  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000898122  normal  0.284155 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1976  preprotein translocase subunit SecY  44.87 
 
 		 446 aa  382  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.923807  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1006  preprotein translocase subunit SecY  45.11 
 
 		 446 aa  384  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38875  hitchhiker  0.00669682 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0507  preprotein translocase subunit SecY  43.99 
 
 		 443 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0640452  normal  0.0135524 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5050  preprotein translocase subunit SecY  46.63 
 
 		 437 aa  384  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.34117  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0441  preprotein translocase subunit SecY  46.54 
 
 		 443 aa  383  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1565  preprotein translocase subunit SecY  46.52 
 
 		 443 aa  384  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.112443  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0504  preprotein translocase subunit SecY  43.99 
 
 		 443 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1246  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  44.03 
 
 		 463 aa  384  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.031052  hitchhiker  0.00314824 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0178  preprotein translocase subunit SecY  46.82 
 
 		 446 aa  384  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000408952  hitchhiker  0.00214614 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1147  preprotein translocase, SecY subunit  46.89 
 
 		 445 aa  382  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4729  preprotein translocase subunit SecY  43.99 
 
 		 443 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0376135  normal  0.430849 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1074  preprotein translocase subunit SecY  43.5 
 
 		 441 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2044  preprotein translocase subunit SecY  46.06 
 
 		 441 aa  382  1e-105  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00113194  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0233  preprotein translocase subunit SecY  45.88 
 
 		 446 aa  382  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000181445  unclonable  0.0000105897 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1062  preprotein translocase subunit SecY  43.5 
 
 		 441 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160681  normal  0.323313 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>